Details for gene set HALLMARK

Table: GSEA Results Summary

Dataset	GMP.GMP.mono_Pheno.cls #Group3_versus_Group4.GMP.mono_Pheno.cls #Group3_versus_Group4_repos
Phenotype	GMP.mono_Pheno.cls#Group3_versus_Group4_repos
Upregulated in class	2
GeneSet	HALLMARK_APOPTOSIS
Enrichment Score (ES)	0.24309699
Normalized Enrichment Score (NES)	1.0594319
Nominal p-value	0.3961165
FDR q-value	1.0
FWER p-Value	0.979

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Ccnd1	222	0.756	0.0190	Yes
2	Gstm2	223	0.756	0.0474	Yes
3	Lmna	344	0.682	0.0680	Yes
4	Cth	607	0.592	0.0791	Yes
5	Sqstm1	648	0.578	0.0992	Yes
6	Gsn	895	0.528	0.1086	Yes
7	Bgn	1014	0.503	0.1225	Yes
8	Krt18	1130	0.483	0.1357	Yes
9	Txnip	1640	0.431	0.1303	Yes
10	Fas	1746	0.419	0.1416	Yes
11	Il18	1781	0.414	0.1557	Yes
12	Ier3	1858	0.406	0.1678	Yes
13	Dffa	1870	0.405	0.1825	Yes
14	Bcl2l2	2394	0.366	0.1740	Yes
15	Ddit3	2405	0.365	0.1873	Yes
16	Rhob	2555	0.354	0.1943	Yes
17	Gpx3	2880	0.327	0.1928	Yes
18	Lef1	2960	0.322	0.2016	Yes
19	Pmaip1	3165	0.309	0.2045	Yes
20	Smad7	3335	0.296	0.2085	Yes
21	Sc5d	3682	0.282	0.2043	Yes
22	Tnfrsf12a	3758	0.277	0.2115	Yes
23	Cdc25b	3763	0.277	0.2218	Yes
24	Aifm3	3805	0.275	0.2304	Yes
25	Timp1	3929	0.271	0.2354	Yes
26	Sptan1	4177	0.260	0.2346	Yes
27	Ppp2r5b	4208	0.259	0.2431	Yes
28	Retsat	4478	0.247	0.2410	No
29	Tnf	5557	0.199	0.2025	No
30	Etf1	5590	0.197	0.2086	No
31	Bcl2l1	5803	0.188	0.2066	No
32	Timp3	5850	0.187	0.2117	No
33	Bax	6626	0.162	0.1848	No
34	Top2a	6760	0.157	0.1850	No
35	Add1	6895	0.152	0.1850	No
36	Madd	6934	0.150	0.1891	No
37	Erbb3	6983	0.149	0.1926	No
38	Birc3	7180	0.141	0.1896	No
39	Mgmt	7355	0.135	0.1873	No
40	Ebp	7380	0.134	0.1913	No
41	Cd38	7408	0.133	0.1952	No
42	Bid	7468	0.131	0.1976	No
43	Pdgfrb	7510	0.130	0.2008	No
44	Psen2	7658	0.125	0.1992	No
45	Dnajc3	7694	0.124	0.2024	No
46	Fdxr	7774	0.122	0.2036	No
47	Gadd45a	7789	0.121	0.2076	No
48	Cflar	8034	0.113	0.2014	No
49	Casp4	8065	0.112	0.2044	No
50	Eno2	8174	0.109	0.2039	No
51	Pdcd4	8427	0.103	0.1970	No
52	Jun	8686	0.095	0.1896	No
53	Sod2	9001	0.085	0.1794	No
54	Casp9	9341	0.077	0.1679	No
55	Cdkn1a	9572	0.071	0.1608	No
56	Diablo	9583	0.071	0.1630	No
57	Wee1	9682	0.068	0.1614	No
58	Casp2	9894	0.062	0.1547	No
59	Emp1	9908	0.062	0.1565	No
60	Casp8	9976	0.060	0.1559	No
61	Xiap	10383	0.049	0.1405	No
62	Ctnnb1	10952	0.035	0.1176	No
63	Btg2	11164	0.029	0.1097	No
64	Ank	11194	0.028	0.1095	No
65	Gch1	11210	0.028	0.1099	No
66	Vdac2	11212	0.028	0.1109	No
67	Cd69	11241	0.027	0.1107	No
68	Cdkn1b	11413	0.023	0.1043	No
69	Bcl2l11	11636	0.017	0.0955	No
70	Cyld	11659	0.016	0.0951	No
71	Satb1	11708	0.015	0.0937	No
72	Tgfbr3	11778	0.013	0.0912	No
73	Igf2r	11801	0.013	0.0908	No
74	Btg3	12007	0.008	0.0823	No
75	Cav1	12013	0.008	0.0824	No
76	Fez1	12065	0.007	0.0805	No
77	Hmox1	12122	0.005	0.0783	No
78	Rhot2	12135	0.005	0.0780	No
79	Psen1	12232	0.002	0.0739	No
80	Il1b	12347	0.000	0.0691	No
81	Gsr	13064	-0.011	0.0390	No
82	Rock1	13096	-0.011	0.0381	No
83	Dcn	13310	-0.017	0.0297	No
84	Casp7	13340	-0.017	0.0291	No
85	Hmgb2	13400	-0.019	0.0273	No
86	Casp1	13553	-0.023	0.0217	No
87	Bik	13561	-0.023	0.0222	No
88	Crebbp	13586	-0.024	0.0221	No
89	Timp2	13967	-0.033	0.0072	No
90	Brca1	14005	-0.034	0.0069	No
91	Ifngr1	14302	-0.041	-0.0042	No
92	H1f0	14348	-0.042	-0.0045	No
93	Rela	14598	-0.049	-0.0133	No
94	Gpx4	14710	-0.052	-0.0160	No
95	Dap	14735	-0.052	-0.0151	No
96	App	14751	-0.053	-0.0137	No
97	Bnip3l	14768	-0.053	-0.0124	No
98	Gpx1	14852	-0.056	-0.0139	No
99	Tap1	14978	-0.059	-0.0170	No
100	Dnm1l	15519	-0.073	-0.0372	No
101	Gna15	15826	-0.081	-0.0472	No
102	Cd44	15844	-0.081	-0.0449	No
103	Hgf	15982	-0.086	-0.0475	No
104	Mcl1	16420	-0.097	-0.0625	No
105	Ccnd2	16577	-0.101	-0.0653	No
106	Plcb2	16682	-0.105	-0.0658	No
107	Ppp3r1	16690	-0.105	-0.0621	No
108	Pea15a	16944	-0.113	-0.0687	No
109	Casp3	16980	-0.114	-0.0659	No
110	Ppt1	17188	-0.121	-0.0701	No
111	Slc20a1	17992	-0.148	-0.0988	No
112	Sod1	18264	-0.158	-0.1044	No
113	Clu	18350	-0.161	-0.1019	No
114	Dap3	18422	-0.164	-0.0988	No
115	Bcap31	18430	-0.164	-0.0929	No
116	Mmp2	18546	-0.169	-0.0914	No
117	Gadd45b	18694	-0.176	-0.0911	No
118	Anxa1	18936	-0.186	-0.0944	No
119	Atf3	18982	-0.188	-0.0892	No
120	Cdk2	19002	-0.188	-0.0829	No
121	Ptk2	19015	-0.189	-0.0763	No
122	Irf1	19108	-0.193	-0.0730	No
123	Nefh	19264	-0.200	-0.0720	No
124	F2	19692	-0.219	-0.0820	No
125	Pak1	20019	-0.230	-0.0872	No
126	Dnaja1	20037	-0.231	-0.0793	No
127	Rnasel	20670	-0.265	-0.0962	No
128	Casp6	20752	-0.270	-0.0895	No
129	Gucy2e	20841	-0.277	-0.0828	No
130	Nedd9	20853	-0.278	-0.0728	No
131	Sat1	21105	-0.292	-0.0726	No
132	Bcl10	21603	-0.320	-0.0817	No
133	Lgals3	21679	-0.326	-0.0726	No
134	Tnfsf10	21859	-0.342	-0.0673	No
135	Tgfb2	21915	-0.347	-0.0566	No
136	Rara	21964	-0.351	-0.0455	No
137	Isg20	22136	-0.369	-0.0388	No
138	Tspo	22147	-0.370	-0.0253	No
139	Cd14	22413	-0.399	-0.0216	No
140	F2r	22513	-0.417	-0.0101	No
141	Dpyd	22764	-0.451	-0.0038	No
142	Ifitm3	22994	-0.493	0.0050	No
143	Bmf	23320	-0.580	0.0129	No