Details for gene set HALLMARK

Table: GSEA Results Summary

Dataset	GMP.GMP.mono_Pheno.cls #Group3_versus_Group4.GMP.mono_Pheno.cls #Group3_versus_Group4_repos
Phenotype	GMP.mono_Pheno.cls#Group3_versus_Group4_repos
Upregulated in class	2
GeneSet	HALLMARK_MYOGENESIS
Enrichment Score (ES)	0.29069632
Normalized Enrichment Score (NES)	1.1520082
Nominal p-value	0.21374045
FDR q-value	1.0
FWER p-Value	0.948

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Pygm	467	0.639	-0.0032	Yes
2	Stc2	480	0.637	0.0129	Yes
3	Fgf2	546	0.614	0.0261	Yes
4	Schip1	582	0.601	0.0403	Yes
5	Ckmt2	623	0.585	0.0538	Yes
6	Igf1	752	0.557	0.0629	Yes
7	Ankrd2	800	0.551	0.0752	Yes
8	Tnnt3	825	0.544	0.0884	Yes
9	Kcnh1	841	0.540	0.1018	Yes
10	Gsn	895	0.528	0.1134	Yes
11	Sh3bgr	901	0.526	0.1269	Yes
12	Sirt2	1111	0.487	0.1306	Yes
13	Itgb4	1258	0.472	0.1367	Yes
14	Fabp3	1407	0.452	0.1422	Yes
15	Sparc	1457	0.448	0.1518	Yes
16	Chrnb1	1696	0.425	0.1527	Yes
17	Mylk	1711	0.423	0.1632	Yes
18	Cox6a2	1718	0.423	0.1739	Yes
19	Cnn3	1775	0.415	0.1824	Yes
20	Mybpc3	1834	0.409	0.1906	Yes
21	Actn3	1911	0.400	0.1978	Yes
22	Sgcd	1915	0.400	0.2081	Yes
23	Slc6a8	2079	0.385	0.2112	Yes
24	Myom2	2153	0.380	0.2180	Yes
25	Crat	2246	0.374	0.2238	Yes
26	Apod	2252	0.373	0.2333	Yes
27	Pick1	2348	0.371	0.2389	Yes
28	Vipr1	2426	0.364	0.2451	Yes
29	Smtn	2522	0.358	0.2504	Yes
30	Ptp4a3	2548	0.355	0.2586	Yes
31	Kifc3	2624	0.350	0.2645	Yes
32	Gpx3	2880	0.327	0.2622	Yes
33	Cd36	2977	0.320	0.2664	Yes
34	Tpd52l1	3067	0.314	0.2708	Yes
35	Pde4dip	3268	0.302	0.2702	Yes
36	Tpm2	3609	0.287	0.2632	Yes
37	Aebp1	3617	0.287	0.2704	Yes
38	Myoz1	3619	0.287	0.2778	Yes
39	Myh11	3639	0.285	0.2844	Yes
40	Gabarapl2	4033	0.269	0.2747	Yes
41	Pcx	4114	0.264	0.2782	Yes
42	Spdef	4117	0.264	0.2850	Yes
43	Sptan1	4177	0.260	0.2892	Yes
44	Sspn	4299	0.254	0.2907	Yes
45	Myh9	4471	0.248	0.2899	No
46	Tnni2	4776	0.235	0.2830	No
47	Klf5	4986	0.224	0.2800	No
48	Actn2	4991	0.224	0.2856	No
49	Sgcg	5189	0.215	0.2829	No
50	Dmpk	5232	0.213	0.2866	No
51	Itgb5	5501	0.202	0.2805	No
52	Myl6b	5791	0.189	0.2731	No
53	Ncam1	5898	0.185	0.2734	No
54	Akt2	5923	0.184	0.2772	No
55	Flii	5979	0.182	0.2796	No
56	Ocel1	6048	0.179	0.2813	No
57	Myom1	6209	0.173	0.2790	No
58	Pfkm	6490	0.169	0.2715	No
59	Ache	6528	0.167	0.2743	No
60	Tsc2	6876	0.153	0.2634	No
61	Erbb3	6983	0.149	0.2628	No
62	Bin1	7066	0.146	0.2631	No
63	Adcy9	7088	0.145	0.2660	No
64	Mylpf	7259	0.139	0.2624	No
65	Reep1	7309	0.137	0.2639	No
66	Foxo4	7321	0.137	0.2670	No
67	Hdac5	7547	0.129	0.2607	No
68	Tagln	7640	0.126	0.2601	No
69	Psen2	7658	0.125	0.2626	No
70	Mef2c	7811	0.121	0.2593	No
71	Ablim1	7917	0.117	0.2579	No
72	Col15a1	8232	0.108	0.2473	No
73	Sh2b1	8277	0.108	0.2483	No
74	Gaa	8351	0.105	0.2479	No
75	Acsl1	8507	0.100	0.2439	No
76	Ppfia4	8963	0.086	0.2268	No
77	Tpm3	9091	0.083	0.2235	No
78	Kcnh2	9172	0.081	0.2222	No
79	Syngr2	9549	0.072	0.2081	No
80	Cdkn1a	9572	0.071	0.2090	No
81	Nav2	9951	0.060	0.1944	No
82	Casq2	10496	0.046	0.1725	No
83	Nqo1	10701	0.041	0.1648	No
84	Ryr1	10709	0.041	0.1656	No
85	Cfd	10736	0.040	0.1655	No
86	Gnao1	10887	0.037	0.1601	No
87	Pdlim7	11064	0.031	0.1534	No
88	Dmd	11380	0.023	0.1406	No
89	Cryab	11556	0.019	0.1336	No
90	Tcap	11684	0.016	0.1286	No
91	Fkbp1b	11921	0.010	0.1188	No
92	Prnp	12005	0.008	0.1155	No
93	Notch1	12109	0.006	0.1113	No
94	Col1a1	12313	0.000	0.1026	No
95	Casq1	12318	0.000	0.1024	No
96	Bdkrb2	12328	0.000	0.1021	No
97	Eif4a2	12820	-0.004	0.0812	No
98	Fdps	12916	-0.007	0.0774	No
99	Myo1c	13028	-0.010	0.0729	No
100	Sorbs3	13056	-0.010	0.0720	No
101	Mef2d	13105	-0.011	0.0703	No
102	Wwtr1	13326	-0.017	0.0613	No
103	Ckb	13887	-0.031	0.0383	No
104	Ifrd1	14333	-0.042	0.0204	No
105	Large1	14435	-0.044	0.0172	No
106	Mras	14552	-0.047	0.0135	No
107	App	14751	-0.053	0.0065	No
108	Agrn	14886	-0.057	0.0022	No
109	Svil	14933	-0.058	0.0018	No
110	Camk2b	15031	-0.061	-0.0008	No
111	Plxnb2	15214	-0.066	-0.0068	No
112	Myh3	15318	-0.068	-0.0094	No
113	Lsp1	15368	-0.069	-0.0097	No
114	Agl	15630	-0.076	-0.0189	No
115	Rb1	15846	-0.081	-0.0259	No
116	Tnni1	15888	-0.083	-0.0255	No
117	Gja5	15988	-0.086	-0.0275	No
118	Mapre3	16113	-0.090	-0.0304	No
119	Fhl1	16265	-0.093	-0.0344	No
120	Nos1	16422	-0.097	-0.0385	No
121	Speg	16611	-0.102	-0.0439	No
122	Mef2a	16891	-0.112	-0.0529	No
123	Tnnc1	17103	-0.118	-0.0588	No
124	Pgam2	17316	-0.126	-0.0645	No
125	Itgb1	17328	-0.126	-0.0617	No
126	Lpin1	17443	-0.130	-0.0632	No
127	Acta1	17591	-0.134	-0.0660	No
128	Aplnr	17660	-0.136	-0.0653	No
129	Myl1	17931	-0.145	-0.0730	No
130	Mapk12	17941	-0.146	-0.0696	No
131	Bag1	18072	-0.151	-0.0712	No
132	Atp2a1	18232	-0.156	-0.0739	No
133	Tgfb1	18253	-0.157	-0.0707	No
134	Clu	18350	-0.161	-0.0706	No
135	Atp6ap1	18458	-0.165	-0.0708	No
136	Rit1	18541	-0.169	-0.0699	No
137	Gadd45b	18694	-0.176	-0.0718	No
138	Tnnt1	18775	-0.180	-0.0705	No
139	Igfbp7	19954	-0.227	-0.1148	No
140	Ak1	20253	-0.244	-0.1212	No
141	Myl4	20360	-0.250	-0.1191	No
142	Ldb3	20426	-0.255	-0.1153	No
143	Tnnc2	20940	-0.285	-0.1297	No
144	Tead4	20942	-0.285	-0.1223	No
145	Col6a3	20947	-0.285	-0.1151	No
146	Bhlhe40	21092	-0.291	-0.1136	No
147	Adam12	21103	-0.291	-0.1065	No
148	Eno3	21292	-0.305	-0.1065	No
149	Hbegf	21404	-0.311	-0.1032	No
150	Dtna	21706	-0.329	-0.1074	No
151	Sorbs1	21856	-0.342	-0.1049	No
152	Cacna1h	22078	-0.362	-0.1048	No
153	Cdh13	22112	-0.366	-0.0967	No
154	Ctf1	22273	-0.382	-0.0936	No
155	Ephb3	22530	-0.420	-0.0935	No
156	Csrp3	22939	-0.485	-0.0983	No
157	Lama2	23074	-0.502	-0.0909	No
158	Cox7a1	23185	-0.530	-0.0818	No
159	Dapk2	23196	-0.534	-0.0683	No
160	Pkia	23205	-0.537	-0.0546	No
161	Col4a2	23456	-0.650	-0.0483	No
162	Itga7	23484	-0.667	-0.0321	No
163	Sphk1	23624	-1.457	-0.0000	No