Details for gene set HALLMARK

Table: GSEA Results Summary

Dataset	GMP.GMP.mono_Pheno.cls #Group2_versus_Group4.GMP.mono_Pheno.cls #Group2_versus_Group4_repos
Phenotype	GMP.mono_Pheno.cls#Group2_versus_Group4_repos
Upregulated in class	1
GeneSet	HALLMARK_HYPOXIA
Enrichment Score (ES)	0.27519
Normalized Enrichment Score (NES)	1.153887
Nominal p-value	0.27005872
FDR q-value	0.50551426
FWER p-Value	0.934

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Vldlr	168	0.790	0.0126	Yes
2	Cp	519	0.644	0.0137	Yes
3	Klf6	550	0.631	0.0282	Yes
4	Pklr	575	0.623	0.0428	Yes
5	Stc2	604	0.614	0.0569	Yes
6	Hmox1	626	0.610	0.0712	Yes
7	Col5a1	668	0.601	0.0845	Yes
8	Bhlhe40	675	0.600	0.0992	Yes
9	Hdlbp	709	0.592	0.1126	Yes
10	Myh9	727	0.590	0.1266	Yes
11	Ero1a	776	0.580	0.1390	Yes
12	Hspa5	845	0.567	0.1503	Yes
13	Pim1	1025	0.541	0.1562	Yes
14	Anxa2	1034	0.540	0.1693	Yes
15	Fos	1497	0.484	0.1617	Yes
16	Gpi1	1544	0.479	0.1717	Yes
17	Pfkp	1774	0.458	0.1734	Yes
18	Rragd	1946	0.443	0.1771	Yes
19	Tktl1	2093	0.433	0.1817	Yes
20	Cdkn1b	2130	0.430	0.1909	Yes
21	Stbd1	2137	0.430	0.2014	Yes
22	Tnfaip3	2142	0.429	0.2120	Yes
23	Adora2b	2154	0.428	0.2222	Yes
24	Tmem45a	2450	0.403	0.2197	Yes
25	Ets1	2695	0.388	0.2190	Yes
26	Jun	2721	0.387	0.2276	Yes
27	Gpc4	2793	0.384	0.2341	Yes
28	Ppargc1a	2946	0.372	0.2369	Yes
29	Chst2	3183	0.356	0.2358	Yes
30	Pfkl	3192	0.356	0.2443	Yes
31	Eno1b	3525	0.337	0.2386	Yes
32	Vhl	3603	0.331	0.2435	Yes
33	Aldoa	3625	0.330	0.2509	Yes
34	Dusp1	3925	0.310	0.2459	Yes
35	Bgn	4022	0.308	0.2495	Yes
36	Angptl4	4186	0.300	0.2500	Yes
37	Akap12	4208	0.299	0.2566	Yes
38	Hs3st1	4500	0.285	0.2513	Yes
39	Grhpr	4695	0.276	0.2499	Yes
40	Ccng2	4747	0.273	0.2546	Yes
41	Noct	4760	0.272	0.2609	Yes
42	Klf7	4836	0.269	0.2644	Yes
43	Mt1	4874	0.267	0.2695	Yes
44	Hk2	4896	0.266	0.2752	Yes
45	Foxo3	5153	0.252	0.2706	No
46	Tpd52	5991	0.215	0.2402	No
47	Pygm	6714	0.187	0.2141	No
48	Pgk1	6996	0.175	0.2065	No
49	Scarb1	7015	0.175	0.2101	No
50	Jmjd6	7024	0.174	0.2141	No
51	Map3k1	7192	0.167	0.2112	No
52	Phkg1	7261	0.165	0.2124	No
53	Eno2	7432	0.158	0.2091	No
54	Sap30	7853	0.140	0.1947	No
55	Cavin1	8122	0.130	0.1865	No
56	Ankzf1	8204	0.126	0.1862	No
57	Ids	8206	0.126	0.1893	No
58	Cavin3	8285	0.124	0.1891	No
59	Nr3c1	8370	0.123	0.1886	No
60	Gck	8396	0.123	0.1906	No
61	Hk1	8487	0.123	0.1898	No
62	Gpc1	8504	0.122	0.1922	No
63	Slc2a3	8574	0.119	0.1922	No
64	P4ha1	8657	0.116	0.1916	No
65	Egfr	8793	0.111	0.1886	No
66	Xpnpep1	8814	0.110	0.1905	No
67	Wsb1	8837	0.109	0.1923	No
68	Ldha	9150	0.098	0.1814	No
69	Ldhc	9154	0.097	0.1837	No
70	Cav1	9646	0.079	0.1647	No
71	Fam162a	9683	0.078	0.1651	No
72	S100a4	9836	0.072	0.1605	No
73	Ddit4	9851	0.071	0.1617	No
74	Tgfbi	9871	0.071	0.1626	No
75	F3	9972	0.068	0.1600	No
76	Pgm1	10060	0.064	0.1579	No
77	Plaur	10086	0.063	0.1584	No
78	Ugp2	10357	0.054	0.1483	No
79	Ddit3	10402	0.052	0.1477	No
80	Pnrc1	10433	0.051	0.1477	No
81	Tpi1	10454	0.050	0.1481	No
82	Ier3	10737	0.041	0.1371	No
83	Tgfb3	10779	0.039	0.1363	No
84	Csrp2	10817	0.038	0.1357	No
85	Zfp36	10849	0.037	0.1353	No
86	Kdelr3	10939	0.034	0.1323	No
87	Cdkn1c	11033	0.030	0.1291	No
88	Nfil3	11191	0.026	0.1231	No
89	Tes	11572	0.012	0.1072	No
90	Atp7a	11662	0.009	0.1036	No
91	Slc6a6	11695	0.008	0.1024	No
92	Ak4	11879	0.002	0.0947	No
93	Ppp1r15a	11887	0.002	0.0944	No
94	Mxi1	11893	0.002	0.0943	No
95	Pam	11903	0.001	0.0939	No
96	Dtna	12189	-0.005	0.0819	No
97	Fosl2	12194	-0.005	0.0819	No
98	Large1	12296	-0.009	0.0778	No
99	Atf3	12314	-0.010	0.0773	No
100	Errfi1	12315	-0.010	0.0775	No
101	Cdkn1a	12342	-0.011	0.0767	No
102	Klhl24	12498	-0.016	0.0705	No
103	Aldoc	12677	-0.022	0.0635	No
104	Ampd3	12829	-0.028	0.0577	No
105	Car12	12848	-0.028	0.0577	No
106	B4galnt2	12930	-0.031	0.0550	No
107	Pfkfb3	13095	-0.037	0.0489	No
108	Pdk1	13325	-0.045	0.0403	No
109	Vegfa	13346	-0.046	0.0406	No
110	Btg1	13869	-0.063	0.0199	No
111	Gaa	14183	-0.074	0.0084	No
112	Ndst1	14190	-0.075	0.0100	No
113	Casp6	14223	-0.076	0.0105	No
114	Tiparp	14331	-0.080	0.0080	No
115	Pgm2	14343	-0.080	0.0095	No
116	Glrx	14350	-0.081	0.0112	No
117	Kif5a	14402	-0.083	0.0111	No
118	Pgam2	14426	-0.084	0.0122	No
119	Nedd4l	14584	-0.090	0.0078	No
120	Gcnt2	14668	-0.093	0.0066	No
121	Hexa	15110	-0.109	-0.0095	No
122	Slc2a1	15129	-0.110	-0.0075	No
123	Plin2	15218	-0.113	-0.0084	No
124	Rbpj	15289	-0.116	-0.0085	No
125	Efna1	15485	-0.124	-0.0137	No
126	Kdm3a	15828	-0.136	-0.0249	No
127	Chst3	15920	-0.139	-0.0253	No
128	Bnip3l	15953	-0.141	-0.0232	No
129	Slc2a5	15979	-0.141	-0.0207	No
130	Tpst2	16011	-0.142	-0.0185	No
131	Zfp292	16170	-0.148	-0.0215	No
132	Ext1	16203	-0.150	-0.0192	No
133	Eno3	16405	-0.156	-0.0238	No
134	P4ha2	16682	-0.169	-0.0314	No
135	Maff	16866	-0.175	-0.0348	No
136	Gbe1	17065	-0.183	-0.0387	No
137	Dcn	17072	-0.184	-0.0344	No
138	Irs2	17353	-0.192	-0.0415	No
139	Selenbp1	17725	-0.206	-0.0522	No
140	Gapdhs	17734	-0.206	-0.0474	No
141	Gys1	17736	-0.206	-0.0423	No
142	Tgm2	18142	-0.221	-0.0540	No
143	Ndst2	18304	-0.229	-0.0552	No
144	B3galt6	18436	-0.235	-0.0549	No
145	Lox	18851	-0.253	-0.0662	No
146	Cxcr4	19016	-0.261	-0.0667	No
147	Prkca	19226	-0.272	-0.0688	No
148	Siah2	19684	-0.293	-0.0810	No
149	Sdc4	19829	-0.303	-0.0795	No
150	Ilvbl	19878	-0.305	-0.0740	No
151	Sdc2	19894	-0.306	-0.0670	No
152	Plac8	20233	-0.320	-0.0734	No
153	Sult2b1	20612	-0.344	-0.0809	No
154	Fbp1	20716	-0.351	-0.0765	No
155	Pdk3	20789	-0.356	-0.0707	No
156	Slc25a1	20919	-0.363	-0.0671	No
157	Mif	21002	-0.369	-0.0614	No
158	Rora	21141	-0.379	-0.0578	No
159	Galk1	21296	-0.391	-0.0546	No
160	Ndrg1	21313	-0.392	-0.0455	No
161	Nagk	21415	-0.400	-0.0399	No
162	Lxn	21633	-0.418	-0.0387	No
163	Prdx5	21818	-0.434	-0.0357	No
164	Bcl2	21828	-0.435	-0.0252	No
165	Slc37a4	22175	-0.463	-0.0284	No
166	Cited2	22935	-0.567	-0.0466	No
167	Ppfia4	22948	-0.572	-0.0328	No
168	Pdgfb	22990	-0.584	-0.0200	No
169	Sdc3	22996	-0.585	-0.0056	No
170	Isg20	23159	-0.624	0.0031	No
171	Gpc3	23298	-0.670	0.0139	No