Details for gene set HALLMARK

Table: GSEA Results Summary

Dataset	GMP.GMP.mono_Pheno.cls #Group2_versus_Group3.GMP.mono_Pheno.cls #Group2_versus_Group3_repos
Phenotype	GMP.mono_Pheno.cls#Group2_versus_Group3_repos
Upregulated in class	1
GeneSet	HALLMARK_COMPLEMENT
Enrichment Score (ES)	0.24601923
Normalized Enrichment Score (NES)	0.98848635
Nominal p-value	0.4920635
FDR q-value	0.8371219
FWER p-Value	0.999

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Hspa1a	17	1.120	0.0258	Yes
2	Lgals3	20	1.064	0.0509	Yes
3	Plg	24	1.039	0.0754	Yes
4	Ctsc	158	0.736	0.0872	Yes
5	Cebpb	324	0.636	0.0952	Yes
6	S100a9	407	0.605	0.1060	Yes
7	Pim1	602	0.554	0.1109	Yes
8	Ctsl	625	0.547	0.1229	Yes
9	Clu	626	0.546	0.1358	Yes
10	Hspa5	816	0.513	0.1399	Yes
11	F2	902	0.497	0.1481	Yes
12	Mmp8	995	0.485	0.1557	Yes
13	Gngt2	1084	0.471	0.1631	Yes
14	Klkb1	1397	0.439	0.1601	Yes
15	Lrp1	1418	0.437	0.1696	Yes
16	Gca	1426	0.436	0.1797	Yes
17	Adam9	1635	0.412	0.1806	Yes
18	Ltf	1888	0.391	0.1791	Yes
19	Dgkg	1905	0.389	0.1876	Yes
20	Pik3r5	1982	0.384	0.1935	Yes
21	Pla2g7	2468	0.347	0.1810	Yes
22	Apoc1	2690	0.334	0.1795	Yes
23	Me1	2715	0.332	0.1864	Yes
24	Lamp2	2746	0.329	0.1929	Yes
25	Prep	2919	0.317	0.1930	Yes
26	Irf1	3008	0.312	0.1967	Yes
27	Cdk5r1	3036	0.310	0.2029	Yes
28	Calm3	3172	0.304	0.2043	Yes
29	Cdh13	3212	0.302	0.2098	Yes
30	Vcpip1	3227	0.301	0.2163	Yes
31	Rbsn	3248	0.300	0.2226	Yes
32	Cr2	3530	0.286	0.2174	Yes
33	Gmfb	3551	0.286	0.2233	Yes
34	Gnai3	3637	0.281	0.2264	Yes
35	Plscr1	3700	0.277	0.2303	Yes
36	C3	3986	0.263	0.2243	Yes
37	Jak2	3989	0.262	0.2305	Yes
38	Irf7	4056	0.259	0.2338	Yes
39	Dock4	4278	0.247	0.2302	Yes
40	F7	4285	0.247	0.2358	Yes
41	F10	4327	0.244	0.2398	Yes
42	Prdm4	4421	0.240	0.2416	Yes
43	C1qc	4649	0.229	0.2373	Yes
44	Rabif	4816	0.224	0.2355	Yes
45	Ctsb	4997	0.215	0.2330	Yes
46	S100a13	5011	0.214	0.2375	Yes
47	Usp14	5113	0.210	0.2381	Yes
48	Pla2g4a	5148	0.208	0.2416	Yes
49	F3	5251	0.203	0.2421	Yes
50	Ccl5	5272	0.202	0.2460	Yes
51	Ppp4c	5481	0.194	0.2417	No
52	Rce1	5492	0.193	0.2459	No
53	C9	5656	0.187	0.2434	No
54	Gzmk	5702	0.185	0.2459	No
55	Gng2	5841	0.179	0.2442	No
56	Anxa5	6100	0.170	0.2372	No
57	Raf1	6277	0.163	0.2336	No
58	Serpinb2	6382	0.159	0.2329	No
59	Msrb1	6559	0.153	0.2290	No
60	Prss36	6575	0.152	0.2320	No
61	Kif2a	6628	0.150	0.2333	No
62	Lap3	6725	0.146	0.2327	No
63	Ctsd	6744	0.145	0.2354	No
64	Pclo	6757	0.145	0.2383	No
65	Hnf4a	7031	0.135	0.2298	No
66	Ppp2cb	7204	0.128	0.2255	No
67	Pik3ca	7216	0.127	0.2281	No
68	Usp8	7434	0.123	0.2217	No
69	Ctsh	7693	0.114	0.2134	No
70	Grb2	7991	0.104	0.2032	No
71	Kynu	8081	0.101	0.2018	No
72	Usp16	8249	0.095	0.1969	No
73	Dock9	8315	0.093	0.1964	No
74	Usp15	8448	0.089	0.1928	No
75	Kcnip2	8679	0.081	0.1849	No
76	Cp	8767	0.078	0.1831	No
77	Casp1	8778	0.077	0.1845	No
78	Gp1ba	8821	0.076	0.1845	No
79	Fcnb	8879	0.074	0.1838	No
80	Col4a2	8887	0.074	0.1853	No
81	Gnai2	9175	0.065	0.1746	No
82	Tfpi2	9332	0.059	0.1693	No
83	Casp3	9529	0.053	0.1622	No
84	Serpinc1	9535	0.053	0.1632	No
85	Actn2	9693	0.047	0.1577	No
86	F5	9916	0.041	0.1492	No
87	Psen1	10197	0.033	0.1380	No
88	Casp4	10201	0.033	0.1387	No
89	Mmp14	10677	0.019	0.1189	No
90	Calm1	10731	0.017	0.1170	No
91	Rnf4	10934	0.011	0.1086	No
92	Dpp4	10955	0.010	0.1080	No
93	Lta4h	11025	0.007	0.1053	No
94	Lcp2	11073	0.006	0.1034	No
95	Car2	11212	0.002	0.0976	No
96	Tmprss6	11469	-0.004	0.0867	No
97	Lyn	11793	-0.015	0.0733	No
98	Stx4a	11918	-0.019	0.0685	No
99	Ctss	12097	-0.024	0.0615	No
100	Xpnpep1	12138	-0.025	0.0604	No
101	Timp1	12320	-0.031	0.0534	No
102	Fdx1	12396	-0.033	0.0509	No
103	Itgam	12629	-0.040	0.0420	No
104	Dyrk2	12630	-0.040	0.0430	No
105	Lgmn	12705	-0.043	0.0408	No
106	Spock2	12771	-0.045	0.0391	No
107	Lipa	12859	-0.048	0.0365	No
108	L3mbtl4	13128	-0.058	0.0265	No
109	Lck	13346	-0.066	0.0188	No
110	Prkcd	13347	-0.066	0.0203	No
111	Sirt6	13508	-0.071	0.0152	No
112	Tnfaip3	13575	-0.074	0.0141	No
113	Cblb	13619	-0.075	0.0141	No
114	Gpd2	13791	-0.081	0.0087	No
115	Phex	13800	-0.081	0.0103	No
116	Sh2b3	14047	-0.089	0.0019	No
117	Olr1	14476	-0.102	-0.0139	No
118	Prcp	14677	-0.108	-0.0199	No
119	Plaur	14731	-0.110	-0.0195	No
120	Rhog	14817	-0.114	-0.0205	No
121	Gnb2	15107	-0.123	-0.0299	No
122	Pcsk9	15129	-0.124	-0.0278	No
123	Fn1	15807	-0.149	-0.0532	No
124	Plek	16060	-0.158	-0.0602	No
125	Was	16168	-0.162	-0.0609	No
126	Fyn	16178	-0.162	-0.0574	No
127	Cfb	16250	-0.165	-0.0566	No
128	Zfpm2	16694	-0.180	-0.0712	No
129	Cd36	16808	-0.183	-0.0717	No
130	Dock10	16892	-0.187	-0.0708	No
131	Cd46	16906	-0.188	-0.0669	No
132	Gata3	16953	-0.190	-0.0644	No
133	Casp9	17450	-0.211	-0.0805	No
134	Gp9	17552	-0.215	-0.0798	No
135	Ang	17848	-0.226	-0.0870	No
136	Fcer1g	17998	-0.234	-0.0878	No
137	Cpq	18031	-0.236	-0.0835	No
138	Rasgrp1	18057	-0.237	-0.0790	No
139	Cpm	18220	-0.243	-0.0802	No
140	Irf2	18322	-0.247	-0.0786	No
141	Serping1	18439	-0.253	-0.0776	No
142	Csrp1	18459	-0.254	-0.0724	No
143	Pdp1	18508	-0.255	-0.0684	No
144	Pfn1	18589	-0.259	-0.0656	No
145	Atox1	18800	-0.267	-0.0683	No
146	Timp2	19068	-0.279	-0.0730	No
147	Mmp15	19223	-0.286	-0.0728	No
148	Psmb9	19462	-0.298	-0.0759	No
149	Gnb4	19570	-0.303	-0.0733	No
150	Scg3	19757	-0.314	-0.0738	No
151	Akap10	19959	-0.325	-0.0747	No
152	Src	20041	-0.330	-0.0703	No
153	Casp7	20305	-0.346	-0.0733	No
154	Brpf3	20501	-0.359	-0.0731	No
155	Pik3cg	20609	-0.365	-0.0690	No
156	Ctso	20860	-0.380	-0.0707	No
157	Maff	20977	-0.388	-0.0664	No
158	Notch4	21291	-0.410	-0.0701	No
159	Cfh	21446	-0.425	-0.0666	No
160	Zeb1	21834	-0.459	-0.0722	No
161	C2	21950	-0.468	-0.0660	No
162	Gzmb	22260	-0.501	-0.0673	No
163	Dusp5	22326	-0.510	-0.0580	No
164	Kcnip3	22622	-0.553	-0.0575	No
165	Dgkh	22660	-0.559	-0.0458	No
166	Dusp6	22828	-0.592	-0.0389	No
167	Cda	23260	-0.714	-0.0404	No
168	F8	23293	-0.727	-0.0245	No
169	Ehd1	23316	-0.736	-0.0080	No
170	Pdgfb	23521	-0.892	0.0044	No