Details for gene set HALLMARK

Table: GSEA Results Summary

Dataset	GMP.GMP.mono_Pheno.cls #Group2_versus_Group3.GMP.mono_Pheno.cls #Group2_versus_Group3_repos
Phenotype	GMP.mono_Pheno.cls#Group2_versus_Group3_repos
Upregulated in class	1
GeneSet	HALLMARK_HYPOXIA
Enrichment Score (ES)	0.25160852
Normalized Enrichment Score (NES)	1.0245882
Nominal p-value	0.42885375
FDR q-value	0.8142715
FWER p-Value	0.994

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Plin2	81	0.821	0.0167	Yes
2	Bhlhe40	95	0.795	0.0357	Yes
3	Hs3st1	125	0.764	0.0532	Yes
4	Adora2b	263	0.667	0.0638	Yes
5	Pgk1	277	0.662	0.0795	Yes
6	Dtna	319	0.640	0.0934	Yes
7	Hmox1	326	0.634	0.1088	Yes
8	Sap30	334	0.630	0.1239	Yes
9	Hdlbp	458	0.589	0.1332	Yes
10	Pim1	602	0.554	0.1407	Yes
11	Pfkp	645	0.543	0.1522	Yes
12	Klf6	678	0.536	0.1640	Yes
13	Fos	777	0.519	0.1726	Yes
14	Hspa5	816	0.513	0.1835	Yes
15	Ero1a	953	0.491	0.1898	Yes
16	Phkg1	1012	0.483	0.1992	Yes
17	Vegfa	1224	0.456	0.2014	Yes
18	Anxa2	1292	0.448	0.2096	Yes
19	Tgfbi	1540	0.424	0.2094	Yes
20	Noct	1633	0.412	0.2157	Yes
21	Gapdhs	1669	0.409	0.2242	Yes
22	Cdkn1b	1691	0.408	0.2333	Yes
23	Pfkl	2136	0.371	0.2235	Yes
24	Dusp1	2270	0.360	0.2267	Yes
25	Chst2	2321	0.356	0.2333	Yes
26	Pklr	2874	0.320	0.2176	Yes
27	Jun	2972	0.313	0.2212	Yes
28	P4ha1	2987	0.313	0.2283	Yes
29	Ak4	3113	0.307	0.2305	Yes
30	Myh9	3191	0.303	0.2347	Yes
31	Zfp36	3222	0.302	0.2408	Yes
32	Hk2	3448	0.290	0.2383	Yes
33	Gpi1	3692	0.278	0.2348	Yes
34	Hk1	3812	0.272	0.2364	Yes
35	Tpd52	3829	0.270	0.2423	Yes
36	Cavin1	3870	0.268	0.2472	Yes
37	Csrp2	3921	0.266	0.2516	Yes
38	Gpc3	4384	0.241	0.2378	No
39	Casp6	4562	0.232	0.2360	No
40	Atf3	4612	0.230	0.2396	No
41	Aldoa	4756	0.227	0.2390	No
42	Btg1	5111	0.210	0.2291	No
43	Eno3	5152	0.208	0.2325	No
44	F3	5251	0.203	0.2333	No
45	Vldlr	5335	0.201	0.2347	No
46	Tktl1	5588	0.189	0.2286	No
47	Tes	5686	0.186	0.2291	No
48	Pdk1	5907	0.177	0.2240	No
49	Jmjd6	5923	0.176	0.2277	No
50	Mt1	6086	0.170	0.2250	No
51	Foxo3	6099	0.170	0.2286	No
52	Rragd	6366	0.160	0.2212	No
53	Klf7	6543	0.153	0.2175	No
54	Ddit4	6591	0.151	0.2192	No
55	Ets1	6726	0.146	0.2171	No
56	Nr3c1	6788	0.143	0.2180	No
57	Slc2a5	6929	0.139	0.2154	No
58	P4ha2	7436	0.123	0.1969	No
59	Lox	7521	0.120	0.1962	No
60	Tpi1	7563	0.118	0.1974	No
61	Ppp1r15a	8045	0.102	0.1794	No
62	Ndst1	8047	0.102	0.1818	No
63	Stbd1	8181	0.098	0.1786	No
64	Tmem45a	8480	0.087	0.1680	No
65	Siah2	8703	0.080	0.1605	No
66	Vhl	8705	0.080	0.1624	No
67	Cp	8767	0.078	0.1617	No
68	Cav1	8832	0.076	0.1609	No
69	Gys1	8899	0.074	0.1599	No
70	Pfkfb3	8921	0.073	0.1607	No
71	Slc6a6	9053	0.069	0.1568	No
72	Col5a1	9088	0.067	0.1570	No
73	Map3k1	9270	0.061	0.1508	No
74	Eno1b	9276	0.061	0.1521	No
75	Scarb1	9343	0.059	0.1507	No
76	Pam	9374	0.058	0.1509	No
77	Pgam2	9443	0.056	0.1494	No
78	Angptl4	9520	0.053	0.1474	No
79	Kdm3a	9773	0.045	0.1378	No
80	Fosl2	9805	0.044	0.1375	No
81	Ldha	9885	0.042	0.1352	No
82	Ccng2	10102	0.036	0.1269	No
83	S100a4	10125	0.035	0.1268	No
84	Large1	10136	0.035	0.1272	No
85	Gpc4	10173	0.034	0.1265	No
86	Atp7a	10183	0.034	0.1270	No
87	Ugp2	10218	0.032	0.1263	No
88	Akap12	10469	0.025	0.1163	No
89	Eno2	10721	0.017	0.1060	No
90	Aldoc	10846	0.013	0.1010	No
91	B4galnt2	10983	0.009	0.0954	No
92	Cxcr4	11053	0.007	0.0927	No
93	Kdelr3	11114	0.005	0.0902	No
94	Nfil3	11222	0.002	0.0857	No
95	Stc2	11750	-0.014	0.0636	No
96	Fam162a	11901	-0.018	0.0576	No
97	Efna1	11913	-0.018	0.0576	No
98	Ankzf1	12096	-0.024	0.0504	No
99	Xpnpep1	12138	-0.025	0.0493	No
100	Egfr	12324	-0.031	0.0422	No
101	Mxi1	12562	-0.038	0.0330	No
102	Car12	12574	-0.038	0.0334	No
103	Cdkn1c	12613	-0.039	0.0328	No
104	Rbpj	12693	-0.042	0.0305	No
105	Nedd4l	12695	-0.042	0.0315	No
106	Tiparp	12709	-0.043	0.0320	No
107	Pdk3	12807	-0.046	0.0290	No
108	Zfp292	12848	-0.048	0.0284	No
109	Slc2a3	13439	-0.069	0.0050	No
110	Tnfaip3	13575	-0.074	0.0010	No
111	Slc37a4	13605	-0.074	0.0016	No
112	Ppargc1a	13732	-0.079	-0.0018	No
113	Cdkn1a	13944	-0.086	-0.0087	No
114	Bnip3l	14002	-0.087	-0.0090	No
115	Gcnt2	14171	-0.093	-0.0139	No
116	Errfi1	14212	-0.094	-0.0133	No
117	Grhpr	14353	-0.099	-0.0168	No
118	Plaur	14731	-0.110	-0.0302	No
119	Ndst2	14764	-0.112	-0.0288	No
120	Wsb1	14797	-0.113	-0.0274	No
121	Tpst2	14815	-0.113	-0.0253	No
122	Glrx	15145	-0.125	-0.0363	No
123	Gpc1	15232	-0.127	-0.0368	No
124	Slc25a1	15425	-0.134	-0.0417	No
125	Tgm2	15427	-0.134	-0.0385	No
126	Irs2	15454	-0.135	-0.0363	No
127	Sdc3	15461	-0.135	-0.0332	No
128	Mif	15862	-0.151	-0.0465	No
129	Kif5a	15910	-0.153	-0.0448	No
130	Plac8	16325	-0.167	-0.0583	No
131	Gaa	16340	-0.168	-0.0548	No
132	Pgm2	16435	-0.171	-0.0546	No
133	Pnrc1	16490	-0.172	-0.0527	No
134	Dcn	16622	-0.177	-0.0539	No
135	Hexa	16921	-0.188	-0.0620	No
136	Ampd3	17026	-0.193	-0.0617	No
137	Gbe1	17399	-0.208	-0.0725	No
138	Isg20	17711	-0.221	-0.0803	No
139	Prdx5	17921	-0.231	-0.0835	No
140	Ext1	18071	-0.237	-0.0841	No
141	Ndrg1	18442	-0.253	-0.0936	No
142	Tgfb3	18535	-0.257	-0.0912	No
143	Prkca	18552	-0.257	-0.0856	No
144	Lxn	18597	-0.260	-0.0811	No
145	Sdc2	18722	-0.264	-0.0799	No
146	Pgm1	18732	-0.264	-0.0738	No
147	Gck	18949	-0.273	-0.0763	No
148	Slc2a1	19341	-0.291	-0.0858	No
149	Klhl24	19592	-0.305	-0.0890	No
150	Selenbp1	19849	-0.319	-0.0921	No
151	Ldhc	20003	-0.327	-0.0906	No
152	Bgn	20174	-0.338	-0.0895	No
153	Ilvbl	20273	-0.345	-0.0852	No
154	Ier3	20403	-0.353	-0.0821	No
155	Nagk	20659	-0.368	-0.0839	No
156	B3galt6	20858	-0.380	-0.0830	No
157	Maff	20977	-0.388	-0.0785	No
158	Ddit3	20997	-0.390	-0.0698	No
159	Sult2b1	21337	-0.414	-0.0740	No
160	Chst3	21341	-0.414	-0.0640	No
161	Sdc4	22222	-0.497	-0.0893	No
162	Bcl2	22286	-0.504	-0.0796	No
163	Pygm	22371	-0.516	-0.0706	No
164	Ids	22385	-0.518	-0.0584	No
165	Ppfia4	22497	-0.535	-0.0500	No
166	Galk1	22733	-0.572	-0.0459	No
167	Rora	22807	-0.586	-0.0347	No
168	Cavin3	22823	-0.591	-0.0208	No
169	Cited2	23059	-0.639	-0.0151	No
170	Fbp1	23233	-0.700	-0.0053	No
171	Pdgfb	23521	-0.892	0.0044	No