Details for gene set HALLMARK

Table: GSEA Results Summary

Dataset	GMP.GMP.mono_Pheno.cls #Group6_versus_Group8.GMP.mono_Pheno.cls #Group6_versus_Group8_repos
Phenotype	GMP.mono_Pheno.cls#Group6_versus_Group8_repos
Upregulated in class	4
GeneSet	HALLMARK_HYPOXIA
Enrichment Score (ES)	0.2396129
Normalized Enrichment Score (NES)	1.0784916
Nominal p-value	0.3403042
FDR q-value	0.6485836
FWER p-Value	0.989

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Tgfbi	113	0.993	0.0219	Yes
2	Adora2b	264	0.828	0.0377	Yes
3	Gck	449	0.724	0.0494	Yes
4	Irs2	800	0.604	0.0507	Yes
5	Fbp1	853	0.590	0.0643	Yes
6	Tnfaip3	885	0.582	0.0786	Yes
7	Plaur	1171	0.548	0.0812	Yes
8	Tgfb3	1507	0.507	0.0806	Yes
9	Fosl2	1518	0.505	0.0937	Yes
10	Fos	1566	0.496	0.1051	Yes
11	Klf6	1571	0.495	0.1182	Yes
12	Efna1	2014	0.425	0.1108	Yes
13	Dusp1	2053	0.421	0.1205	Yes
14	Ppp1r15a	2178	0.408	0.1262	Yes
15	Sap30	2444	0.397	0.1255	Yes
16	Bgn	2705	0.380	0.1246	Yes
17	Hmox1	2812	0.374	0.1302	Yes
18	Stc2	3117	0.351	0.1266	Yes
19	Phkg1	3297	0.334	0.1280	Yes
20	Tgm2	3309	0.333	0.1365	Yes
21	Myh9	3364	0.327	0.1430	Yes
22	Jun	3385	0.324	0.1508	Yes
23	Atf3	3388	0.324	0.1595	Yes
24	Dtna	3558	0.310	0.1606	Yes
25	Zfp36	3650	0.303	0.1648	Yes
26	Ddit4	3654	0.303	0.1729	Yes
27	B3galt6	3756	0.297	0.1765	Yes
28	S100a4	3812	0.293	0.1821	Yes
29	Prdx5	3960	0.282	0.1834	Yes
30	Maff	3999	0.281	0.1893	Yes
31	Cavin3	4007	0.280	0.1966	Yes
32	Ndst2	4212	0.268	0.1951	Yes
33	Ldhc	4241	0.266	0.2010	Yes
34	Hs3st1	4487	0.257	0.1975	Yes
35	Ets1	4571	0.252	0.2007	Yes
36	Rragd	4620	0.250	0.2054	Yes
37	Tpd52	4711	0.248	0.2082	Yes
38	Pdgfb	4766	0.245	0.2125	Yes
39	Ext1	4791	0.243	0.2180	Yes
40	Vhl	4842	0.240	0.2223	Yes
41	Noct	4867	0.238	0.2277	Yes
42	Xpnpep1	4903	0.236	0.2326	Yes
43	Rora	4979	0.232	0.2356	Yes
44	Tktl1	5205	0.223	0.2320	Yes
45	Ero1a	5449	0.218	0.2275	Yes
46	Pfkl	5518	0.214	0.2303	Yes
47	F3	5527	0.213	0.2357	Yes
48	Dcn	5583	0.211	0.2391	Yes
49	Gpc1	5700	0.205	0.2396	Yes
50	Ier3	5931	0.198	0.2351	No
51	Pgm1	6024	0.194	0.2364	No
52	Large1	6099	0.192	0.2384	No
53	Fam162a	6395	0.178	0.2306	No
54	Map3k1	6530	0.173	0.2296	No
55	Tpst2	6576	0.171	0.2323	No
56	Pklr	6647	0.168	0.2338	No
57	Mxi1	6681	0.167	0.2369	No
58	Pfkfb3	6738	0.165	0.2389	No
59	Cavin1	7193	0.147	0.2235	No
60	Nfil3	7291	0.143	0.2232	No
61	Nedd4l	7299	0.143	0.2267	No
62	Lxn	7409	0.139	0.2258	No
63	Slc2a1	7619	0.131	0.2204	No
64	Cav1	7686	0.129	0.2211	No
65	Scarb1	8127	0.114	0.2054	No
66	Eno2	8186	0.112	0.2059	No
67	Ddit3	8311	0.109	0.2036	No
68	Gpc3	8313	0.109	0.2064	No
69	P4ha1	8342	0.108	0.2081	No
70	Aldoc	8369	0.107	0.2099	No
71	Pfkp	8439	0.105	0.2098	No
72	Jmjd6	8457	0.104	0.2119	No
73	Anxa2	8528	0.102	0.2116	No
74	Vegfa	9131	0.084	0.1882	No
75	Nr3c1	9293	0.080	0.1835	No
76	Hdlbp	9433	0.075	0.1796	No
77	Siah2	9454	0.074	0.1807	No
78	Ak4	9497	0.073	0.1809	No
79	Prkca	9838	0.063	0.1681	No
80	Kdm3a	9877	0.062	0.1682	No
81	Hk2	9924	0.061	0.1678	No
82	Tiparp	10251	0.051	0.1553	No
83	Ppfia4	10279	0.050	0.1555	No
84	Ugp2	10623	0.041	0.1420	No
85	Ampd3	10788	0.036	0.1359	No
86	Cxcr4	10882	0.034	0.1329	No
87	Rbpj	10886	0.034	0.1337	No
88	Pam	11058	0.028	0.1271	No
89	Isg20	11199	0.024	0.1218	No
90	Foxo3	11241	0.023	0.1207	No
91	Chst2	11252	0.022	0.1209	No
92	Hexa	11335	0.020	0.1179	No
93	Cdkn1b	11452	0.017	0.1134	No
94	P4ha2	11515	0.014	0.1111	No
95	Gys1	11530	0.014	0.1109	No
96	Zfp292	11680	0.010	0.1048	No
97	Pygm	11691	0.010	0.1047	No
98	Ilvbl	11769	0.008	0.1016	No
99	Gbe1	11795	0.007	0.1007	No
100	Hk1	11830	0.006	0.0994	No
101	Sdc4	11841	0.006	0.0991	No
102	Pgk1	11879	0.005	0.0977	No
103	Lox	12052	0.000	0.0904	No
104	Bcl2	12405	-0.003	0.0754	No
105	Eno3	12433	-0.003	0.0744	No
106	Nagk	12755	-0.011	0.0610	No
107	Atp7a	12758	-0.011	0.0612	No
108	Selenbp1	12801	-0.013	0.0597	No
109	Pdk1	12908	-0.016	0.0556	No
110	Gpi1	13256	-0.025	0.0415	No
111	Slc37a4	13390	-0.029	0.0366	No
112	Ids	13494	-0.031	0.0331	No
113	Slc6a6	13502	-0.032	0.0336	No
114	B4galnt2	13573	-0.033	0.0316	No
115	Hspa5	13744	-0.039	0.0254	No
116	Grhpr	13885	-0.043	0.0205	No
117	Ndst1	14155	-0.051	0.0104	No
118	Btg1	14408	-0.058	0.0013	No
119	Bhlhe40	14500	-0.060	-0.0010	No
120	Wsb1	14998	-0.076	-0.0202	No
121	Klf7	15027	-0.077	-0.0193	No
122	Pdk3	15319	-0.087	-0.0294	No
123	Pgm2	15329	-0.087	-0.0274	No
124	Glrx	15461	-0.091	-0.0305	No
125	Aldoa	15944	-0.105	-0.0483	No
126	Akap12	16113	-0.111	-0.0525	No
127	Gapdhs	16245	-0.115	-0.0550	No
128	Kdelr3	16389	-0.120	-0.0578	No
129	Mt1	16733	-0.133	-0.0689	No
130	Vldlr	16873	-0.137	-0.0711	No
131	Eno1b	17170	-0.148	-0.0798	No
132	Sdc3	17251	-0.151	-0.0791	No
133	Egfr	17262	-0.152	-0.0755	No
134	Kif5a	17264	-0.152	-0.0714	No
135	Slc2a5	17387	-0.156	-0.0724	No
136	Sdc2	17411	-0.157	-0.0692	No
137	Pgam2	17793	-0.171	-0.0808	No
138	Ppargc1a	18373	-0.192	-0.1003	No
139	Stbd1	18448	-0.196	-0.0982	No
140	Pim1	18467	-0.196	-0.0937	No
141	Errfi1	18655	-0.204	-0.0962	No
142	Chst3	18709	-0.206	-0.0930	No
143	Gaa	18733	-0.207	-0.0884	No
144	Pnrc1	19196	-0.226	-0.1020	No
145	Slc2a3	19242	-0.229	-0.0977	No
146	Bnip3l	19454	-0.238	-0.1003	No
147	Csrp2	19577	-0.244	-0.0990	No
148	Galk1	19729	-0.252	-0.0986	No
149	Plac8	20090	-0.272	-0.1067	No
150	Klhl24	20204	-0.279	-0.1040	No
151	Ccng2	20504	-0.294	-0.1088	No
152	Ldha	20626	-0.302	-0.1059	No
153	Tmem45a	20644	-0.303	-0.0984	No
154	Tpi1	20760	-0.310	-0.0950	No
155	Ankzf1	21168	-0.332	-0.1034	No
156	Cited2	21539	-0.357	-0.1096	No
157	Car12	21571	-0.359	-0.1013	No
158	Plin2	21714	-0.370	-0.0974	No
159	Mif	22110	-0.409	-0.1032	No
160	Cp	22156	-0.414	-0.0940	No
161	Ndrg1	22174	-0.416	-0.0836	No
162	Slc25a1	22210	-0.420	-0.0738	No
163	Tes	22223	-0.422	-0.0630	No
164	Col5a1	22303	-0.429	-0.0548	No
165	Angptl4	22374	-0.437	-0.0460	No
166	Cdkn1c	22581	-0.467	-0.0422	No
167	Gcnt2	22620	-0.473	-0.0312	No
168	Casp6	23313	-0.621	-0.0440	No
169	Sult2b1	23339	-0.630	-0.0281	No
170	Gpc4	23501	-0.743	-0.0150	No
171	Cdkn1a	23508	-0.752	0.0049	No