Details for gene set HALLMARK

Table: GSEA Results Summary

Dataset	GMP.GMP.neu_Pheno.cls #Group2_versus_Group4.GMP.neu_Pheno.cls #Group2_versus_Group4_repos
Phenotype	GMP.neu_Pheno.cls#Group2_versus_Group4_repos
Upregulated in class	1
GeneSet	HALLMARK_GLYCOLYSIS
Enrichment Score (ES)	0.20952824
Normalized Enrichment Score (NES)	1.0195202
Nominal p-value	0.41666666
FDR q-value	0.69303244
FWER p-Value	0.983

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Fkbp4	256	0.701	0.0021	Yes
2	Psmc4	278	0.691	0.0159	Yes
3	Hspa5	296	0.683	0.0297	Yes
4	Aldoa	334	0.666	0.0421	Yes
5	Xylt2	410	0.640	0.0521	Yes
6	Abcb6	453	0.628	0.0634	Yes
7	Chst1	454	0.628	0.0769	Yes
8	Dld	537	0.608	0.0858	Yes
9	Kif20a	567	0.599	0.0972	Yes
10	B4galt7	760	0.555	0.0994	Yes
11	Bpnt1	912	0.525	0.1031	Yes
12	Cth	932	0.521	0.1133	Yes
13	Ugp2	984	0.513	0.1217	Yes
14	Chpf	1151	0.488	0.1238	Yes
15	Hmmr	1270	0.472	0.1280	Yes
16	Copb2	1276	0.471	0.1379	Yes
17	Mpi	1420	0.455	0.1404	Yes
18	Ero1a	1498	0.447	0.1461	Yes
19	Sdc1	1579	0.438	0.1515	Yes
20	Hdlbp	1775	0.421	0.1507	Yes
21	Slc16a3	1818	0.416	0.1575	Yes
22	B4galt2	1825	0.416	0.1661	Yes
23	Depdc1a	1869	0.414	0.1728	Yes
24	Adora2b	2047	0.397	0.1724	Yes
25	P4ha1	2145	0.391	0.1760	Yes
26	Ddit4	2179	0.389	0.1826	Yes
27	Txn1	2488	0.366	0.1750	Yes
28	Ppia	2532	0.362	0.1806	Yes
29	Stc2	2688	0.350	0.1803	Yes
30	Ak3	2863	0.339	0.1788	Yes
31	Lhx9	2907	0.336	0.1838	Yes
32	Slc25a10	2978	0.332	0.1874	Yes
33	Lhpp	3043	0.326	0.1912	Yes
34	Me2	3190	0.317	0.1907	Yes
35	Aldh9a1	3262	0.314	0.1938	Yes
36	Egfr	3279	0.313	0.1997	Yes
37	Pfkp	3389	0.307	0.2008	Yes
38	Idh1	3429	0.304	0.2054	Yes
39	Aldh7a1	3890	0.277	0.1881	Yes
40	Eno1b	3951	0.274	0.1910	Yes
41	Ang	4025	0.270	0.1931	Yes
42	Pgk1	4172	0.264	0.1914	Yes
43	B4galt1	4207	0.261	0.1953	Yes
44	Got2	4234	0.259	0.1995	Yes
45	Nasp	4386	0.250	0.1973	Yes
46	Srd5a3	4392	0.250	0.2024	Yes
47	B3galt6	4399	0.249	0.2074	Yes
48	Pkm	4463	0.245	0.2095	Yes
49	Mxi1	4814	0.227	0.1968	No
50	Vegfa	5197	0.207	0.1820	No
51	Eno2	5217	0.206	0.1854	No
52	Ppfia4	5331	0.200	0.1840	No
53	Tgfa	5678	0.187	0.1706	No
54	Vcan	5870	0.177	0.1648	No
55	Mdh2	5886	0.176	0.1678	No
56	Slc37a4	6273	0.158	0.1518	No
57	Vldlr	6278	0.158	0.1550	No
58	Pgam1	6385	0.153	0.1529	No
59	Cdk1	6388	0.153	0.1561	No
60	Nsdhl	6426	0.151	0.1574	No
61	Mertk	6454	0.150	0.1593	No
62	Isg20	6519	0.149	0.1592	No
63	Got1	6758	0.136	0.1502	No
64	Hk2	6804	0.134	0.1508	No
65	Aurka	6866	0.129	0.1505	No
66	Pmm2	6964	0.125	0.1483	No
67	Irs2	7001	0.123	0.1491	No
68	Ecd	7043	0.121	0.1496	No
69	Pgam2	7075	0.120	0.1506	No
70	Cenpa	7155	0.116	0.1491	No
71	Polr3k	7232	0.113	0.1477	No
72	Gys1	7262	0.110	0.1486	No
73	Agl	7387	0.108	0.1447	No
74	Alg1	7435	0.105	0.1446	No
75	B4galt4	7495	0.103	0.1438	No
76	Me1	7534	0.101	0.1441	No
77	Slc35a3	7552	0.100	0.1454	No
78	Gfpt1	7583	0.099	0.1460	No
79	Ldhc	7707	0.094	0.1418	No
80	Tpi1	7849	0.091	0.1366	No
81	Ppp2cb	8021	0.082	0.1298	No
82	Cln6	8031	0.082	0.1311	No
83	Cyb5a	8235	0.073	0.1224	No
84	Gnpda1	8416	0.064	0.1147	No
85	Glce	8483	0.062	0.1127	No
86	Qsox1	8491	0.062	0.1137	No
87	Sap30	8599	0.058	0.1095	No
88	B3gat3	8644	0.055	0.1085	No
89	Cacna1h	8726	0.052	0.1055	No
90	Ldha	8794	0.049	0.1032	No
91	Cog2	8803	0.049	0.1038	No
92	Ak4	8828	0.048	0.1037	No
93	B3gnt3	8845	0.047	0.1039	No
94	Hax1	8946	0.042	0.0997	No
95	Rpe	9336	0.026	0.0807	No
96	Gpr87	9358	0.025	0.0802	No
97	Plod1	9381	0.023	0.0796	No
98	Sod1	9501	0.018	0.0739	No
99	Ext2	9545	0.016	0.0721	No
100	G6pdx	9549	0.016	0.0723	No
101	Rbck1	9693	0.009	0.0653	No
102	Kdelr3	10024	-0.003	0.0487	No
103	Met	10153	-0.009	0.0425	No
104	Zfp292	10345	-0.017	0.0332	No
105	Arpp19	10351	-0.017	0.0333	No
106	Hs6st2	10393	-0.019	0.0317	No
107	Hs2st1	10439	-0.020	0.0298	No
108	Kif2a	10463	-0.021	0.0291	No
109	Pam	10589	-0.026	0.0234	No
110	Gpc3	10623	-0.028	0.0223	No
111	Pygb	10707	-0.031	0.0188	No
112	Spag4	10746	-0.032	0.0176	No
113	Gale	10956	-0.042	0.0080	No
114	Gusb	11045	-0.045	0.0045	No
115	Med24	11113	-0.048	0.0021	No
116	Sdc3	11203	-0.053	-0.0012	No
117	Bik	11493	-0.066	-0.0144	No
118	Fam162a	11507	-0.067	-0.0136	No
119	Slc25a13	11551	-0.069	-0.0143	No
120	Glrx	11811	-0.081	-0.0256	No
121	Gpc1	11864	-0.084	-0.0264	No
122	Prps1	12019	-0.091	-0.0322	No
123	Casp6	12034	-0.092	-0.0309	No
124	Gapdhs	12035	-0.092	-0.0289	No
125	Mdh1	12060	-0.093	-0.0282	No
126	Gmppb	12344	-0.106	-0.0401	No
127	Rragd	13022	-0.133	-0.0714	No
128	Ankzf1	13051	-0.135	-0.0699	No
129	Gclc	13077	-0.136	-0.0683	No
130	Tpst1	13317	-0.146	-0.0772	No
131	Gpc4	13347	-0.148	-0.0755	No
132	Paxip1	13380	-0.149	-0.0739	No
133	Gne	13394	-0.150	-0.0713	No
134	Lct	13399	-0.150	-0.0683	No
135	Pfkfb1	13591	-0.160	-0.0745	No
136	Pygl	14064	-0.184	-0.0943	No
137	Homer1	14147	-0.188	-0.0944	No
138	Pdk3	14371	-0.199	-0.1014	No
139	Galk1	14712	-0.216	-0.1139	No
140	Egln3	15041	-0.232	-0.1254	No
141	Ext1	15169	-0.235	-0.1268	No
142	Chpf2	15232	-0.238	-0.1248	No
143	Nanp	15434	-0.248	-0.1296	No
144	Phka2	15780	-0.267	-0.1413	No
145	Akr1a1	16003	-0.280	-0.1465	No
146	Col5a1	16150	-0.287	-0.1477	No
147	Dcn	16498	-0.307	-0.1586	No
148	Fbp2	16566	-0.311	-0.1553	No
149	Pgm2	16642	-0.315	-0.1523	No
150	Gmppa	16807	-0.325	-0.1536	No
151	Galk2	16982	-0.336	-0.1551	No
152	Ndufv3	17206	-0.352	-0.1588	No
153	Cd44	17217	-0.353	-0.1518	No
154	Ndst3	17255	-0.355	-0.1460	No
155	Mif	17311	-0.359	-0.1411	No
156	Gal3st1	17391	-0.364	-0.1372	No
157	Agrn	17456	-0.370	-0.1325	No
158	Il13ra1	17517	-0.375	-0.1275	No
159	Chst12	17697	-0.391	-0.1282	No
160	Pcx	17909	-0.409	-0.1300	No
161	Fut8	18357	-0.451	-0.1429	No
162	Taldo1	18718	-0.489	-0.1505	No
163	Pkp2	18949	-0.521	-0.1509	No
164	Gfus	19039	-0.536	-0.1439	No
165	Pgls	19138	-0.553	-0.1370	No
166	Angptl4	19210	-0.567	-0.1284	No
167	Cited2	19231	-0.570	-0.1172	No
168	Sdhc	19248	-0.574	-0.1056	No
169	Cxcr4	19477	-0.631	-0.1036	No
170	Nt5e	19531	-0.645	-0.0925	No
171	Tgfbi	19601	-0.667	-0.0816	No
172	Idua	19630	-0.677	-0.0685	No
173	Sdc2	19754	-0.729	-0.0591	No
174	Plod2	19778	-0.742	-0.0443	No
175	Stmn1	19880	-0.828	-0.0316	No
176	Ier3	19920	-0.877	-0.0148	No
177	Capn5	19953	-0.936	0.0037	No