Details for gene set HALLMARK

Table: GSEA Results Summary

Dataset	GMP.GMP.neu_Pheno.cls #Group1_versus_Group2.GMP.neu_Pheno.cls #Group1_versus_Group2_repos
Phenotype	GMP.neu_Pheno.cls#Group1_versus_Group2_repos
Upregulated in class	0
GeneSet	HALLMARK_MYOGENESIS
Enrichment Score (ES)	0.2681559
Normalized Enrichment Score (NES)	1.0738947
Nominal p-value	0.30919766
FDR q-value	0.87588185
FWER p-Value	0.985

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Reep1	15	1.176	0.0314	Yes
2	Cnn3	47	1.011	0.0576	Yes
3	Igfbp7	56	0.987	0.0842	Yes
4	Myom1	210	0.790	0.0982	Yes
5	Bin1	217	0.786	0.1194	Yes
6	Ocel1	290	0.736	0.1359	Yes
7	Lpin1	417	0.685	0.1484	Yes
8	Eno3	612	0.621	0.1556	Yes
9	Pkia	832	0.565	0.1601	Yes
10	Actn2	892	0.554	0.1723	Yes
11	Gabarapl2	983	0.537	0.1824	Yes
12	Cd36	1179	0.507	0.1865	Yes
13	Aplnr	1531	0.465	0.1816	Yes
14	Sh3bgr	1535	0.464	0.1942	Yes
15	Cox7a1	1573	0.460	0.2049	Yes
16	Sgcd	1716	0.441	0.2098	Yes
17	Ncam1	1915	0.419	0.2113	Yes
18	Hdac5	2026	0.410	0.2170	Yes
19	Ctf1	2195	0.396	0.2194	Yes
20	Pygm	2381	0.381	0.2205	Yes
21	Kcnh2	2409	0.378	0.2295	Yes
22	Col4a2	2529	0.370	0.2337	Yes
23	Schip1	2688	0.358	0.2355	Yes
24	Gpx3	3262	0.316	0.2154	Yes
25	Col15a1	3423	0.305	0.2157	Yes
26	Mylpf	3427	0.305	0.2239	Yes
27	Prnp	3853	0.276	0.2101	Yes
28	Sh2b1	3874	0.275	0.2166	Yes
29	Smtn	3993	0.267	0.2179	Yes
30	Itgb4	4025	0.266	0.2237	Yes
31	Pcx	4028	0.266	0.2308	Yes
32	Mef2d	4077	0.263	0.2356	Yes
33	Myh11	4209	0.255	0.2360	Yes
34	Rit1	4251	0.252	0.2409	Yes
35	Myom2	4356	0.247	0.2424	Yes
36	Tnnt1	4403	0.245	0.2468	Yes
37	Ptp4a3	4428	0.244	0.2523	Yes
38	Pfkm	4445	0.243	0.2581	Yes
39	Cdh13	4448	0.243	0.2647	Yes
40	Nos1	4599	0.235	0.2636	Yes
41	Mapre3	4636	0.233	0.2682	Yes
42	Mef2c	4811	0.225	0.2656	No
43	Tnni2	4948	0.219	0.2647	No
44	Stc2	4999	0.217	0.2682	No
45	Nav2	5189	0.208	0.2643	No
46	Mras	5462	0.193	0.2560	No
47	Agrn	5624	0.184	0.2529	No
48	Fhl1	5732	0.179	0.2525	No
49	Svil	5766	0.178	0.2557	No
50	Ablim1	5772	0.177	0.2603	No
51	Akt2	5787	0.176	0.2644	No
52	Lama2	6150	0.160	0.2506	No
53	Agl	6234	0.157	0.2507	No
54	Ryr1	6255	0.156	0.2539	No
55	Tnnt3	6312	0.154	0.2553	No
56	Fgf2	6559	0.143	0.2469	No
57	Ankrd2	6866	0.130	0.2351	No
58	Erbb3	7131	0.119	0.2251	No
59	Atp2a1	7246	0.115	0.2225	No
60	Lsp1	7724	0.095	0.2011	No
61	Atp6ap1	7756	0.093	0.2021	No
62	Sirt2	7780	0.092	0.2034	No
63	Notch1	8040	0.082	0.1926	No
64	Csrp3	8460	0.066	0.1734	No
65	Acsl1	8570	0.062	0.1696	No
66	Pick1	8753	0.055	0.1619	No
67	Fdps	8832	0.052	0.1594	No
68	Camk2b	9025	0.044	0.1510	No
69	Dtna	9138	0.040	0.1465	No
70	Itgb5	9142	0.040	0.1474	No
71	Kcnh1	9315	0.033	0.1397	No
72	Large1	9469	0.027	0.1327	No
73	Sptan1	9636	0.021	0.1249	No
74	Dmd	9731	0.018	0.1207	No
75	Nqo1	9866	0.012	0.1143	No
76	Pde4dip	9867	0.012	0.1147	No
77	Myl4	9892	0.012	0.1138	No
78	Sparc	10257	0.000	0.0955	No
79	Flii	10578	-0.010	0.0796	No
80	Tsc2	10950	-0.023	0.0616	No
81	Sorbs3	11042	-0.026	0.0577	No
82	Gaa	11413	-0.039	0.0402	No
83	Klf5	11478	-0.041	0.0381	No
84	Dapk2	11482	-0.041	0.0391	No
85	Eif4a2	11539	-0.043	0.0374	No
86	Tpm2	11784	-0.053	0.0266	No
87	Actn3	12041	-0.061	0.0154	No
88	Adcy9	12286	-0.070	0.0051	No
89	Myoz1	12413	-0.075	0.0008	No
90	Rb1	12414	-0.075	0.0028	No
91	Myh9	12441	-0.076	0.0036	No
92	Bag1	12476	-0.077	0.0040	No
93	Gsn	12568	-0.081	0.0016	No
94	Tnnc1	12685	-0.085	-0.0019	No
95	Crat	12920	-0.093	-0.0111	No
96	Dmpk	13125	-0.101	-0.0186	No
97	Ppfia4	13228	-0.105	-0.0209	No
98	Mylk	13373	-0.110	-0.0251	No
99	Cryab	13679	-0.120	-0.0372	No
100	Itgb1	13693	-0.121	-0.0345	No
101	Tgfb1	13958	-0.131	-0.0442	No
102	Ifrd1	13964	-0.131	-0.0409	No
103	Mef2a	13971	-0.131	-0.0376	No
104	Myh8	14113	-0.137	-0.0409	No
105	Tpm3	14188	-0.140	-0.0408	No
106	Slc6a8	14740	-0.162	-0.0641	No
107	Psen2	14921	-0.170	-0.0685	No
108	Cdkn1a	15413	-0.189	-0.0880	No
109	Col1a1	15798	-0.206	-0.1016	No
110	Sphk1	15899	-0.210	-0.1009	No
111	Gnao1	15942	-0.211	-0.0972	No
112	Cfd	16094	-0.219	-0.0988	No
113	Sorbs1	16157	-0.222	-0.0958	No
114	Gja5	16211	-0.226	-0.0923	No
115	Mybpc3	16479	-0.239	-0.0992	No
116	Foxo4	16569	-0.242	-0.0970	No
117	Myl6b	16676	-0.248	-0.0956	No
118	Syngr2	16851	-0.258	-0.0973	No
119	Ak1	16923	-0.262	-0.0936	No
120	Pgam2	17197	-0.277	-0.0998	No
121	Tagln	17300	-0.283	-0.0972	No
122	Chrnb1	17438	-0.292	-0.0961	No
123	Cacna1h	17439	-0.292	-0.0881	No
124	Fst	17516	-0.297	-0.0838	No
125	Fkbp1b	17580	-0.302	-0.0787	No
126	Hbegf	17742	-0.313	-0.0782	No
127	Gadd45b	18116	-0.339	-0.0877	No
128	Tpd52l1	18173	-0.343	-0.0811	No
129	Igf1	18314	-0.355	-0.0784	No
130	Ckmt2	18473	-0.371	-0.0762	No
131	Plxnb2	18521	-0.375	-0.0683	No
132	Kifc3	18747	-0.398	-0.0687	No
133	Pdlim7	19174	-0.446	-0.0779	No
134	Myo1c	19418	-0.490	-0.0767	No
135	Bhlhe40	19475	-0.502	-0.0658	No
136	Adam12	19610	-0.540	-0.0577	No
137	App	19712	-0.570	-0.0472	No
138	Wwtr1	19749	-0.580	-0.0331	No
139	Clu	19846	-0.634	-0.0206	No
140	Ache	20017	-1.079	0.0005	No