Details for gene set HALLMARK

Table: GSEA Results Summary

Dataset	CMP.CMP_Pheno.cls#Group3_versus_Group4.CMP_Pheno.cls#Group3_versus_Group4_repos
Phenotype	CMP_Pheno.cls#Group3_versus_Group4_repos
Upregulated in class	2
GeneSet	HALLMARK_COMPLEMENT
Enrichment Score (ES)	0.23554786
Normalized Enrichment Score (NES)	1.0240321
Nominal p-value	0.42708334
FDR q-value	0.74227107
FWER p-Value	0.969

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Me1	0	2.144	0.0585	Yes
2	Dock4	94	0.862	0.0773	Yes
3	Cfb	197	0.753	0.0926	Yes
4	Tnfaip3	295	0.676	0.1061	Yes
5	Plaur	493	0.600	0.1124	Yes
6	Zfpm2	534	0.588	0.1264	Yes
7	Dusp6	580	0.577	0.1399	Yes
8	Ccl5	628	0.566	0.1529	Yes
9	Mmp15	877	0.509	0.1541	Yes
10	Rasgrp1	889	0.507	0.1674	Yes
11	Notch4	919	0.502	0.1796	Yes
12	C9	1304	0.443	0.1721	Yes
13	Spock2	1331	0.441	0.1828	Yes
14	Ltf	1455	0.426	0.1882	Yes
15	Fn1	1694	0.398	0.1869	Yes
16	Olr1	1768	0.390	0.1938	Yes
17	Fyn	1989	0.369	0.1927	Yes
18	Lgmn	2059	0.363	0.1991	Yes
19	Fdx1	2261	0.344	0.1982	Yes
20	C1qa	2312	0.340	0.2049	Yes
21	Apoc1	2374	0.336	0.2110	Yes
22	Gmfb	2411	0.332	0.2182	Yes
23	C2	2535	0.325	0.2208	Yes
24	Mmp8	2744	0.307	0.2185	Yes
25	Scg3	2826	0.302	0.2226	Yes
26	Gnb4	2981	0.291	0.2227	Yes
27	Ang	3020	0.286	0.2286	Yes
28	Car2	3126	0.277	0.2308	Yes
29	Casp3	3311	0.264	0.2286	Yes
30	Rbsn	3317	0.264	0.2355	Yes
31	L3mbtl4	3608	0.247	0.2275	No
32	Casp4	3829	0.237	0.2227	No
33	Calm3	3942	0.230	0.2233	No
34	Stx4a	4203	0.216	0.2159	No
35	Fcer1g	4217	0.215	0.2211	No
36	Csrp1	4281	0.211	0.2237	No
37	Plek	4470	0.203	0.2196	No
38	Ctso	4513	0.200	0.2229	No
39	Ctsd	4565	0.198	0.2257	No
40	Hnf4a	4679	0.192	0.2252	No
41	Gnai3	4765	0.187	0.2260	No
42	Atox1	4797	0.186	0.2295	No
43	Usp8	4995	0.176	0.2242	No
44	Brpf3	5007	0.176	0.2284	No
45	Phex	5017	0.175	0.2328	No
46	Actn2	5155	0.169	0.2304	No
47	Dgkg	5159	0.168	0.2348	No
48	Prkcd	5274	0.165	0.2335	No
49	Ppp2cb	5442	0.158	0.2293	No
50	Adam9	5627	0.149	0.2240	No
51	Zeb1	5631	0.149	0.2279	No
52	Psen1	5727	0.145	0.2270	No
53	Was	5818	0.141	0.2262	No
54	Gata3	5852	0.139	0.2284	No
55	F5	6162	0.131	0.2162	No
56	Ctsc	6282	0.127	0.2136	No
57	Cpm	6285	0.127	0.2169	No
58	S100a9	6295	0.127	0.2199	No
59	Pcsk9	6332	0.126	0.2215	No
60	Sh2b3	6379	0.123	0.2225	No
61	Dusp5	6514	0.117	0.2189	No
62	F7	6727	0.109	0.2111	No
63	F3	6891	0.103	0.2055	No
64	Gca	7208	0.092	0.1919	No
65	Pdgfb	7325	0.088	0.1884	No
66	Rce1	7365	0.086	0.1888	No
67	Psmb9	7409	0.085	0.1889	No
68	Lipa	7522	0.081	0.1854	No
69	Kif2a	7588	0.079	0.1842	No
70	Rhog	7907	0.068	0.1698	No
71	Anxa5	8054	0.063	0.1641	No
72	Prss36	8101	0.062	0.1635	No
73	Grb2	8234	0.057	0.1583	No
74	Irf2	8624	0.043	0.1396	No
75	Prdm4	8717	0.041	0.1361	No
76	Col4a2	8771	0.039	0.1344	No
77	Cblb	8772	0.039	0.1355	No
78	Lta4h	8813	0.037	0.1345	No
79	Klkb1	8906	0.034	0.1307	No
80	Prep	8943	0.033	0.1298	No
81	Raf1	8944	0.033	0.1306	No
82	Gp9	9215	0.023	0.1175	No
83	Maff	9241	0.023	0.1169	No
84	Usp15	9416	0.017	0.1085	No
85	Ppp4c	9483	0.015	0.1055	No
86	Jak2	9601	0.011	0.0999	No
87	Gnb2	9635	0.010	0.0984	No
88	Gnai2	9666	0.009	0.0972	No
89	Lgals3	9708	0.008	0.0953	No
90	Ehd1	9712	0.008	0.0953	No
91	Usp14	9740	0.007	0.0942	No
92	Gpd2	9831	0.004	0.0897	No
93	Casp7	9844	0.004	0.0892	No
94	Hspa5	9908	0.001	0.0860	No
95	Serpinb2	10144	-0.002	0.0741	No
96	Rnf4	10200	-0.004	0.0714	No
97	Mmp14	10277	-0.006	0.0676	No
98	Dock9	10431	-0.011	0.0601	No
99	Dyrk2	10446	-0.011	0.0597	No
100	F10	10590	-0.016	0.0529	No
101	Pik3ca	10667	-0.018	0.0495	No
102	Src	10695	-0.019	0.0486	No
103	Fcnb	10705	-0.019	0.0487	No
104	Gng2	10727	-0.020	0.0482	No
105	S100a13	10828	-0.023	0.0437	No
106	Dock10	10882	-0.025	0.0417	No
107	Pdp1	10893	-0.025	0.0419	No
108	Xpnpep1	10965	-0.027	0.0390	No
109	Pfn1	11271	-0.037	0.0245	No
110	Plscr1	11359	-0.040	0.0211	No
111	Gzmk	11788	-0.054	0.0007	No
112	Lck	12097	-0.063	-0.0133	No
113	Lap3	12235	-0.068	-0.0184	No
114	Il6	12296	-0.070	-0.0195	No
115	C3	12398	-0.071	-0.0227	No
116	Timp2	12517	-0.075	-0.0267	No
117	Lamp2	12519	-0.075	-0.0247	No
118	Lyn	12542	-0.076	-0.0238	No
119	Calm1	12935	-0.089	-0.0414	No
120	F8	13076	-0.094	-0.0459	No
121	Ctsb	13077	-0.094	-0.0434	No
122	Kcnip3	13659	-0.115	-0.0699	No
123	Akap10	14216	-0.137	-0.0945	No
124	Cpq	14268	-0.139	-0.0933	No
125	Casp1	14292	-0.140	-0.0907	No
126	Plg	14360	-0.142	-0.0902	No
127	Prcp	14380	-0.143	-0.0873	No
128	Vcpip1	14464	-0.147	-0.0875	No
129	Dgkh	14679	-0.155	-0.0942	No
130	Pla2g4a	14828	-0.163	-0.0973	No
131	Usp16	15574	-0.191	-0.1301	No
132	Cd36	15863	-0.206	-0.1391	No
133	Cd46	15921	-0.209	-0.1363	No
134	Pik3cg	15950	-0.211	-0.1320	No
135	Ctss	16067	-0.216	-0.1320	No
136	Casp9	16192	-0.224	-0.1322	No
137	Lrp1	16612	-0.247	-0.1468	No
138	Cdh13	16614	-0.247	-0.1402	No
139	Cp	16733	-0.255	-0.1392	No
140	C1qc	16921	-0.267	-0.1415	No
141	Cr2	17006	-0.270	-0.1384	No
142	Cebpb	17008	-0.271	-0.1311	No
143	Pim1	17246	-0.290	-0.1352	No
144	Ctsh	17271	-0.291	-0.1285	No
145	Kcnip2	17489	-0.305	-0.1313	No
146	Sirt6	17543	-0.309	-0.1255	No
147	Lcp2	17611	-0.314	-0.1204	No
148	Irf1	17623	-0.315	-0.1124	No
149	Gngt2	18004	-0.348	-0.1223	No
150	Cdk5r1	18041	-0.352	-0.1145	No
151	Pik3r5	18172	-0.364	-0.1112	No
152	Tfpi2	18318	-0.382	-0.1082	No
153	Ctsl	18343	-0.384	-0.0989	No
154	Pclo	18546	-0.403	-0.0982	No
155	Rabif	18609	-0.412	-0.0902	No
156	Serpinc1	18629	-0.415	-0.0798	No
157	Kynu	18643	-0.417	-0.0691	No
158	Dpp4	19138	-0.500	-0.0806	No
159	Hspa1a	19357	-0.560	-0.0765	No
160	Irf7	19441	-0.587	-0.0647	No
161	Clu	19523	-0.626	-0.0518	No
162	Itgam	19667	-0.740	-0.0389	No
163	Msrb1	19670	-0.747	-0.0186	No
164	Gp1ba	19728	-0.869	0.0022	No