Details for gene set HALLMARK_DNA

Table: GSEA Results Summary

Dataset	HSC.HSC_Pheno.cls#Group1_versus_Group3.HSC_Pheno.cls#Group1_versus_Group3_repos
Phenotype	HSC_Pheno.cls#Group1_versus_Group3_repos
Upregulated in class	0
GeneSet	HALLMARK_DNA_REPAIR
Enrichment Score (ES)	0.26373103
Normalized Enrichment Score (NES)	1.2025496
Nominal p-value	0.12840466
FDR q-value	0.6077729
FWER p-Value	0.949

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Bcam	232	0.789	0.0030	Yes
2	Taf13	233	0.788	0.0249	Yes
3	Gtf2a2	261	0.773	0.0442	Yes
4	Taf1c	321	0.737	0.0599	Yes
5	Ddb1	339	0.727	0.0788	Yes
6	Supt5	360	0.714	0.0970	Yes
7	Ada	450	0.662	0.1082	Yes
8	Nudt21	496	0.634	0.1221	Yes
9	Pde4b	510	0.625	0.1385	Yes
10	Sec61a1	542	0.616	0.1531	Yes
11	Guk1	572	0.606	0.1676	Yes
12	Nelfcd	626	0.585	0.1795	Yes
13	Polr1h	689	0.569	0.1903	Yes
14	Npr2	942	0.504	0.1837	Yes
15	Pnp	963	0.500	0.1960	Yes
16	Polh	967	0.499	0.2096	Yes
17	Pom121	972	0.498	0.2232	Yes
18	Vps28	1096	0.473	0.2263	Yes
19	Nelfe	1195	0.450	0.2308	Yes
20	Taf6	1309	0.428	0.2335	Yes
21	Gpx4	1429	0.413	0.2352	Yes
22	Ak1	1431	0.413	0.2467	Yes
23	Snapc5	1437	0.412	0.2577	Yes
24	Ssrp1	1807	0.370	0.2379	Yes
25	Rbx1	1879	0.360	0.2421	Yes
26	Ercc3	1980	0.344	0.2435	Yes
27	Gtf2b	2154	0.322	0.2383	Yes
28	Smad5	2182	0.319	0.2450	Yes
29	Ncbp2	2361	0.298	0.2387	Yes
30	Xpc	2404	0.293	0.2434	Yes
31	Cox17	2409	0.292	0.2512	Yes
32	Rala	2495	0.281	0.2521	Yes
33	Rad51	2568	0.275	0.2538	Yes
34	Sdcbp	2619	0.269	0.2573	Yes
35	Pold4	2663	0.266	0.2611	Yes
36	Vps37d	2721	0.261	0.2637	Yes
37	Adcy6	2894	0.244	0.2564	No
38	Rpa3	3018	0.232	0.2528	No
39	Polr3gl	3069	0.228	0.2551	No
40	Nt5c3	3332	0.209	0.2395	No
41	Tsg101	3456	0.201	0.2350	No
42	Ago4	3479	0.199	0.2387	No
43	Ercc1	3484	0.198	0.2439	No
44	Gtf2h1	3564	0.192	0.2428	No
45	Ercc5	3638	0.186	0.2420	No
46	Edf1	3845	0.168	0.2298	No
47	Srsf6	4007	0.154	0.2210	No
48	Polr3c	4199	0.139	0.2092	No
49	Polr1d	4459	0.119	0.1913	No
50	Nelfb	4502	0.116	0.1911	No
51	Gtf3c5	4720	0.097	0.1761	No
52	Adrm1	4904	0.084	0.1634	No
53	Stx3	4925	0.082	0.1641	No
54	Eloa	5037	0.074	0.1570	No
55	Pola2	5255	0.058	0.1409	No
56	Usp11	5306	0.055	0.1383	No
57	Fen1	5341	0.052	0.1370	No
58	Polr2j	5385	0.048	0.1348	No
59	Gtf2h3	5453	0.045	0.1306	No
60	Rfc3	5532	0.039	0.1253	No
61	Ddb2	5621	0.033	0.1190	No
62	Mrpl40	5655	0.030	0.1172	No
63	Ell	5668	0.030	0.1170	No
64	Clp1	5672	0.030	0.1176	No
65	Tarbp2	5720	0.027	0.1145	No
66	Rad52	5764	0.023	0.1116	No
67	Umps	5791	0.021	0.1101	No
68	Polb	5800	0.021	0.1100	No
69	Arl6ip1	5921	0.011	0.1005	No
70	Polr2a	5944	0.010	0.0990	No
71	Taf9	5988	0.007	0.0957	No
72	Prim1	6046	0.003	0.0911	No
73	Pcna	6061	0.002	0.0900	No
74	Brf2	6186	-0.003	0.0800	No
75	Surf1	6217	-0.005	0.0777	No
76	Rfc2	6236	-0.007	0.0764	No
77	Nme4	6387	-0.017	0.0646	No
78	Rfc4	6423	-0.020	0.0623	No
79	Polr2g	6450	-0.022	0.0607	No
80	Cant1	6628	-0.034	0.0472	No
81	Poll	6683	-0.038	0.0439	No
82	Gmpr2	6731	-0.041	0.0411	No
83	Mpg	6736	-0.041	0.0420	No
84	Polr1c	7152	-0.068	0.0099	No
85	Ercc4	7154	-0.068	0.0117	No
86	Hcls1	7207	-0.071	0.0095	No
87	Snapc4	7236	-0.073	0.0092	No
88	Nudt9	7309	-0.077	0.0055	No
89	Sf3a3	7382	-0.082	0.0019	No
90	Cmpk2	7383	-0.082	0.0042	No
91	Gtf2f1	7420	-0.084	0.0036	No
92	Rev3l	7493	-0.089	0.0002	No
93	Nt5c	7785	-0.111	-0.0206	No
94	Lig1	7891	-0.117	-0.0259	No
95	Rae1	7896	-0.117	-0.0230	No
96	Aprt	7981	-0.122	-0.0264	No
97	Supt4a	8184	-0.136	-0.0392	No
98	Tyms	8262	-0.143	-0.0415	No
99	Ak3	8270	-0.144	-0.0381	No
100	Rfc5	8503	-0.158	-0.0527	No
101	Dut	8555	-0.161	-0.0524	No
102	Itpa	8719	-0.174	-0.0609	No
103	Tk2	8734	-0.175	-0.0571	No
104	Taf10	8750	-0.176	-0.0535	No
105	Rpa2	8780	-0.178	-0.0509	No
106	Ercc2	8853	-0.184	-0.0516	No
107	Pole4	8973	-0.193	-0.0560	No
108	Pola1	9034	-0.198	-0.0554	No
109	Nfx1	9036	-0.198	-0.0500	No
110	Polr2h	9072	-0.201	-0.0473	No
111	Vps37b	9113	-0.204	-0.0448	No
112	Gsdme	9226	-0.211	-0.0481	No
113	Zfp707	9245	-0.212	-0.0437	No
114	Cetn2	9298	-0.217	-0.0419	No
115	Ercc8	9470	-0.232	-0.0494	No
116	Rnmt	9514	-0.236	-0.0464	No
117	Mpc2	9516	-0.236	-0.0399	No
118	Bcap31	9571	-0.241	-0.0376	No
119	Taf12	9681	-0.251	-0.0395	No
120	Polr2c	9832	-0.262	-0.0445	No
121	Dgcr8	10035	-0.280	-0.0532	No
122	Dctn4	10080	-0.285	-0.0489	No
123	Dad1	10326	-0.306	-0.0604	No
124	Pold3	10382	-0.311	-0.0562	No
125	Impdh2	10495	-0.324	-0.0564	No
126	Gtf2h5	10513	-0.326	-0.0487	No
127	Upf3b	10691	-0.346	-0.0535	No
128	Dguok	10706	-0.348	-0.0450	No
129	Aaas	10790	-0.356	-0.0419	No
130	Cstf3	10850	-0.364	-0.0366	No
131	Pold1	10975	-0.384	-0.0360	No
132	Alyref	11253	-0.426	-0.0468	No
133	Polr2f	11899	-0.558	-0.0840	No
134	Rrm2b	12038	-0.608	-0.0784	No
135	Trp53	12088	-0.635	-0.0647	No
136	Polr2e	12161	-0.679	-0.0517	No
137	Zwint	12202	-0.716	-0.0351	No
138	Nme1	12290	-0.816	-0.0195	No
139	Eif1b	12327	-0.912	0.0029	No