Details for gene set HALLMARK_APICAL

Table: GSEA Results Summary

Dataset	GMP.GMP.neu_Pheno.cls #Group1_versus_Group4.GMP.neu_Pheno.cls #Group1_versus_Group4_repos
Phenotype	GMP.neu_Pheno.cls#Group1_versus_Group4_repos
Upregulated in class	0
GeneSet	HALLMARK_APICAL_JUNCTION
Enrichment Score (ES)	0.17157568
Normalized Enrichment Score (NES)	0.8437473
Nominal p-value	0.8687259
FDR q-value	1.0
FWER p-Value	1.0

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Insig1	320	0.732	0.0051	Yes
2	Myh9	574	0.625	0.0105	Yes
3	Egfr	713	0.588	0.0206	Yes
4	Actn1	798	0.570	0.0329	Yes
5	Nectin4	1032	0.521	0.0363	Yes
6	Irs1	1111	0.512	0.0472	Yes
7	Cldn14	1262	0.492	0.0539	Yes
8	Ldlrap1	1345	0.474	0.0635	Yes
9	Amh	1850	0.419	0.0503	Yes
10	Bmp1	1914	0.414	0.0591	Yes
11	Pten	1941	0.410	0.0697	Yes
12	Kcnh2	1974	0.407	0.0799	Yes
13	Cdh8	2073	0.398	0.0865	Yes
14	Rasa1	2114	0.396	0.0959	Yes
15	Dhx16	2257	0.384	0.0999	Yes
16	Adra1b	2362	0.374	0.1055	Yes
17	Itgb4	2363	0.373	0.1163	Yes
18	Alox8	2411	0.370	0.1247	Yes
19	Vcan	2417	0.369	0.1351	Yes
20	Vcl	2708	0.346	0.1305	Yes
21	Cap1	2762	0.340	0.1377	Yes
22	Cdk8	2768	0.339	0.1473	Yes
23	Shroom2	3195	0.311	0.1349	Yes
24	Itga9	3294	0.303	0.1387	Yes
25	Ikbkg	3367	0.298	0.1437	Yes
26	Akt2	3780	0.272	0.1309	Yes
27	Cntn1	3868	0.268	0.1343	Yes
28	Itga10	4009	0.262	0.1348	Yes
29	Cdh11	4081	0.258	0.1387	Yes
30	Ctnna1	4099	0.256	0.1453	Yes
31	Jam3	4506	0.234	0.1317	Yes
32	Msn	4623	0.230	0.1325	Yes
33	Adam23	4732	0.224	0.1335	Yes
34	Actn3	4822	0.221	0.1355	Yes
35	Traf1	4825	0.221	0.1418	Yes
36	Map3k20	5014	0.213	0.1385	Yes
37	Pkd1	5021	0.213	0.1444	Yes
38	Mapk13	5121	0.207	0.1454	Yes
39	Pals1	5123	0.207	0.1513	Yes
40	Evl	5167	0.204	0.1551	Yes
41	Ywhah	5183	0.204	0.1603	Yes
42	Itgb1	5308	0.197	0.1597	Yes
43	Col17a1	5309	0.197	0.1654	Yes
44	Adam15	5417	0.191	0.1656	Yes
45	Actn2	5786	0.171	0.1520	Yes
46	Mpzl1	5791	0.171	0.1567	Yes
47	Nrap	5836	0.169	0.1594	Yes
48	Plcg1	5880	0.166	0.1621	Yes
49	Src	5892	0.166	0.1663	Yes
50	Arhgef6	6105	0.154	0.1601	Yes
51	Vcam1	6117	0.154	0.1641	Yes
52	Nfasc	6137	0.154	0.1676	Yes
53	Parva	6147	0.154	0.1716	Yes
54	Itga3	6361	0.148	0.1652	No
55	Amigo1	6577	0.140	0.1584	No
56	Vasp	6702	0.134	0.1561	No
57	Mmp2	6720	0.133	0.1591	No
58	Tubg1	6794	0.129	0.1591	No
59	Actn4	6836	0.127	0.1607	No
60	Gnai2	6994	0.121	0.1563	No
61	Tmem8b	7008	0.120	0.1592	No
62	B4galt1	7079	0.117	0.1590	No
63	Gtf2f1	7202	0.112	0.1562	No
64	Mvd	7245	0.110	0.1572	No
65	Hras	7461	0.101	0.1494	No
66	Ctnnd1	7824	0.085	0.1336	No
67	Shc1	7881	0.082	0.1332	No
68	Nectin2	8034	0.077	0.1277	No
69	Cldn15	8232	0.068	0.1198	No
70	Baiap2	8242	0.068	0.1213	No
71	Inppl1	8301	0.065	0.1203	No
72	Actb	8364	0.063	0.1190	No
73	Wasl	8378	0.062	0.1201	No
74	Mapk14	8385	0.062	0.1216	No
75	Pard6g	8563	0.053	0.1143	No
76	Cdh1	8575	0.053	0.1152	No
77	Vav2	8781	0.046	0.1062	No
78	Dlg1	9036	0.036	0.0945	No
79	Nf2	9158	0.031	0.0893	No
80	Sirpa	9307	0.025	0.0826	No
81	Map4k2	9351	0.024	0.0811	No
82	Cd86	9398	0.023	0.0795	No
83	Tjp1	9470	0.020	0.0765	No
84	Calb2	9496	0.019	0.0758	No
85	Tial1	9521	0.019	0.0751	No
86	Actg1	9535	0.018	0.0750	No
87	Nectin1	9730	0.010	0.0655	No
88	Nlgn2	9814	0.007	0.0615	No
89	Mdk	9828	0.007	0.0611	No
90	Akt3	9848	0.006	0.0603	No
91	Taok2	9994	0.000	0.0530	No
92	Cx3cl1	10035	0.000	0.0510	No
93	Gnai1	10064	0.000	0.0496	No
94	Myl9	10069	0.000	0.0494	No
95	Lamb3	10184	-0.001	0.0436	No
96	Sgce	10224	-0.003	0.0418	No
97	Nf1	10258	-0.004	0.0402	No
98	Skap2	10506	-0.013	0.0282	No
99	Zyx	10598	-0.017	0.0241	No
100	Wnk4	11022	-0.033	0.0037	No
101	Negr1	11070	-0.035	0.0024	No
102	Adam9	11198	-0.041	-0.0028	No
103	Itga2	11298	-0.044	-0.0065	No
104	Col16a1	11523	-0.053	-0.0163	No
105	Adamts5	11557	-0.055	-0.0163	No
106	Pik3cb	11903	-0.068	-0.0317	No
107	Icam4	12284	-0.083	-0.0484	No
108	Icam2	12289	-0.083	-0.0462	No
109	Crat	12595	-0.096	-0.0588	No
110	Thbs3	12605	-0.097	-0.0564	No
111	Rac2	12669	-0.100	-0.0567	No
112	Pbx2	12860	-0.107	-0.0632	No
113	Slit2	13255	-0.120	-0.0795	No
114	Cadm3	13413	-0.127	-0.0837	No
115	Cadm2	13439	-0.128	-0.0813	No
116	Ptk2	13473	-0.129	-0.0792	No
117	Sympk	13505	-0.130	-0.0770	No
118	Rhof	13511	-0.130	-0.0735	No
119	Nrxn2	13619	-0.134	-0.0750	No
120	Nrtn	13632	-0.135	-0.0717	No
121	Epb41l2	13802	-0.143	-0.0760	No
122	Tsc1	14138	-0.157	-0.0883	No
123	Exoc4	14558	-0.176	-0.1043	No
124	Ptprc	14562	-0.177	-0.0994	No
125	Myh10	14571	-0.177	-0.0946	No
126	Arpc2	14616	-0.179	-0.0916	No
127	Rsu1	14675	-0.182	-0.0893	No
128	Gamt	14796	-0.188	-0.0899	No
129	Pfn1	14996	-0.199	-0.0941	No
130	Syk	15172	-0.207	-0.0969	No
131	Amigo2	15442	-0.217	-0.1042	No
132	Lama3	15482	-0.219	-0.0998	No
133	Stx4a	15530	-0.219	-0.0958	No
134	Nexn	15570	-0.221	-0.0914	No
135	Rras	15779	-0.231	-0.0951	No
136	Nectin3	15908	-0.238	-0.0947	No
137	Atp1a3	16032	-0.245	-0.0938	No
138	Icam5	16127	-0.252	-0.0912	No
139	Myl12b	16748	-0.285	-0.1141	No
140	Tspan4	17012	-0.301	-0.1186	No
141	Nlgn3	17126	-0.308	-0.1154	No
142	Pecam1	17650	-0.339	-0.1319	No
143	Tgfbi	17667	-0.340	-0.1228	No
144	Vwf	17827	-0.354	-0.1206	No
145	Cd274	17939	-0.362	-0.1157	No
146	Cercam	17970	-0.365	-0.1066	No
147	Fbn1	18163	-0.382	-0.1052	No
148	Cdh6	18493	-0.408	-0.1099	No
149	Cd34	18511	-0.409	-0.0989	No
150	Cnn2	18552	-0.415	-0.0889	No
151	Pik3r3	18684	-0.427	-0.0831	No
152	Jup	18727	-0.433	-0.0727	No
153	Layn	18739	-0.434	-0.0606	No
154	Lima1	18900	-0.458	-0.0554	No
155	Thy1	19430	-0.554	-0.0660	No
156	Hadh	19513	-0.574	-0.0535	No
157	Icam1	19617	-0.601	-0.0412	No
158	Sorbs3	19808	-0.676	-0.0312	No
159	Sdc3	19848	-0.703	-0.0128	No
160	Cdh4	19889	-0.748	0.0069	No