Details for gene set HALLMARK

Table: GSEA Results Summary

Dataset	CMP.CMP_Pheno.cls#Group3_versus_Group4.CMP_Pheno.cls#Group3_versus_Group4_repos
Phenotype	CMP_Pheno.cls#Group3_versus_Group4_repos
Upregulated in class	2
GeneSet	HALLMARK_GLYCOLYSIS
Enrichment Score (ES)	0.2689161
Normalized Enrichment Score (NES)	1.3029177
Nominal p-value	0.05
FDR q-value	0.71105045
FWER p-Value	0.7

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Me1	0	2.144	0.0610	Yes
2	Bik	6	1.315	0.0982	Yes
3	Gale	22	1.118	0.1293	Yes
4	Gmppb	213	0.731	0.1404	Yes
5	Stc2	349	0.652	0.1521	Yes
6	Eno2	393	0.634	0.1679	Yes
7	B3galt6	783	0.527	0.1631	Yes
8	Ndufv3	823	0.518	0.1758	Yes
9	Got1	1117	0.467	0.1742	Yes
10	Polr3k	1212	0.454	0.1823	Yes
11	Gpc1	1445	0.428	0.1826	Yes
12	Mertk	1452	0.426	0.1944	Yes
13	Sdc2	1815	0.387	0.1870	Yes
14	Alg1	2033	0.366	0.1863	Yes
15	Fam162a	2038	0.365	0.1965	Yes
16	Gys1	2220	0.349	0.1972	Yes
17	Galk1	2270	0.343	0.2045	Yes
18	Pmm2	2402	0.333	0.2073	Yes
19	Stmn1	2408	0.332	0.2165	Yes
20	B3gnt3	2412	0.332	0.2258	Yes
21	Adora2b	2566	0.322	0.2272	Yes
22	Aurka	2822	0.302	0.2227	Yes
23	Rragd	2848	0.300	0.2300	Yes
24	Ldhc	2888	0.297	0.2365	Yes
25	Slc25a13	2915	0.295	0.2435	Yes
26	Aldoa	2992	0.290	0.2479	Yes
27	Ang	3020	0.286	0.2547	Yes
28	P4ha1	3040	0.284	0.2618	Yes
29	Pfkp	3060	0.283	0.2689	Yes
30	Cited2	3619	0.246	0.2474	No
31	Egfr	3690	0.242	0.2507	No
32	Sap30	3838	0.236	0.2500	No
33	Pam	4310	0.210	0.2319	No
34	Qsox1	4396	0.207	0.2335	No
35	Lct	4493	0.201	0.2343	No
36	Ero1a	4503	0.201	0.2395	No
37	Xylt2	4728	0.190	0.2335	No
38	Hs6st2	5077	0.172	0.2206	No
39	Pgam1	5109	0.170	0.2239	No
40	Hs2st1	5114	0.170	0.2285	No
41	Med24	5134	0.169	0.2324	No
42	Dcn	5382	0.160	0.2244	No
43	Ppp2cb	5442	0.158	0.2258	No
44	Lhpp	5487	0.155	0.2280	No
45	Cth	5791	0.143	0.2166	No
46	Cog2	5840	0.140	0.2181	No
47	Gapdhs	6139	0.132	0.2067	No
48	Gmppa	6201	0.130	0.2073	No
49	Ext1	6336	0.126	0.2040	No
50	Chpf2	6387	0.123	0.2050	No
51	Ak4	6456	0.120	0.2049	No
52	Ecd	6495	0.118	0.2063	No
53	Phka2	6616	0.113	0.2034	No
54	Pdk3	6639	0.113	0.2055	No
55	Pgm2	6662	0.112	0.2076	No
56	Ndst3	6701	0.110	0.2088	No
57	Gpc4	6752	0.108	0.2093	No
58	Gfpt1	6772	0.107	0.2114	No
59	Fkbp4	6810	0.106	0.2125	No
60	Vldlr	6862	0.104	0.2129	No
61	Idua	6932	0.102	0.2122	No
62	Angptl4	6983	0.100	0.2125	No
63	Srd5a3	7067	0.097	0.2111	No
64	Chst12	7070	0.097	0.2137	No
65	Me2	7174	0.093	0.2111	No
66	Tpi1	7175	0.093	0.2138	No
67	Cln6	7199	0.092	0.2152	No
68	Kdelr3	7246	0.090	0.2154	No
69	Gclc	7425	0.084	0.2087	No
70	Kif2a	7588	0.079	0.2027	No
71	Slc37a4	7705	0.074	0.1989	No
72	Col5a1	7718	0.074	0.2004	No
73	Eno1b	7959	0.066	0.1900	No
74	Gpr87	8044	0.064	0.1876	No
75	Gusb	8185	0.058	0.1821	No
76	Sdc1	8273	0.056	0.1792	No
77	Aldh7a1	8323	0.054	0.1783	No
78	Spag4	8577	0.045	0.1666	No
79	Hdlbp	8636	0.043	0.1649	No
80	Dld	8700	0.041	0.1628	No
81	Rpe	8746	0.040	0.1617	No
82	Sdhc	8752	0.040	0.1626	No
83	Abcb6	9003	0.030	0.1507	No
84	Nsdhl	9033	0.030	0.1500	No
85	P4ha2	9139	0.026	0.1454	No
86	Glce	9171	0.025	0.1445	No
87	Sod1	9223	0.023	0.1426	No
88	Copb2	9460	0.016	0.1310	No
89	Vegfa	9466	0.016	0.1312	No
90	Gfus	9630	0.010	0.1232	No
91	Slc35a3	9643	0.010	0.1228	No
92	Akr1a1	9671	0.009	0.1217	No
93	Gne	9782	0.006	0.1163	No
94	Hax1	9855	0.003	0.1127	No
95	Galk2	9872	0.003	0.1119	No
96	Hspa5	9908	0.001	0.1102	No
97	Ugp2	9934	0.001	0.1089	No
98	Dsc2	9960	0.000	0.1077	No
99	Gnpda1	10081	-0.001	0.1016	No
100	Mpi	10149	-0.002	0.0982	No
101	Nanp	10329	-0.008	0.0893	No
102	Zfp292	10340	-0.008	0.0890	No
103	Aldh9a1	10448	-0.012	0.0839	No
104	Idh1	10471	-0.012	0.0831	No
105	Cenpa	10500	-0.013	0.0820	No
106	Pcx	10637	-0.017	0.0756	No
107	Mdh1	11046	-0.030	0.0556	No
108	Cyb5a	11119	-0.033	0.0529	No
109	Cdk1	11177	-0.034	0.0510	No
110	Pygl	11302	-0.038	0.0457	No
111	Nol3	11365	-0.040	0.0437	No
112	Plod2	11367	-0.040	0.0448	No
113	Pfkfb1	11515	-0.045	0.0385	No
114	Txn1	11568	-0.046	0.0372	No
115	Fut8	11677	-0.050	0.0331	No
116	Prps1	11756	-0.053	0.0306	No
117	Agrn	11802	-0.054	0.0299	No
118	Nasp	11845	-0.055	0.0293	No
119	Hk2	12009	-0.061	0.0227	No
120	Cd44	12090	-0.063	0.0204	No
121	Cxcr4	12155	-0.066	0.0190	No
122	Irs2	12211	-0.067	0.0181	No
123	Homer1	12240	-0.068	0.0186	No
124	Mdh2	12603	-0.077	0.0024	No
125	Egln3	12609	-0.077	0.0043	No
126	Taldo1	12668	-0.079	0.0036	No
127	Ldha	12804	-0.084	-0.0009	No
128	Pygb	12811	-0.084	0.0012	No
129	Slc25a10	12828	-0.085	0.0028	No
130	Casp6	13046	-0.093	-0.0057	No
131	Pkm	13289	-0.102	-0.0151	No
132	Paxip1	13596	-0.113	-0.0275	No
133	Tpst1	13744	-0.119	-0.0317	No
134	Hmmr	13823	-0.121	-0.0322	No
135	Ppia	14039	-0.129	-0.0395	No
136	Isg20	14197	-0.136	-0.0436	No
137	Ext2	14214	-0.137	-0.0405	No
138	Plod1	14229	-0.137	-0.0373	No
139	Kif20a	14254	-0.139	-0.0346	No
140	Pgk1	14596	-0.152	-0.0477	No
141	B4galt4	14652	-0.154	-0.0461	No
142	G6pdx	14920	-0.167	-0.0550	No
143	B4galt7	15028	-0.172	-0.0556	No
144	Gal3st1	15039	-0.172	-0.0512	No
145	Ppfia4	15591	-0.192	-0.0738	No
146	Capn5	15639	-0.194	-0.0707	No
147	Il13ra1	15720	-0.198	-0.0691	No
148	Ddit4	15793	-0.203	-0.0670	No
149	Slc16a3	15862	-0.206	-0.0646	No
150	Ak3	15885	-0.208	-0.0598	No
151	Bpnt1	15906	-0.208	-0.0549	No
152	Arpp19	16093	-0.218	-0.0582	No
153	Nt5e	16314	-0.230	-0.0629	No
154	Ier3	16342	-0.232	-0.0577	No
155	Met	16494	-0.240	-0.0586	No
156	Mif	16515	-0.241	-0.0527	No
157	B4galt1	16819	-0.260	-0.0607	No
158	Glrx	16841	-0.262	-0.0544	No
159	Pgls	16855	-0.263	-0.0475	No
160	Rbck1	16961	-0.268	-0.0453	No
161	Depdc1a	17070	-0.276	-0.0429	No
162	B3gat3	17080	-0.277	-0.0355	No
163	Got2	17107	-0.280	-0.0289	No
164	Chst1	17241	-0.289	-0.0274	No
165	Tgfa	17416	-0.299	-0.0278	No
166	Agl	17656	-0.318	-0.0309	No
167	B4galt2	17807	-0.329	-0.0292	No
168	Ankzf1	18253	-0.374	-0.0413	No
169	Pkp2	18427	-0.390	-0.0390	No
170	Mxi1	18513	-0.399	-0.0320	No
171	Psmc4	18664	-0.420	-0.0277	No
172	Vcan	18800	-0.439	-0.0221	No
173	Tgfbi	19183	-0.512	-0.0270	No
174	Chpf	19334	-0.551	-0.0190	No
175	Gpc3	19592	-0.675	-0.0129	No
176	Sdc3	19686	-0.772	0.0043	No