Details for gene set HALLMARK_INTERFERON_GAMMA

Table: GSEA Results Summary

Dataset	GMP.GMP.neu_Pheno.cls #Group2_versus_Group3.GMP.neu_Pheno.cls #Group2_versus_Group3_repos
Phenotype	GMP.neu_Pheno.cls#Group2_versus_Group3_repos
Upregulated in class	1
GeneSet	HALLMARK_INTERFERON_GAMMA_RESPONSE
Enrichment Score (ES)	0.22208709
Normalized Enrichment Score (NES)	0.9848791
Nominal p-value	0.49385247
FDR q-value	0.74549764
FWER p-Value	0.991

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Oas2	20	0.954	0.0194	Yes
2	Parp14	44	0.859	0.0365	Yes
3	Myd88	109	0.740	0.0491	Yes
4	Pim1	110	0.739	0.0648	Yes
5	Ogfr	190	0.669	0.0751	Yes
6	Rsad2	237	0.648	0.0866	Yes
7	Ifitm3	315	0.612	0.0958	Yes
8	Ptgs2	620	0.527	0.0918	Yes
9	Lap3	795	0.493	0.0935	Yes
10	Irf9	872	0.483	0.1000	Yes
11	Ifit3	974	0.468	0.1049	Yes
12	Parp12	991	0.466	0.1140	Yes
13	Cd74	1030	0.461	0.1219	Yes
14	Plscr1	1119	0.448	0.1271	Yes
15	Tnfaip2	1161	0.445	0.1345	Yes
16	Trim25	1179	0.443	0.1431	Yes
17	Fcgr1	1242	0.434	0.1492	Yes
18	Socs3	1539	0.403	0.1429	Yes
19	Pfkp	1603	0.399	0.1483	Yes
20	Stat3	1685	0.391	0.1525	Yes
21	Rnf213	1735	0.387	0.1583	Yes
22	Ube2l6	1741	0.386	0.1663	Yes
23	Bank1	1778	0.383	0.1727	Yes
24	Dhx58	1837	0.378	0.1778	Yes
25	Psma3	2177	0.351	0.1682	Yes
26	H2-Aa	2258	0.344	0.1715	Yes
27	Fgl2	2374	0.335	0.1729	Yes
28	Itgb7	2381	0.335	0.1797	Yes
29	Cd38	2433	0.330	0.1842	Yes
30	Cmpk2	2680	0.313	0.1785	Yes
31	Il18bp	2742	0.309	0.1820	Yes
32	Cmtr1	2784	0.305	0.1864	Yes
33	Gbp3	2828	0.303	0.1907	Yes
34	Cd86	2870	0.300	0.1951	Yes
35	Il4ra	2883	0.298	0.2008	Yes
36	Oas3	2891	0.298	0.2068	Yes
37	Cxcl10	2947	0.295	0.2103	Yes
38	Casp1	3043	0.290	0.2117	Yes
39	Bst2	3265	0.276	0.2065	Yes
40	Nup93	3318	0.273	0.2097	Yes
41	Stat1	3359	0.271	0.2135	Yes
42	Helz2	3547	0.261	0.2096	Yes
43	Ifih1	3844	0.245	0.1999	Yes
44	Pnp	3858	0.244	0.2045	Yes
45	Jak2	3861	0.244	0.2096	Yes
46	Samd9l	3907	0.241	0.2125	Yes
47	Znfx1	4032	0.236	0.2113	Yes
48	Rigi	4053	0.235	0.2153	Yes
49	Mx2	4095	0.233	0.2182	Yes
50	Zbp1	4116	0.231	0.2221	Yes
51	Eif2ak2	4423	0.214	0.2113	No
52	Tdrd7	4623	0.205	0.2056	No
53	Marchf1	4972	0.188	0.1921	No
54	Btg1	5059	0.184	0.1917	No
55	Ptpn6	5429	0.167	0.1767	No
56	Cd69	5432	0.167	0.1801	No
57	Wars1	5512	0.162	0.1796	No
58	Cdkn1a	5553	0.161	0.1810	No
59	Icam1	5676	0.155	0.1782	No
60	Irf4	5680	0.155	0.1813	No
61	Vcam1	5743	0.152	0.1815	No
62	Pnpt1	5856	0.147	0.1789	No
63	Ncoa3	5946	0.143	0.1775	No
64	Trafd1	6134	0.134	0.1710	No
65	Slc25a28	6163	0.133	0.1724	No
66	Ifit2	6168	0.133	0.1750	No
67	Irf1	6321	0.127	0.1701	No
68	Ifi30	6357	0.125	0.1710	No
69	Hif1a	6376	0.124	0.1727	No
70	St3gal5	6525	0.120	0.1678	No
71	Adar	6552	0.118	0.1691	No
72	Ptpn2	6687	0.113	0.1647	No
73	Peli1	6781	0.110	0.1624	No
74	Ifitm2	6875	0.106	0.1599	No
75	Oasl1	7043	0.098	0.1536	No
76	Ifi44	7098	0.096	0.1529	No
77	Sod2	7138	0.094	0.1530	No
78	Rbck1	7246	0.090	0.1495	No
79	Pla2g4a	7278	0.089	0.1499	No
80	Isg20	7443	0.081	0.1433	No
81	Tapbp	7478	0.080	0.1433	No
82	Psma2	7485	0.080	0.1447	No
83	Eif4e3	7807	0.066	0.1300	No
84	Rnf31	7840	0.064	0.1297	No
85	Arl4a	8155	0.051	0.1150	No
86	Mthfd2	8574	0.032	0.0946	No
87	Psme1	8616	0.030	0.0932	No
88	Sppl2a	8623	0.030	0.0935	No
89	Irf2	8649	0.029	0.0929	No
90	Psmb2	8750	0.024	0.0884	No
91	Psmb10	8907	0.017	0.0809	No
92	Ripk1	9060	0.010	0.0734	No
93	Nlrc5	9086	0.009	0.0723	No
94	Rapgef6	9209	0.003	0.0663	No
95	Nod1	9245	0.002	0.0646	No
96	Socs1	9375	-0.002	0.0581	No
97	Isg15	9411	-0.003	0.0564	No
98	Trim21	9482	-0.007	0.0530	No
99	Sri	9563	-0.011	0.0492	No
100	Selp	9685	-0.016	0.0435	No
101	Ifi27	9887	-0.023	0.0338	No
102	Ripk2	9910	-0.024	0.0332	No
103	Trim14	10101	-0.033	0.0244	No
104	Il7	10114	-0.033	0.0245	No
105	Irf7	10483	-0.049	0.0070	No
106	Herc6	10655	-0.056	-0.0004	No
107	Tap1	10753	-0.060	-0.0040	No
108	St8sia4	10951	-0.069	-0.0125	No
109	Nampt	11136	-0.074	-0.0202	No
110	Il15ra	11253	-0.079	-0.0243	No
111	Epsti1	11461	-0.088	-0.0329	No
112	Ptpn1	11673	-0.097	-0.0414	No
113	Casp4	11914	-0.108	-0.0512	No
114	Ddx60	12012	-0.113	-0.0537	No
115	Pml	12212	-0.120	-0.0611	No
116	Lats2	12569	-0.138	-0.0761	No
117	Nfkb1	12793	-0.148	-0.0842	No
118	Il10ra	13052	-0.159	-0.0938	No
119	B2m	13120	-0.161	-0.0937	No
120	Irf8	13384	-0.174	-0.1033	No
121	Lcp2	13615	-0.185	-0.1109	No
122	Isoc1	13759	-0.192	-0.1140	No
123	Arid5b	13976	-0.200	-0.1206	No
124	Tnfaip6	14105	-0.207	-0.1227	No
125	Samhd1	14260	-0.216	-0.1258	No
126	Ifnar2	14644	-0.235	-0.1401	No
127	Xaf1	14663	-0.236	-0.1360	No
128	Gch1	14743	-0.240	-0.1348	No
129	Lgals3bp	14764	-0.242	-0.1307	No
130	Psme2	14859	-0.246	-0.1301	No
131	Casp8	14939	-0.250	-0.1288	No
132	Usp18	15102	-0.257	-0.1315	No
133	Sp110	15132	-0.258	-0.1274	No
134	Txnip	15223	-0.262	-0.1263	No
135	Ly6e	15256	-0.264	-0.1223	No
136	Lysmd2	15527	-0.279	-0.1300	No
137	Cfh	15571	-0.282	-0.1261	No
138	Psmb8	15653	-0.286	-0.1241	No
139	Tnfaip3	15746	-0.291	-0.1225	No
140	Tor1b	15873	-0.299	-0.1225	No
141	Vamp5	16618	-0.340	-0.1527	No
142	Ciita	16726	-0.346	-0.1507	No
143	Psmb9	16779	-0.350	-0.1459	No
144	Nfkbia	16843	-0.355	-0.1415	No
145	Casp7	17274	-0.382	-0.1550	No
146	Stat4	17282	-0.383	-0.1471	No
147	Stat2	17467	-0.397	-0.1479	No
148	Nmi	17470	-0.397	-0.1396	No
149	Gpr18	17826	-0.428	-0.1483	No
150	Batf2	17893	-0.433	-0.1424	No
151	Bpgm	17971	-0.440	-0.1369	No
152	Mvp	18297	-0.471	-0.1432	No
153	Cfb	18424	-0.485	-0.1392	No
154	Casp3	18480	-0.491	-0.1315	No
155	Tnfsf10	18658	-0.510	-0.1295	No
156	Ifi35	18937	-0.550	-0.1318	No
157	Cd274	19059	-0.571	-0.1257	No
158	P2ry14	19136	-0.583	-0.1171	No
159	Fas	19210	-0.599	-0.1080	No
160	Cd40	19282	-0.614	-0.0985	No
161	Il15	19338	-0.628	-0.0878	No
162	Irf5	19350	-0.632	-0.0749	No
163	Trim26	19432	-0.649	-0.0651	No
164	Vamp8	19597	-0.702	-0.0584	No
165	Rtp4	19623	-0.713	-0.0445	No
166	H2-DMa	19633	-0.719	-0.0296	No
167	Pde4b	19673	-0.734	-0.0159	No
168	Auts2	19703	-0.747	-0.0014	No
169	Cmklr1	19820	-0.827	0.0104	No