Details for gene set HALLMARK_G2M

Table: GSEA Results Summary

Dataset	GMP.GMP.neu_Pheno.cls #Group2_versus_Group4.GMP.neu_Pheno.cls #Group2_versus_Group4_repos
Phenotype	GMP.neu_Pheno.cls#Group2_versus_Group4_repos
Upregulated in class	1
GeneSet	HALLMARK_G2M_CHECKPOINT
Enrichment Score (ES)	0.39541852
Normalized Enrichment Score (NES)	1.7451614
Nominal p-value	0.034764826
FDR q-value	0.04282671
FWER p-Value	0.079

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Srsf1	49	0.914	0.0156	Yes
2	Hspa8	54	0.902	0.0333	Yes
3	Kpnb1	87	0.854	0.0485	Yes
4	Cdkn2c	159	0.777	0.0603	Yes
5	Nek2	189	0.747	0.0737	Yes
6	Sqle	198	0.741	0.0879	Yes
7	Hnrnpu	341	0.664	0.0939	Yes
8	Xpo1	391	0.646	0.1042	Yes
9	Ube2c	401	0.642	0.1165	Yes
10	Ccna2	464	0.624	0.1257	Yes
11	Ddx39a	493	0.617	0.1365	Yes
12	Upf1	520	0.612	0.1473	Yes
13	Bcl3	695	0.568	0.1498	Yes
14	Lig3	738	0.558	0.1587	Yes
15	Cdc25b	805	0.546	0.1662	Yes
16	Odc1	820	0.543	0.1762	Yes
17	Jpt1	905	0.527	0.1824	Yes
18	G3bp1	941	0.520	0.1909	Yes
19	Ndc80	955	0.518	0.2005	Yes
20	Lmnb1	1066	0.501	0.2049	Yes
21	E2f4	1094	0.496	0.2133	Yes
22	Incenp	1113	0.494	0.2222	Yes
23	Hmmr	1270	0.472	0.2237	Yes
24	Lbr	1449	0.453	0.2236	Yes
25	Dr1	1453	0.452	0.2324	Yes
26	Smc1a	1455	0.452	0.2413	Yes
27	Cenpf	1558	0.440	0.2449	Yes
28	Kif11	1640	0.432	0.2493	Yes
29	Sfpq	1653	0.431	0.2573	Yes
30	Cdc6	1756	0.422	0.2605	Yes
31	Prc1	1963	0.404	0.2581	Yes
32	Rad23b	1970	0.403	0.2658	Yes
33	Top2a	2003	0.401	0.2721	Yes
34	Amd1	2105	0.396	0.2748	Yes
35	Rad21	2106	0.396	0.2827	Yes
36	Bub1	2124	0.394	0.2896	Yes
37	Plk4	2127	0.394	0.2973	Yes
38	Syncrip	2180	0.389	0.3024	Yes
39	Ccnf	2218	0.385	0.3081	Yes
40	Cdc7	2239	0.384	0.3147	Yes
41	Dbf4	2254	0.382	0.3216	Yes
42	Nup98	2264	0.381	0.3287	Yes
43	Cenpe	2310	0.378	0.3339	Yes
44	Racgap1	2316	0.377	0.3411	Yes
45	Plk1	2425	0.371	0.3430	Yes
46	Mybl2	2517	0.364	0.3456	Yes
47	H2bc12	2629	0.354	0.3470	Yes
48	Hif1a	2678	0.351	0.3515	Yes
49	Tpx2	2769	0.347	0.3538	Yes
50	Ncl	3160	0.319	0.3405	Yes
51	Nolc1	3174	0.318	0.3461	Yes
52	Kif4	3387	0.307	0.3415	Yes
53	Tacc3	3420	0.305	0.3459	Yes
54	Espl1	3469	0.302	0.3495	Yes
55	Mki67	3471	0.302	0.3554	Yes
56	Mcm5	3472	0.302	0.3614	Yes
57	Uck2	3532	0.297	0.3643	Yes
58	Hnrnpd	3622	0.292	0.3656	Yes
59	Cul1	3677	0.290	0.3686	Yes
60	Kif20b	3729	0.287	0.3717	Yes
61	Mcm3	3845	0.281	0.3715	Yes
62	Mad2l1	3884	0.278	0.3751	Yes
63	Mcm2	3914	0.276	0.3791	Yes
64	Tnpo2	4094	0.267	0.3753	Yes
65	Aurkb	4318	0.253	0.3691	Yes
66	Birc5	4364	0.251	0.3718	Yes
67	Nasp	4386	0.250	0.3757	Yes
68	Tent4a	4400	0.249	0.3800	Yes
69	Cks2	4410	0.249	0.3844	Yes
70	Tmpo	4483	0.243	0.3856	Yes
71	Tfdp1	4594	0.239	0.3848	Yes
72	Odf2	4856	0.225	0.3761	Yes
73	Notch2	4939	0.220	0.3763	Yes
74	Wrn	5071	0.213	0.3739	Yes
75	Cdc25a	5099	0.212	0.3768	Yes
76	Numa1	5150	0.210	0.3784	Yes
77	Top1	5276	0.204	0.3761	Yes
78	Smc2	5339	0.200	0.3770	Yes
79	E2f2	5366	0.198	0.3796	Yes
80	Slc38a1	5429	0.195	0.3803	Yes
81	Cdc20	5472	0.192	0.3820	Yes
82	Cdkn1b	5687	0.187	0.3749	Yes
83	Gspt1	5689	0.186	0.3785	Yes
84	Polq	5719	0.184	0.3807	Yes
85	Ttk	5760	0.182	0.3823	Yes
86	Bard1	5831	0.178	0.3823	Yes
87	Chaf1a	5847	0.178	0.3851	Yes
88	Hira	5881	0.176	0.3869	Yes
89	Ctcf	5900	0.175	0.3895	Yes
90	Kif15	6066	0.168	0.3845	Yes
91	Rbl1	6086	0.167	0.3868	Yes
92	Kif23	6127	0.166	0.3881	Yes
93	Mcm6	6138	0.166	0.3909	Yes
94	Cul3	6158	0.165	0.3932	Yes
95	Slc7a1	6210	0.162	0.3938	Yes
96	Gins2	6256	0.159	0.3947	Yes
97	Ccnt1	6304	0.157	0.3954	Yes
98	Cdk1	6388	0.153	0.3943	No
99	Ilf3	6551	0.147	0.3890	No
100	Map3k20	6625	0.143	0.3881	No
101	Atrx	6708	0.138	0.3867	No
102	Aurka	6866	0.129	0.3814	No
103	Stil	6931	0.126	0.3807	No
104	Meis2	6936	0.126	0.3830	No
105	Chmp1a	7067	0.120	0.3788	No
106	Cenpa	7155	0.116	0.3767	No
107	Smarcc1	7345	0.110	0.3693	No
108	H2az1	7365	0.109	0.3705	No
109	Atf5	7486	0.103	0.3665	No
110	Ccnb2	7541	0.101	0.3658	No
111	Nsd2	7597	0.098	0.3650	No
112	Stag1	8013	0.082	0.3457	No
113	Pafah1b1	8014	0.082	0.3473	No
114	Kif2c	8082	0.080	0.3455	No
115	Cks1b	8109	0.078	0.3457	No
116	Fancc	8118	0.078	0.3469	No
117	Nusap1	8120	0.078	0.3484	No
118	Ewsr1	8152	0.077	0.3483	No
119	Cul4a	8261	0.072	0.3443	No
120	Mtf2	8311	0.069	0.3432	No
121	Mapk14	8399	0.065	0.3401	No
122	Cdc27	8415	0.064	0.3406	No
123	Prpf4b	8454	0.063	0.3399	No
124	Cul5	8467	0.062	0.3406	No
125	Ss18	8531	0.061	0.3386	No
126	Bub3	8547	0.060	0.3390	No
127	Troap	8568	0.059	0.3392	No
128	Sap30	8599	0.058	0.3388	No
129	Hmga1b	8807	0.048	0.3293	No
130	Kmt5a	8925	0.043	0.3243	No
131	Cdkn3	9031	0.039	0.3198	No
132	H2ax	9059	0.038	0.3192	No
133	Slc7a5	9269	0.029	0.3092	No
134	Srsf2	9350	0.025	0.3057	No
135	Pbk	9407	0.022	0.3033	No
136	Tra2b	9426	0.021	0.3028	No
137	Marcks	9567	0.015	0.2960	No
138	Suv39h1	9680	0.010	0.2906	No
139	Prmt5	9707	0.008	0.2894	No
140	Rad54l	9784	0.005	0.2857	No
141	Nup50	9966	-0.001	0.2766	No
142	Kif5b	9984	-0.001	0.2758	No
143	Smc4	10013	-0.003	0.2744	No
144	Arid4a	10139	-0.009	0.2683	No
145	Dtymk	10288	-0.014	0.2611	No
146	Ythdc1	10384	-0.018	0.2566	No
147	Kif22	10547	-0.025	0.2490	No
148	Dmd	10716	-0.031	0.2411	No
149	Casp8ap2	10974	-0.043	0.2290	No
150	Ezh2	11050	-0.045	0.2261	No
151	Knl1	11082	-0.047	0.2255	No
152	E2f3	11091	-0.047	0.2260	No
153	Prim2	11304	-0.057	0.2165	No
154	Smad3	11443	-0.064	0.2108	No
155	Fbxo5	11588	-0.071	0.2049	No
156	Ube2s	11608	-0.072	0.2054	No
157	Traip	11716	-0.076	0.2015	No
158	Abl1	11906	-0.087	0.1937	No
159	Chek1	12036	-0.092	0.1890	No
160	Myc	12714	-0.119	0.1572	No
161	Pds5b	12746	-0.120	0.1580	No
162	Orc5	12821	-0.123	0.1567	No
163	Exo1	12881	-0.126	0.1562	No
164	Foxn3	13002	-0.133	0.1528	No
165	Snrpd1	13059	-0.135	0.1527	No
166	Pml	13237	-0.143	0.1466	No
167	Brca2	13804	-0.171	0.1214	No
168	Srsf10	13843	-0.173	0.1229	No
169	Rasal2	14024	-0.182	0.1175	No
170	Dkc1	14157	-0.189	0.1146	No
171	Cdk4	14186	-0.190	0.1169	No
172	Tle3	14351	-0.198	0.1125	No
173	Pttg1	14471	-0.203	0.1106	No
174	Cbx1	14651	-0.212	0.1057	No
175	Tgfb1	14901	-0.224	0.0976	No
176	Rps6ka5	15332	-0.243	0.0807	No
177	Cdc45	15385	-0.246	0.0830	No
178	Mnat1	15670	-0.261	0.0738	No
179	Meis1	16074	-0.283	0.0591	No
180	Hus1	16165	-0.288	0.0603	No
181	Hmgb3	16994	-0.337	0.0252	No
182	Pole	17083	-0.344	0.0275	No
183	Pola2	17572	-0.380	0.0105	No
184	Efna5	17657	-0.386	0.0139	No
185	E2f1	18140	-0.430	-0.0019	No
186	Rpa2	18208	-0.437	0.0033	No
187	Ccnd1	18272	-0.442	0.0089	No
188	Orc6	18584	-0.477	0.0027	No
189	Slc12a2	18695	-0.487	0.0068	No
190	Pura	18716	-0.489	0.0154	No
191	H2az2	18736	-0.491	0.0242	No
192	Katna1	19053	-0.538	0.0189	No
193	Egf	19660	-0.691	0.0020	No
194	Stmn1	19880	-0.828	0.0074	No