Details for gene set HALLMARK

Table: GSEA Results Summary

Dataset	GMP.GMP.neu_Pheno.cls #Group3_versus_Group4.GMP.neu_Pheno.cls #Group3_versus_Group4_repos
Phenotype	GMP.neu_Pheno.cls#Group3_versus_Group4_repos
Upregulated in class	2
GeneSet	HALLMARK_GLYCOLYSIS
Enrichment Score (ES)	0.24027312
Normalized Enrichment Score (NES)	1.2221268
Nominal p-value	0.08421053
FDR q-value	0.90249056
FWER p-Value	0.877

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Ppfia4	152	0.787	0.0122	Yes
2	Xylt2	156	0.782	0.0318	Yes
3	Slc16a3	288	0.689	0.0427	Yes
4	Gale	454	0.625	0.0501	Yes
5	Srd5a3	466	0.621	0.0653	Yes
6	Vcan	499	0.609	0.0791	Yes
7	Sdc1	558	0.594	0.0912	Yes
8	Depdc1a	579	0.586	0.1050	Yes
9	Eno2	1003	0.502	0.0964	Yes
10	Stc2	1078	0.492	0.1051	Yes
11	Nsdhl	1243	0.471	0.1087	Yes
12	Eno1b	1276	0.465	0.1189	Yes
13	Cln6	1355	0.455	0.1264	Yes
14	Glce	1390	0.453	0.1362	Yes
15	Adora2b	1560	0.434	0.1386	Yes
16	Aldoa	1805	0.411	0.1367	Yes
17	Ecd	2058	0.387	0.1338	Yes
18	Gnpda1	2147	0.377	0.1389	Yes
19	B3galt6	2150	0.376	0.1483	Yes
20	Kdelr3	2301	0.365	0.1500	Yes
21	Vldlr	2315	0.364	0.1585	Yes
22	Cth	2336	0.361	0.1666	Yes
23	Hs6st2	2374	0.360	0.1739	Yes
24	Gapdhs	2467	0.355	0.1782	Yes
25	Slc25a10	2479	0.354	0.1866	Yes
26	Slc37a4	2541	0.348	0.1923	Yes
27	Ang	2572	0.346	0.1995	Yes
28	Gys1	2662	0.340	0.2037	Yes
29	Agl	2665	0.340	0.2121	Yes
30	Fkbp4	2778	0.332	0.2149	Yes
31	Abcb6	2793	0.330	0.2225	Yes
32	Lhpp	2872	0.322	0.2267	Yes
33	Glrx	2893	0.321	0.2338	Yes
34	Tpst1	3006	0.317	0.2362	Yes
35	Mpi	3083	0.312	0.2403	Yes
36	B4galt4	3698	0.275	0.2163	No
37	Hk2	3772	0.269	0.2194	No
38	B4galt7	3774	0.269	0.2262	No
39	Pmm2	3842	0.263	0.2294	No
40	Pgk1	4201	0.245	0.2176	No
41	Ppia	4208	0.244	0.2235	No
42	Polr3k	4253	0.242	0.2274	No
43	Me2	4409	0.232	0.2254	No
44	Mertk	4463	0.229	0.2285	No
45	Bpnt1	4546	0.229	0.2302	No
46	Gpc1	4550	0.228	0.2358	No
47	Mxi1	4812	0.215	0.2281	No
48	Copb2	5146	0.198	0.2163	No
49	Angptl4	5270	0.192	0.2150	No
50	Pam	5309	0.190	0.2179	No
51	Mdh2	5351	0.188	0.2206	No
52	Gmppb	5539	0.183	0.2157	No
53	Kif20a	5558	0.182	0.2194	No
54	Egln3	5573	0.181	0.2233	No
55	Ddit4	5693	0.174	0.2217	No
56	B4galt2	5783	0.170	0.2215	No
57	Lhx9	5898	0.165	0.2199	No
58	Ugp2	5999	0.161	0.2190	No
59	Dld	6105	0.155	0.2176	No
60	Got2	6560	0.134	0.1981	No
61	Rpe	6671	0.129	0.1958	No
62	Spag4	6768	0.124	0.1941	No
63	Vegfa	6806	0.123	0.1954	No
64	Chst1	6945	0.119	0.1914	No
65	Idua	7267	0.112	0.1781	No
66	Txn1	7272	0.111	0.1807	No
67	Hmmr	7594	0.099	0.1670	No
68	Casp6	7600	0.099	0.1693	No
69	Isg20	7667	0.097	0.1684	No
70	Idh1	7770	0.092	0.1656	No
71	B4galt1	7896	0.088	0.1615	No
72	Cenpa	7958	0.085	0.1606	No
73	Aldh9a1	7967	0.085	0.1624	No
74	Qsox1	7981	0.084	0.1638	No
75	Ext1	8051	0.081	0.1624	No
76	Pgam2	8122	0.078	0.1608	No
77	Pgam1	8330	0.071	0.1522	No
78	Pkm	8397	0.068	0.1506	No
79	Psmc4	8612	0.059	0.1413	No
80	Ak4	8681	0.056	0.1393	No
81	Alg1	8835	0.050	0.1328	No
82	Ldhc	8841	0.050	0.1339	No
83	Fam162a	8957	0.046	0.1292	No
84	Ldha	8969	0.045	0.1298	No
85	Pcx	9343	0.032	0.1118	No
86	Lct	9564	0.024	0.1013	No
87	Pgls	9915	0.012	0.0840	No
88	Egfr	10256	0.000	0.0669	No
89	Sdc2	10444	-0.001	0.0575	No
90	Ero1a	10594	-0.005	0.0501	No
91	Cdk1	10637	-0.006	0.0482	No
92	Cited2	10719	-0.009	0.0443	No
93	Galk1	10727	-0.009	0.0442	No
94	Paxip1	10988	-0.019	0.0316	No
95	Hspa5	10997	-0.019	0.0316	No
96	Galk2	11156	-0.024	0.0243	No
97	Hdlbp	11282	-0.029	0.0187	No
98	Tpi1	11424	-0.034	0.0125	No
99	Il13ra1	11452	-0.035	0.0120	No
100	Agrn	11651	-0.041	0.0031	No
101	Aldh7a1	11724	-0.044	0.0005	No
102	Chpf2	11942	-0.052	-0.0091	No
103	Prps1	11959	-0.052	-0.0086	No
104	Ext2	12088	-0.055	-0.0136	No
105	Ankzf1	12325	-0.064	-0.0239	No
106	Phka2	12384	-0.066	-0.0252	No
107	Gclc	12455	-0.068	-0.0270	No
108	Gmppa	12491	-0.070	-0.0270	No
109	Chst12	12645	-0.076	-0.0328	No
110	Nasp	12658	-0.076	-0.0314	No
111	Sdc3	12724	-0.079	-0.0327	No
112	Gpc3	12936	-0.086	-0.0412	No
113	Rbck1	13020	-0.089	-0.0431	No
114	Pfkp	13118	-0.092	-0.0457	No
115	Cyb5a	13136	-0.093	-0.0442	No
116	Cog2	13152	-0.094	-0.0426	No
117	Akr1a1	13160	-0.094	-0.0406	No
118	Nanp	13168	-0.094	-0.0385	No
119	B3gnt3	13304	-0.099	-0.0428	No
120	G6pdx	13444	-0.104	-0.0472	No
121	Cd44	13524	-0.107	-0.0485	No
122	Gusb	13568	-0.108	-0.0479	No
123	Plod2	13591	-0.109	-0.0463	No
124	Homer1	13620	-0.110	-0.0449	No
125	Plod1	13669	-0.112	-0.0445	No
126	Slc35a3	13774	-0.116	-0.0468	No
127	Mdh1	13802	-0.117	-0.0452	No
128	Dcn	13823	-0.118	-0.0432	No
129	Fut8	13858	-0.119	-0.0419	No
130	Sod1	13877	-0.120	-0.0398	No
131	Met	14101	-0.130	-0.0477	No
132	P4ha1	14168	-0.132	-0.0477	No
133	Hax1	14345	-0.139	-0.0530	No
134	Aurka	14452	-0.143	-0.0548	No
135	Stmn1	14571	-0.148	-0.0570	No
136	Irs2	14636	-0.150	-0.0564	No
137	Gpc4	14740	-0.155	-0.0577	No
138	Zfp292	14840	-0.159	-0.0586	No
139	B3gat3	14929	-0.163	-0.0589	No
140	Cxcr4	14994	-0.167	-0.0579	No
141	Me1	15004	-0.167	-0.0542	No
142	Slc25a13	15165	-0.173	-0.0579	No
143	Ier3	15206	-0.175	-0.0555	No
144	Pdk3	15231	-0.176	-0.0522	No
145	Taldo1	15330	-0.181	-0.0526	No
146	Cacna1h	15351	-0.182	-0.0490	No
147	Gne	15532	-0.185	-0.0534	No
148	Chpf	15637	-0.191	-0.0538	No
149	Hs2st1	15743	-0.195	-0.0542	No
150	Mif	16263	-0.219	-0.0748	No
151	Pygb	16331	-0.223	-0.0725	No
152	Ppp2cb	16332	-0.223	-0.0669	No
153	Ndst3	16376	-0.226	-0.0633	No
154	Gal3st1	16727	-0.246	-0.0748	No
155	Kif2a	16925	-0.258	-0.0782	No
156	Capn5	17006	-0.263	-0.0755	No
157	Ndufv3	17079	-0.269	-0.0724	No
158	Rragd	17197	-0.272	-0.0714	No
159	Pygl	17469	-0.287	-0.0778	No
160	Ak3	17489	-0.289	-0.0715	No
161	Gfpt1	17570	-0.294	-0.0680	No
162	Fbp2	18053	-0.328	-0.0840	No
163	Med24	18219	-0.338	-0.0838	No
164	Pfkfb1	18321	-0.345	-0.0802	No
165	Sdhc	18463	-0.359	-0.0782	No
166	Sap30	18493	-0.363	-0.0705	No
167	Arpp19	18529	-0.367	-0.0630	No
168	Got1	18586	-0.372	-0.0564	No
169	Col5a1	18645	-0.377	-0.0498	No
170	Tgfa	19158	-0.441	-0.0644	No
171	Bik	19172	-0.444	-0.0539	No
172	Pgm2	19335	-0.470	-0.0501	No
173	Gfus	19707	-0.573	-0.0543	No
174	Gpr87	19786	-0.605	-0.0430	No
175	Nt5e	19807	-0.624	-0.0282	No
176	Tgfbi	19952	-0.761	-0.0162	No
177	Pkp2	19964	-0.788	0.0031	No