Details for gene set HALLMARK

Table: GSEA Results Summary

Dataset	GMP.GMP.mono_Pheno.cls #Group3_versus_Group4.GMP.mono_Pheno.cls #Group3_versus_Group4_repos
Phenotype	GMP.mono_Pheno.cls#Group3_versus_Group4_repos
Upregulated in class	2
GeneSet	HALLMARK_HYPOXIA
Enrichment Score (ES)	0.18833384
Normalized Enrichment Score (NES)	0.80495846
Nominal p-value	0.81128407
FDR q-value	1.0
FWER p-Value	1.0

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Tnfaip3	122	0.850	0.0203	Yes
2	Pygm	467	0.639	0.0248	Yes
3	Stc2	480	0.637	0.0434	Yes
4	Cavin3	727	0.565	0.0498	Yes
5	Ids	769	0.556	0.0648	Yes
6	Bgn	1014	0.503	0.0695	Yes
7	Col5a1	1265	0.469	0.0729	Yes
8	Grhpr	1294	0.463	0.0856	Yes
9	Ldhc	1530	0.443	0.0888	Yes
10	Stbd1	1634	0.433	0.0974	Yes
11	Rragd	1829	0.409	0.1014	Yes
12	Ier3	1858	0.406	0.1124	Yes
13	Pklr	1952	0.395	0.1203	Yes
14	Fbp1	2005	0.391	0.1298	Yes
15	Ddit3	2405	0.365	0.1237	Yes
16	Ppargc1a	2733	0.340	0.1200	Yes
17	Pgm1	2868	0.328	0.1241	Yes
18	Rora	3054	0.315	0.1257	Yes
19	Akap12	3088	0.314	0.1337	Yes
20	Ets1	3216	0.305	0.1374	Yes
21	Klhl24	3595	0.288	0.1300	Yes
22	Gpc1	3633	0.286	0.1370	Yes
23	Gck	3715	0.279	0.1419	Yes
24	Tmem45a	3854	0.272	0.1442	Yes
25	Tgfb3	4167	0.261	0.1387	Yes
26	Gpc4	4191	0.260	0.1455	Yes
27	Chst3	4400	0.252	0.1442	Yes
28	Vhl	4433	0.250	0.1503	Yes
29	Myh9	4471	0.248	0.1562	Yes
30	Ccng2	4666	0.240	0.1551	Yes
31	Slc2a1	4725	0.236	0.1597	Yes
32	Vldlr	4820	0.233	0.1627	Yes
33	B3galt6	4866	0.231	0.1677	Yes
34	Pnrc1	4894	0.229	0.1734	Yes
35	Wsb1	5036	0.222	0.1740	Yes
36	Galk1	5279	0.211	0.1701	Yes
37	Angptl4	5329	0.208	0.1742	Yes
38	Gpi1	5492	0.202	0.1734	Yes
39	Eno1b	5582	0.197	0.1755	Yes
40	Tktl1	5686	0.193	0.1769	Yes
41	Cp	5772	0.190	0.1790	Yes
42	Slc2a3	5813	0.188	0.1829	Yes
43	Ampd3	5934	0.184	0.1833	Yes
44	Maff	6001	0.181	0.1859	Yes
45	Klf6	6070	0.178	0.1883	Yes
46	Selenbp1	6459	0.170	0.1769	No
47	Plaur	6892	0.152	0.1630	No
48	Ankzf1	6995	0.149	0.1632	No
49	Xpnpep1	7359	0.135	0.1517	No
50	Egfr	7422	0.133	0.1531	No
51	Sult2b1	7985	0.115	0.1325	No
52	Eno2	8174	0.109	0.1278	No
53	Map3k1	8320	0.106	0.1248	No
54	Gaa	8351	0.105	0.1267	No
55	Aldoa	8379	0.105	0.1287	No
56	Fam162a	8650	0.096	0.1200	No
57	Errfi1	8682	0.095	0.1216	No
58	Jun	8686	0.095	0.1243	No
59	Scarb1	8713	0.094	0.1260	No
60	Anxa2	8759	0.093	0.1268	No
61	Pgm2	8829	0.091	0.1266	No
62	Ero1a	8850	0.090	0.1285	No
63	Ext1	8906	0.088	0.1288	No
64	Ppfia4	8963	0.086	0.1290	No
65	Foxo3	9109	0.082	0.1253	No
66	Hexa	9251	0.079	0.1216	No
67	Mt1	9290	0.078	0.1223	No
68	Cited2	9419	0.075	0.1191	No
69	Bcl2	9513	0.072	0.1173	No
70	Cdkn1a	9572	0.071	0.1170	No
71	Sdc4	9610	0.070	0.1175	No
72	Nagk	9742	0.066	0.1139	No
73	Klf7	9846	0.063	0.1114	No
74	Cdkn1c	9959	0.060	0.1084	No
75	Glrx	10595	0.044	0.0827	No
76	Ilvbl	10717	0.041	0.0788	No
77	Mxi1	10775	0.039	0.0775	No
78	Ldha	10848	0.038	0.0756	No
79	Nfil3	10954	0.035	0.0721	No
80	S100a4	11075	0.031	0.0679	No
81	Kdelr3	11101	0.030	0.0678	No
82	Hspa5	11174	0.028	0.0656	No
83	Gbe1	11322	0.025	0.0600	No
84	Cdkn1b	11413	0.023	0.0569	No
85	Ugp2	11467	0.021	0.0553	No
86	Car12	11658	0.017	0.0477	No
87	Dusp1	11763	0.014	0.0436	No
88	Gcnt2	11883	0.011	0.0389	No
89	Cav1	12013	0.008	0.0336	No
90	Hmox1	12122	0.005	0.0292	No
91	Hdlbp	12187	0.003	0.0265	No
92	Prkca	12198	0.003	0.0262	No
93	Jmjd6	12305	0.000	0.0217	No
94	Chst2	12371	0.000	0.0189	No
95	Tpst2	12701	-0.001	0.0049	No
96	Fos	12979	-0.008	-0.0066	No
97	Kif5a	13161	-0.013	-0.0140	No
98	Dcn	13310	-0.017	-0.0198	No
99	Pfkl	13380	-0.018	-0.0222	No
100	Nr3c1	13440	-0.020	-0.0241	No
101	Hk2	13599	-0.024	-0.0301	No
102	Atp7a	13620	-0.025	-0.0302	No
103	Aldoc	14035	-0.035	-0.0468	No
104	Tiparp	14138	-0.037	-0.0501	No
105	B4galnt2	14237	-0.039	-0.0531	No
106	Large1	14435	-0.044	-0.0602	No
107	Nedd4l	14554	-0.047	-0.0638	No
108	Fosl2	14645	-0.050	-0.0661	No
109	F3	14720	-0.052	-0.0677	No
110	Bnip3l	14768	-0.053	-0.0681	No
111	Tpd52	14831	-0.055	-0.0691	No
112	Pam	14882	-0.057	-0.0695	No
113	Slc6a6	15040	-0.061	-0.0744	No
114	Pdgfb	15350	-0.069	-0.0855	No
115	Tpi1	15358	-0.069	-0.0837	No
116	Rbpj	15569	-0.074	-0.0905	No
117	Cavin1	15643	-0.076	-0.0913	No
118	Pfkp	16080	-0.089	-0.1072	No
119	Efna1	16219	-0.093	-0.1103	No
120	Sdc2	16324	-0.094	-0.1120	No
121	Tgm2	16368	-0.095	-0.1109	No
122	Ddit4	16494	-0.099	-0.1133	No
123	Zfp292	16564	-0.101	-0.1132	No
124	Irs2	16596	-0.102	-0.1115	No
125	Pfkfb3	16821	-0.109	-0.1178	No
126	Ppp1r15a	17032	-0.116	-0.1232	No
127	Ndst2	17095	-0.118	-0.1223	No
128	Mif	17108	-0.118	-0.1193	No
129	Pgam2	17316	-0.126	-0.1243	No
130	Noct	17794	-0.141	-0.1405	No
131	Hk1	18036	-0.149	-0.1463	No
132	Plac8	18160	-0.154	-0.1469	No
133	Ndrg1	18237	-0.156	-0.1455	No
134	Prdx5	18524	-0.168	-0.1526	No
135	Tes	18664	-0.174	-0.1533	No
136	Ndst1	18710	-0.177	-0.1499	No
137	Lxn	18735	-0.178	-0.1456	No
138	Kdm3a	18788	-0.180	-0.1424	No
139	Pim1	18958	-0.187	-0.1440	No
140	Atf3	18982	-0.188	-0.1394	No
141	P4ha1	19210	-0.197	-0.1431	No
142	Slc25a1	19395	-0.207	-0.1448	No
143	Cxcr4	19674	-0.218	-0.1501	No
144	Pdk1	19861	-0.222	-0.1514	No
145	Slc2a5	20494	-0.257	-0.1706	No
146	Csrp2	20649	-0.263	-0.1693	No
147	P4ha2	20735	-0.269	-0.1648	No
148	Casp6	20752	-0.270	-0.1574	No
149	Btg1	20785	-0.273	-0.1506	No
150	Gys1	20882	-0.280	-0.1463	No
151	Vegfa	21074	-0.288	-0.1458	No
152	Zfp36	21085	-0.290	-0.1375	No
153	Bhlhe40	21092	-0.291	-0.1290	No
154	Lox	21094	-0.291	-0.1204	No
155	Ak4	21114	-0.292	-0.1124	No
156	Eno3	21292	-0.305	-0.1108	No
157	Pdk3	21353	-0.310	-0.1041	No
158	Hs3st1	21520	-0.314	-0.1017	No
159	Dtna	21706	-0.329	-0.0998	No
160	Siah2	21812	-0.337	-0.0941	No
161	Isg20	22136	-0.369	-0.0968	No
162	Slc37a4	22332	-0.390	-0.0934	No
163	Adora2b	22348	-0.392	-0.0823	No
164	Sdc3	22366	-0.394	-0.0712	No
165	Tgfbi	22526	-0.420	-0.0654	No
166	Phkg1	22582	-0.425	-0.0550	No
167	Pgk1	22875	-0.471	-0.0534	No
168	Sap30	23056	-0.498	-0.0461	No
169	Gapdhs	23430	-0.634	-0.0430	No
170	Gpc3	23566	-0.784	-0.0252	No
171	Plin2	23602	-0.922	0.0009	No