Details for gene set HALLMARK_TNFA_SIGNALING_VIA

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Eosinophil.Eosinophil_Pheno.cls #Group2_versus_Group4.Eosinophil_Pheno.cls #Group2_versus_Group4_repos
Phenotype	Eosinophil_Pheno.cls#Group2_versus_Group4_repos
Upregulated in class	1
GeneSet	HALLMARK_TNFA_SIGNALING_VIA_NFKB
Enrichment Score (ES)	0.22939745
Normalized Enrichment Score (NES)	1.0662698
Nominal p-value	0.32874015
FDR q-value	0.58733904
FWER p-Value	0.981

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Ptger4	24	1.208	0.0308	Yes
2	Cd69	52	1.072	0.0577	Yes
3	Dusp1	57	1.045	0.0859	Yes
4	Irf1	218	0.798	0.0937	Yes
5	Zc3h12a	222	0.796	0.1151	Yes
6	Il6st	277	0.756	0.1311	Yes
7	Jun	286	0.753	0.1509	Yes
8	Nfkbie	287	0.751	0.1714	Yes
9	Dennd5a	325	0.731	0.1881	Yes
10	Tap1	598	0.618	0.1813	Yes
11	Fut4	606	0.614	0.1974	Yes
12	Btg3	695	0.580	0.2055	Yes
13	Tnfaip3	784	0.563	0.2132	Yes
14	Junb	857	0.550	0.2220	Yes
15	Cebpd	1078	0.508	0.2167	Yes
16	Ninj1	1091	0.505	0.2294	Yes
17	Fos	1328	0.467	0.2216	No
18	Sod2	1643	0.419	0.2057	No
19	Gpr183	1956	0.382	0.1889	No
20	Pmepa1	2163	0.355	0.1807	No
21	Zbtb10	2174	0.354	0.1895	No
22	Pde4b	2312	0.339	0.1868	No
23	Csf1	2336	0.337	0.1940	No
24	Trip10	2435	0.326	0.1944	No
25	Marcks	2555	0.312	0.1925	No
26	Ppp1r15a	2563	0.310	0.2003	No
27	Fosb	2587	0.308	0.2067	No
28	Cd44	2690	0.295	0.2059	No
29	Smad3	2776	0.287	0.2063	No
30	Zfp36	2819	0.283	0.2104	No
31	Gadd45a	2846	0.282	0.2158	No
32	Sqstm1	3086	0.259	0.2021	No
33	Trib1	3088	0.259	0.2090	No
34	Vegfa	3156	0.251	0.2101	No
35	Plek	3164	0.251	0.2163	No
36	Ripk2	3248	0.241	0.2156	No
37	Ifit2	3324	0.232	0.2154	No
38	Plaur	3431	0.220	0.2122	No
39	Litaf	3464	0.216	0.2153	No
40	Pnrc1	3519	0.213	0.2164	No
41	Map3k8	3668	0.199	0.2090	No
42	Ier5	3762	0.196	0.2062	No
43	Olr1	3791	0.194	0.2091	No
44	Tgif1	3858	0.190	0.2085	No
45	Il15ra	3881	0.187	0.2117	No
46	Rela	4138	0.164	0.1939	No
47	Sat1	4404	0.138	0.1746	No
48	Mcl1	4466	0.131	0.1728	No
49	Klf6	4553	0.127	0.1688	No
50	Ldlr	4575	0.125	0.1704	No
51	Cebpb	4582	0.124	0.1733	No
52	Cflar	4606	0.122	0.1746	No
53	Nfat5	4638	0.119	0.1751	No
54	Dram1	4734	0.109	0.1698	No
55	Btg2	4744	0.107	0.1720	No
56	Ifngr2	4825	0.100	0.1678	No
57	Mxd1	5144	0.075	0.1421	No
58	Dusp2	5200	0.070	0.1392	No
59	Irs2	5278	0.066	0.1343	No
60	Abca1	5415	0.054	0.1240	No
61	Birc3	5443	0.051	0.1230	No
62	Rel	5585	0.037	0.1117	No
63	Icam1	5657	0.031	0.1064	No
64	Tnfaip8	5803	0.019	0.0943	No
65	Cdkn1a	6033	0.000	0.0744	No
66	Sphk1	6056	0.000	0.0724	No
67	Slc2a3	6131	-0.003	0.0661	No
68	Map2k3	6275	-0.015	0.0541	No
69	Stat5a	6350	-0.021	0.0482	No
70	Nfkb1	6450	-0.029	0.0404	No
71	Atp2b1	6595	-0.040	0.0289	No
72	Ier3	6651	-0.046	0.0254	No
73	Bcl3	6669	-0.046	0.0252	No
74	Gch1	6742	-0.050	0.0203	No
75	Klf10	7127	-0.080	-0.0109	No
76	Dnajb4	7206	-0.087	-0.0154	No
77	Kdm6b	7214	-0.087	-0.0136	No
78	Nfkbia	7286	-0.093	-0.0172	No
79	Ifih1	7545	-0.113	-0.0366	No
80	Birc2	7614	-0.119	-0.0393	No
81	Sgk1	8123	-0.159	-0.0791	No
82	B4galt1	8166	-0.163	-0.0783	No
83	Slc16a6	8233	-0.169	-0.0795	No
84	Ets2	8249	-0.170	-0.0761	No
85	Rhob	8387	-0.181	-0.0831	No
86	Nfe2l2	8407	-0.183	-0.0798	No
87	Tnip2	8625	-0.204	-0.0931	No
88	Bcl6	8821	-0.220	-0.1041	No
89	Yrdc	8855	-0.222	-0.1009	No
90	Fosl2	8948	-0.232	-0.1026	No
91	Ptpre	9006	-0.238	-0.1010	No
92	Pdlim5	9057	-0.243	-0.0988	No
93	Clcf1	9098	-0.247	-0.0955	No
94	Ier2	9164	-0.253	-0.0943	No
95	Nr4a2	9410	-0.276	-0.1081	No
96	Gadd45b	9442	-0.279	-0.1032	No
97	Tiparp	9510	-0.286	-0.1012	No
98	Tank	9774	-0.313	-0.1156	No
99	Rcan1	9797	-0.315	-0.1089	No
100	Rigi	10361	-0.376	-0.1476	No
101	Klf9	10373	-0.378	-0.1383	No
102	Nfkb2	10429	-0.384	-0.1326	No
103	Myc	10470	-0.388	-0.1255	No
104	Tnip1	10515	-0.396	-0.1185	No
105	Ehd1	10622	-0.411	-0.1166	No
106	Tnfaip2	10636	-0.413	-0.1064	No
107	Lamb3	10862	-0.458	-0.1135	No
108	Per1	11056	-0.502	-0.1166	No
109	Rnf19b	11106	-0.517	-0.1068	No
110	Eif1	11141	-0.529	-0.0953	No
111	B4galt5	11152	-0.532	-0.0817	No
112	Btg1	11229	-0.565	-0.0729	No
113	Ccrl2	11230	-0.566	-0.0575	No
114	Pfkfb3	11236	-0.568	-0.0424	No
115	Nampt	11343	-0.608	-0.0350	No
116	Ccnl1	11403	-0.643	-0.0226	No
117	Panx1	11428	-0.661	-0.0067	No
118	Tsc22d1	11558	-0.820	0.0044	No