Details for gene set HALLMARK

Table: GSEA Results Summary

Dataset	GMP.GMP.mono_Pheno.cls #Group2_versus_Group4.GMP.mono_Pheno.cls #Group2_versus_Group4_repos
Phenotype	GMP.mono_Pheno.cls#Group2_versus_Group4_repos
Upregulated in class	1
GeneSet	HALLMARK_APOPTOSIS
Enrichment Score (ES)	0.27355963
Normalized Enrichment Score (NES)	1.2248588
Nominal p-value	0.16475096
FDR q-value	0.5539922
FWER p-Value	0.863

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Sptan1	131	0.817	0.0193	Yes
2	Tnfrsf12a	364	0.694	0.0305	Yes
3	Lgals3	440	0.669	0.0476	Yes
4	Etf1	547	0.634	0.0624	Yes
5	Hmox1	626	0.610	0.0776	Yes
6	Pmaip1	1041	0.539	0.0764	Yes
7	Mcl1	1047	0.538	0.0925	Yes
8	Rhob	1065	0.536	0.1081	Yes
9	Lmna	1115	0.527	0.1221	Yes
10	Gadd45a	1194	0.519	0.1345	Yes
11	Cdc25b	1569	0.475	0.1330	Yes
12	Dffa	1643	0.467	0.1441	Yes
13	Top2a	2019	0.440	0.1415	Yes
14	Cdkn1b	2130	0.430	0.1499	Yes
15	App	2153	0.428	0.1620	Yes
16	Jun	2721	0.387	0.1496	Yes
17	Retsat	3111	0.361	0.1441	Yes
18	Smad7	3112	0.361	0.1550	Yes
19	Timp3	3180	0.356	0.1630	Yes
20	Il1b	3201	0.356	0.1730	Yes
21	Dnajc3	3241	0.353	0.1821	Yes
22	Cd38	3418	0.342	0.1850	Yes
23	Il18	3654	0.329	0.1850	Yes
24	F2	3729	0.325	0.1917	Yes
25	Cth	3830	0.317	0.1971	Yes
26	Timp1	3952	0.310	0.2013	Yes
27	Bgn	4022	0.308	0.2078	Yes
28	Casp2	4137	0.303	0.2121	Yes
29	Igf2r	4141	0.302	0.2212	Yes
30	Clu	4182	0.300	0.2286	Yes
31	Cd69	4265	0.295	0.2341	Yes
32	Sc5d	4444	0.289	0.2353	Yes
33	Erbb3	4634	0.280	0.2358	Yes
34	Txnip	4694	0.276	0.2417	Yes
35	Gsr	4876	0.267	0.2421	Yes
36	Brca1	5039	0.257	0.2430	Yes
37	Sqstm1	5196	0.249	0.2439	Yes
38	Gpx3	5343	0.242	0.2451	Yes
39	Lef1	5428	0.237	0.2487	Yes
40	Madd	5482	0.235	0.2536	Yes
41	Ctnnb1	5696	0.228	0.2515	Yes
42	Fdxr	5910	0.219	0.2491	Yes
43	Bcl2l1	5996	0.215	0.2520	Yes
44	Tnf	6071	0.211	0.2553	Yes
45	Aifm3	6247	0.203	0.2540	Yes
46	Ppp3r1	6304	0.201	0.2577	Yes
47	Ifngr1	6427	0.198	0.2586	Yes
48	Sod2	6451	0.197	0.2636	Yes
49	Bcap31	6754	0.185	0.2563	Yes
50	Tgfbr3	6759	0.185	0.2618	Yes
51	Add1	6913	0.179	0.2607	Yes
52	Hmgb2	6914	0.179	0.2662	Yes
53	Fas	7301	0.163	0.2547	Yes
54	Btg3	7326	0.162	0.2586	Yes
55	Nefh	7346	0.161	0.2627	Yes
56	Gstm2	7408	0.158	0.2649	Yes
57	Casp4	7428	0.158	0.2689	Yes
58	Eno2	7432	0.158	0.2736	Yes
59	Birc3	7583	0.151	0.2718	No
60	Bax	8240	0.125	0.2476	No
61	Anxa1	8377	0.123	0.2456	No
62	Irf1	8586	0.118	0.2403	No
63	Gsn	8697	0.114	0.2391	No
64	Bcl2l2	8718	0.114	0.2417	No
65	Slc20a1	8817	0.110	0.2409	No
66	Psen2	8901	0.107	0.2406	No
67	Dnm1l	9058	0.101	0.2370	No
68	H1f0	9101	0.099	0.2383	No
69	Cav1	9646	0.079	0.2175	No
70	Ppt1	9838	0.072	0.2116	No
71	Wee1	9934	0.069	0.2096	No
72	Xiap	10089	0.063	0.2050	No
73	Emp1	10206	0.059	0.2018	No
74	Casp1	10342	0.054	0.1977	No
75	Ddit3	10402	0.052	0.1968	No
76	Cyld	10521	0.048	0.1932	No
77	Cflar	10676	0.043	0.1880	No
78	Ier3	10737	0.041	0.1867	No
79	Sat1	10797	0.039	0.1853	No
80	Psen1	10910	0.035	0.1816	No
81	Tspo	10952	0.034	0.1809	No
82	Dnaja1	11269	0.023	0.1682	No
83	Ebp	11332	0.021	0.1661	No
84	Gpx1	11466	0.016	0.1610	No
85	Rara	11782	0.005	0.1477	No
86	Ccnd1	12071	-0.001	0.1355	No
87	Gpx4	12085	-0.001	0.1350	No
88	Pdcd4	12117	-0.002	0.1337	No
89	Dap3	12307	-0.010	0.1260	No
90	Atf3	12314	-0.010	0.1260	No
91	Mmp2	12338	-0.011	0.1254	No
92	Cdkn1a	12342	-0.011	0.1256	No
93	Gadd45b	13055	-0.035	0.0963	No
94	Pea15a	13085	-0.036	0.0962	No
95	Rock1	13107	-0.037	0.0964	No
96	Casp3	13810	-0.061	0.0684	No
97	Bik	14032	-0.068	0.0611	No
98	Casp6	14223	-0.076	0.0553	No
99	Tap1	14358	-0.081	0.0520	No
100	Hgf	14458	-0.085	0.0504	No
101	Casp8	14559	-0.089	0.0489	No
102	Ppp2r5b	14606	-0.090	0.0497	No
103	Cd44	14616	-0.091	0.0520	No
104	Cd14	14679	-0.093	0.0522	No
105	Btg2	14863	-0.099	0.0474	No
106	Sod1	15144	-0.111	0.0389	No
107	Crebbp	15219	-0.113	0.0392	No
108	Bid	15225	-0.114	0.0424	No
109	Krt18	15240	-0.114	0.0453	No
110	Fez1	15626	-0.128	0.0328	No
111	Casp9	15861	-0.137	0.0270	No
112	Bnip3l	15953	-0.141	0.0274	No
113	Rhot2	16128	-0.147	0.0244	No
114	Vdac2	16288	-0.152	0.0223	No
115	Rela	16476	-0.159	0.0192	No
116	Pak1	16897	-0.177	0.0067	No
117	Cdk2	17064	-0.183	0.0052	No
118	Dcn	17072	-0.184	0.0105	No
119	Ccnd2	17240	-0.187	0.0091	No
120	Ifitm3	18018	-0.217	-0.0174	No
121	Rnasel	18558	-0.239	-0.0331	No
122	Gch1	18734	-0.248	-0.0330	No
123	Timp2	18808	-0.251	-0.0285	No
124	Mgmt	18875	-0.253	-0.0236	No
125	Diablo	18901	-0.255	-0.0169	No
126	Tgfb2	19010	-0.261	-0.0136	No
127	Dap	19286	-0.275	-0.0169	No
128	Bcl10	19493	-0.283	-0.0171	No
129	Gna15	19907	-0.307	-0.0253	No
130	Tnfsf10	19999	-0.310	-0.0198	No
131	Bcl2l11	20156	-0.316	-0.0168	No
132	Satb1	20227	-0.320	-0.0101	No
133	Nedd9	20238	-0.321	-0.0007	No
134	Bmf	20607	-0.343	-0.0060	No
135	Casp7	20915	-0.363	-0.0080	No
136	Dpyd	21035	-0.372	-0.0017	No
137	Gucy2e	21092	-0.376	0.0073	No
138	Pdgfrb	21402	-0.399	0.0063	No
139	Plcb2	21622	-0.417	0.0096	No
140	Ptk2	22661	-0.521	-0.0187	No
141	Isg20	23159	-0.624	-0.0209	No
142	Ank	23208	-0.641	-0.0034	No
143	F2r	23363	-0.694	0.0111	No