Details for gene set HALLMARK

Table: GSEA Results Summary

Dataset	GMP.GMP.mono_Pheno.cls #Group1_versus_Group4.GMP.mono_Pheno.cls #Group1_versus_Group4_repos
Phenotype	GMP.mono_Pheno.cls#Group1_versus_Group4_repos
Upregulated in class	0
GeneSet	HALLMARK_MYOGENESIS
Enrichment Score (ES)	0.26678237
Normalized Enrichment Score (NES)	1.111604
Nominal p-value	0.236
FDR q-value	1.0
FWER p-Value	0.966

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Stc2	66	1.008	0.0205	Yes
2	Kcnh1	68	1.003	0.0436	Yes
3	Fhl1	112	0.910	0.0627	Yes
4	Sptan1	120	0.903	0.0833	Yes
5	Igf1	148	0.855	0.1019	Yes
6	Sh3bgr	282	0.757	0.1137	Yes
7	Myh11	374	0.719	0.1264	Yes
8	Itgb5	493	0.666	0.1368	Yes
9	Ankrd2	723	0.601	0.1409	Yes
10	Myom2	751	0.594	0.1535	Yes
11	Myh9	796	0.584	0.1651	Yes
12	Sgcd	1023	0.548	0.1681	Yes
13	Ckmt2	1235	0.525	0.1712	Yes
14	Casq1	1251	0.523	0.1826	Yes
15	Flii	1383	0.500	0.1886	Yes
16	Pde4dip	1421	0.495	0.1985	Yes
17	Gpx3	1638	0.464	0.2000	Yes
18	Bhlhe40	1657	0.462	0.2099	Yes
19	Pcx	1735	0.454	0.2171	Yes
20	Tagln	1863	0.438	0.2218	Yes
21	Eif4a2	1948	0.432	0.2282	Yes
22	Prnp	2043	0.424	0.2340	Yes
23	Smtn	2236	0.409	0.2352	Yes
24	Tsc2	2596	0.386	0.2288	Yes
25	Myoz1	2603	0.385	0.2375	Yes
26	Hdac5	2625	0.384	0.2455	Yes
27	Fabp3	2906	0.369	0.2421	Yes
28	Col15a1	2968	0.366	0.2479	Yes
29	Ncam1	3091	0.359	0.2510	Yes
30	Fgf2	3239	0.350	0.2528	Yes
31	Fkbp1b	3428	0.338	0.2526	Yes
32	Agl	3728	0.319	0.2472	Yes
33	Sirt2	3751	0.318	0.2536	Yes
34	Gabarapl2	3831	0.313	0.2575	Yes
35	Apod	3851	0.311	0.2639	Yes
36	Ak1	4213	0.292	0.2552	Yes
37	Adcy9	4327	0.285	0.2570	Yes
38	Acsl1	4458	0.278	0.2579	Yes
39	Pygm	4518	0.275	0.2617	Yes
40	Nav2	4548	0.273	0.2668	Yes
41	Foxo4	4813	0.260	0.2615	No
42	Gsn	5250	0.238	0.2484	No
43	Nqo1	5254	0.238	0.2538	No
44	Pgam2	5701	0.223	0.2399	No
45	Akt2	5756	0.220	0.2427	No
46	Vipr1	5812	0.218	0.2454	No
47	Myom1	6017	0.212	0.2416	No
48	Sh2b1	6422	0.197	0.2289	No
49	Cfd	6439	0.197	0.2328	No
50	Sparc	6543	0.193	0.2328	No
51	Bdkrb2	6545	0.193	0.2372	No
52	Itgb4	6837	0.184	0.2291	No
53	Aebp1	6986	0.178	0.2269	No
54	Myl4	7162	0.172	0.2234	No
55	App	7564	0.157	0.2100	No
56	Pick1	7650	0.154	0.2099	No
57	Tead4	7662	0.154	0.2130	No
58	Lpin1	7737	0.151	0.2133	No
59	Wwtr1	7814	0.147	0.2134	No
60	Crat	7884	0.146	0.2139	No
61	Erbb3	7983	0.141	0.2129	No
62	Cd36	8035	0.139	0.2140	No
63	Slc6a8	8100	0.135	0.2144	No
64	Ache	8336	0.126	0.2073	No
65	Mapre3	8370	0.125	0.2087	No
66	Mras	9078	0.099	0.1809	No
67	Ppfia4	9224	0.094	0.1769	No
68	Svil	9422	0.088	0.1705	No
69	Itgb1	9489	0.085	0.1696	No
70	Mylk	9568	0.082	0.1682	No
71	Kcnh2	9574	0.082	0.1699	No
72	Bin1	9587	0.081	0.1712	No
73	Tpm2	9970	0.067	0.1565	No
74	Tnni2	10514	0.047	0.1345	No
75	Mybpc3	10532	0.047	0.1348	No
76	Rit1	10535	0.047	0.1358	No
77	Speg	11102	0.026	0.1123	No
78	Rb1	11120	0.026	0.1122	No
79	Col6a3	11160	0.025	0.1111	No
80	Tcap	11544	0.013	0.0950	No
81	Mef2d	11577	0.012	0.0940	No
82	Ocel1	11674	0.008	0.0901	No
83	Large1	11838	0.003	0.0832	No
84	Gja5	11851	0.002	0.0827	No
85	Pfkm	11856	0.002	0.0826	No
86	Tnnt3	11917	0.000	0.0801	No
87	Col1a1	11928	0.000	0.0796	No
88	Sspn	11952	0.000	0.0786	No
89	Casq2	12240	-0.002	0.0665	No
90	Dmpk	12342	-0.006	0.0623	No
91	Ifrd1	12373	-0.007	0.0612	No
92	Psen2	12513	-0.011	0.0555	No
93	Klf5	13274	-0.038	0.0240	No
94	Dapk2	13491	-0.046	0.0158	No
95	Actn3	13550	-0.048	0.0145	No
96	Tpm3	13667	-0.051	0.0107	No
97	Tpd52l1	13929	-0.060	0.0010	No
98	Fdps	14110	-0.067	-0.0052	No
99	Ptp4a3	14316	-0.075	-0.0122	No
100	Schip1	14785	-0.091	-0.0300	No
101	Dtna	14946	-0.096	-0.0346	No
102	Nos1	14981	-0.098	-0.0338	No
103	Lsp1	15043	-0.100	-0.0341	No
104	Mef2a	15066	-0.101	-0.0327	No
105	Ctf1	15493	-0.116	-0.0482	No
106	Gaa	15528	-0.118	-0.0469	No
107	Pdlim7	15615	-0.121	-0.0478	No
108	Eno3	15651	-0.122	-0.0465	No
109	Mylpf	15714	-0.125	-0.0462	No
110	Myl6b	15716	-0.125	-0.0434	No
111	Tnni1	15728	-0.125	-0.0409	No
112	Reep1	16007	-0.137	-0.0496	No
113	Camk2b	16066	-0.139	-0.0489	No
114	Agrn	16160	-0.142	-0.0496	No
115	Notch1	16258	-0.147	-0.0503	No
116	Mapk12	16433	-0.154	-0.0542	No
117	Sgcg	16556	-0.158	-0.0557	No
118	Csrp3	16609	-0.160	-0.0543	No
119	Ckb	16638	-0.161	-0.0517	No
120	Myh3	16647	-0.162	-0.0483	No
121	Spdef	16648	-0.162	-0.0446	No
122	Ldb3	16691	-0.162	-0.0426	No
123	Myo1c	16728	-0.164	-0.0404	No
124	Cnn3	16796	-0.166	-0.0394	No
125	Gnao1	17006	-0.175	-0.0443	No
126	Cdh13	17504	-0.194	-0.0610	No
127	Hbegf	18004	-0.215	-0.0773	No
128	Cryab	18023	-0.217	-0.0731	No
129	Bag1	18076	-0.218	-0.0702	No
130	Adam12	18205	-0.221	-0.0706	No
131	Plxnb2	18297	-0.225	-0.0693	No
132	Acta1	18498	-0.234	-0.0724	No
133	Mef2c	18593	-0.238	-0.0709	No
134	Ryr1	19008	-0.261	-0.0826	No
135	Kifc3	19110	-0.266	-0.0807	No
136	Atp6ap1	19127	-0.267	-0.0752	No
137	Cacna1h	19200	-0.270	-0.0721	No
138	Cox6a2	19280	-0.273	-0.0691	No
139	Myl1	19403	-0.280	-0.0679	No
140	Tnnc2	19494	-0.285	-0.0651	No
141	Igfbp7	19791	-0.300	-0.0708	No
142	Lama2	19829	-0.301	-0.0654	No
143	Clu	19888	-0.306	-0.0609	No
144	Aplnr	19907	-0.306	-0.0546	No
145	Atp2a1	19951	-0.309	-0.0493	No
146	Dmd	20139	-0.316	-0.0499	No
147	Syngr2	20255	-0.323	-0.0474	No
148	Cdkn1a	20892	-0.363	-0.0661	No
149	Tnnt1	20938	-0.367	-0.0596	No
150	Actn2	20945	-0.367	-0.0514	No
151	Cox7a1	20982	-0.369	-0.0444	No
152	Tgfb1	21043	-0.373	-0.0383	No
153	Tnnc1	21076	-0.376	-0.0310	No
154	Chrnb1	21389	-0.400	-0.0351	No
155	Sorbs1	21478	-0.407	-0.0294	No
156	Ephb3	21625	-0.420	-0.0259	No
157	Pkia	22598	-0.518	-0.0554	No
158	Ablim1	22834	-0.552	-0.0527	No
159	Gadd45b	22876	-0.561	-0.0415	No
160	Sorbs3	23270	-0.662	-0.0429	No
161	Itga7	23285	-0.667	-0.0281	No
162	Sphk1	23552	-0.854	-0.0198	No
163	Col4a2	23604	-0.987	0.0009	No