Details for gene set HALLMARK_INFLAMMATORY

Table: GSEA Results Summary

Dataset	GMP.GMP.neu_Pheno.cls #Group3_versus_Group4.GMP.neu_Pheno.cls #Group3_versus_Group4_repos
Phenotype	GMP.neu_Pheno.cls#Group3_versus_Group4_repos
Upregulated in class	2
GeneSet	HALLMARK_INFLAMMATORY_RESPONSE
Enrichment Score (ES)	0.2342334
Normalized Enrichment Score (NES)	1.1074759
Nominal p-value	0.23742455
FDR q-value	0.6643088
FWER p-Value	0.962

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Cmklr1	94	0.855	0.0170	Yes
2	P2rx7	105	0.844	0.0379	Yes
3	F3	129	0.804	0.0572	Yes
4	Rgs16	366	0.660	0.0621	Yes
5	Sema4d	369	0.658	0.0787	Yes
6	Cd40	420	0.638	0.0924	Yes
7	Il18rap	443	0.631	0.1073	Yes
8	Il7r	503	0.608	0.1198	Yes
9	Ldlr	547	0.595	0.1328	Yes
10	Cx3cl1	673	0.564	0.1408	Yes
11	Tnfaip6	711	0.556	0.1531	Yes
12	Tlr2	880	0.527	0.1580	Yes
13	Kcnmb2	1020	0.501	0.1637	Yes
14	Tacr1	1082	0.491	0.1731	Yes
15	Nfkbia	1093	0.491	0.1851	Yes
16	Gch1	1173	0.482	0.1934	Yes
17	Nod2	1319	0.459	0.1977	Yes
18	Fzd5	1483	0.441	0.2008	Yes
19	Kif1b	1495	0.440	0.2114	Yes
20	Adora2b	1560	0.434	0.2192	Yes
21	Slc7a2	1909	0.400	0.2119	Yes
22	Pde4b	1995	0.394	0.2176	Yes
23	Gpr183	2027	0.391	0.2260	Yes
24	Ccrl2	2059	0.387	0.2342	Yes
25	Irf1	2736	0.336	0.2088	No
26	Dcbld2	2789	0.331	0.2145	No
27	Olr1	3076	0.313	0.2081	No
28	Ebi3	3094	0.311	0.2152	No
29	Rhog	3175	0.306	0.2189	No
30	Btg2	3450	0.292	0.2125	No
31	Pvr	3613	0.281	0.2115	No
32	Myc	3693	0.275	0.2145	No
33	Ifnar1	3885	0.261	0.2116	No
34	Tlr1	4056	0.250	0.2094	No
35	Hif1a	4224	0.244	0.2072	No
36	Ros1	4466	0.229	0.2008	No
37	Il18	4907	0.210	0.1840	No
38	Ptgir	4912	0.209	0.1891	No
39	Rnf144b	4939	0.207	0.1931	No
40	Pcdh7	5197	0.195	0.1851	No
41	Sgms2	5242	0.194	0.1879	No
42	Klf6	5359	0.188	0.1868	No
43	Il18r1	5741	0.171	0.1720	No
44	P2ry2	5939	0.163	0.1662	No
45	Osm	5948	0.163	0.1699	No
46	Gnai3	6130	0.154	0.1648	No
47	Tlr3	6211	0.150	0.1645	No
48	Kcnj2	6215	0.150	0.1682	No
49	Slc7a1	6292	0.146	0.1681	No
50	Slc31a2	6343	0.143	0.1692	No
51	Hpn	6486	0.138	0.1656	No
52	Kcna3	6544	0.134	0.1661	No
53	Clec5a	6632	0.130	0.1651	No
54	Plaur	6651	0.129	0.1674	No
55	Slc31a1	6659	0.129	0.1704	No
56	Cd82	6812	0.123	0.1658	No
57	Itga5	6894	0.120	0.1648	No
58	Npffr2	6961	0.119	0.1645	No
59	Atp2a2	7131	0.118	0.1590	No
60	Il4ra	7191	0.115	0.1590	No
61	Gna15	7439	0.105	0.1492	No
62	Csf3r	7453	0.105	0.1513	No
63	Il1r1	7712	0.095	0.1407	No
64	Tnfrsf1b	7814	0.091	0.1379	No
65	Cd69	7938	0.086	0.1339	No
66	Ptger2	7954	0.085	0.1353	No
67	Icosl	8007	0.083	0.1348	No
68	Atp2b1	8270	0.073	0.1235	No
69	Psen1	8424	0.067	0.1175	No
70	Scarf1	8447	0.066	0.1180	No
71	Nampt	8605	0.059	0.1116	No
72	Sri	8606	0.059	0.1131	No
73	Ptafr	8680	0.056	0.1109	No
74	Lyn	8697	0.056	0.1115	No
75	Slc28a2	8708	0.055	0.1124	No
76	Mefv	9294	0.034	0.0838	No
77	Lck	9311	0.033	0.0839	No
78	Cybb	9376	0.031	0.0814	No
79	Atp2c1	9526	0.026	0.0746	No
80	Stab1	9536	0.025	0.0748	No
81	Lpar1	9914	0.012	0.0561	No
82	Cd14	10026	0.008	0.0507	No
83	Aqp9	10046	0.007	0.0500	No
84	Slc1a2	10066	0.007	0.0492	No
85	Ffar2	10720	-0.009	0.0165	No
86	Sell	10815	-0.013	0.0121	No
87	Inhba	11184	-0.025	-0.0057	No
88	Ptpre	11477	-0.035	-0.0195	No
89	Slc11a2	11661	-0.042	-0.0277	No
90	Abi1	11739	-0.045	-0.0304	No
91	Lcp2	11909	-0.050	-0.0377	No
92	Ptger4	12076	-0.055	-0.0446	No
93	Aplnr	12271	-0.062	-0.0528	No
94	Emp3	12626	-0.075	-0.0687	No
95	Hbegf	12734	-0.079	-0.0721	No
96	Ripk2	12775	-0.080	-0.0721	No
97	Nmur1	12824	-0.081	-0.0724	No
98	Cd48	12878	-0.084	-0.0729	No
99	Gpc3	12936	-0.086	-0.0736	No
100	Raf1	12957	-0.087	-0.0724	No
101	Ifngr2	13038	-0.090	-0.0742	No
102	Adgre1	13063	-0.090	-0.0731	No
103	Icam4	13104	-0.091	-0.0728	No
104	Nfkb1	13161	-0.094	-0.0732	No
105	Itgb3	13195	-0.095	-0.0725	No
106	Tapbp	13470	-0.105	-0.0836	No
107	Il15ra	13684	-0.113	-0.0915	No
108	Gp1ba	13952	-0.123	-0.1018	No
109	Met	14101	-0.130	-0.1059	No
110	Rasgrp1	14175	-0.132	-0.1062	No
111	Tacr3	14337	-0.139	-0.1108	No
112	Pik3r5	14548	-0.147	-0.1176	No
113	Ly6e	14575	-0.148	-0.1152	No
114	Axl	14859	-0.161	-0.1253	No
115	Bst2	14899	-0.162	-0.1232	No
116	Gabbr1	14912	-0.163	-0.1196	No
117	Rela	15053	-0.169	-0.1224	No
118	Eif2ak2	15121	-0.171	-0.1214	No
119	Slamf1	15705	-0.194	-0.1458	No
120	Slc4a4	15786	-0.198	-0.1448	No
121	Sele	16022	-0.210	-0.1513	No
122	Ifitm1	16123	-0.212	-0.1510	No
123	Mxd1	16146	-0.213	-0.1467	No
124	Irak2	16158	-0.214	-0.1418	No
125	Selenos	16365	-0.225	-0.1464	No
126	Irf7	16495	-0.232	-0.1470	No
127	Icam1	16597	-0.238	-0.1461	No
128	Cxcr6	16610	-0.239	-0.1406	No
129	Il10ra	16755	-0.247	-0.1416	No
130	Scn1b	17189	-0.272	-0.1564	No
131	Rtp4	17257	-0.274	-0.1528	No
132	Tnfsf10	17305	-0.277	-0.1482	No
133	Tnfsf9	17541	-0.292	-0.1525	No
134	Adrm1	17642	-0.300	-0.1500	No
135	Rgs1	17754	-0.307	-0.1477	No
136	Mmp14	17849	-0.314	-0.1445	No
137	P2rx4	17860	-0.315	-0.1370	No
138	Cxcl10	17887	-0.316	-0.1303	No
139	Tnfrsf9	18039	-0.327	-0.1296	No
140	Gpr132	18367	-0.350	-0.1371	No
141	Ahr	18462	-0.359	-0.1327	No
142	Acvr1b	18790	-0.397	-0.1391	No
143	Sphk1	18909	-0.411	-0.1346	No
144	Nmi	18934	-0.415	-0.1253	No
145	Acvr2a	18967	-0.419	-0.1162	No
146	Il10	18987	-0.420	-0.1065	No
147	Il15	19280	-0.461	-0.1095	No
148	Cdkn1a	19498	-0.508	-0.1075	No
149	Msr1	19504	-0.509	-0.0948	No
150	Best1	19505	-0.510	-0.0819	No
151	Calcrl	19583	-0.529	-0.0723	No
152	Nlrp3	19729	-0.578	-0.0649	No
153	Hrh1	19940	-0.733	-0.0569	No
154	Csf1	20004	-0.905	-0.0370	No
155	Abca1	20024	-1.500	0.0001	No