Details for gene set HALLMARK_TNFA_SIGNALING_VIA

Table: GSEA Results Summary

Dataset	GMP.GMP.neu_Pheno.cls #Group1_versus_Group4.GMP.neu_Pheno.cls #Group1_versus_Group4_repos
Phenotype	GMP.neu_Pheno.cls#Group1_versus_Group4_repos
Upregulated in class	0
GeneSet	HALLMARK_TNFA_SIGNALING_VIA_NFKB
Enrichment Score (ES)	0.18799166
Normalized Enrichment Score (NES)	0.7932709
Nominal p-value	0.8635514
FDR q-value	1.0
FWER p-Value	1.0

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Gpr183	87	0.954	0.0183	Yes
2	F3	97	0.928	0.0400	Yes
3	Tnfaip3	134	0.861	0.0587	Yes
4	Klf4	201	0.806	0.0746	Yes
5	Egr2	335	0.724	0.0851	Yes
6	Jun	723	0.587	0.0796	Yes
7	Ldlr	747	0.582	0.0923	Yes
8	Tnfaip6	837	0.562	0.1012	Yes
9	Birc2	915	0.541	0.1102	Yes
10	Irf1	926	0.538	0.1225	Yes
11	Gem	956	0.533	0.1338	Yes
12	Tlr2	1108	0.512	0.1384	Yes
13	Spsb1	1269	0.491	0.1420	Yes
14	Tnf	1411	0.465	0.1460	Yes
15	Rhob	1625	0.437	0.1457	Yes
16	Bhlhe40	2042	0.400	0.1343	Yes
17	Jag1	2186	0.389	0.1363	Yes
18	Egr1	2270	0.382	0.1413	Yes
19	Il7r	2307	0.380	0.1485	Yes
20	Nfkbie	2725	0.344	0.1357	Yes
21	Tiparp	2952	0.330	0.1321	Yes
22	Klf6	2994	0.329	0.1379	Yes
23	Marcks	3012	0.327	0.1449	Yes
24	Dennd5a	3085	0.321	0.1489	Yes
25	Tubb2a	3136	0.317	0.1539	Yes
26	Sgk1	3161	0.314	0.1602	Yes
27	Ets2	3198	0.311	0.1658	Yes
28	Btg2	3254	0.306	0.1703	Yes
29	Klf10	3281	0.304	0.1762	Yes
30	Cxcl10	3290	0.303	0.1830	Yes
31	Nfkbia	3465	0.291	0.1812	Yes
32	Gch1	3504	0.288	0.1861	Yes
33	Ccnd1	3786	0.272	0.1785	Yes
34	Atp2b1	3854	0.268	0.1815	Yes
35	Ppp1r15a	3971	0.264	0.1819	Yes
36	B4galt5	4014	0.262	0.1861	Yes
37	Ripk2	4176	0.252	0.1840	Yes
38	Ehd1	4268	0.246	0.1852	Yes
39	Plaur	4329	0.242	0.1880	Yes
40	Dusp4	4521	0.233	0.1839	No
41	Id2	4581	0.233	0.1865	No
42	F2rl1	4728	0.224	0.1845	No
43	Traf1	4825	0.221	0.1849	No
44	Cebpb	5204	0.202	0.1707	No
45	Tap1	5342	0.195	0.1684	No
46	Yrdc	5408	0.191	0.1697	No
47	Ccrl2	5430	0.190	0.1732	No
48	Tnip1	5474	0.187	0.1755	No
49	Il6st	5708	0.175	0.1679	No
50	Sod2	5735	0.174	0.1707	No
51	Il18	5745	0.173	0.1744	No
52	Ier2	5810	0.170	0.1752	No
53	Zfp36	5867	0.167	0.1764	No
54	Nr4a1	5972	0.162	0.1750	No
55	Cebpd	5982	0.161	0.1784	No
56	Plpp3	6109	0.154	0.1757	No
57	Mcl1	6248	0.154	0.1724	No
58	Litaf	6312	0.151	0.1728	No
59	Vegfa	6406	0.147	0.1717	No
60	Zbtb10	6467	0.145	0.1721	No
61	Gadd45b	6726	0.133	0.1623	No
62	Plk2	6740	0.132	0.1647	No
63	B4galt1	7079	0.117	0.1505	No
64	Inhba	7142	0.114	0.1501	No
65	Birc3	7497	0.100	0.1347	No
66	Nr4a2	7555	0.098	0.1341	No
67	Kdm6b	7573	0.097	0.1356	No
68	G0s2	7600	0.096	0.1366	No
69	Dusp2	7602	0.096	0.1388	No
70	Ccnl1	7649	0.093	0.1387	No
71	Nampt	7667	0.092	0.1400	No
72	Plek	7674	0.092	0.1419	No
73	Pde4b	7724	0.089	0.1415	No
74	Olr1	7808	0.086	0.1394	No
75	Maff	7828	0.085	0.1405	No
76	Plau	8058	0.076	0.1307	No
77	Bcl6	8169	0.070	0.1269	No
78	Phlda1	8173	0.070	0.1284	No
79	Rel	8213	0.069	0.1281	No
80	Klf2	8428	0.060	0.1187	No
81	Ifit2	8765	0.047	0.1029	No
82	Fos	8800	0.045	0.1023	No
83	Map2k3	9039	0.036	0.0912	No
84	Bcl3	9169	0.031	0.0854	No
85	Pdlim5	9267	0.027	0.0812	No
86	Btg3	9322	0.024	0.0790	No
87	Fosl2	9394	0.023	0.0760	No
88	Zc3h12a	9467	0.020	0.0729	No
89	Fjx1	9507	0.019	0.0713	No
90	Cd80	9620	0.014	0.0660	No
91	Pfkfb3	9646	0.013	0.0651	No
92	Cd69	9767	0.009	0.0593	No
93	Dusp1	9866	0.005	0.0545	No
94	Slc2a3	9932	0.002	0.0512	No
95	Per1	9959	0.002	0.0500	No
96	Nfe2l2	9981	0.001	0.0489	No
97	Lamb3	10184	-0.001	0.0388	No
98	Smad3	10394	-0.009	0.0285	No
99	Trib1	10888	-0.027	0.0043	No
100	Rnf19b	10947	-0.030	0.0021	No
101	Sphk1	10991	-0.032	0.0007	No
102	Ier5	11094	-0.036	-0.0036	No
103	Cflar	11097	-0.036	-0.0029	No
104	Cd44	11127	-0.038	-0.0034	No
105	Nfil3	11684	-0.059	-0.0300	No
106	Dnajb4	11768	-0.063	-0.0327	No
107	Hbegf	11840	-0.066	-0.0347	No
108	Nfkb2	11902	-0.068	-0.0361	No
109	Klf9	11932	-0.069	-0.0360	No
110	Serpinb2	11962	-0.070	-0.0357	No
111	Serpinb8	12267	-0.082	-0.0491	No
112	Tnc	12362	-0.086	-0.0518	No
113	Irs2	13128	-0.116	-0.0875	No
114	Tnip2	13469	-0.129	-0.1016	No
115	Dusp5	13491	-0.129	-0.0996	No
116	Rigi	13645	-0.135	-0.1041	No
117	Rela	13711	-0.138	-0.1040	No
118	Sqstm1	13713	-0.138	-0.1008	No
119	Gadd45a	13913	-0.148	-0.1073	No
120	Icosl	14255	-0.162	-0.1206	No
121	Nfkb1	14256	-0.162	-0.1168	No
122	Slc16a6	14257	-0.162	-0.1129	No
123	Tank	14341	-0.166	-0.1131	No
124	Gfpt2	14368	-0.167	-0.1104	No
125	Atf3	14386	-0.168	-0.1073	No
126	Sat1	14557	-0.176	-0.1116	No
127	Relb	14653	-0.181	-0.1121	No
128	Tnfaip8	14722	-0.185	-0.1111	No
129	Ninj1	14837	-0.190	-0.1124	No
130	Fut4	14963	-0.197	-0.1139	No
131	Ptgs2	15375	-0.213	-0.1296	No
132	Socs3	15473	-0.218	-0.1293	No
133	Ptpre	15820	-0.233	-0.1411	No
134	Tnfsf9	16049	-0.247	-0.1467	No
135	Slc2a6	16125	-0.252	-0.1445	No
136	Pnrc1	16346	-0.265	-0.1493	No
137	Panx1	16367	-0.266	-0.1439	No
138	Clcf1	16374	-0.267	-0.1379	No
139	Tsc22d1	16455	-0.271	-0.1355	No
140	Fosb	16589	-0.277	-0.1356	No
141	Il15ra	16594	-0.278	-0.1291	No
142	Nfat5	16838	-0.291	-0.1345	No
143	Trip10	16903	-0.295	-0.1307	No
144	Myc	16912	-0.295	-0.1240	No
145	Mxd1	17073	-0.304	-0.1248	No
146	Rcan1	17169	-0.310	-0.1222	No
147	Btg1	17353	-0.319	-0.1238	No
148	Tgif1	17367	-0.321	-0.1169	No
149	Ifngr2	17526	-0.330	-0.1170	No
150	Tnfrsf9	17608	-0.335	-0.1131	No
151	Ptger4	17668	-0.340	-0.1079	No
152	Nr4a3	17745	-0.348	-0.1035	No
153	Dram1	17780	-0.350	-0.0968	No
154	Junb	17922	-0.361	-0.0953	No
155	Ifih1	18062	-0.372	-0.0935	No
156	Stat5a	18136	-0.379	-0.0881	No
157	Snn	18316	-0.396	-0.0877	No
158	Bcl2a1d	18601	-0.419	-0.0920	No
159	Kynu	18694	-0.428	-0.0865	No
160	Fosl1	18964	-0.466	-0.0889	No
161	Eif1	19165	-0.498	-0.0871	No
162	Tnfaip2	19270	-0.522	-0.0799	No
163	Pmepa1	19297	-0.525	-0.0687	No
164	Cdkn1a	19559	-0.586	-0.0679	No
165	Icam1	19617	-0.601	-0.0565	No
166	Ier3	19821	-0.685	-0.0504	No
167	Abca1	19894	-0.754	-0.0360	No
168	Csf1	19963	-0.856	-0.0191	No
169	Map3k8	19986	-0.932	0.0020	No