Details for gene set HALLMARK_PROTEIN

Table: GSEA Results Summary

Dataset	GMP.GMP.neu_Pheno.cls #Group1_versus_Group3.GMP.neu_Pheno.cls #Group1_versus_Group3_repos
Phenotype	GMP.neu_Pheno.cls#Group1_versus_Group3_repos
Upregulated in class	0
GeneSet	HALLMARK_PROTEIN_SECRETION
Enrichment Score (ES)	0.13805515
Normalized Enrichment Score (NES)	0.66403735
Nominal p-value	0.8816794
FDR q-value	1.0
FWER p-Value	1.0

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Egfr	460	0.588	0.0115	Yes
2	Stx12	518	0.577	0.0426	Yes
3	Abca1	1124	0.444	0.0384	Yes
4	Atp1a1	1559	0.389	0.0396	Yes
5	Cltc	1627	0.382	0.0587	Yes
6	Kif1b	1720	0.372	0.0760	Yes
7	Galc	1892	0.355	0.0884	Yes
8	Anp32e	2176	0.332	0.0937	Yes
9	Arfgef2	2256	0.327	0.1090	Yes
10	Napa	3083	0.265	0.0831	Yes
11	Igf2r	3142	0.262	0.0956	Yes
12	Rab22a	3733	0.227	0.0794	Yes
13	Mapk1	3922	0.218	0.0828	Yes
14	Cog2	3924	0.218	0.0956	Yes
15	Zw10	4025	0.216	0.1033	Yes
16	Ppt1	4203	0.209	0.1067	Yes
17	Copb1	4372	0.200	0.1101	Yes
18	Ap1g1	4565	0.192	0.1117	Yes
19	Lman1	4585	0.191	0.1220	Yes
20	Bnip3	4698	0.185	0.1273	Yes
21	Ap3b1	5162	0.165	0.1137	Yes
22	Arfgef1	5233	0.161	0.1197	Yes
23	Dop1a	5423	0.154	0.1193	Yes
24	Adam10	5585	0.147	0.1198	Yes
25	Atp6v1h	5586	0.147	0.1285	Yes
26	Sgms1	6146	0.123	0.1077	Yes
27	Snx2	6180	0.122	0.1132	Yes
28	Napg	6330	0.116	0.1125	Yes
29	Golga4	6338	0.115	0.1190	Yes
30	Tpd52	6366	0.114	0.1243	Yes
31	Ykt6	6473	0.110	0.1255	Yes
32	Lamp2	6568	0.106	0.1270	Yes
33	Yipf6	6595	0.105	0.1319	Yes
34	Sec31a	6709	0.100	0.1322	Yes
35	Copb2	6740	0.099	0.1365	Yes
36	Mon2	6875	0.095	0.1353	Yes
37	Arf1	6933	0.093	0.1379	Yes
38	M6pr	7036	0.089	0.1381	Yes
39	Cope	7150	0.084	0.1373	No
40	Ap2s1	7267	0.080	0.1362	No
41	Vamp4	7588	0.070	0.1243	No
42	Gosr2	7623	0.069	0.1266	No
43	Gla	7714	0.065	0.1259	No
44	Snap23	8008	0.053	0.1144	No
45	Clta	8046	0.052	0.1156	No
46	Dst	8302	0.042	0.1053	No
47	Stx16	8351	0.040	0.1052	No
48	Uso1	8432	0.037	0.1034	No
49	Vps4b	8467	0.036	0.1038	No
50	Ap2b1	8612	0.031	0.0984	No
51	Stx7	9195	0.011	0.0698	No
52	Vamp3	9802	-0.008	0.0399	No
53	Rab2a	10266	-0.024	0.0181	No
54	Arfip1	10337	-0.027	0.0162	No
55	Scamp3	10691	-0.040	0.0008	No
56	Rab5a	10846	-0.046	-0.0042	No
57	Dnm1l	10930	-0.049	-0.0055	No
58	Arcn1	10997	-0.051	-0.0058	No
59	Sec22b	12031	-0.088	-0.0525	No
60	Sh3gl2	12141	-0.092	-0.0525	No
61	Ocrl	12179	-0.093	-0.0489	No
62	Rab14	12394	-0.102	-0.0536	No
63	Gbf1	12499	-0.106	-0.0525	No
64	Tmed10	12558	-0.109	-0.0490	No
65	Scamp1	12737	-0.116	-0.0511	No
66	Bet1	13404	-0.140	-0.0763	No
67	Tmx1	13470	-0.142	-0.0712	No
68	Ap3s1	13874	-0.158	-0.0821	No
69	Ica1	13875	-0.158	-0.0728	No
70	Ergic3	13975	-0.162	-0.0683	No
71	Vps45	14141	-0.170	-0.0666	No
72	Pam	14380	-0.179	-0.0680	No
73	Tom1l1	14659	-0.189	-0.0708	No
74	Stam	14665	-0.189	-0.0599	No
75	Clcn3	14759	-0.194	-0.0532	No
76	Tsg101	14840	-0.198	-0.0455	No
77	Rab9	14984	-0.204	-0.0407	No
78	Ctsc	15400	-0.226	-0.0482	No
79	Sod1	15622	-0.236	-0.0454	No
80	Sec24d	15761	-0.242	-0.0381	No
81	Rps6ka3	15947	-0.251	-0.0326	No
82	Rer1	16592	-0.288	-0.0479	No
83	Krt18	16740	-0.295	-0.0379	No
84	Cln5	17287	-0.327	-0.0461	No
85	Atp7a	18368	-0.415	-0.0758	No
86	Cd63	18523	-0.430	-0.0582	No
87	Gnas	18533	-0.431	-0.0333	No
88	Tspan8	18663	-0.446	-0.0135	No
89	Cav2	18686	-0.448	0.0118	No
90	Ap2m1	18715	-0.452	0.0369	No
91	Arfgap3	19006	-0.489	0.0512	No