Details for gene set HALLMARK_APICAL

Table: GSEA Results Summary

Dataset	GMP.GMP.neu_Pheno.cls #Group3_versus_Group4.GMP.neu_Pheno.cls #Group3_versus_Group4_repos
Phenotype	GMP.neu_Pheno.cls#Group3_versus_Group4_repos
Upregulated in class	2
GeneSet	HALLMARK_APICAL_JUNCTION
Enrichment Score (ES)	0.23836853
Normalized Enrichment Score (NES)	1.12915
Nominal p-value	0.22896282
FDR q-value	0.7022466
FWER p-Value	0.945

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Insig1	136	0.798	0.0172	Yes
2	Mmp2	431	0.635	0.0215	Yes
3	Vcan	499	0.609	0.0365	Yes
4	Cx3cl1	673	0.564	0.0448	Yes
5	Nectin3	680	0.563	0.0614	Yes
6	Tmem8b	820	0.537	0.0706	Yes
7	Vasp	954	0.510	0.0793	Yes
8	Actn3	1017	0.501	0.0913	Yes
9	Evl	1204	0.477	0.0963	Yes
10	Rhof	1313	0.459	0.1047	Yes
11	Nlgn2	1446	0.446	0.1115	Yes
12	Amh	1747	0.416	0.1089	Yes
13	Actb	1801	0.412	0.1186	Yes
14	Cntn1	1814	0.410	0.1304	Yes
15	Itga9	1931	0.398	0.1365	Yes
16	Sgce	1991	0.394	0.1454	Yes
17	Cdh1	2170	0.373	0.1477	Yes
18	Traf1	2188	0.373	0.1581	Yes
19	Slit2	2530	0.349	0.1514	Yes
20	Itga3	2622	0.343	0.1572	Yes
21	Cdk8	2624	0.343	0.1675	Yes
22	Cldn14	2671	0.339	0.1754	Yes
23	Vcl	2787	0.331	0.1796	Yes
24	Col17a1	2865	0.323	0.1854	Yes
25	Mvd	3125	0.310	0.1817	Yes
26	Ptk2	3135	0.309	0.1906	Yes
27	Parva	3199	0.305	0.1966	Yes
28	Itga10	3278	0.303	0.2018	Yes
29	Adam23	3393	0.293	0.2049	Yes
30	Src	3515	0.288	0.2075	Yes
31	Tubg1	3547	0.286	0.2145	Yes
32	Cldn15	3619	0.280	0.2194	Yes
33	Icam2	3674	0.277	0.2250	Yes
34	Ldlrap1	3881	0.261	0.2225	Yes
35	Msn	4173	0.247	0.2153	Yes
36	Myh9	4248	0.242	0.2188	Yes
37	Pten	4340	0.236	0.2214	Yes
38	Shroom2	4373	0.234	0.2268	Yes
39	Cadm2	4662	0.224	0.2190	Yes
40	Negr1	4735	0.219	0.2220	Yes
41	Nectin4	5018	0.204	0.2139	Yes
42	Lama3	5092	0.201	0.2163	Yes
43	Thy1	5224	0.195	0.2156	Yes
44	Actn1	5312	0.190	0.2169	Yes
45	Zyx	5344	0.188	0.2211	Yes
46	Actn2	5379	0.187	0.2250	Yes
47	Pals1	5384	0.186	0.2304	Yes
48	Cdh8	5432	0.184	0.2336	Yes
49	Myl9	5448	0.184	0.2384	Yes
50	Myl12b	5828	0.167	0.2243	No
51	Calb2	5896	0.165	0.2259	No
52	Map3k20	5935	0.164	0.2289	No
53	Nf1	6177	0.152	0.2214	No
54	Amigo1	6257	0.148	0.2218	No
55	Gnai2	6275	0.147	0.2254	No
56	Inppl1	6487	0.138	0.2189	No
57	Akt2	6599	0.132	0.2173	No
58	Mapk14	6710	0.127	0.2156	No
59	Adam15	6749	0.125	0.2175	No
60	Myh10	6858	0.122	0.2157	No
61	Nfasc	6941	0.119	0.2152	No
62	Kcnh2	6967	0.119	0.2175	No
63	Irs1	6991	0.119	0.2199	No
64	Ywhah	7297	0.110	0.2079	No
65	Vcam1	7335	0.109	0.2093	No
66	Arhgef6	7389	0.108	0.2099	No
67	Hras	7432	0.106	0.2109	No
68	Pfn1	7519	0.102	0.2097	No
69	Crat	7739	0.094	0.2015	No
70	Pard6g	7839	0.090	0.1992	No
71	B4galt1	7896	0.088	0.1990	No
72	Dhx16	8022	0.082	0.1952	No
73	Rac2	8055	0.081	0.1961	No
74	Nrap	8167	0.077	0.1928	No
75	Plcg1	8227	0.074	0.1921	No
76	Rasa1	8692	0.056	0.1704	No
77	Itgb4	8769	0.053	0.1681	No
78	Lamb3	8848	0.050	0.1657	No
79	Cap1	9061	0.041	0.1563	No
80	Actn4	9140	0.038	0.1535	No
81	Adra1b	9216	0.036	0.1508	No
82	Akt3	9253	0.035	0.1501	No
83	Jam3	9421	0.029	0.1425	No
84	Cadm3	9585	0.023	0.1350	No
85	Pkd1	9620	0.022	0.1340	No
86	Atp1a3	9753	0.017	0.1278	No
87	Ikbkg	9756	0.017	0.1282	No
88	Ctnna1	9792	0.016	0.1270	No
89	Baiap2	9988	0.010	0.1174	No
90	Gtf2f1	9991	0.010	0.1176	No
91	Map4k2	10060	0.007	0.1144	No
92	Adam9	10223	0.001	0.1063	No
93	Egfr	10256	0.000	0.1047	No
94	Alox8	10262	0.000	0.1044	No
95	Gnai1	10321	0.000	0.1015	No
96	Syk	10597	-0.005	0.0878	No
97	Vav2	10892	-0.015	0.0735	No
98	Skap2	11013	-0.020	0.0680	No
99	Cercam	11064	-0.021	0.0661	No
100	Mapk13	11144	-0.024	0.0629	No
101	Sirpa	11274	-0.028	0.0572	No
102	Taok2	11449	-0.034	0.0495	No
103	Pik3r3	11512	-0.037	0.0475	No
104	Nlgn3	11680	-0.043	0.0404	No
105	Mdk	11779	-0.046	0.0368	No
106	Cd274	11848	-0.048	0.0349	No
107	Layn	12055	-0.054	0.0261	No
108	Dlg1	12459	-0.069	0.0079	No
109	Lima1	12485	-0.070	0.0087	No
110	Nectin2	12514	-0.071	0.0095	No
111	Stx4a	12592	-0.073	0.0078	No
112	Arpc2	12632	-0.075	0.0081	No
113	Wnk4	12657	-0.076	0.0092	No
114	Sdc3	12724	-0.079	0.0082	No
115	Cd34	12814	-0.081	0.0062	No
116	Wasl	12926	-0.086	0.0032	No
117	Rsu1	13034	-0.089	0.0005	No
118	Icam4	13104	-0.091	-0.0002	No
119	Mpzl1	13211	-0.096	-0.0027	No
120	Cd86	13340	-0.100	-0.0061	No
121	Nrxn2	13456	-0.104	-0.0088	No
122	Sympk	13554	-0.108	-0.0104	No
123	Shc1	13596	-0.109	-0.0092	No
124	Itgb1	13687	-0.113	-0.0103	No
125	Ptprc	13831	-0.118	-0.0139	No
126	Tjp1	13837	-0.118	-0.0106	No
127	Cdh11	13976	-0.124	-0.0139	No
128	Cnn2	14285	-0.138	-0.0252	No
129	Nf2	14429	-0.142	-0.0281	No
130	Pik3cb	14483	-0.145	-0.0264	No
131	Exoc4	14643	-0.151	-0.0299	No
132	Tial1	14667	-0.152	-0.0265	No
133	Bmp1	14729	-0.154	-0.0249	No
134	Pecam1	14931	-0.164	-0.0301	No
135	Amigo2	15085	-0.170	-0.0327	No
136	Gamt	15555	-0.186	-0.0507	No
137	Ctnnd1	16005	-0.209	-0.0670	No
138	Icam5	16189	-0.216	-0.0697	No
139	Pbx2	16234	-0.218	-0.0654	No
140	Tsc1	16405	-0.228	-0.0671	No
141	Nectin1	16500	-0.232	-0.0648	No
142	Icam1	16597	-0.238	-0.0625	No
143	Actg1	16826	-0.251	-0.0664	No
144	Epb41l2	16960	-0.260	-0.0652	No
145	Col16a1	17035	-0.265	-0.0610	No
146	Tspan4	17238	-0.273	-0.0629	No
147	Thbs3	17306	-0.277	-0.0580	No
148	Itga2	17984	-0.321	-0.0824	No
149	Fbn1	18488	-0.363	-0.0968	No
150	Nrtn	18580	-0.371	-0.0902	No
151	Rras	18581	-0.371	-0.0790	No
152	Nexn	18584	-0.372	-0.0679	No
153	Cdh6	19109	-0.437	-0.0811	No
154	Hadh	19381	-0.479	-0.0803	No
155	Jup	19606	-0.540	-0.0753	No
156	Cdh4	19739	-0.582	-0.0644	No
157	Sorbs3	19765	-0.595	-0.0477	No
158	Adamts5	19813	-0.627	-0.0312	No
159	Vwf	19817	-0.628	-0.0125	No
160	Tgfbi	19952	-0.761	0.0037	No