Details for gene set HALLMARK_TNFA_SIGNALING_VIA

Table: GSEA Results Summary

Dataset	GMP.GMP.neu_Pheno.cls #Group6_versus_Group8.GMP.neu_Pheno.cls #Group6_versus_Group8_repos
Phenotype	GMP.neu_Pheno.cls#Group6_versus_Group8_repos
Upregulated in class	4
GeneSet	HALLMARK_TNFA_SIGNALING_VIA_NFKB
Enrichment Score (ES)	0.2228548
Normalized Enrichment Score (NES)	0.98204046
Nominal p-value	0.4742268
FDR q-value	0.92204803
FWER p-Value	1.0

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Vegfa	73	0.978	0.0190	Yes
2	Spsb1	80	0.973	0.0413	Yes
3	Inhba	93	0.946	0.0626	Yes
4	Klf4	126	0.901	0.0818	Yes
5	Olr1	285	0.754	0.0914	Yes
6	Kdm6b	339	0.720	0.1054	Yes
7	Ccrl2	445	0.678	0.1158	Yes
8	Sat1	926	0.557	0.1046	Yes
9	Bhlhe40	1136	0.524	0.1062	Yes
10	Fosl2	1224	0.513	0.1137	Yes
11	Tnfsf9	1345	0.498	0.1192	Yes
12	Phlda1	1471	0.482	0.1241	Yes
13	Trib1	1523	0.476	0.1326	Yes
14	Per1	1582	0.471	0.1406	Yes
15	Nr4a1	1642	0.464	0.1483	Yes
16	Dram1	1728	0.457	0.1547	Yes
17	Btg2	1729	0.457	0.1653	Yes
18	Zc3h12a	1766	0.451	0.1739	Yes
19	Egr1	1811	0.445	0.1820	Yes
20	Irs2	1838	0.442	0.1909	Yes
21	Fosb	1839	0.441	0.2012	Yes
22	Rigi	1941	0.432	0.2061	Yes
23	Trip10	2013	0.424	0.2123	Yes
24	Jag1	2035	0.421	0.2210	Yes
25	F3	2233	0.396	0.2203	Yes
26	Maff	2723	0.361	0.2041	Yes
27	Pfkfb3	2864	0.352	0.2052	Yes
28	Socs3	2926	0.346	0.2101	Yes
29	Tnfaip8	3184	0.331	0.2049	Yes
30	Fos	3289	0.323	0.2071	Yes
31	Pdlim5	3379	0.321	0.2101	Yes
32	Atf3	3425	0.317	0.2152	Yes
33	Lamb3	3518	0.312	0.2178	Yes
34	Rnf19b	3600	0.304	0.2207	Yes
35	Serpinb8	3696	0.298	0.2229	Yes
36	Nfkbie	3902	0.280	0.2190	No
37	Kynu	4107	0.266	0.2149	No
38	Nfat5	4365	0.251	0.2078	No
39	Zbtb10	4631	0.236	0.1999	No
40	Plk2	4663	0.234	0.2038	No
41	Cflar	4857	0.223	0.1992	No
42	Tnf	5052	0.211	0.1944	No
43	Zfp36	5118	0.208	0.1959	No
44	Dnajb4	5141	0.206	0.1996	No
45	Cebpb	5167	0.205	0.2031	No
46	B4galt1	5235	0.202	0.2044	No
47	Sgk1	5326	0.199	0.2044	No
48	Icam1	5433	0.197	0.2037	No
49	Nr4a3	5562	0.191	0.2017	No
50	Rela	5773	0.183	0.1953	No
51	Tnip2	5866	0.179	0.1948	No
52	Ripk2	5920	0.175	0.1962	No
53	Tnfaip3	5956	0.173	0.1985	No
54	Jun	6045	0.170	0.1980	No
55	Gem	6336	0.160	0.1871	No
56	Dusp5	6358	0.159	0.1897	No
57	Stat5a	6362	0.158	0.1932	No
58	Gadd45a	6370	0.158	0.1965	No
59	Mcl1	6452	0.153	0.1960	No
60	Dennd5a	6671	0.143	0.1883	No
61	Atp2b1	6866	0.135	0.1817	No
62	Tnfrsf9	6911	0.133	0.1825	No
63	Ier5	7070	0.126	0.1775	No
64	Ppp1r15a	7148	0.122	0.1765	No
65	Tank	7164	0.121	0.1785	No
66	Ldlr	7290	0.115	0.1749	No
67	Sphk1	7458	0.107	0.1690	No
68	Klf9	7521	0.105	0.1683	No
69	Slc16a6	7639	0.100	0.1647	No
70	Btg3	7688	0.098	0.1646	No
71	Gch1	8291	0.073	0.1359	No
72	Smad3	8384	0.069	0.1329	No
73	Hbegf	8523	0.064	0.1274	No
74	Ifngr2	8549	0.063	0.1276	No
75	Ehd1	8604	0.060	0.1263	No
76	Panx1	8608	0.060	0.1275	No
77	Rhob	8920	0.048	0.1130	No
78	Birc3	9067	0.042	0.1066	No
79	Icosl	9229	0.036	0.0993	No
80	Tnfaip6	9255	0.034	0.0989	No
81	Map2k3	9278	0.034	0.0985	No
82	Ccnl1	9285	0.033	0.0990	No
83	Birc2	9320	0.032	0.0980	No
84	Nampt	9366	0.030	0.0965	No
85	Slc2a6	9862	0.009	0.0717	No
86	Klf2	10020	0.003	0.0639	No
87	Ptpre	10078	0.000	0.0610	No
88	Tgif1	10460	-0.006	0.0420	No
89	Yrdc	10815	-0.018	0.0246	No
90	Rel	10904	-0.021	0.0206	No
91	Il7r	11081	-0.029	0.0124	No
92	Ier3	11142	-0.031	0.0101	No
93	Il15ra	11162	-0.031	0.0099	No
94	Bcl6	11302	-0.037	0.0038	No
95	Cxcl10	11335	-0.038	0.0030	No
96	Junb	11384	-0.040	0.0015	No
97	Pmepa1	11639	-0.051	-0.0101	No
98	Relb	11786	-0.057	-0.0161	No
99	Snn	11893	-0.061	-0.0200	No
100	Cd44	12079	-0.069	-0.0277	No
101	Tiparp	12291	-0.079	-0.0365	No
102	Pde4b	12326	-0.080	-0.0364	No
103	Nfkb1	12608	-0.093	-0.0484	No
104	Gfpt2	12620	-0.094	-0.0467	No
105	Rcan1	12786	-0.101	-0.0527	No
106	Klf6	12872	-0.104	-0.0546	No
107	Bcl2a1d	12905	-0.105	-0.0537	No
108	Fosl1	12952	-0.107	-0.0536	No
109	Nfil3	13130	-0.114	-0.0598	No
110	Bcl3	13184	-0.117	-0.0598	No
111	Fjx1	13193	-0.118	-0.0575	No
112	Tlr2	13219	-0.119	-0.0560	No
113	Plaur	13226	-0.119	-0.0535	No
114	Pnrc1	13261	-0.120	-0.0524	No
115	Plek	13418	-0.127	-0.0574	No
116	Btg1	13431	-0.127	-0.0550	No
117	B4galt5	13533	-0.131	-0.0571	No
118	Tnip1	13711	-0.139	-0.0627	No
119	Mxd1	13864	-0.146	-0.0670	No
120	Ifih1	13867	-0.146	-0.0637	No
121	F2rl1	13879	-0.147	-0.0609	No
122	Egr2	14162	-0.158	-0.0714	No
123	Dusp4	14239	-0.161	-0.0715	No
124	Plau	14301	-0.163	-0.0708	No
125	Tnc	14433	-0.170	-0.0734	No
126	Il18	14671	-0.181	-0.0812	No
127	Nfkb2	14709	-0.183	-0.0788	No
128	Abca1	14805	-0.188	-0.0792	No
129	Dusp1	14897	-0.192	-0.0794	No
130	Sqstm1	15111	-0.202	-0.0854	No
131	Cd80	15271	-0.209	-0.0886	No
132	Gpr183	15371	-0.215	-0.0886	No
133	Irf1	15681	-0.230	-0.0988	No
134	Nr4a2	16162	-0.255	-0.1171	No
135	Ier2	16198	-0.257	-0.1129	No
136	Ccnd1	16221	-0.259	-0.1080	No
137	Id2	16403	-0.266	-0.1109	No
138	Gadd45b	16482	-0.272	-0.1085	No
139	G0s2	16499	-0.273	-0.1030	No
140	Plpp3	16614	-0.278	-0.1023	No
141	Clcf1	16846	-0.293	-0.1072	No
142	Cd69	16849	-0.294	-0.1004	No
143	Sod2	16952	-0.300	-0.0986	No
144	Map3k8	16998	-0.302	-0.0939	No
145	Cdkn1a	17015	-0.304	-0.0877	No
146	Klf10	17033	-0.305	-0.0814	No
147	Fut4	17139	-0.313	-0.0795	No
148	Slc2a3	17228	-0.319	-0.0765	No
149	Cebpd	17276	-0.321	-0.0714	No
150	Ninj1	17439	-0.330	-0.0719	No
151	Tap1	17500	-0.335	-0.0672	No
152	Tnfaip2	17540	-0.336	-0.0614	No
153	Eif1	17584	-0.339	-0.0557	No
154	Ptgs2	17613	-0.342	-0.0492	No
155	Ets2	17732	-0.350	-0.0470	No
156	Litaf	17885	-0.363	-0.0462	No
157	Traf1	17973	-0.371	-0.0420	No
158	Dusp2	18031	-0.376	-0.0362	No
159	Nfe2l2	18156	-0.387	-0.0334	No
160	Ifit2	18244	-0.394	-0.0287	No
161	Csf1	18247	-0.394	-0.0196	No
162	Myc	18603	-0.431	-0.0275	No
163	Nfkbia	18967	-0.480	-0.0347	No
164	Serpinb2	19013	-0.486	-0.0257	No
165	Ptger4	19225	-0.528	-0.0241	No
166	Tsc22d1	19265	-0.535	-0.0136	No
167	Tubb2a	19498	-0.598	-0.0114	No
168	Marcks	19662	-0.659	-0.0044	No
169	Il6st	19995	-0.977	0.0016	No