Details for gene set HALLMARK_EPITHELIAL_MESENCHYMAL

Table: GSEA Results Summary

Dataset	GMP.GMP.mono_Pheno.cls #Group2_versus_Group4.GMP.mono_Pheno.cls #Group2_versus_Group4_repos
Phenotype	GMP.mono_Pheno.cls#Group2_versus_Group4_repos
Upregulated in class	1
GeneSet	HALLMARK_EPITHELIAL_MESENCHYMAL_TRANSITION
Enrichment Score (ES)	0.291143
Normalized Enrichment Score (NES)	1.1913793
Nominal p-value	0.14174758
FDR q-value	0.49775207
FWER p-Value	0.908

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Lamc1	76	0.890	0.0173	Yes
2	Itgb5	91	0.860	0.0366	Yes
3	Mylk	241	0.747	0.0475	Yes
4	Tnfrsf12a	364	0.694	0.0583	Yes
5	Gem	445	0.667	0.0703	Yes
6	Sgcd	557	0.630	0.0801	Yes
7	Calu	572	0.624	0.0939	Yes
8	Col5a1	668	0.601	0.1037	Yes
9	Efemp2	820	0.572	0.1105	Yes
10	Capg	830	0.569	0.1233	Yes
11	Gja1	913	0.560	0.1327	Yes
12	Dpysl3	978	0.549	0.1427	Yes
13	Rhob	1065	0.536	0.1514	Yes
14	Comp	1084	0.533	0.1629	Yes
15	Gadd45a	1194	0.519	0.1702	Yes
16	Fstl1	1372	0.497	0.1742	Yes
17	Htra1	1451	0.490	0.1821	Yes
18	Serpinh1	1576	0.474	0.1878	Yes
19	Tagln	1656	0.465	0.1952	Yes
20	Loxl1	1704	0.463	0.2039	Yes
21	Fbln1	1882	0.449	0.2067	Yes
22	Pcolce	2064	0.436	0.2091	Yes
23	Nt5e	2119	0.431	0.2167	Yes
24	Tnfaip3	2142	0.429	0.2257	Yes
25	Magee1	2360	0.410	0.2259	Yes
26	Slit3	2700	0.388	0.2204	Yes
27	Jun	2721	0.387	0.2285	Yes
28	Thbs2	3080	0.363	0.2216	Yes
29	Fgf2	3150	0.359	0.2270	Yes
30	Timp3	3180	0.356	0.2340	Yes
31	Itgb1	3266	0.352	0.2384	Yes
32	Vim	3450	0.340	0.2385	Yes
33	Copa	3838	0.316	0.2293	Yes
34	Flna	3850	0.316	0.2361	Yes
35	Timp1	3952	0.310	0.2390	Yes
36	Pcolce2	3972	0.309	0.2453	Yes
37	Bgn	4022	0.308	0.2503	Yes
38	Col1a1	4060	0.307	0.2558	Yes
39	Sfrp4	4172	0.301	0.2581	Yes
40	Dab2	4246	0.297	0.2618	Yes
41	Dst	4284	0.294	0.2670	Yes
42	Serpine2	4503	0.285	0.2643	Yes
43	Fermt2	4589	0.281	0.2672	Yes
44	P3h1	4613	0.281	0.2727	Yes
45	Edil3	5071	0.256	0.2591	Yes
46	Inhba	5097	0.255	0.2639	Yes
47	Cap2	5099	0.255	0.2698	Yes
48	Gm21451	5202	0.249	0.2711	Yes
49	Sdc1	5203	0.248	0.2769	Yes
50	Cald1	5215	0.248	0.2821	Yes
51	Fstl3	5226	0.248	0.2874	Yes
52	Basp1	5273	0.246	0.2911	Yes
53	Spock1	5942	0.217	0.2677	No
54	Tfpi2	6068	0.211	0.2672	No
55	Itga2	6078	0.211	0.2717	No
56	Matn2	6386	0.200	0.2633	No
57	Plod2	6494	0.195	0.2632	No
58	Prrx1	6597	0.190	0.2633	No
59	Col11a1	6598	0.190	0.2676	No
60	Sparc	6634	0.189	0.2705	No
61	Lrp1	6688	0.188	0.2726	No
62	Tgfbr3	6759	0.185	0.2739	No
63	Ecm1	6794	0.184	0.2767	No
64	Sfrp1	6805	0.183	0.2805	No
65	Mcm7	6810	0.183	0.2845	No
66	Ppib	6866	0.181	0.2864	No
67	Fap	6888	0.180	0.2896	No
68	Wipf1	7018	0.174	0.2882	No
69	Itga5	7063	0.172	0.2903	No
70	Lama3	7282	0.164	0.2848	No
71	Fas	7301	0.163	0.2878	No
72	Eno2	7432	0.158	0.2859	No
73	Slit2	8033	0.133	0.2634	No
74	Myl9	8300	0.124	0.2549	No
75	Gpc1	8504	0.122	0.2490	No
76	Anpep	8722	0.114	0.2424	No
77	Itgb3	8725	0.113	0.2450	No
78	Notch2	9096	0.099	0.2315	No
79	Itgav	9111	0.099	0.2332	No
80	Slc6a8	9587	0.082	0.2148	No
81	Lama1	9718	0.076	0.2110	No
82	Tgfbi	9871	0.071	0.2062	No
83	Plaur	10086	0.063	0.1985	No
84	Col7a1	10273	0.057	0.1919	No
85	Fn1	10401	0.052	0.1877	No
86	Vcan	10437	0.051	0.1874	No
87	Sat1	10797	0.039	0.1730	No
88	Col4a1	10898	0.035	0.1695	No
89	Cdh6	11159	0.027	0.1591	No
90	Thy1	11304	0.022	0.1535	No
91	Cdh11	11397	0.019	0.1500	No
92	Pfn2	11420	0.018	0.1494	No
93	Cxcl12	11951	0.000	0.1269	No
94	Colgalt1	12127	-0.003	0.1195	No
95	Mmp2	12338	-0.011	0.1108	No
96	Plod3	12433	-0.014	0.1071	No
97	Mmp14	12866	-0.029	0.0894	No
98	Tpm4	12905	-0.030	0.0884	No
99	Gadd45b	13055	-0.035	0.0829	No
100	Pmepa1	13128	-0.038	0.0807	No
101	Vegfa	13346	-0.046	0.0725	No
102	Fuca1	13408	-0.048	0.0710	No
103	Tpm1	13418	-0.049	0.0718	No
104	Thbs1	13420	-0.049	0.0728	No
105	Fbn2	13423	-0.049	0.0739	No
106	Spp1	13523	-0.052	0.0709	No
107	Acta2	13914	-0.065	0.0558	No
108	Col1a2	14106	-0.071	0.0493	No
109	Col5a2	14329	-0.080	0.0416	No
110	Col5a3	14335	-0.080	0.0433	No
111	Cd44	14616	-0.091	0.0334	No
112	Vcam1	14734	-0.095	0.0307	No
113	Plod1	14839	-0.099	0.0285	No
114	Sgcb	15117	-0.110	0.0192	No
115	Lgals1	15418	-0.121	0.0092	No
116	Tpm2	15631	-0.128	0.0032	No
117	Qsox1	15663	-0.130	0.0048	No
118	Oxtr	15729	-0.132	0.0051	No
119	Lamc2	16020	-0.143	-0.0039	No
120	Fzd8	16722	-0.170	-0.0299	No
121	Dcn	17072	-0.184	-0.0405	No
122	Eln	17292	-0.189	-0.0455	No
123	Adam12	17409	-0.193	-0.0460	No
124	Pdlim4	17529	-0.198	-0.0465	No
125	Col12a1	17573	-0.200	-0.0437	No
126	Ntm	17921	-0.214	-0.0535	No
127	Tgm2	18142	-0.221	-0.0578	No
128	Ecm2	18815	-0.251	-0.0806	No
129	Sgcg	18819	-0.251	-0.0749	No
130	Lox	18851	-0.253	-0.0704	No
131	Igfbp4	19156	-0.268	-0.0772	No
132	Nid2	19198	-0.271	-0.0727	No
133	Col6a3	19357	-0.279	-0.0730	No
134	Tnc	19471	-0.282	-0.0713	No
135	Il15	19802	-0.301	-0.0784	No
136	Sdc4	19829	-0.303	-0.0725	No
137	Crlf1	19862	-0.305	-0.0669	No
138	Fbn1	20155	-0.316	-0.0720	No
139	Cdh2	20198	-0.319	-0.0664	No
140	Sntb1	20441	-0.332	-0.0691	No
141	Emp3	20559	-0.339	-0.0662	No
142	Mest	20608	-0.344	-0.0603	No
143	Lama2	20657	-0.347	-0.0544	No
144	Glipr1	20758	-0.354	-0.0505	No
145	Cadm1	21012	-0.370	-0.0527	No
146	Tgfb1	21120	-0.378	-0.0485	No
147	Pdgfrb	21402	-0.399	-0.0513	No
148	Matn3	21475	-0.404	-0.0450	No
149	Fbln5	21809	-0.433	-0.0492	No
150	Pvr	22041	-0.451	-0.0487	No
151	Abi3bp	22100	-0.457	-0.0406	No
152	Gpx7	22395	-0.489	-0.0418	No
153	Postn	22807	-0.544	-0.0468	No
154	Col16a1	22850	-0.551	-0.0358	No
155	Vegfc	23102	-0.609	-0.0324	No
156	Bmp1	23196	-0.637	-0.0217	No
157	Col4a2	23515	-0.805	-0.0167	No
158	Id2	23574	-0.922	0.0021	No