Details for gene set HALLMARK_EPITHELIAL_MESENCHYMAL

Table: GSEA Results Summary

Dataset	HSC.HSC_Pheno.cls#Group1_versus_Group3.HSC_Pheno.cls#Group1_versus_Group3_repos
Phenotype	HSC_Pheno.cls#Group1_versus_Group3_repos
Upregulated in class	0
GeneSet	HALLMARK_EPITHELIAL_MESENCHYMAL_TRANSITION
Enrichment Score (ES)	0.2520757
Normalized Enrichment Score (NES)	1.0305713
Nominal p-value	0.40480962
FDR q-value	0.861015
FWER p-Value	0.997

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Rhob	85	1.009	0.0375	Yes
2	Fbn1	208	0.825	0.0640	Yes
3	Wipf1	365	0.709	0.0825	Yes
4	Gpc1	564	0.608	0.0932	Yes
5	Thbs1	577	0.605	0.1189	Yes
6	Fap	756	0.553	0.1287	Yes
7	Itgav	864	0.525	0.1432	Yes
8	Jun	952	0.502	0.1582	Yes
9	Itgb1	1015	0.490	0.1747	Yes
10	Calu	1036	0.482	0.1943	Yes
11	Sdc4	1125	0.465	0.2077	Yes
12	Abi3bp	1132	0.463	0.2276	Yes
13	Sat1	1396	0.417	0.2246	Yes
14	Notch2	1538	0.401	0.2307	Yes
15	Magee1	1770	0.375	0.2284	Yes
16	Capg	1796	0.372	0.2428	Yes
17	Col16a1	1878	0.360	0.2521	Yes
18	Fermt2	2431	0.289	0.2199	No
19	Igfbp4	2451	0.287	0.2310	No
20	Mmp14	2509	0.279	0.2386	No
21	Fas	2630	0.269	0.2407	No
22	Tpm2	2649	0.267	0.2510	No
23	Eno2	3173	0.221	0.2181	No
24	Tgfbi	3176	0.221	0.2277	No
25	Pmepa1	3345	0.208	0.2232	No
26	Plaur	3465	0.200	0.2223	No
27	Plod2	3739	0.177	0.2079	No
28	Cadm1	3886	0.164	0.2032	No
29	Itgb3	3981	0.157	0.2025	No
30	Ecm2	4057	0.150	0.2030	No
31	Mylk	4110	0.146	0.2052	No
32	Glipr1	4325	0.129	0.1934	No
33	Vcan	4351	0.127	0.1970	No
34	Qsox1	4460	0.119	0.1935	No
35	Plod1	4481	0.117	0.1970	No
36	Anpep	4599	0.107	0.1922	No
37	Bgn	4687	0.099	0.1894	No
38	Mcm7	4993	0.078	0.1680	No
39	Lamc1	5079	0.070	0.1642	No
40	Bmp1	5133	0.066	0.1628	No
41	Col1a2	5359	0.051	0.1467	No
42	Vegfc	5422	0.047	0.1437	No
43	Fstl1	5597	0.034	0.1311	No
44	Copa	5718	0.027	0.1225	No
45	Itga5	5772	0.023	0.1191	No
46	Sgcb	5779	0.022	0.1196	No
47	Lgals1	5806	0.021	0.1184	No
48	Gja1	5967	0.009	0.1058	No
49	Vegfa	6004	0.006	0.1031	No
50	Inhba	6598	-0.032	0.0562	No
51	Basp1	6672	-0.037	0.0519	No
52	Cd44	6722	-0.040	0.0497	No
53	Emp3	6885	-0.052	0.0388	No
54	Vim	7054	-0.062	0.0278	No
55	Lrp1	7107	-0.066	0.0265	No
56	Tpm1	7147	-0.068	0.0263	No
57	Tgm2	7210	-0.071	0.0244	No
58	Fuca1	7408	-0.083	0.0120	No
59	Fzd8	7526	-0.092	0.0065	No
60	Gem	7709	-0.105	-0.0036	No
61	Dst	7746	-0.108	-0.0018	No
62	Tgfb1	7830	-0.113	-0.0036	No
63	Il15	8325	-0.147	-0.0374	No
64	Tnfaip3	8893	-0.188	-0.0753	No
65	Sfrp1	9424	-0.229	-0.1084	No
66	P3h1	9506	-0.236	-0.1046	No
67	Plod3	9662	-0.249	-0.1062	No
68	Itga2	9708	-0.253	-0.0987	No
69	Flna	9893	-0.268	-0.1019	No
70	Slit2	9898	-0.268	-0.0904	No
71	Colgalt1	9910	-0.270	-0.0795	No
72	Cap2	9933	-0.272	-0.0693	No
73	Ppib	10161	-0.292	-0.0749	No
74	Sntb1	10164	-0.292	-0.0622	No
75	Gadd45b	10506	-0.326	-0.0756	No
76	Timp3	10837	-0.362	-0.0865	No
77	Ecm1	10986	-0.386	-0.0815	No
78	Pdgfrb	10997	-0.387	-0.0653	No
79	Pvr	11250	-0.425	-0.0671	No
80	Col4a1	11420	-0.455	-0.0608	No
81	Col4a2	11621	-0.492	-0.0554	No
82	Lama3	11650	-0.497	-0.0358	No
83	Tgfbr3	11740	-0.517	-0.0203	No
84	Mmp2	11760	-0.521	0.0012	No
85	Serpinh1	11789	-0.528	0.0222	No
86	Tpm4	11894	-0.556	0.0382	No