Details for gene set HALLMARK_PI3K_AKT_MTOR

Table: GSEA Results Summary

Dataset	GMP.GMP.neu_Pheno.cls #Group2_versus_Group3.GMP.neu_Pheno.cls #Group2_versus_Group3_repos
Phenotype	GMP.neu_Pheno.cls#Group2_versus_Group3_repos
Upregulated in class	1
GeneSet	HALLMARK_PI3K_AKT_MTOR_SIGNALING
Enrichment Score (ES)	0.25988343
Normalized Enrichment Score (NES)	1.3554959
Nominal p-value	0.060150377
FDR q-value	0.27841586
FWER p-Value	0.67

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Hsp90b1	94	0.763	0.0273	Yes
2	Myd88	109	0.740	0.0576	Yes
3	Plcb1	217	0.657	0.0798	Yes
4	Cltc	358	0.598	0.0979	Yes
5	Arf1	434	0.577	0.1183	Yes
6	Hras	552	0.546	0.1353	Yes
7	Calr	741	0.503	0.1470	Yes
8	Actr2	799	0.492	0.1648	Yes
9	Akt1	909	0.478	0.1794	Yes
10	Cdkn1b	951	0.472	0.1971	Yes
11	Rps6ka3	1272	0.430	0.1991	Yes
12	Ralb	1390	0.416	0.2107	Yes
13	Atf1	1869	0.376	0.2025	Yes
14	Ptpn11	1990	0.367	0.2118	Yes
15	Ube2d3	2006	0.366	0.2264	Yes
16	Egfr	2687	0.313	0.2054	Yes
17	Cab39	2930	0.296	0.2057	Yes
18	Smad2	3042	0.290	0.2122	Yes
19	Lck	3196	0.280	0.2163	Yes
20	Ecsit	3242	0.278	0.2257	Yes
21	Mapk1	3673	0.255	0.2148	Yes
22	Dusp3	4140	0.230	0.2011	Yes
23	Prkag1	4414	0.215	0.1964	Yes
24	Pikfyve	4464	0.212	0.2028	Yes
25	Acaca	4475	0.212	0.2112	Yes
26	Mapkap1	4617	0.205	0.2127	Yes
27	Map2k3	4677	0.201	0.2182	Yes
28	Pten	4756	0.196	0.2225	Yes
29	Traf2	4765	0.195	0.2303	Yes
30	Grb2	4862	0.191	0.2335	Yes
31	Rac1	4996	0.187	0.2347	Yes
32	Ppp1ca	5133	0.181	0.2354	Yes
33	Ube2n	5205	0.177	0.2393	Yes
34	Cdk1	5228	0.176	0.2456	Yes
35	Actr3	5233	0.176	0.2527	Yes
36	Sqstm1	5411	0.168	0.2509	Yes
37	Gsk3b	5508	0.163	0.2529	Yes
38	Cdkn1a	5553	0.161	0.2574	Yes
39	Mapk10	5758	0.151	0.2535	Yes
40	Nck1	5852	0.147	0.2550	Yes
41	Tbk1	5878	0.146	0.2599	Yes
42	Sla	6297	0.128	0.2443	No
43	Arhgdia	6331	0.126	0.2479	No
44	Mapk8	6683	0.113	0.2351	No
45	Cdk2	6778	0.110	0.2349	No
46	Eif4e	6924	0.104	0.2320	No
47	Adcy2	7175	0.092	0.2233	No
48	Pak4	7510	0.078	0.2099	No
49	Mknk2	7526	0.077	0.2123	No
50	Arpc3	7554	0.076	0.2142	No
51	Pin1	7584	0.075	0.2158	No
52	Rit1	7717	0.069	0.2121	No
53	Raf1	7982	0.058	0.2013	No
54	Rps6ka1	8500	0.036	0.1769	No
55	Map3k7	8611	0.030	0.1726	No
56	Tiam1	8823	0.020	0.1629	No
57	Ripk1	9060	0.010	0.1515	No
58	Nod1	9245	0.002	0.1423	No
59	Rptor	9287	0.000	0.1403	No
60	Mapk9	9516	-0.009	0.1292	No
61	Sfn	9523	-0.009	0.1292	No
62	Nfkbib	10539	-0.052	0.0805	No
63	Tnfrsf1a	10576	-0.053	0.0809	No
64	Vav3	10577	-0.053	0.0831	No
65	Ywhab	10804	-0.062	0.0744	No
66	Pdk1	10981	-0.070	0.0685	No
67	Gna14	11016	-0.071	0.0697	No
68	Ap2m1	11548	-0.091	0.0469	No
69	Cfl1	12021	-0.113	0.0280	No
70	Akt1s1	12466	-0.132	0.0112	No
71	Plcg1	12698	-0.144	0.0057	No
72	Slc2a1	13459	-0.178	-0.0250	No
73	Fgf22	13681	-0.188	-0.0282	No
74	Grk2	13888	-0.196	-0.0303	No
75	Mknk1	13898	-0.197	-0.0225	No
76	Map2k6	13903	-0.197	-0.0144	No
77	Irak4	14311	-0.219	-0.0257	No
78	Trib3	14357	-0.221	-0.0186	No
79	E2f1	14569	-0.230	-0.0196	No
80	Csnk2b	14576	-0.231	-0.0102	No
81	Prkar2a	14853	-0.246	-0.0137	No
82	Tsc2	14947	-0.250	-0.0079	No
83	Pfn1	15004	-0.252	-0.0001	No
84	Il4	15108	-0.258	0.0055	No
85	Cab39l	15726	-0.290	-0.0133	No
86	Camk4	15835	-0.296	-0.0063	No
87	Itpr2	16054	-0.310	-0.0042	No
88	Prkaa2	16123	-0.314	0.0055	No
89	Cdk4	16515	-0.333	-0.0001	No
90	Them4	17010	-0.365	-0.0096	No
91	Pik3r3	17319	-0.386	-0.0089	No
92	Stat2	17467	-0.397	0.0004	No
93	Prkcb	17529	-0.401	0.0141	No
94	Cxcr4	17610	-0.407	0.0272	No
95	Ppp2r1b	17719	-0.418	0.0393	No
96	Il2rg	17767	-0.423	0.0547	No
97	Dapp1	17779	-0.424	0.0719	No
98	Pla2g12a	17897	-0.434	0.0842	No
99	Ddit3	18849	-0.539	0.0591	No