Details for gene set HALLMARK

Table: GSEA Results Summary

Dataset	GMP.GMP.neu_Pheno.cls #Group2_versus_Group3.GMP.neu_Pheno.cls #Group2_versus_Group3_repos
Phenotype	GMP.neu_Pheno.cls#Group2_versus_Group3_repos
Upregulated in class	1
GeneSet	HALLMARK_ADIPOGENESIS
Enrichment Score (ES)	0.18104494
Normalized Enrichment Score (NES)	0.83984
Nominal p-value	0.64853555
FDR q-value	0.9166462
FWER p-Value	0.999

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Abca1	76	0.792	0.0147	Yes
2	Apoe	133	0.708	0.0285	Yes
3	Grpel1	259	0.638	0.0371	Yes
4	Dnajb9	311	0.614	0.0489	Yes
5	Esyt1	891	0.480	0.0309	Yes
6	Acadl	1020	0.462	0.0353	Yes
7	Dld	1102	0.451	0.0418	Yes
8	Stom	1218	0.437	0.0462	Yes
9	Ywhag	1354	0.421	0.0493	Yes
10	Ubqln1	1501	0.406	0.0514	Yes
11	Chuk	1507	0.406	0.0607	Yes
12	Mrpl15	1631	0.396	0.0637	Yes
13	Col4a1	1678	0.392	0.0706	Yes
14	Cd151	1892	0.373	0.0686	Yes
15	Ptcd3	1897	0.373	0.0771	Yes
16	Ddt	2056	0.361	0.0776	Yes
17	Gadd45a	2075	0.360	0.0851	Yes
18	Mrap	2193	0.350	0.0874	Yes
19	Scp2	2260	0.344	0.0921	Yes
20	Aco2	2435	0.330	0.0910	Yes
21	Aldoa	2442	0.329	0.0984	Yes
22	Sorbs1	2522	0.323	0.1020	Yes
23	Ak2	2536	0.322	0.1089	Yes
24	Gphn	2700	0.312	0.1080	Yes
25	Acads	2726	0.310	0.1140	Yes
26	Agpat3	2845	0.302	0.1151	Yes
27	Acly	2928	0.296	0.1179	Yes
28	Cdkn2c	2967	0.294	0.1228	Yes
29	Plin2	2978	0.293	0.1292	Yes
30	Acadm	2984	0.293	0.1358	Yes
31	Rmdn3	3139	0.282	0.1346	Yes
32	Preb	3392	0.269	0.1282	Yes
33	Ppp1r15b	3394	0.269	0.1345	Yes
34	Suclg1	3467	0.266	0.1371	Yes
35	Slc5a6	3646	0.256	0.1341	Yes
36	Hadh	3696	0.253	0.1375	Yes
37	Me1	3721	0.252	0.1422	Yes
38	Mtch2	3798	0.247	0.1442	Yes
39	Lpcat3	3877	0.243	0.1459	Yes
40	Fzd4	3881	0.243	0.1515	Yes
41	Prdx3	4021	0.237	0.1500	Yes
42	Mccc1	4098	0.232	0.1516	Yes
43	Abcb8	4229	0.225	0.1503	Yes
44	Cd302	4268	0.223	0.1536	Yes
45	Cd36	4329	0.219	0.1557	Yes
46	Idh1	4465	0.212	0.1538	Yes
47	Enpp2	4469	0.212	0.1587	Yes
48	G3bp2	4550	0.209	0.1595	Yes
49	Tkt	4575	0.207	0.1631	Yes
50	Cmpk1	4627	0.205	0.1654	Yes
51	Uqcr11	4681	0.201	0.1674	Yes
52	Atp1b3	4723	0.198	0.1699	Yes
53	Cs	4733	0.197	0.1741	Yes
54	Retsat	4843	0.192	0.1731	Yes
55	Immt	4861	0.191	0.1767	Yes
56	Cox6a1	4884	0.190	0.1800	Yes
57	Gpat4	5008	0.187	0.1782	Yes
58	Atl2	5039	0.185	0.1810	Yes
59	Dhcr7	5476	0.164	0.1629	No
60	Dlat	5524	0.162	0.1643	No
61	Pemt	5542	0.161	0.1672	No
62	Nmt1	5566	0.160	0.1698	No
63	Ptger3	5658	0.156	0.1689	No
64	Idh3a	5673	0.155	0.1718	No
65	Pfkfb3	5694	0.154	0.1744	No
66	Ech1	5763	0.151	0.1745	No
67	Por	5863	0.147	0.1730	No
68	Lama4	5889	0.145	0.1751	No
69	Sod1	5950	0.143	0.1754	No
70	Gpd2	5980	0.141	0.1773	No
71	Bcl6	6103	0.136	0.1743	No
72	C3	6129	0.135	0.1762	No
73	Slc25a10	6404	0.123	0.1653	No
74	Aifm1	6564	0.118	0.1600	No
75	Adcy6	6854	0.107	0.1479	No
76	Ephx2	6926	0.104	0.1468	No
77	Pex14	7056	0.098	0.1426	No
78	Pim3	7089	0.096	0.1432	No
79	Ndufs3	7343	0.086	0.1325	No
80	Etfb	7382	0.085	0.1325	No
81	Acox1	7577	0.075	0.1245	No
82	Col15a1	8058	0.055	0.1016	No
83	Cpt2	8128	0.052	0.0993	No
84	Arl4a	8155	0.051	0.0992	No
85	Acaa2	8195	0.049	0.0984	No
86	Uqcr10	8257	0.046	0.0964	No
87	Sowahc	8391	0.040	0.0906	No
88	Phldb1	8477	0.037	0.0872	No
89	Gpam	8663	0.028	0.0785	No
90	Itih5	8761	0.023	0.0742	No
91	Uqcrq	8781	0.023	0.0738	No
92	Uqcrc1	8794	0.022	0.0737	No
93	Ppm1b	8803	0.021	0.0738	No
94	Dram2	8849	0.019	0.0720	No
95	Mylk	8878	0.018	0.0710	No
96	Esrra	8916	0.016	0.0695	No
97	Tank	9077	0.009	0.0616	No
98	Aplp2	9116	0.007	0.0599	No
99	Rtn3	9133	0.007	0.0592	No
100	Stat5a	9157	0.006	0.0582	No
101	Gpx4	9489	-0.007	0.0417	No
102	Mdh2	9585	-0.012	0.0372	No
103	Pfkl	9597	-0.012	0.0369	No
104	Scarb1	9656	-0.015	0.0343	No
105	Ccng2	9664	-0.015	0.0343	No
106	Bcl2l13	9703	-0.017	0.0328	No
107	Adipor2	9704	-0.017	0.0332	No
108	Gbe1	9826	-0.022	0.0277	No
109	Ubc	9909	-0.024	0.0241	No
110	Reep5	9961	-0.026	0.0221	No
111	Ghitm	10104	-0.033	0.0157	No
112	Riok3	10126	-0.034	0.0155	No
113	Dnajc15	10343	-0.044	0.0056	No
114	Ndufab1	10351	-0.044	0.0063	No
115	Dgat1	10401	-0.046	0.0049	No
116	Baz2a	10435	-0.047	0.0044	No
117	Sqor	10514	-0.051	0.0016	No
118	Qdpr	10532	-0.051	0.0020	No
119	Nkiras1	10822	-0.063	-0.0111	No
120	Rnf11	11312	-0.082	-0.0339	No
121	Nabp1	11393	-0.085	-0.0359	No
122	Slc1a5	11445	-0.087	-0.0364	No
123	Elovl6	11449	-0.088	-0.0345	No
124	Mgst3	11500	-0.090	-0.0349	No
125	Tst	11993	-0.112	-0.0571	No
126	Cox7b	12069	-0.115	-0.0582	No
127	Samm50	12221	-0.120	-0.0630	No
128	Map4k3	12226	-0.120	-0.0604	No
129	Chchd10	12247	-0.121	-0.0586	No
130	Pgm1	12638	-0.141	-0.0749	No
131	Jagn1	12696	-0.144	-0.0744	No
132	Fah	12720	-0.144	-0.0722	No
133	Ucp2	12859	-0.151	-0.0756	No
134	Rab34	13084	-0.160	-0.0832	No
135	Mtarc2	13104	-0.161	-0.0804	No
136	Decr1	13205	-0.166	-0.0816	No
137	Lifr	13213	-0.166	-0.0780	No
138	Crat	13451	-0.177	-0.0858	No
139	Araf	13550	-0.182	-0.0865	No
140	Ndufb7	13599	-0.184	-0.0846	No
141	Cat	13624	-0.185	-0.0815	No
142	Rreb1	13641	-0.186	-0.0779	No
143	Dbt	13662	-0.188	-0.0746	No
144	Bckdha	13696	-0.188	-0.0718	No
145	Slc25a1	14025	-0.203	-0.0836	No
146	Pdcd4	14270	-0.216	-0.0908	No
147	Sdhc	14283	-0.217	-0.0863	No
148	Cavin1	14435	-0.225	-0.0887	No
149	Itsn1	14513	-0.229	-0.0872	No
150	Coq5	14597	-0.232	-0.0860	No
151	Gpx3	14693	-0.237	-0.0852	No
152	Taldo1	15020	-0.253	-0.0957	No
153	Vegfb	15059	-0.254	-0.0917	No
154	Ltc4s	15290	-0.266	-0.0971	No
155	Miga2	15445	-0.274	-0.0984	No
156	Mgll	15484	-0.276	-0.0939	No
157	Slc27a1	15497	-0.277	-0.0880	No
158	Cmbl	15558	-0.281	-0.0844	No
159	Aldh2	16010	-0.307	-0.1000	No
160	Lpl	16030	-0.308	-0.0937	No
161	Dhrs7b	16412	-0.328	-0.1052	No
162	Slc19a1	16476	-0.332	-0.1007	No
163	Ifngr1	16526	-0.334	-0.0953	No
164	Cox8a	16555	-0.335	-0.0889	No
165	Hibch	16645	-0.341	-0.0854	No
166	Echs1	17185	-0.377	-0.1037	No
167	Cyp4b1	17554	-0.403	-0.1129	No
168	Reep6	17560	-0.403	-0.1037	No
169	Ndufa5	17561	-0.404	-0.0942	No
170	Phyh	17563	-0.404	-0.0848	No
171	Dhrs7	17859	-0.430	-0.0896	No
172	Sult1a1	17986	-0.442	-0.0856	No
173	Sdhb	18021	-0.445	-0.0769	No
174	Coq9	18032	-0.446	-0.0670	No
175	Uck1	18048	-0.447	-0.0573	No
176	Omd	18126	-0.454	-0.0506	No
177	Coq3	18144	-0.456	-0.0407	No
178	Tob1	18354	-0.477	-0.0401	No
179	Elmod3	18580	-0.500	-0.0397	No
180	Pparg	18626	-0.507	-0.0302	No
181	Cyc1	18902	-0.544	-0.0313	No
182	Idh3g	18917	-0.547	-0.0192	No
183	Lipe	19505	-0.670	-0.0331	No
184	Angptl4	19515	-0.673	-0.0178	No
185	Angpt1	19764	-0.790	-0.0118	No
186	Cavin2	19983	-1.067	0.0022	No