Details for gene set HALLMARK

Table: GSEA Results Summary

Dataset	GMP.GMP.mono_Pheno.cls #Group2_versus_Group3.GMP.mono_Pheno.cls #Group2_versus_Group3_repos
Phenotype	GMP.mono_Pheno.cls#Group2_versus_Group3_repos
Upregulated in class	1
GeneSet	HALLMARK_APOPTOSIS
Enrichment Score (ES)	0.24233261
Normalized Enrichment Score (NES)	1.0442579
Nominal p-value	0.3908524
FDR q-value	0.8013605
FWER p-Value	0.99

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Lgals3	20	1.064	0.0342	Yes
2	Mcl1	148	0.748	0.0534	Yes
3	Hmox1	326	0.634	0.0667	Yes
4	Clu	626	0.546	0.0720	Yes
5	Sptan1	886	0.500	0.0775	Yes
6	F2	902	0.497	0.0932	Yes
7	App	1077	0.472	0.1013	Yes
8	Igf2r	1314	0.445	0.1059	Yes
9	Gadd45a	1325	0.444	0.1201	Yes
10	Etf1	1396	0.439	0.1316	Yes
11	Cdkn1b	1691	0.408	0.1325	Yes
12	Tspo	1716	0.406	0.1449	Yes
13	Il1b	2334	0.356	0.1303	Yes
14	Bcap31	2445	0.349	0.1371	Yes
15	Rara	2588	0.340	0.1423	Yes
16	Sat1	2755	0.328	0.1460	Yes
17	Jun	2972	0.313	0.1472	Yes
18	Irf1	3008	0.312	0.1559	Yes
19	Nefh	3013	0.311	0.1660	Yes
20	Cd14	3064	0.308	0.1740	Yes
21	Ppp3r1	3146	0.306	0.1807	Yes
22	Top2a	3338	0.295	0.1822	Yes
23	Brca1	3395	0.291	0.1894	Yes
24	Anxa1	3408	0.291	0.1985	Yes
25	Gsr	3717	0.276	0.1945	Yes
26	Slc20a1	4092	0.257	0.1870	Yes
27	Dnaja1	4177	0.252	0.1918	Yes
28	Casp2	4398	0.241	0.1903	Yes
29	Ifngr1	4441	0.239	0.1964	Yes
30	Hmgb2	4539	0.233	0.1999	Yes
31	Casp6	4562	0.232	0.2067	Yes
32	Atf3	4612	0.230	0.2121	Yes
33	Dnajc3	4629	0.230	0.2190	Yes
34	Cd69	4782	0.226	0.2200	Yes
35	Tnfrsf12a	4903	0.220	0.2221	Yes
36	Ifitm3	4905	0.220	0.2293	Yes
37	Bmf	5239	0.204	0.2219	Yes
38	Cdc25b	5365	0.199	0.2231	Yes
39	Ctnnb1	5480	0.194	0.2246	Yes
40	Ppt1	5494	0.193	0.2305	Yes
41	Tgfbr3	5498	0.193	0.2367	Yes
42	Rhob	5530	0.192	0.2417	Yes
43	Erbb3	5858	0.179	0.2336	Yes
44	Mmp2	5891	0.178	0.2381	Yes
45	Dnm1l	5989	0.174	0.2397	Yes
46	Timp3	6061	0.171	0.2423	Yes
47	Gadd45b	6211	0.165	0.2414	No
48	Btg3	6514	0.154	0.2337	No
49	Dap3	6516	0.154	0.2387	No
50	H1f0	6718	0.146	0.2349	No
51	Retsat	7499	0.121	0.2057	No
52	Tgfb2	7879	0.107	0.1931	No
53	Pea15a	7923	0.106	0.1948	No
54	Cd38	8147	0.099	0.1885	No
55	Sod2	8158	0.098	0.1913	No
56	Fdxr	8177	0.098	0.1938	No
57	Smad7	8520	0.086	0.1820	No
58	Madd	8545	0.085	0.1838	No
59	Gpx1	8719	0.079	0.1791	No
60	Casp1	8778	0.077	0.1791	No
61	Sod1	8810	0.076	0.1803	No
62	Cav1	8832	0.076	0.1819	No
63	Pmaip1	8854	0.075	0.1835	No
64	Tnf	8969	0.071	0.1810	No
65	Dffa	9204	0.063	0.1731	No
66	Pak1	9528	0.053	0.1611	No
67	Casp3	9529	0.053	0.1629	No
68	Gpx4	9929	0.041	0.1472	No
69	Tnfsf10	9962	0.040	0.1471	No
70	Bcl10	10064	0.037	0.1441	No
71	Psen1	10197	0.033	0.1395	No
72	Casp4	10201	0.033	0.1405	No
73	Cyld	10231	0.032	0.1403	No
74	Bcl2l1	10394	0.027	0.1343	No
75	Add1	10407	0.027	0.1347	No
76	Rnasel	10435	0.026	0.1344	No
77	Sc5d	10460	0.025	0.1342	No
78	Eno2	10721	0.017	0.1237	No
79	Xiap	10826	0.014	0.1197	No
80	Birc3	10968	0.009	0.1140	No
81	Cdk2	11086	0.005	0.1092	No
82	Aifm3	11101	0.005	0.1088	No
83	Wee1	11261	0.001	0.1020	No
84	Hgf	11486	-0.004	0.0926	No
85	Emp1	11626	-0.009	0.0870	No
86	Cd44	11631	-0.010	0.0871	No
87	Psen2	11906	-0.018	0.0761	No
88	Tap1	12043	-0.022	0.0710	No
89	Rock1	12153	-0.026	0.0672	No
90	Timp1	12320	-0.031	0.0611	No
91	Dpyd	12465	-0.035	0.0562	No
92	Bax	12656	-0.041	0.0494	No
93	Nedd9	12745	-0.044	0.0471	No
94	Bik	13060	-0.056	0.0356	No
95	Cflar	13468	-0.070	0.0206	No
96	Cdkn1a	13944	-0.086	0.0032	No
97	Bnip3l	14002	-0.087	0.0036	No
98	Crebbp	14063	-0.089	0.0040	No
99	Gpx3	14114	-0.091	0.0049	No
100	Ccnd2	14477	-0.102	-0.0072	No
101	Pdcd4	14592	-0.105	-0.0086	No
102	Lef1	14622	-0.106	-0.0063	No
103	Il18	14657	-0.107	-0.0042	No
104	Rela	14735	-0.110	-0.0039	No
105	Ebp	14783	-0.112	-0.0022	No
106	Casp8	15815	-0.149	-0.0412	No
107	F2r	15905	-0.152	-0.0399	No
108	Rhot2	15958	-0.154	-0.0371	No
109	Txnip	15979	-0.155	-0.0328	No
110	Btg2	16222	-0.164	-0.0377	No
111	Fez1	16437	-0.171	-0.0412	No
112	Dcn	16622	-0.177	-0.0432	No
113	Vdac2	16698	-0.180	-0.0405	No
114	Casp9	17450	-0.211	-0.0655	No
115	Cth	17519	-0.213	-0.0614	No
116	Isg20	17711	-0.221	-0.0622	No
117	Dap	17767	-0.223	-0.0572	No
118	Gna15	17847	-0.226	-0.0532	No
119	Bid	18266	-0.245	-0.0629	No
120	Fas	18527	-0.256	-0.0655	No
121	Gucy2e	18679	-0.262	-0.0633	No
122	Gsn	18770	-0.266	-0.0584	No
123	Bcl2l2	18893	-0.271	-0.0547	No
124	Ptk2	19017	-0.276	-0.0508	No
125	Satb1	19038	-0.277	-0.0425	No
126	Timp2	19068	-0.279	-0.0346	No
127	Gch1	19144	-0.283	-0.0285	No
128	Plcb2	19882	-0.320	-0.0493	No
129	Lmna	19940	-0.323	-0.0411	No
130	Diablo	19973	-0.326	-0.0317	No
131	Bcl2l11	20091	-0.333	-0.0257	No
132	Bgn	20174	-0.338	-0.0181	No
133	Sqstm1	20184	-0.339	-0.0073	No
134	Casp7	20305	-0.346	-0.0010	No
135	Ier3	20403	-0.353	0.0065	No
136	Ppp2r5b	20459	-0.356	0.0159	No
137	Ddit3	20997	-0.390	0.0058	No
138	Mgmt	21013	-0.391	0.0181	No
139	Pdgfrb	21768	-0.452	0.0009	No
140	Ccnd1	22105	-0.483	0.0025	No
141	Krt18	22772	-0.580	-0.0068	No
142	Gstm2	23047	-0.637	0.0025	No
143	Ank	23150	-0.668	0.0202	No