Details for gene set HALLMARK

Table: GSEA Results Summary

Dataset	CMP.CMP_Pheno.cls#Group3_versus_Group4.CMP_Pheno.cls#Group3_versus_Group4_repos
Phenotype	CMP_Pheno.cls#Group3_versus_Group4_repos
Upregulated in class	2
GeneSet	HALLMARK_HYPOXIA
Enrichment Score (ES)	0.2509109
Normalized Enrichment Score (NES)	1.1663356
Nominal p-value	0.1541502
FDR q-value	0.8791423
FWER p-Value	0.877

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Slc25a1	30	1.050	0.0296	Yes
2	Tnfaip3	295	0.676	0.0361	Yes
3	Stc2	349	0.652	0.0527	Yes
4	Eno2	393	0.634	0.0693	Yes
5	Plaur	493	0.600	0.0820	Yes
6	Cdkn1c	583	0.575	0.0945	Yes
7	B3galt6	783	0.527	0.1000	Yes
8	Hs3st1	893	0.507	0.1094	Yes
9	Bgn	998	0.487	0.1185	Yes
10	Vhl	1067	0.474	0.1291	Yes
11	Ilvbl	1273	0.446	0.1318	Yes
12	Gpc1	1445	0.428	0.1357	Yes
13	Pklr	1500	0.421	0.1455	Yes
14	Car12	1794	0.388	0.1420	Yes
15	Sdc2	1815	0.387	0.1524	Yes
16	Fam162a	2038	0.365	0.1519	Yes
17	S100a4	2213	0.350	0.1534	Yes
18	Gys1	2220	0.349	0.1634	Yes
19	Galk1	2270	0.343	0.1711	Yes
20	Adora2b	2566	0.322	0.1656	Yes
21	Phkg1	2618	0.318	0.1724	Yes
22	Akap12	2623	0.318	0.1816	Yes
23	Rragd	2848	0.300	0.1791	Yes
24	Ldhc	2888	0.297	0.1859	Yes
25	Aldoa	2992	0.290	0.1892	Yes
26	P4ha1	3040	0.284	0.1953	Yes
27	Pfkp	3060	0.283	0.2027	Yes
28	Slc2a3	3103	0.279	0.2088	Yes
29	Gpi1	3173	0.274	0.2134	Yes
30	Cdkn1a	3213	0.271	0.2194	Yes
31	Gaa	3244	0.269	0.2258	Yes
32	Cited2	3619	0.246	0.2140	Yes
33	Egfr	3690	0.242	0.2176	Yes
34	Rbpj	3735	0.241	0.2225	Yes
35	Sap30	3838	0.236	0.2243	Yes
36	Hmox1	3864	0.234	0.2300	Yes
37	Jmjd6	3916	0.232	0.2342	Yes
38	Errfi1	3984	0.228	0.2376	Yes
39	Myh9	4022	0.226	0.2424	Yes
40	Gbe1	4093	0.221	0.2453	Yes
41	Csrp2	4113	0.221	0.2509	Yes
42	Pam	4310	0.210	0.2471	No
43	Ero1a	4503	0.201	0.2433	No
44	Aldoc	4670	0.193	0.2405	No
45	Scarb1	4963	0.178	0.2309	No
46	Bcl2	4969	0.177	0.2359	No
47	Dtna	5202	0.167	0.2290	No
48	Ccng2	5255	0.165	0.2312	No
49	Dcn	5382	0.160	0.2295	No
50	Ets1	5742	0.145	0.2155	No
51	Fosl2	6109	0.133	0.2008	No
52	Gapdhs	6139	0.132	0.2032	No
53	Ids	6221	0.129	0.2029	No
54	Gcnt2	6245	0.128	0.2055	No
55	Slc2a5	6287	0.127	0.2072	No
56	Ext1	6336	0.126	0.2084	No
57	Prdx5	6390	0.123	0.2094	No
58	Ak4	6456	0.120	0.2096	No
59	Jun	6492	0.118	0.2113	No
60	Pdk3	6639	0.113	0.2072	No
61	Pgm2	6662	0.112	0.2094	No
62	Gpc4	6752	0.108	0.2081	No
63	Noct	6781	0.107	0.2098	No
64	Vldlr	6862	0.104	0.2088	No
65	F3	6891	0.103	0.2104	No
66	Pdk1	6892	0.103	0.2135	No
67	Ndst2	6903	0.103	0.2160	No
68	Angptl4	6983	0.100	0.2150	No
69	Eno3	7166	0.093	0.2084	No
70	Tpi1	7175	0.093	0.2108	No
71	Kdelr3	7246	0.090	0.2099	No
72	Pdgfb	7325	0.088	0.2085	No
73	Ndrg1	7530	0.081	0.2005	No
74	Wsb1	7557	0.080	0.2015	No
75	Slc2a1	7558	0.080	0.2039	No
76	Slc37a4	7705	0.074	0.1986	No
77	Col5a1	7718	0.074	0.2002	No
78	Eno1b	7959	0.066	0.1899	No
79	Zfp36	8163	0.060	0.1813	No
80	Pfkl	8244	0.057	0.1789	No
81	Selenbp1	8356	0.053	0.1748	No
82	Prkca	8383	0.052	0.1750	No
83	Mt1	8560	0.045	0.1674	No
84	Anxa2	8571	0.045	0.1682	No
85	Ddit3	8583	0.045	0.1690	No
86	Hdlbp	8636	0.043	0.1676	No
87	Klhl24	8652	0.043	0.1681	No
88	Dusp1	8817	0.037	0.1609	No
89	P4ha2	9139	0.026	0.1453	No
90	Tpd52	9208	0.024	0.1425	No
91	Ndst1	9224	0.023	0.1424	No
92	Maff	9241	0.023	0.1423	No
93	Nedd4l	9272	0.021	0.1414	No
94	Klf7	9314	0.020	0.1399	No
95	Vegfa	9466	0.016	0.1326	No
96	Tiparp	9687	0.008	0.1217	No
97	Hspa5	9908	0.001	0.1105	No
98	Nfil3	9916	0.001	0.1102	No
99	Ugp2	9934	0.001	0.1093	No
100	Siah2	10178	-0.003	0.0970	No
101	Pgm1	10334	-0.008	0.0893	No
102	Zfp292	10340	-0.008	0.0893	No
103	Ppargc1a	10361	-0.009	0.0886	No
104	Slc6a6	10387	-0.009	0.0876	No
105	Pfkfb3	10550	-0.015	0.0797	No
106	Hexa	10575	-0.016	0.0790	No
107	Ppp1r15a	10659	-0.018	0.0753	No
108	Xpnpep1	10965	-0.027	0.0605	No
109	Kdm3a	11033	-0.030	0.0580	No
110	Nr3c1	11062	-0.031	0.0575	No
111	Cavin1	11247	-0.036	0.0492	No
112	Fos	11260	-0.037	0.0497	No
113	Atp7a	11414	-0.041	0.0431	No
114	Tes	11576	-0.047	0.0363	No
115	Pnrc1	11632	-0.048	0.0349	No
116	Map3k1	11742	-0.052	0.0309	No
117	Foxo3	11871	-0.056	0.0260	No
118	Hk2	12009	-0.061	0.0208	No
119	Klf6	12108	-0.064	0.0177	No
120	Cxcr4	12155	-0.066	0.0173	No
121	Irs2	12211	-0.067	0.0165	No
122	Il6	12296	-0.070	0.0143	No
123	Cavin3	12510	-0.075	0.0056	No
124	Tpst2	12739	-0.081	-0.0036	No
125	Ldha	12804	-0.084	-0.0044	No
126	Casp6	13046	-0.093	-0.0139	No
127	Isg20	14197	-0.136	-0.0685	No
128	Pygm	14457	-0.146	-0.0774	No
129	Pgk1	14596	-0.152	-0.0800	No
130	Grhpr	14755	-0.159	-0.0833	No
131	Btg1	14897	-0.166	-0.0856	No
132	Tgfb3	14926	-0.167	-0.0821	No
133	Ampd3	15004	-0.171	-0.0810	No
134	Bhlhe40	15156	-0.173	-0.0835	No
135	Large1	15243	-0.177	-0.0827	No
136	Fbp1	15361	-0.182	-0.0833	No
137	Ppfia4	15591	-0.192	-0.0892	No
138	Plac8	15712	-0.198	-0.0895	No
139	Sult2b1	15760	-0.201	-0.0860	No
140	Ddit4	15793	-0.203	-0.0816	No
141	Cdkn1b	15818	-0.204	-0.0768	No
142	Ier3	16342	-0.232	-0.0966	No
143	Mif	16515	-0.241	-0.0982	No
144	Cp	16733	-0.255	-0.1017	No
145	Glrx	16841	-0.262	-0.0994	No
146	Hk1	16909	-0.266	-0.0950	No
147	B4galnt2	16986	-0.269	-0.0909	No
148	Pim1	17246	-0.290	-0.0955	No
149	Atf3	17473	-0.305	-0.0980	No
150	Kif5a	17559	-0.310	-0.0932	No
151	Nagk	17617	-0.314	-0.0868	No
152	Lxn	17803	-0.328	-0.0865	No
153	Ankzf1	18253	-0.374	-0.0983	No
154	Mxi1	18513	-0.399	-0.0997	No
155	Rora	18644	-0.417	-0.0940	No
156	Cav1	19125	-0.497	-0.1037	No
157	Tgfbi	19183	-0.512	-0.0915	No
158	Plin2	19474	-0.600	-0.0885	No
159	Bnip3l	19531	-0.631	-0.0727	No
160	Tgm2	19533	-0.633	-0.0540	No
161	Gpc3	19592	-0.675	-0.0369	No
162	Sdc3	19686	-0.772	-0.0188	No
163	Stbd1	19692	-0.781	0.0040	No