Details for gene set HALLMARK_TNFA_SIGNALING_VIA

Table: GSEA Results Summary

Dataset	GMP.GMP.mono_Pheno.cls #Group6_versus_Group8.GMP.mono_Pheno.cls #Group6_versus_Group8_repos
Phenotype	GMP.mono_Pheno.cls#Group6_versus_Group8_repos
Upregulated in class	4
GeneSet	HALLMARK_TNFA_SIGNALING_VIA_NFKB
Enrichment Score (ES)	0.25960982
Normalized Enrichment Score (NES)	0.9413853
Nominal p-value	0.4951267
FDR q-value	0.6310188
FWER p-Value	0.999

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Klf4	187	0.909	0.0140	Yes
2	Serpinb2	403	0.739	0.0227	Yes
3	Il23a	604	0.680	0.0306	Yes
4	Irs2	800	0.604	0.0369	Yes
5	Pdlim5	811	0.601	0.0510	Yes
6	Tnfaip3	885	0.582	0.0620	Yes
7	Fosb	1034	0.563	0.0693	Yes
8	Plaur	1171	0.548	0.0767	Yes
9	Olr1	1445	0.519	0.0776	Yes
10	Tnfrsf9	1504	0.507	0.0874	Yes
11	Fosl2	1518	0.505	0.0991	Yes
12	Fos	1566	0.496	0.1091	Yes
13	Klf6	1571	0.495	0.1209	Yes
14	Cd80	1875	0.440	0.1186	Yes
15	Dusp4	1941	0.434	0.1263	Yes
16	Efna1	2014	0.425	0.1336	Yes
17	Gem	2047	0.423	0.1424	Yes
18	Dusp1	2053	0.421	0.1524	Yes
19	Ppp1r15a	2178	0.408	0.1570	Yes
20	Csf1	2350	0.401	0.1594	Yes
21	Phlda1	2447	0.396	0.1648	Yes
22	Per1	2456	0.396	0.1741	Yes
23	Mcl1	2526	0.390	0.1806	Yes
24	Panx1	2821	0.373	0.1770	Yes
25	Tnf	3059	0.357	0.1755	Yes
26	Rhob	3154	0.347	0.1799	Yes
27	Slc2a6	3328	0.331	0.1805	Yes
28	Jun	3385	0.324	0.1860	Yes
29	Atf3	3388	0.324	0.1938	Yes
30	Map2k3	3605	0.307	0.1920	Yes
31	Nr4a1	3611	0.306	0.1991	Yes
32	Zfp36	3650	0.303	0.2048	Yes
33	Ldlr	3699	0.300	0.2101	Yes
34	Bcl3	3915	0.286	0.2078	Yes
35	Maff	3999	0.281	0.2110	Yes
36	Tnfaip6	4162	0.271	0.2107	Yes
37	Tnfaip8	4234	0.266	0.2141	Yes
38	Inhba	4607	0.250	0.2043	Yes
39	Bcl2a1d	4671	0.249	0.2076	Yes
40	Klf2	4756	0.245	0.2100	Yes
41	Ccl5	4778	0.244	0.2150	Yes
42	Rela	4854	0.239	0.2176	Yes
43	Rcan1	5014	0.230	0.2163	Yes
44	Junb	5027	0.229	0.2214	Yes
45	Icosl	5040	0.228	0.2264	Yes
46	Fjx1	5114	0.225	0.2287	Yes
47	Clcf1	5299	0.222	0.2262	Yes
48	F3	5527	0.213	0.2217	Yes
49	B4galt5	5596	0.210	0.2239	Yes
50	Ehd1	5634	0.208	0.2273	Yes
51	Litaf	5728	0.203	0.2283	Yes
52	G0s2	5811	0.199	0.2296	Yes
53	Hes1	5816	0.199	0.2342	Yes
54	Ier3	5931	0.198	0.2342	Yes
55	Atp2b1	5956	0.197	0.2379	Yes
56	Slc16a6	5974	0.197	0.2419	Yes
57	Cebpd	5998	0.196	0.2457	Yes
58	Btg3	6049	0.194	0.2482	Yes
59	Map3k8	6054	0.193	0.2527	Yes
60	Plpp3	6126	0.190	0.2543	Yes
61	Tnip1	6153	0.189	0.2578	Yes
62	Birc2	6216	0.186	0.2596	Yes
63	Btg2	6512	0.174	0.2512	No
64	Ptgs2	6514	0.173	0.2554	No
65	Tnfsf9	6732	0.165	0.2501	No
66	Pfkfb3	6738	0.165	0.2539	No
67	Sod2	6749	0.165	0.2574	No
68	Gadd45a	7019	0.154	0.2497	No
69	Nr4a2	7027	0.153	0.2531	No
70	Cd44	7139	0.149	0.2519	No
71	Tnip2	7235	0.146	0.2514	No
72	Nfil3	7291	0.143	0.2525	No
73	Cd69	7539	0.134	0.2452	No
74	B4galt1	7927	0.121	0.2316	No
75	Plk2	8004	0.118	0.2313	No
76	Smad3	8080	0.116	0.2309	No
77	Klf9	8253	0.110	0.2262	No
78	Zc3h12a	8415	0.106	0.2219	No
79	Lamb3	8750	0.095	0.2099	No
80	Kdm6b	8803	0.093	0.2100	No
81	Stat5a	8982	0.088	0.2045	No
82	Egr1	9087	0.085	0.2021	No
83	Vegfa	9131	0.084	0.2023	No
84	Tank	9179	0.083	0.2023	No
85	Nfkb1	9196	0.082	0.2036	No
86	Rnf19b	9292	0.080	0.2015	No
87	Il6st	9350	0.078	0.2009	No
88	Rel	9424	0.075	0.1996	No
89	Ier2	9728	0.066	0.1883	No
90	Tiparp	10251	0.051	0.1673	No
91	Plau	10255	0.051	0.1684	No
92	Serpinb8	10541	0.043	0.1573	No
93	Egr2	10563	0.042	0.1574	No
94	Nfe2l2	10625	0.041	0.1558	No
95	Dram1	10666	0.040	0.1550	No
96	Ifngr2	10839	0.035	0.1486	No
97	Trib1	10978	0.031	0.1434	No
98	Nampt	10987	0.031	0.1438	No
99	Dnajb4	11046	0.029	0.1420	No
100	Tnc	11092	0.027	0.1408	No
101	Nfat5	11127	0.026	0.1400	No
102	Traf1	11171	0.025	0.1387	No
103	Ccnl1	11182	0.025	0.1389	No
104	Tubb2a	11814	0.006	0.1121	No
105	Yrdc	11832	0.006	0.1116	No
106	Sdc4	11841	0.006	0.1114	No
107	Fut4	11894	0.004	0.1092	No
108	Gfpt2	11903	0.003	0.1090	No
109	Ifih1	12463	-0.004	0.0852	No
110	Mxd1	12515	-0.005	0.0832	No
111	Cflar	12822	-0.013	0.0705	No
112	Nr4a3	12948	-0.017	0.0655	No
113	Sqstm1	13045	-0.019	0.0619	No
114	Nfkb2	13165	-0.022	0.0574	No
115	Plek	13175	-0.023	0.0575	No
116	Ripk2	13393	-0.029	0.0490	No
117	Lif	13538	-0.032	0.0436	No
118	Birc3	13770	-0.040	0.0347	No
119	Ptpre	13880	-0.043	0.0311	No
120	Ccnd1	13886	-0.043	0.0320	No
121	Ptger4	14247	-0.054	0.0179	No
122	Btg1	14408	-0.058	0.0125	No
123	Bhlhe40	14500	-0.060	0.0101	No
124	Dennd5a	14563	-0.062	0.0089	No
125	Il18	14744	-0.067	0.0029	No
126	Gch1	14797	-0.069	0.0023	No
127	Fosl1	14954	-0.074	-0.0025	No
128	Il15ra	15216	-0.083	-0.0117	No
129	Trip10	15264	-0.085	-0.0116	No
130	Ifit2	15691	-0.097	-0.0274	No
131	Eif1	16173	-0.113	-0.0452	No
132	Sat1	16498	-0.124	-0.0561	No
133	Tlr2	16654	-0.130	-0.0595	No
134	Tnfaip2	16675	-0.131	-0.0572	No
135	Cxcl10	16716	-0.132	-0.0557	No
136	Dusp5	16753	-0.133	-0.0540	No
137	Cebpb	17058	-0.144	-0.0635	No
138	Icam1	17106	-0.146	-0.0620	No
139	Pde4b	17530	-0.161	-0.0762	No
140	Irf1	17602	-0.164	-0.0752	No
141	Ier5	17758	-0.170	-0.0777	No
142	Sgk1	17998	-0.179	-0.0836	No
143	Il1b	18269	-0.188	-0.0906	No
144	Spsb1	18512	-0.198	-0.0961	No
145	Tsc22d1	18832	-0.210	-0.1046	No
146	Bcl6	18989	-0.218	-0.1060	No
147	Kynu	19005	-0.219	-0.1013	No
148	Pnrc1	19196	-0.226	-0.1039	No
149	Slc2a3	19242	-0.229	-0.1003	No
150	Jag1	19315	-0.232	-0.0978	No
151	F2rl1	19359	-0.234	-0.0940	No
152	Gadd45b	19571	-0.244	-0.0971	No
153	Pmepa1	19610	-0.246	-0.0927	No
154	Nfkbie	20088	-0.272	-0.1065	No
155	Ets2	20168	-0.277	-0.1032	No
156	Relb	20315	-0.286	-0.1025	No
157	Tgif1	20521	-0.295	-0.1041	No
158	Hbegf	20625	-0.302	-0.1012	No
159	Tap1	20864	-0.317	-0.1037	No
160	Dusp2	20960	-0.320	-0.1000	No
161	Id2	21177	-0.333	-0.1011	No
162	Ninj1	21327	-0.344	-0.0992	No
163	Gpr183	21330	-0.344	-0.0909	No
164	Rigi	21566	-0.359	-0.0923	No
165	Klf10	21586	-0.360	-0.0844	No
166	Sphk1	22086	-0.405	-0.0958	No
167	Il7r	22167	-0.415	-0.0892	No
168	Myc	22533	-0.459	-0.0937	No
169	Ccrl2	22628	-0.474	-0.0862	No
170	Nfkbia	22674	-0.479	-0.0766	No
171	Abca1	22949	-0.527	-0.0755	No
172	Cd83	23053	-0.545	-0.0667	No
173	Marcks	23173	-0.576	-0.0579	No
174	Snn	23278	-0.611	-0.0475	No
175	Cdkn1a	23508	-0.752	-0.0391	No
176	Zbtb10	23577	-0.888	-0.0205	No
177	Socs3	23587	-0.931	0.0016	No