Details for gene set HALLMARK_APICAL

Table: GSEA Results Summary

Dataset	GMP.GMP.mono_Pheno.cls #Group2_versus_Group4.GMP.mono_Pheno.cls #Group2_versus_Group4_repos
Phenotype	GMP.mono_Pheno.cls#Group2_versus_Group4_repos
Upregulated in class	3
GeneSet	HALLMARK_APICAL_JUNCTION
Enrichment Score (ES)	-0.15763989
Normalized Enrichment Score (NES)	-0.6850196
Nominal p-value	0.97352344
FDR q-value	0.9422106
FWER p-Value	1.0

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Cdk8	124	0.829	0.0142	No
2	Cd86	157	0.802	0.0317	No
3	Dhx16	568	0.627	0.0290	No
4	Myh9	727	0.590	0.0362	No
5	Mpzl1	788	0.578	0.0472	No
6	Tmem8b	1174	0.522	0.0430	No
7	Adam9	1263	0.511	0.0513	No
8	Ywhah	1304	0.504	0.0615	No
9	Gnai1	1413	0.494	0.0685	No
10	Inppl1	1501	0.484	0.0762	No
11	Mmp9	1680	0.463	0.0795	No
12	Cadm3	1804	0.455	0.0849	No
13	Flnc	2129	0.430	0.0812	No
14	Jam3	2225	0.422	0.0871	No
15	Adam15	2618	0.394	0.0797	No
16	Cd276	2952	0.372	0.0742	No
17	Itgb1	3266	0.352	0.0691	No
18	Fscn1	3568	0.334	0.0642	No
19	Actn3	3637	0.330	0.0690	No
20	Cdh4	3699	0.327	0.0741	No
21	Msn	3712	0.326	0.0813	No
22	Epb41l2	4016	0.308	0.0756	No
23	Tro	4019	0.308	0.0828	No
24	Myh10	4267	0.295	0.0792	No
25	Ikbkg	4268	0.295	0.0861	No
26	Gtf2f1	4339	0.291	0.0900	No
27	Rras	4350	0.290	0.0964	No
28	Parva	4390	0.290	0.1015	No
29	Vwf	4702	0.276	0.0947	No
30	Tsc1	4782	0.271	0.0977	No
31	Plcg1	5065	0.256	0.0917	No
32	Vcl	5199	0.249	0.0919	No
33	Actg2	5307	0.244	0.0931	No
34	Lima1	5437	0.237	0.0932	No
35	Rasa1	5459	0.236	0.0978	No
36	Insig1	5544	0.231	0.0997	No
37	Ctnna1	5584	0.230	0.1034	No
38	Crat	5592	0.230	0.1086	No
39	Actb	5831	0.223	0.1037	No
40	Itga3	5951	0.217	0.1037	No
41	Itga2	6078	0.211	0.1033	No
42	Thbs3	6199	0.205	0.1030	No
43	Actg1	6202	0.205	0.1077	No
44	Itgb4	6245	0.203	0.1107	No
45	Nrtn	6445	0.197	0.1069	No
46	Arhgef6	6533	0.193	0.1077	No
47	Nrap	6589	0.191	0.1099	No
48	Icam1	6769	0.185	0.1066	No
49	Amh	6890	0.180	0.1057	No
50	Wasl	6916	0.179	0.1088	No
51	Shroom2	6937	0.177	0.1121	No
52	Actn2	6974	0.176	0.1148	No
53	Pten	6998	0.175	0.1179	No
54	Negr1	7106	0.170	0.1173	No
55	Lama3	7282	0.164	0.1137	No
56	Cap1	7411	0.158	0.1120	No
57	Actn1	7420	0.158	0.1154	No
58	Skap2	7514	0.154	0.1150	No
59	Akt2	7589	0.151	0.1154	No
60	B4galt1	7590	0.150	0.1189	No
61	Slc30a3	8017	0.133	0.1039	No
62	Slit2	8033	0.133	0.1064	No
63	Nlgn2	8234	0.125	0.1008	No
64	Nf2	8236	0.125	0.1037	No
65	Ptprc	8254	0.125	0.1059	No
66	Col9a1	8276	0.124	0.1080	No
67	Dsc1	8291	0.124	0.1103	No
68	Myl9	8300	0.124	0.1128	No
69	Cdh3	8407	0.123	0.1112	No
70	Nectin2	8626	0.117	0.1047	No
71	Shc1	8736	0.113	0.1027	No
72	Egfr	8793	0.111	0.1029	No
73	Pik3cb	8830	0.109	0.1039	No
74	Cntn1	8864	0.108	0.1051	No
75	Cldn15	8881	0.108	0.1069	No
76	Pals1	9108	0.099	0.0996	No
77	Hras	9340	0.090	0.0919	No
78	Tial1	9343	0.090	0.0939	No
79	Ctnnd1	9391	0.089	0.0940	No
80	Rhof	9412	0.088	0.0952	No
81	Vasp	9421	0.088	0.0970	No
82	Map3k20	9543	0.083	0.0938	No
83	Nfasc	9605	0.081	0.0931	No
84	Actn4	9781	0.074	0.0874	No
85	Tgfbi	9871	0.071	0.0852	No
86	Tspan4	9874	0.071	0.0868	No
87	Kcnh2	9946	0.068	0.0854	No
88	Mapk14	9997	0.067	0.0848	No
89	Vcan	10437	0.051	0.0673	No
90	Adamts5	10556	0.048	0.0634	No
91	Ldlrap1	10690	0.042	0.0587	No
92	Amigo2	10863	0.036	0.0522	No
93	Stx4a	11017	0.031	0.0464	No
94	Cdh6	11159	0.027	0.0411	No
95	Thy1	11304	0.022	0.0354	No
96	Cdh11	11397	0.019	0.0320	No
97	Mapk11	11631	0.010	0.0223	No
98	Gamt	12337	-0.011	-0.0076	No
99	Mmp2	12338	-0.011	-0.0073	No
100	Evl	12525	-0.017	-0.0148	No
101	Taok2	12787	-0.026	-0.0254	No
102	Nrxn2	12913	-0.030	-0.0300	No
103	Gnai2	12935	-0.031	-0.0301	No
104	Cdh8	13329	-0.045	-0.0458	No
105	Dlg1	13504	-0.051	-0.0520	No
106	Speg	13640	-0.056	-0.0565	No
107	Nf1	13860	-0.063	-0.0643	No
108	Tjp1	14117	-0.072	-0.0736	No
109	Mvd	14252	-0.077	-0.0775	No
110	Adam23	14418	-0.083	-0.0826	No
111	Sgce	14491	-0.087	-0.0836	No
112	Src	14624	-0.091	-0.0871	No
113	Wnk4	14710	-0.094	-0.0885	No
114	Vcam1	14734	-0.095	-0.0872	No
115	Irs1	14907	-0.101	-0.0922	No
116	Vav2	15136	-0.110	-0.0993	No
117	Mapk13	15483	-0.124	-0.1112	No
118	Icam4	15489	-0.124	-0.1085	No
119	Pik3r3	15730	-0.132	-0.1156	No
120	Map4k2	15777	-0.134	-0.1144	No
121	Lamc2	16020	-0.143	-0.1214	No
122	Baiap2	16064	-0.144	-0.1198	No
123	Cldn14	16152	-0.147	-0.1200	No
124	Cadm2	16210	-0.150	-0.1189	No
125	Icam2	16247	-0.151	-0.1169	No
126	Zyx	16345	-0.154	-0.1174	No
127	Sirpa	16348	-0.154	-0.1139	No
128	Tubg1	16717	-0.170	-0.1256	No
129	Adra1b	16818	-0.173	-0.1258	No
130	Syk	16862	-0.175	-0.1235	No
131	Rsu1	17009	-0.181	-0.1255	No
132	Itga10	17125	-0.185	-0.1260	No
133	Pkd1	17518	-0.198	-0.1381	No
134	Hadh	17548	-0.199	-0.1346	No
135	Exoc4	17567	-0.200	-0.1307	No
136	Lamb3	18034	-0.218	-0.1454	No
137	Cdh1	18118	-0.221	-0.1438	No
138	Icam5	18175	-0.223	-0.1409	No
139	Pecam1	18297	-0.229	-0.1407	No
140	Arpc2	18580	-0.240	-0.1471	No
141	Alox8	18685	-0.245	-0.1458	No
142	Nectin1	18828	-0.252	-0.1459	No
143	Akt3	18964	-0.257	-0.1456	No
144	Sympk	19038	-0.263	-0.1425	No
145	Mdk	19350	-0.278	-0.1492	No
146	Calb2	19520	-0.285	-0.1498	No
147	Cx3cl1	19706	-0.294	-0.1507	Yes
148	Jup	19735	-0.297	-0.1449	Yes
149	Crb3	19941	-0.309	-0.1464	Yes
150	Fbn1	20155	-0.316	-0.1481	Yes
151	Nlgn3	20222	-0.320	-0.1433	Yes
152	Cercam	20309	-0.325	-0.1394	Yes
153	Nectin4	20408	-0.330	-0.1358	Yes
154	Traf1	20463	-0.334	-0.1302	Yes
155	Pfn1	20629	-0.345	-0.1291	Yes
156	Amigo1	20724	-0.352	-0.1249	Yes
157	Myl12b	21025	-0.372	-0.1289	Yes
158	Pbx2	21098	-0.376	-0.1231	Yes
159	Itga9	21227	-0.386	-0.1195	Yes
160	Cnn2	21329	-0.393	-0.1146	Yes
161	Nectin3	21576	-0.412	-0.1154	Yes
162	Layn	21583	-0.413	-0.1059	Yes
163	Dsc3	22178	-0.463	-0.1203	Yes
164	Cd34	22576	-0.510	-0.1253	Yes
165	Ptk2	22661	-0.521	-0.1166	Yes
166	Pard6g	22758	-0.538	-0.1080	Yes
167	Nexn	22762	-0.539	-0.0954	Yes
168	Acta1	22796	-0.543	-0.0841	Yes
169	Col17a1	22844	-0.550	-0.0731	Yes
170	Col16a1	22850	-0.551	-0.0604	Yes
171	Sdc3	22996	-0.585	-0.0528	Yes
172	Cd274	23061	-0.600	-0.0414	Yes
173	Bmp1	23196	-0.637	-0.0321	Yes
174	Sorbs3	23215	-0.642	-0.0178	Yes
175	Atp1a3	23263	-0.657	-0.0043	Yes
176	Rac2	23539	-0.835	0.0036	Yes