Details for gene set HALLMARK

Table: GSEA Results Summary

Dataset	GMP.GMP.mono_Pheno.cls #Group2_versus_Group4.GMP.mono_Pheno.cls #Group2_versus_Group4_repos
Phenotype	GMP.mono_Pheno.cls#Group2_versus_Group4_repos
Upregulated in class	1
GeneSet	HALLMARK_MYOGENESIS
Enrichment Score (ES)	0.2642634
Normalized Enrichment Score (NES)	1.0961777
Nominal p-value	0.2519685
FDR q-value	0.53746706
FWER p-Value	0.983

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Fhl1	16	1.091	0.0234	Yes
2	Kcnh1	47	0.944	0.0429	Yes
3	Itgb5	91	0.860	0.0601	Yes
4	Sptan1	131	0.817	0.0764	Yes
5	Sh3bgr	210	0.764	0.0900	Yes
6	Mylk	241	0.747	0.1051	Yes
7	Prnp	481	0.656	0.1094	Yes
8	Sgcd	557	0.630	0.1201	Yes
9	Stc2	604	0.614	0.1317	Yes
10	Myh11	670	0.601	0.1422	Yes
11	Bhlhe40	675	0.600	0.1553	Yes
12	Eif4a2	712	0.592	0.1668	Yes
13	Myh9	727	0.590	0.1792	Yes
14	Flii	775	0.580	0.1900	Yes
15	Mybpc3	871	0.564	0.1984	Yes
16	Ankrd2	879	0.563	0.2105	Yes
17	Myom2	929	0.557	0.2207	Yes
18	Igf1	1099	0.529	0.2252	Yes
19	Cox6a2	1277	0.509	0.2289	Yes
20	Casq1	1441	0.490	0.2327	Yes
21	Myoz1	1561	0.476	0.2382	Yes
22	Tagln	1656	0.465	0.2444	Yes
23	Aebp1	1872	0.450	0.2452	Yes
24	App	2153	0.428	0.2427	Yes
25	Kifc3	2474	0.402	0.2379	Yes
26	Gja5	2789	0.384	0.2330	Yes
27	Casq2	2880	0.378	0.2375	Yes
28	Tnnt3	3033	0.366	0.2391	Yes
29	Fgf2	3150	0.359	0.2421	Yes
30	Itgb1	3266	0.352	0.2449	Yes
31	Nqo1	3537	0.336	0.2408	Yes
32	Plxnb2	3572	0.334	0.2467	Yes
33	Actn3	3637	0.330	0.2513	Yes
34	Sirt2	3792	0.320	0.2518	Yes
35	Gabarapl2	3961	0.310	0.2515	Yes
36	Col1a1	4060	0.307	0.2540	Yes
37	Tpd52l1	4160	0.301	0.2565	Yes
38	Clu	4182	0.300	0.2622	Yes
39	Fabp3	4553	0.281	0.2526	Yes
40	Erbb3	4634	0.280	0.2554	Yes
41	Cfd	4890	0.266	0.2504	Yes
42	Cacna1h	5051	0.257	0.2492	Yes
43	Rit1	5104	0.254	0.2526	Yes
44	Tnnc1	5178	0.250	0.2551	Yes
45	Pde4dip	5264	0.246	0.2569	Yes
46	Apod	5321	0.243	0.2598	Yes
47	Gpx3	5343	0.242	0.2643	Yes
48	Vipr1	5570	0.231	0.2597	No
49	Crat	5592	0.230	0.2639	No
50	Bdkrb2	5704	0.228	0.2642	No
51	Ifrd1	5855	0.222	0.2627	No
52	Klf5	6014	0.214	0.2607	No
53	Tpm3	6140	0.207	0.2599	No
54	Itgb4	6245	0.203	0.2600	No
55	Sparc	6634	0.189	0.2476	No
56	Pygm	6714	0.187	0.2484	No
57	Bag1	6836	0.182	0.2472	No
58	Foxo4	6968	0.176	0.2455	No
59	Actn2	6974	0.176	0.2492	No
60	Pick1	7039	0.173	0.2503	No
61	Chrnb1	7323	0.162	0.2418	No
62	Akt2	7589	0.151	0.2338	No
63	Tsc2	7756	0.143	0.2299	No
64	Ak1	7772	0.143	0.2324	No
65	Myl6b	7837	0.140	0.2328	No
66	Cd36	7893	0.138	0.2335	No
67	Fkbp1b	7954	0.136	0.2339	No
68	Ablim1	7956	0.136	0.2369	No
69	Mras	8113	0.130	0.2331	No
70	Ptp4a3	8218	0.126	0.2314	No
71	Sspn	8279	0.124	0.2316	No
72	Tnni2	8535	0.120	0.2234	No
73	Fdps	8602	0.118	0.2232	No
74	Nav2	8620	0.117	0.2251	No
75	Gsn	8697	0.114	0.2243	No
76	Myo1c	8756	0.112	0.2243	No
77	Agl	8856	0.109	0.2225	No
78	Psen2	8901	0.107	0.2230	No
79	Slc6a8	9587	0.082	0.1956	No
80	Ncam1	9945	0.068	0.1819	No
81	Kcnh2	9946	0.068	0.1834	No
82	Pcx	10395	0.052	0.1655	No
83	Agrn	10430	0.051	0.1652	No
84	Dapk2	10554	0.048	0.1610	No
85	Tcap	11057	0.030	0.1402	No
86	Bin1	11434	0.017	0.1246	No
87	Tnni1	11545	0.013	0.1202	No
88	Ckmt2	11996	0.000	0.1010	No
89	Tnnt1	12159	-0.004	0.0942	No
90	Tnnc2	12166	-0.004	0.0940	No
91	Dtna	12189	-0.005	0.0932	No
92	Large1	12296	-0.009	0.0889	No
93	Acsl1	12316	-0.010	0.0883	No
94	Svil	12321	-0.010	0.0883	No
95	Cdkn1a	12342	-0.011	0.0877	No
96	Smtn	12510	-0.017	0.0810	No
97	Tead4	12574	-0.019	0.0787	No
98	Camk2b	12739	-0.024	0.0722	No
99	Rb1	12976	-0.033	0.0629	No
100	Gadd45b	13055	-0.035	0.0604	No
101	Mapre3	13164	-0.039	0.0566	No
102	Lsp1	13337	-0.045	0.0503	No
103	Mylpf	13443	-0.049	0.0469	No
104	Speg	13640	-0.056	0.0398	No
105	Gnao1	13654	-0.057	0.0405	No
106	Ckb	13756	-0.059	0.0375	No
107	Hdac5	13862	-0.063	0.0344	No
108	Igfbp7	13965	-0.067	0.0315	No
109	Spdef	13998	-0.068	0.0317	No
110	Myh3	14050	-0.069	0.0310	No
111	Gaa	14183	-0.074	0.0270	No
112	Pgam2	14426	-0.084	0.0186	No
113	Dmpk	14625	-0.091	0.0121	No
114	Sorbs1	15147	-0.111	-0.0076	No
115	Itga7	15615	-0.128	-0.0247	No
116	Pfkm	15619	-0.128	-0.0220	No
117	Tpm2	15631	-0.128	-0.0197	No
118	Ephb3	15673	-0.130	-0.0185	No
119	Syngr2	15837	-0.136	-0.0225	No
120	Sh2b1	15969	-0.141	-0.0249	No
121	Wwtr1	16018	-0.143	-0.0238	No
122	Eno3	16405	-0.156	-0.0369	No
123	Myom1	16553	-0.163	-0.0395	No
124	Cdh13	16922	-0.178	-0.0513	No
125	Col15a1	17099	-0.184	-0.0547	No
126	Ctf1	17203	-0.186	-0.0550	No
127	Ache	17247	-0.187	-0.0527	No
128	Mef2a	17274	-0.189	-0.0496	No
129	Aplnr	17324	-0.191	-0.0475	No
130	Adam12	17409	-0.193	-0.0468	No
131	Mef2c	17424	-0.194	-0.0432	No
132	Nos1	17956	-0.216	-0.0610	No
133	Cryab	18008	-0.217	-0.0584	No
134	Adcy9	18354	-0.231	-0.0680	No
135	Cnn3	18478	-0.237	-0.0680	No
136	Ryr1	18491	-0.237	-0.0633	No
137	Sgcg	18819	-0.251	-0.0717	No
138	Pdlim7	19112	-0.266	-0.0783	No
139	Col6a3	19357	-0.279	-0.0826	No
140	Reep1	19759	-0.298	-0.0931	No
141	Atp6ap1	19945	-0.309	-0.0941	No
142	Mef2d	20057	-0.313	-0.0920	No
143	Atp2a1	20191	-0.319	-0.0906	No
144	Ocel1	20292	-0.324	-0.0877	No
145	Dmd	20525	-0.338	-0.0902	No
146	Lama2	20657	-0.347	-0.0881	No
147	Myl1	20798	-0.357	-0.0862	No
148	Tgfb1	21120	-0.378	-0.0915	No
149	Ldb3	21162	-0.381	-0.0849	No
150	Notch1	22095	-0.457	-0.1145	No
151	Hbegf	22162	-0.462	-0.1072	No
152	Pkia	22237	-0.471	-0.0999	No
153	Cox7a1	22339	-0.483	-0.0936	No
154	Mapk12	22740	-0.534	-0.0988	No
155	Acta1	22796	-0.543	-0.0892	No
156	Ppfia4	22948	-0.572	-0.0830	No
157	Schip1	22961	-0.576	-0.0708	No
158	Lpin1	23161	-0.625	-0.0655	No
159	Csrp3	23212	-0.641	-0.0535	No
160	Sorbs3	23215	-0.642	-0.0395	No
161	Col4a2	23515	-0.805	-0.0344	No
162	Sphk1	23549	-0.860	-0.0169	No
163	Myl4	23570	-0.908	0.0023	No