Details for gene set HALLMARK_G2M

Table: GSEA Results Summary

Dataset	GMP.GMP.neu_Pheno.cls #Group2_versus_Group3.GMP.neu_Pheno.cls #Group2_versus_Group3_repos
Phenotype	GMP.neu_Pheno.cls#Group2_versus_Group3_repos
Upregulated in class	1
GeneSet	HALLMARK_G2M_CHECKPOINT
Enrichment Score (ES)	0.4448873
Normalized Enrichment Score (NES)	1.8355536
Nominal p-value	0.004048583
FDR q-value	0.016020494
FWER p-Value	0.035

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Hspa8	15	1.001	0.0206	Yes
2	Srsf1	45	0.858	0.0374	Yes
3	Kpnb1	276	0.632	0.0392	Yes
4	Nek2	307	0.616	0.0509	Yes
5	H2bc12	339	0.605	0.0622	Yes
6	Sap30	390	0.586	0.0722	Yes
7	Racgap1	424	0.579	0.0829	Yes
8	Rad54l	426	0.578	0.0951	Yes
9	Bcl3	499	0.561	0.1035	Yes
10	Cenpe	601	0.532	0.1097	Yes
11	Cks2	622	0.526	0.1199	Yes
12	Hnrnpu	662	0.517	0.1290	Yes
13	Odc1	680	0.514	0.1391	Yes
14	Cdc7	716	0.508	0.1481	Yes
15	Xpo1	888	0.482	0.1498	Yes
16	Upf1	889	0.481	0.1600	Yes
17	Jpt1	898	0.479	0.1698	Yes
18	Lbr	919	0.477	0.1790	Yes
19	Cdkn1b	951	0.472	0.1875	Yes
20	Hmmr	1011	0.463	0.1944	Yes
21	Ddx39a	1031	0.461	0.2032	Yes
22	Plk4	1208	0.439	0.2037	Yes
23	Ncl	1230	0.436	0.2119	Yes
24	Nolc1	1286	0.429	0.2183	Yes
25	Rad21	1306	0.426	0.2264	Yes
26	Dr1	1373	0.419	0.2320	Yes
27	Bub1	1394	0.416	0.2399	Yes
28	Incenp	1406	0.415	0.2482	Yes
29	Kif4	1453	0.411	0.2546	Yes
30	Cdc6	1495	0.407	0.2612	Yes
31	Lig3	1525	0.405	0.2684	Yes
32	Syncrip	1554	0.402	0.2755	Yes
33	G3bp1	1669	0.393	0.2782	Yes
34	Mki67	1779	0.383	0.2808	Yes
35	Ttk	1854	0.377	0.2851	Yes
36	Sfpq	1942	0.371	0.2886	Yes
37	Mcm2	2008	0.366	0.2931	Yes
38	E2f4	2142	0.353	0.2940	Yes
39	Top2a	2252	0.345	0.2958	Yes
40	Mcm3	2333	0.339	0.2990	Yes
41	Lmnb1	2341	0.338	0.3058	Yes
42	Kif11	2401	0.333	0.3100	Yes
43	Tpx2	2411	0.332	0.3166	Yes
44	Chaf1a	2417	0.331	0.3234	Yes
45	Nasp	2531	0.322	0.3246	Yes
46	Cdc25a	2542	0.321	0.3309	Yes
47	Kif15	2564	0.320	0.3367	Yes
48	Ccnt1	2584	0.319	0.3425	Yes
49	Amd1	2657	0.314	0.3456	Yes
50	Kif5b	2785	0.305	0.3457	Yes
51	E2f2	2840	0.302	0.3494	Yes
52	Casp8ap2	2912	0.296	0.3521	Yes
53	Cdkn2c	2967	0.294	0.3557	Yes
54	Nsd2	2970	0.294	0.3618	Yes
55	Tnpo2	3016	0.291	0.3658	Yes
56	Hnrnpd	3038	0.290	0.3709	Yes
57	Birc5	3173	0.281	0.3701	Yes
58	Ndc80	3227	0.278	0.3734	Yes
59	Kif20b	3294	0.274	0.3759	Yes
60	Notch2	3637	0.256	0.3641	Yes
61	Aurka	3648	0.256	0.3690	Yes
62	Nup98	3755	0.249	0.3690	Yes
63	Dbf4	3772	0.248	0.3735	Yes
64	Smc1a	3774	0.248	0.3787	Yes
65	Cenpf	3787	0.248	0.3834	Yes
66	Prmt5	3790	0.248	0.3886	Yes
67	Gspt1	3794	0.247	0.3937	Yes
68	Prc1	3839	0.245	0.3967	Yes
69	Tent4a	3848	0.245	0.4015	Yes
70	Kif23	4022	0.237	0.3978	Yes
71	Pttg1	4024	0.236	0.4028	Yes
72	Tra2b	4068	0.234	0.4057	Yes
73	Ube2s	4136	0.230	0.4072	Yes
74	Slc38a1	4183	0.227	0.4097	Yes
75	Kif22	4193	0.227	0.4141	Yes
76	Mcm5	4249	0.224	0.4161	Yes
77	Ythdc1	4255	0.224	0.4206	Yes
78	Sqle	4310	0.220	0.4226	Yes
79	Hira	4353	0.218	0.4251	Yes
80	Cul1	4360	0.218	0.4294	Yes
81	Tfdp1	4556	0.208	0.4240	Yes
82	Troap	4597	0.206	0.4264	Yes
83	Uck2	4619	0.205	0.4297	Yes
84	E2f3	4650	0.203	0.4325	Yes
85	Rad23b	4731	0.197	0.4327	Yes
86	Pafah1b1	4737	0.197	0.4366	Yes
87	Ccnf	5045	0.185	0.4251	Yes
88	Numa1	5122	0.181	0.4251	Yes
89	Plk1	5152	0.180	0.4275	Yes
90	Abl1	5180	0.178	0.4299	Yes
91	Mtf2	5187	0.178	0.4334	Yes
92	Cdk1	5228	0.176	0.4352	Yes
93	Top1	5239	0.175	0.4384	Yes
94	Wrn	5250	0.175	0.4416	Yes
95	Atrx	5295	0.173	0.4431	Yes
96	Cdc27	5333	0.172	0.4449	Yes
97	H2az1	5558	0.161	0.4370	No
98	Ilf3	5611	0.158	0.4378	No
99	Stag1	5654	0.156	0.4390	No
100	Odf2	5737	0.152	0.4381	No
101	Mybl2	5816	0.149	0.4373	No
102	Chmp1a	5872	0.146	0.4377	No
103	Rbl1	5969	0.142	0.4359	No
104	Slc7a5	6026	0.139	0.4360	No
105	Smc2	6039	0.139	0.4383	No
106	Kif2c	6060	0.137	0.4403	No
107	Smarcc1	6130	0.135	0.4397	No
108	Ss18	6330	0.126	0.4323	No
109	Tmpo	6374	0.124	0.4328	No
110	Hif1a	6376	0.124	0.4354	No
111	Bard1	6573	0.117	0.4280	No
112	Tacc3	6619	0.115	0.4282	No
113	Mcm6	6709	0.112	0.4261	No
114	Prpf4b	6713	0.112	0.4283	No
115	Ccna2	6738	0.110	0.4295	No
116	Chek1	6865	0.106	0.4254	No
117	Stil	6873	0.106	0.4273	No
118	Polq	6986	0.101	0.4238	No
119	Arid4a	7008	0.100	0.4249	No
120	Kmt5a	7047	0.098	0.4250	No
121	Pbk	7063	0.098	0.4264	No
122	Suv39h1	7300	0.088	0.4163	No
123	Snrpd1	7334	0.087	0.4165	No
124	Smad3	7555	0.076	0.4071	No
125	Espl1	8018	0.057	0.3850	No
126	Atf5	8116	0.053	0.3812	No
127	Cul3	8340	0.042	0.3708	No
128	Exo1	8426	0.039	0.3674	No
129	Gins2	8465	0.038	0.3663	No
130	Cenpa	8555	0.033	0.3625	No
131	Aurkb	8650	0.028	0.3584	No
132	Cks1b	8660	0.028	0.3585	No
133	Orc5	8734	0.025	0.3554	No
134	Fancc	8837	0.020	0.3506	No
135	Slc7a1	8937	0.015	0.3460	No
136	Rpa2	9066	0.010	0.3397	No
137	Tle3	9291	0.000	0.3285	No
138	Smc4	9397	-0.003	0.3232	No
139	Cul5	9407	-0.003	0.3228	No
140	Cdc45	9445	-0.005	0.3211	No
141	Ctcf	9665	-0.015	0.3104	No
142	Map3k20	9790	-0.021	0.3045	No
143	Ewsr1	9821	-0.022	0.3035	No
144	Cul4a	9885	-0.023	0.3008	No
145	Dkc1	9956	-0.026	0.2978	No
146	Srsf10	10011	-0.029	0.2957	No
147	Bub3	10190	-0.037	0.2875	No
148	Knl1	10262	-0.040	0.2848	No
149	Srsf2	10410	-0.047	0.2784	No
150	Pura	10434	-0.047	0.2782	No
151	Prim2	10436	-0.047	0.2792	No
152	Cdc25b	10686	-0.057	0.2679	No
153	Ube2c	10781	-0.061	0.2644	No
154	Mapk14	10785	-0.061	0.2656	No
155	Hmgb3	10857	-0.064	0.2634	No
156	Foxn3	10860	-0.065	0.2647	No
157	Pds5b	11026	-0.071	0.2579	No
158	Ccnb2	11121	-0.074	0.2547	No
159	Traip	11190	-0.077	0.2529	No
160	Hus1	11218	-0.078	0.2532	No
161	Brca2	11313	-0.082	0.2502	No
162	Efna5	11689	-0.098	0.2334	No
163	Slc12a2	11703	-0.099	0.2348	No
164	Ezh2	12048	-0.114	0.2199	No
165	Fbxo5	12052	-0.115	0.2222	No
166	Pml	12212	-0.120	0.2167	No
167	Pola2	12311	-0.124	0.2144	No
168	Rps6ka5	12462	-0.132	0.2097	No
169	Meis1	12567	-0.138	0.2074	No
170	Nusap1	12710	-0.144	0.2033	No
171	Mnat1	12714	-0.144	0.2062	No
172	Cdc20	12882	-0.152	0.2010	No
173	Orc6	12973	-0.156	0.1998	No
174	Hmga1b	13194	-0.165	0.1922	No
175	Nup50	13222	-0.166	0.1944	No
176	Pole	13251	-0.167	0.1966	No
177	Tgfb1	13944	-0.199	0.1659	No
178	Mad2l1	13956	-0.200	0.1696	No
179	Rasal2	14299	-0.218	0.1570	No
180	E2f1	14569	-0.230	0.1483	No
181	Katna1	14588	-0.231	0.1524	No
182	Dmd	15238	-0.264	0.1253	No
183	Cbx1	15306	-0.266	0.1276	No
184	Dtymk	15637	-0.285	0.1170	No
185	H2ax	15768	-0.293	0.1167	No
186	Meis2	15937	-0.303	0.1147	No
187	Cdk4	16515	-0.333	0.0927	No
188	H2az2	17058	-0.368	0.0732	No
189	Myc	17216	-0.379	0.0733	No
190	Egf	17727	-0.419	0.0565	No
191	Cdkn3	18595	-0.503	0.0235	No
192	Marcks	19032	-0.566	0.0136	No
193	Stmn1	19564	-0.687	0.0015	No
194	Ccnd1	19976	-1.022	0.0025	No