Details for gene set HALLMARK_PI3K_AKT_MTOR

Table: GSEA Results Summary

Dataset	GMP.GMP.neu_Pheno.cls #Group2_versus_Group4.GMP.neu_Pheno.cls #Group2_versus_Group4_repos
Phenotype	GMP.neu_Pheno.cls#Group2_versus_Group4_repos
Upregulated in class	1
GeneSet	HALLMARK_PI3K_AKT_MTOR_SIGNALING
Enrichment Score (ES)	0.26146233
Normalized Enrichment Score (NES)	1.2957475
Nominal p-value	0.096114516
FDR q-value	0.49988237
FWER p-Value	0.763

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Myd88	1	1.425	0.0531	Yes
2	Akt1	45	0.931	0.0856	Yes
3	Ralb	161	0.775	0.1087	Yes
4	Cltc	346	0.662	0.1242	Yes
5	Hsp90b1	402	0.642	0.1454	Yes
6	Actr2	412	0.640	0.1687	Yes
7	Arf1	607	0.588	0.1809	Yes
8	Calr	915	0.525	0.1851	Yes
9	Atf1	1069	0.500	0.1960	Yes
10	Rps6ka3	1212	0.480	0.2068	Yes
11	Traf2	1374	0.460	0.2159	Yes
12	Hras	1426	0.454	0.2303	Yes
13	Ap2m1	1636	0.432	0.2359	Yes
14	Pten	1655	0.431	0.2511	Yes
15	Adcy2	1762	0.421	0.2615	Yes
16	Lck	2217	0.385	0.2530	No
17	Actr3	2944	0.335	0.2291	No
18	Them4	2963	0.333	0.2406	No
19	Mapk10	3156	0.319	0.2429	No
20	Egfr	3279	0.313	0.2484	No
21	Pla2g12a	3306	0.312	0.2587	No
22	Smad2	3885	0.278	0.2401	No
23	Tnfrsf1a	3955	0.273	0.2468	No
24	Cab39	4182	0.263	0.2453	No
25	Plcb1	4497	0.242	0.2386	No
26	Map2k3	4579	0.240	0.2434	No
27	Arpc3	4891	0.223	0.2361	No
28	Tsc2	4989	0.218	0.2394	No
29	Pin1	5073	0.213	0.2432	No
30	Sqstm1	5156	0.210	0.2469	No
31	Ptpn11	5205	0.206	0.2522	No
32	Eif4e	5299	0.203	0.2550	No
33	Cdkn1b	5687	0.187	0.2426	No
34	Mknk2	5783	0.181	0.2446	No
35	Pdk1	5830	0.178	0.2489	No
36	Sla	5913	0.175	0.2513	No
37	Mapk8	6101	0.167	0.2482	No
38	Cdk1	6388	0.153	0.2395	No
39	Ube2d3	6542	0.148	0.2373	No
40	Rps6ka1	6636	0.142	0.2380	No
41	Mapkap1	6854	0.130	0.2319	No
42	Pikfyve	6933	0.126	0.2327	No
43	Grb2	6963	0.125	0.2359	No
44	Akt1s1	7215	0.113	0.2275	No
45	Acaca	7447	0.105	0.2198	No
46	Trib3	7474	0.104	0.2224	No
47	Gsk3b	7712	0.093	0.2140	No
48	Mapk9	7737	0.092	0.2162	No
49	Mapk1	7738	0.092	0.2196	No
50	Gna14	8002	0.083	0.2095	No
51	Ywhab	8130	0.078	0.2060	No
52	Ppp2r1b	8197	0.075	0.2055	No
53	Rac1	8400	0.065	0.1978	No
54	Ppp1ca	8775	0.050	0.1809	No
55	Prkar2a	8849	0.047	0.1790	No
56	Nck1	9020	0.039	0.1719	No
57	Prkag1	9127	0.034	0.1679	No
58	Rptor	9622	0.012	0.1435	No
59	Ripk1	9862	0.001	0.1316	No
60	Ube2n	10152	-0.009	0.1174	No
61	Raf1	10634	-0.029	0.0943	No
62	Tiam1	10756	-0.033	0.0895	No
63	Dusp3	11250	-0.055	0.0668	No
64	Arhgdia	11604	-0.071	0.0517	No
65	Prkcb	11779	-0.080	0.0460	No
66	Cdk2	11877	-0.085	0.0443	No
67	Plcg1	11883	-0.085	0.0472	No
68	Map3k7	11915	-0.087	0.0489	No
69	Pak4	11999	-0.090	0.0481	No
70	Sfn	12726	-0.120	0.0161	No
71	Pfn1	12771	-0.122	0.0184	No
72	Slc2a1	12993	-0.132	0.0123	No
73	Itpr2	13334	-0.147	0.0007	No
74	Vav3	13442	-0.152	0.0010	No
75	Cfl1	13991	-0.180	-0.0198	No
76	Camk4	14083	-0.185	-0.0174	No
77	Mknk1	14114	-0.187	-0.0120	No
78	Cdk4	14186	-0.190	-0.0085	No
79	Tbk1	14204	-0.191	-0.0022	No
80	Nfkbib	14304	-0.195	0.0001	No
81	Nod1	14660	-0.213	-0.0098	No
82	Cdkn1a	14725	-0.216	-0.0049	No
83	Irak4	14872	-0.223	-0.0039	No
84	Ecsit	14983	-0.228	-0.0009	No
85	Stat2	15809	-0.269	-0.0323	No
86	Csnk2b	16069	-0.283	-0.0348	No
87	Grk2	16089	-0.284	-0.0251	No
88	Il2rg	16775	-0.323	-0.0475	No
89	Map2k6	16975	-0.335	-0.0450	No
90	Pik3r3	17047	-0.341	-0.0358	No
91	Cab39l	17866	-0.408	-0.0617	No
92	Fgf22	17994	-0.415	-0.0526	No
93	E2f1	18140	-0.430	-0.0438	No
94	Rit1	18919	-0.517	-0.0636	No
95	Ddit3	18932	-0.518	-0.0449	No
96	Prkaa2	19382	-0.607	-0.0448	No
97	Cxcr4	19477	-0.631	-0.0260	No
98	Dapp1	19716	-0.710	-0.0115	No
99	Il4	19740	-0.724	0.0144	No