Details for gene set HALLMARK_APICAL

Table: GSEA Results Summary

Dataset	GMP.GMP.mono_Pheno.cls #Group6_versus_Group8.GMP.mono_Pheno.cls #Group6_versus_Group8_repos
Phenotype	GMP.mono_Pheno.cls#Group6_versus_Group8_repos
Upregulated in class	4
GeneSet	HALLMARK_APICAL_JUNCTION
Enrichment Score (ES)	0.2653619
Normalized Enrichment Score (NES)	1.2562987
Nominal p-value	0.08206107
FDR q-value	0.48329347
FWER p-Value	0.833

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Cntn1	54	1.146	0.0239	Yes
2	Itgb4	82	1.033	0.0463	Yes
3	Gamt	96	1.015	0.0690	Yes
4	Tgfbi	113	0.993	0.0910	Yes
5	Gnai1	158	0.940	0.1106	Yes
6	Tro	335	0.767	0.1206	Yes
7	Amh	352	0.762	0.1374	Yes
8	Dsc3	390	0.742	0.1528	Yes
9	Tjp1	662	0.657	0.1562	Yes
10	Cldn15	685	0.646	0.1700	Yes
11	Cdk8	751	0.621	0.1814	Yes
12	Adra1b	906	0.579	0.1881	Yes
13	Nectin1	1543	0.500	0.1724	Yes
14	Vcl	1588	0.492	0.1818	Yes
15	Vcan	1615	0.485	0.1918	Yes
16	Negr1	1746	0.460	0.1967	Yes
17	Cd276	1945	0.434	0.1982	Yes
18	Evl	2123	0.411	0.2000	Yes
19	Cx3cl1	2334	0.402	0.2003	Yes
20	Fscn1	2674	0.381	0.1945	Yes
21	Slc30a3	2704	0.380	0.2020	Yes
22	Msn	2882	0.367	0.2028	Yes
23	Vwf	2901	0.365	0.2104	Yes
24	Cercam	3284	0.335	0.2018	Yes
25	Nectin3	3338	0.329	0.2070	Yes
26	Myh9	3364	0.327	0.2134	Yes
27	Cdh6	3386	0.324	0.2199	Yes
28	Actg1	3417	0.322	0.2260	Yes
29	Jup	3427	0.321	0.2330	Yes
30	Pkd1	3471	0.317	0.2384	Yes
31	Nectin2	3568	0.309	0.2413	Yes
32	Actg2	3619	0.305	0.2462	Yes
33	Crat	3748	0.297	0.2475	Yes
34	Mpzl1	3784	0.295	0.2528	Yes
35	Adam9	3808	0.293	0.2585	Yes
36	Tubg1	3859	0.289	0.2630	Yes
37	Rac2	3956	0.283	0.2654	Yes
38	Jam3	4339	0.262	0.2551	No
39	Speg	4365	0.261	0.2600	No
40	Vav2	4600	0.250	0.2557	No
41	Crb3	4647	0.249	0.2594	No
42	Itga3	5166	0.225	0.2425	No
43	Flnc	5305	0.221	0.2416	No
44	Irs1	5342	0.220	0.2451	No
45	Taok2	5412	0.219	0.2472	No
46	Hras	5471	0.216	0.2497	No
47	Sirpa	5672	0.206	0.2459	No
48	Alox8	5814	0.199	0.2444	No
49	Adam15	6079	0.192	0.2375	No
50	Map3k20	6110	0.191	0.2406	No
51	Slit2	6134	0.189	0.2440	No
52	Epb41l2	6288	0.182	0.2416	No
53	Cap1	6582	0.171	0.2330	No
54	Baiap2	6662	0.167	0.2335	No
55	Akt3	6743	0.165	0.2338	No
56	Cdh1	6919	0.158	0.2300	No
57	Parva	7121	0.149	0.2248	No
58	Col16a1	7158	0.148	0.2266	No
59	Mapk14	7212	0.146	0.2277	No
60	Icam2	7379	0.140	0.2238	No
61	Nrxn2	7423	0.138	0.2252	No
62	Cd86	7436	0.138	0.2278	No
63	Exoc4	7542	0.134	0.2264	No
64	Lima1	7646	0.130	0.2250	No
65	Arhgef6	7688	0.129	0.2262	No
66	B4galt1	7927	0.121	0.2188	No
67	Dlg1	7950	0.120	0.2206	No
68	Layn	8073	0.116	0.2180	No
69	Cldn14	8577	0.100	0.1989	No
70	Skap2	8600	0.099	0.2002	No
71	Lamb3	8750	0.095	0.1960	No
72	Atp1a3	8911	0.090	0.1912	No
73	Pik3cb	9053	0.086	0.1872	No
74	Vcam1	9083	0.085	0.1879	No
75	Tsc1	9191	0.083	0.1852	No
76	Mapk11	9213	0.082	0.1862	No
77	Nf1	9616	0.070	0.1706	No
78	Nf2	9744	0.066	0.1667	No
79	Rasa1	9794	0.064	0.1661	No
80	Ctnna1	10025	0.058	0.1576	No
81	Syk	10166	0.054	0.1529	No
82	Myh10	10175	0.054	0.1538	No
83	Cadm2	10289	0.050	0.1501	No
84	Tial1	10472	0.045	0.1434	No
85	Itga2	10703	0.039	0.1344	No
86	Amigo2	10861	0.034	0.1285	No
87	Rsu1	10977	0.031	0.1243	No
88	Sorbs3	11005	0.030	0.1239	No
89	Sympk	11011	0.030	0.1243	No
90	Calb2	11145	0.026	0.1192	No
91	Traf1	11171	0.025	0.1188	No
92	Lama3	11202	0.024	0.1180	No
93	Mdk	11269	0.022	0.1157	No
94	Itga10	11487	0.015	0.1068	No
95	Dhx16	11531	0.014	0.1053	No
96	Inppl1	11615	0.012	0.1020	No
97	Fbn1	11707	0.009	0.0984	No
98	Wasl	11818	0.006	0.0938	No
99	Sgce	12334	-0.001	0.0719	No
100	Nlgn3	12369	-0.002	0.0704	No
101	Actn4	12535	-0.006	0.0635	No
102	Adamts5	12544	-0.006	0.0633	No
103	Akt2	12657	-0.009	0.0588	No
104	Ldlrap1	12734	-0.010	0.0558	No
105	Tspan4	12956	-0.017	0.0467	No
106	Vasp	13025	-0.018	0.0442	No
107	Col9a1	13147	-0.022	0.0396	No
108	Myl12b	13247	-0.025	0.0359	No
109	Stx4a	13267	-0.026	0.0357	No
110	Hadh	13279	-0.026	0.0358	No
111	Ywhah	13441	-0.030	0.0296	No
112	Pals1	13550	-0.033	0.0258	No
113	Cdh4	13904	-0.044	0.0117	No
114	Arpc2	13932	-0.045	0.0116	No
115	Src	14386	-0.057	-0.0064	No
116	Kcnh2	14493	-0.060	-0.0095	No
117	Map4k2	14516	-0.061	-0.0091	No
118	Nlgn2	14553	-0.062	-0.0092	No
119	Nfasc	14616	-0.064	-0.0104	No
120	Icam5	15294	-0.086	-0.0373	No
121	Ctnnd1	15513	-0.092	-0.0445	No
122	Ikbkg	15572	-0.094	-0.0448	No
123	Zyx	15723	-0.098	-0.0490	No
124	Pten	15814	-0.101	-0.0505	No
125	Nrap	16098	-0.110	-0.0601	No
126	Ptprc	16134	-0.111	-0.0590	No
127	Pecam1	16159	-0.112	-0.0575	No
128	Shc1	16391	-0.120	-0.0646	No
129	Insig1	16611	-0.129	-0.0710	No
130	Shroom2	16908	-0.139	-0.0805	No
131	Nexn	16962	-0.140	-0.0795	No
132	Actn1	17004	-0.142	-0.0780	No
133	Icam1	17106	-0.146	-0.0790	No
134	Sdc3	17251	-0.151	-0.0817	No
135	Egfr	17262	-0.152	-0.0786	No
136	Myl9	17296	-0.153	-0.0765	No
137	Gnai2	17366	-0.155	-0.0759	No
138	Col17a1	17483	-0.159	-0.0773	No
139	Rhof	17633	-0.165	-0.0798	No
140	Cdh11	17824	-0.172	-0.0840	No
141	Pfn1	17870	-0.174	-0.0819	No
142	Cadm3	17875	-0.175	-0.0781	No
143	Adam23	18062	-0.181	-0.0819	No
144	Gtf2f1	18515	-0.198	-0.0967	No
145	Thbs3	18624	-0.202	-0.0966	No
146	Actn2	18731	-0.207	-0.0964	No
147	Cdh8	18783	-0.208	-0.0938	No
148	Mmp9	18925	-0.215	-0.0949	No
149	Itgb1	19475	-0.239	-0.1129	No
150	Actb	20022	-0.268	-0.1300	No
151	Itga9	20084	-0.272	-0.1264	No
152	Rras	20458	-0.292	-0.1357	No
153	Pbx2	20481	-0.293	-0.1299	No
154	Ptk2	21011	-0.323	-0.1451	No
155	Mmp2	21353	-0.346	-0.1517	No
156	Cnn2	21363	-0.347	-0.1442	No
157	Mapk13	21383	-0.348	-0.1370	No
158	Tmem8b	21830	-0.381	-0.1473	No
159	Pik3r3	22198	-0.419	-0.1534	No
160	Nrtn	22226	-0.422	-0.1449	No
161	Actn3	22306	-0.430	-0.1384	No
162	Icam4	22341	-0.434	-0.1300	No
163	Mvd	22377	-0.438	-0.1215	No
164	Dsc1	22386	-0.438	-0.1118	No
165	Acta1	22466	-0.450	-0.1049	No
166	Cd274	22482	-0.452	-0.0952	No
167	Plcg1	22514	-0.457	-0.0861	No
168	Lamc2	22758	-0.492	-0.0852	No
169	Wnk4	22900	-0.517	-0.0794	No
170	Bmp1	22962	-0.528	-0.0699	No
171	Pard6g	23140	-0.566	-0.0645	No
172	Amigo1	23376	-0.653	-0.0597	No
173	Nectin4	23427	-0.684	-0.0461	No
174	Cd34	23481	-0.725	-0.0318	No
175	Cdh3	23500	-0.742	-0.0157	No
176	Thy1	23584	-0.914	0.0017	No