Details for gene set HALLMARK_APICAL

Table: GSEA Results Summary

Dataset	GMP.GMP.mono_Pheno.cls #Group3_versus_Group4.GMP.mono_Pheno.cls #Group3_versus_Group4_repos
Phenotype	GMP.mono_Pheno.cls#Group3_versus_Group4_repos
Upregulated in class	2
GeneSet	HALLMARK_APICAL_JUNCTION
Enrichment Score (ES)	0.17087364
Normalized Enrichment Score (NES)	0.75899374
Nominal p-value	0.9070707
FDR q-value	1.0
FWER p-Value	1.0

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Tmem8b	19	1.135	0.0336	Yes
2	Rras	751	0.557	0.0193	Yes
3	Fscn1	1074	0.494	0.0206	Yes
4	Myl9	1090	0.491	0.0348	Yes
5	Itgb4	1258	0.472	0.0420	Yes
6	Myh10	1268	0.469	0.0558	Yes
7	Inppl1	1281	0.466	0.0694	Yes
8	Cadm3	1630	0.433	0.0677	Yes
9	Gnai1	1763	0.418	0.0748	Yes
10	Actn3	1911	0.400	0.0806	Yes
11	Adam15	1969	0.393	0.0901	Yes
12	Crat	2246	0.374	0.0897	Yes
13	Thy1	2381	0.368	0.0951	Yes
14	Vwf	2914	0.326	0.0823	Yes
15	Icam2	2937	0.324	0.0912	Yes
16	Lama3	3108	0.313	0.0934	Yes
17	Adamts5	3201	0.307	0.0988	Yes
18	Thbs3	3232	0.304	0.1067	Yes
19	Cd276	3444	0.292	0.1066	Yes
20	Tspan4	3832	0.273	0.0984	Yes
21	Nlgn2	4221	0.257	0.0896	Yes
22	Nrtn	4268	0.255	0.0954	Yes
23	Mmp9	4292	0.254	0.1021	Yes
24	Cdh3	4315	0.254	0.1089	Yes
25	Cdk8	4379	0.253	0.1138	Yes
26	Evl	4408	0.251	0.1203	Yes
27	Itga2	4420	0.251	0.1274	Yes
28	Myh9	4471	0.248	0.1328	Yes
29	Map4k2	4508	0.246	0.1387	Yes
30	Mpzl1	4527	0.245	0.1453	Yes
31	Jam3	4652	0.241	0.1474	Yes
32	Adam23	4671	0.239	0.1538	Yes
33	Rhof	4772	0.235	0.1567	Yes
34	Actn2	4991	0.224	0.1542	Yes
35	Slc30a3	5438	0.204	0.1413	Yes
36	Actb	5703	0.192	0.1359	Yes
37	Dhx16	5749	0.190	0.1398	Yes
38	Ikbkg	5769	0.190	0.1447	Yes
39	Akt2	5923	0.184	0.1438	Yes
40	Plcg1	6248	0.171	0.1351	Yes
41	Tro	6256	0.171	0.1400	Yes
42	Col9a1	6257	0.171	0.1452	Yes
43	Nectin2	6436	0.171	0.1428	Yes
44	Cldn15	6512	0.168	0.1447	Yes
45	Nectin1	6566	0.165	0.1475	Yes
46	Nexn	6605	0.164	0.1508	Yes
47	Zyx	6636	0.162	0.1544	Yes
48	Tubg1	6745	0.157	0.1546	Yes
49	Baiap2	6815	0.154	0.1563	Yes
50	Cdh6	6888	0.152	0.1579	Yes
51	Src	6898	0.152	0.1621	Yes
52	Nectin4	6908	0.152	0.1663	Yes
53	Cx3cl1	6910	0.151	0.1709	Yes
54	Ldlrap1	7242	0.139	0.1610	No
55	Egfr	7422	0.133	0.1574	No
56	Vcam1	7652	0.125	0.1514	No
57	Hras	8107	0.111	0.1354	No
58	Gamt	8150	0.110	0.1369	No
59	Nfasc	8315	0.107	0.1332	No
60	Adam9	8522	0.100	0.1274	No
61	Wnk4	8579	0.098	0.1280	No
62	Mapk11	8666	0.095	0.1272	No
63	Icam4	8689	0.095	0.1292	No
64	Cercam	8786	0.092	0.1279	No
65	Tsc1	8852	0.090	0.1278	No
66	Actg2	8915	0.088	0.1279	No
67	Vcl	9155	0.081	0.1201	No
68	Kcnh2	9172	0.081	0.1219	No
69	Amh	9268	0.079	0.1202	No
70	Rasa1	9383	0.075	0.1176	No
71	Epb41l2	9389	0.075	0.1197	No
72	Mapk14	9824	0.064	0.1032	No
73	Pals1	9842	0.063	0.1044	No
74	Cdh4	9844	0.063	0.1062	No
75	Nf2	9853	0.063	0.1078	No
76	Pten	9862	0.063	0.1094	No
77	Nrap	9865	0.063	0.1112	No
78	Nectin3	10013	0.059	0.1067	No
79	Pkd1	10055	0.058	0.1067	No
80	Sirpa	10137	0.056	0.1050	No
81	Amigo1	10176	0.055	0.1050	No
82	Ywhah	10379	0.049	0.0979	No
83	Vasp	10461	0.047	0.0959	No
84	Stx4a	10673	0.042	0.0882	No
85	Actn4	10741	0.040	0.0865	No
86	Tial1	11370	0.024	0.0604	No
87	B4galt1	11412	0.023	0.0594	No
88	Dlg1	11567	0.019	0.0534	No
89	Irs1	11586	0.018	0.0532	No
90	Shc1	11749	0.014	0.0467	No
91	Hadh	11841	0.012	0.0432	No
92	Nf1	11949	0.009	0.0389	No
93	Actn1	12130	0.005	0.0314	No
94	Dsc1	12391	0.000	0.0203	No
95	Flnc	12432	0.000	0.0186	No
96	Msn	12781	-0.003	0.0038	No
97	Rsu1	12940	-0.007	-0.0027	No
98	Map3k20	13012	-0.009	-0.0054	No
99	Negr1	13016	-0.010	-0.0053	No
100	Sorbs3	13056	-0.010	-0.0066	No
101	Mapk13	13058	-0.011	-0.0063	No
102	Insig1	13095	-0.011	-0.0075	No
103	Cd34	13107	-0.012	-0.0077	No
104	Pfn1	13398	-0.019	-0.0195	No
105	Ptprc	13421	-0.019	-0.0198	No
106	Cdh1	13699	-0.026	-0.0308	No
107	Exoc4	14357	-0.043	-0.0576	No
108	Wasl	14359	-0.043	-0.0563	No
109	Myl12b	14369	-0.043	-0.0554	No
110	Lamb3	14806	-0.055	-0.0723	No
111	Lima1	14963	-0.059	-0.0772	No
112	Vcan	15163	-0.065	-0.0837	No
113	Nrxn2	15399	-0.070	-0.0916	No
114	Atp1a3	15420	-0.070	-0.0904	No
115	Vav2	15438	-0.071	-0.0889	No
116	Pecam1	15565	-0.074	-0.0921	No
117	Adra1b	15631	-0.076	-0.0925	No
118	Cldn14	15698	-0.077	-0.0930	No
119	Akt3	15718	-0.078	-0.0915	No
120	Gtf2f1	15788	-0.080	-0.0920	No
121	Cnn2	15807	-0.080	-0.0903	No
122	Syk	15848	-0.081	-0.0896	No
123	Mdk	15859	-0.082	-0.0875	No
124	Cd86	15931	-0.084	-0.0880	No
125	Taok2	15942	-0.084	-0.0859	No
126	Skap2	16035	-0.087	-0.0872	No
127	Arpc2	16043	-0.088	-0.0848	No
128	Gnai2	16369	-0.095	-0.0958	No
129	Speg	16611	-0.102	-0.1029	No
130	Pik3cb	17198	-0.122	-0.1242	No
131	Itgb1	17328	-0.126	-0.1259	No
132	Arhgef6	17415	-0.129	-0.1257	No
133	Cap1	17472	-0.131	-0.1241	No
134	Crb3	17534	-0.133	-0.1227	No
135	Acta1	17591	-0.134	-0.1210	No
136	Traf1	17597	-0.134	-0.1171	No
137	Tjp1	17702	-0.137	-0.1174	No
138	Ctnna1	17868	-0.143	-0.1201	No
139	Itga3	17975	-0.147	-0.1202	No
140	Pik3r3	18078	-0.151	-0.1199	No
141	Actg1	18126	-0.152	-0.1173	No
142	Cntn1	18283	-0.158	-0.1192	No
143	Mmp2	18546	-0.169	-0.1252	No
144	Sympk	18672	-0.175	-0.1253	No
145	Cd274	18823	-0.182	-0.1261	No
146	Itga9	18871	-0.184	-0.1226	No
147	Pard6g	19009	-0.189	-0.1227	No
148	Ptk2	19015	-0.189	-0.1172	No
149	Ctnnd1	19145	-0.195	-0.1167	No
150	Cdh8	19155	-0.195	-0.1112	No
151	Cadm2	19239	-0.199	-0.1087	No
152	Calb2	19509	-0.213	-0.1137	No
153	Mvd	19613	-0.216	-0.1116	No
154	Icam5	19881	-0.223	-0.1162	No
155	Parva	20204	-0.241	-0.1226	No
156	Cdh11	20410	-0.254	-0.1237	No
157	Pbx2	20437	-0.255	-0.1170	No
158	Layn	20722	-0.268	-0.1210	No
159	Alox8	20837	-0.277	-0.1175	No
160	Jup	21049	-0.287	-0.1178	No
161	Rac2	21259	-0.302	-0.1176	No
162	Fbn1	21920	-0.347	-0.1352	No
163	Lamc2	21974	-0.352	-0.1268	No
164	Col17a1	22049	-0.358	-0.1190	No
165	Sdc3	22366	-0.394	-0.1206	No
166	Nlgn3	22471	-0.408	-0.1126	No
167	Tgfbi	22526	-0.420	-0.1022	No
168	Sgce	22793	-0.456	-0.0997	No
169	Dsc3	22835	-0.463	-0.0874	No
170	Icam1	22862	-0.467	-0.0743	No
171	Itga10	22964	-0.487	-0.0639	No
172	Shroom2	23230	-0.546	-0.0586	No
173	Bmp1	23312	-0.575	-0.0446	No
174	Col16a1	23367	-0.604	-0.0286	No
175	Amigo2	23450	-0.643	-0.0126	No
176	Slit2	23474	-0.659	0.0064	No