Details for gene set HALLMARK_APICAL

Table: GSEA Results Summary

Dataset	CMP.CMP_Pheno.cls#Group3_versus_Group4.CMP_Pheno.cls#Group3_versus_Group4_repos
Phenotype	CMP_Pheno.cls#Group3_versus_Group4_repos
Upregulated in class	2
GeneSet	HALLMARK_APICAL_JUNCTION
Enrichment Score (ES)	0.2928661
Normalized Enrichment Score (NES)	1.1581545
Nominal p-value	0.24654832
FDR q-value	0.8099056
FWER p-Value	0.889

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Cadm3	4	1.349	0.0362	Yes
2	Traf1	83	0.877	0.0560	Yes
3	Icam5	185	0.773	0.0717	Yes
4	Adam15	337	0.656	0.0817	Yes
5	Alox8	515	0.593	0.0887	Yes
6	Itga3	556	0.582	0.1024	Yes
7	Mapk13	619	0.568	0.1146	Yes
8	Negr1	1200	0.455	0.0973	Yes
9	Cldn15	1274	0.445	0.1056	Yes
10	Mpzl1	1319	0.442	0.1153	Yes
11	Shroom2	1451	0.427	0.1201	Yes
12	Cdh1	1508	0.421	0.1286	Yes
13	Cd276	1629	0.408	0.1335	Yes
14	Mdk	1691	0.399	0.1412	Yes
15	Actb	1709	0.397	0.1510	Yes
16	Insig1	1781	0.389	0.1579	Yes
17	Jup	1833	0.385	0.1657	Yes
18	Amigo2	1910	0.376	0.1720	Yes
19	Dhx16	1999	0.368	0.1774	Yes
20	Hadh	2009	0.367	0.1869	Yes
21	Vasp	2179	0.354	0.1878	Yes
22	Mvd	2233	0.348	0.1945	Yes
23	Ikbkg	2254	0.345	0.2028	Yes
24	Cx3cl1	2273	0.343	0.2112	Yes
25	Actn3	2308	0.340	0.2186	Yes
26	Mmp9	2486	0.327	0.2184	Yes
27	Lama3	2625	0.318	0.2199	Yes
28	Plcg1	2720	0.309	0.2235	Yes
29	Adamts5	2820	0.303	0.2266	Yes
30	Cdk8	2840	0.301	0.2338	Yes
31	Crat	2873	0.298	0.2402	Yes
32	Adam23	2924	0.294	0.2456	Yes
33	Speg	3050	0.284	0.2469	Yes
34	Nectin3	3080	0.281	0.2530	Yes
35	Jam3	3185	0.273	0.2551	Yes
36	Thy1	3246	0.268	0.2593	Yes
37	Cap1	3356	0.261	0.2608	Yes
38	Crb3	3384	0.259	0.2664	Yes
39	Cercam	3430	0.257	0.2711	Yes
40	Adra1b	3502	0.254	0.2743	Yes
41	Vav2	3563	0.250	0.2780	Yes
42	Cdh11	3631	0.245	0.2812	Yes
43	Egfr	3690	0.242	0.2848	Yes
44	Nfasc	3693	0.242	0.2912	Yes
45	Pik3r3	3917	0.232	0.2861	Yes
46	Myh9	4022	0.226	0.2869	Yes
47	Nrtn	4025	0.226	0.2929	Yes
48	Stx4a	4203	0.216	0.2897	No
49	Tmem8b	4579	0.197	0.2759	No
50	Cdh4	4677	0.192	0.2761	No
51	Inppl1	4852	0.183	0.2722	No
52	Vwf	4984	0.176	0.2703	No
53	Vcl	5015	0.175	0.2735	No
54	Icam2	5036	0.174	0.2771	No
55	Actn2	5155	0.169	0.2757	No
56	Tro	5204	0.167	0.2777	No
57	Ywhah	5399	0.159	0.2721	No
58	Tjp1	5532	0.153	0.2695	No
59	Pals1	5580	0.151	0.2712	No
60	Myh10	5611	0.149	0.2737	No
61	Adam9	5627	0.149	0.2770	No
62	Cadm2	5752	0.144	0.2746	No
63	Msn	5767	0.144	0.2777	No
64	Pkd1	5833	0.141	0.2782	No
65	Fscn1	5873	0.139	0.2800	No
66	Tspan4	5989	0.138	0.2778	No
67	Rasa1	6210	0.129	0.2701	No
68	Icam1	6547	0.116	0.2561	No
69	Baiap2	6607	0.114	0.2562	No
70	Col16a1	6659	0.112	0.2566	No
71	Mapk14	6694	0.110	0.2578	No
72	Sgce	6930	0.102	0.2486	No
73	Taok2	7003	0.100	0.2476	No
74	Evl	7477	0.082	0.2257	No
75	Cd34	7546	0.080	0.2244	No
76	Tubg1	7602	0.078	0.2237	No
77	Wasl	7638	0.077	0.2240	No
78	Syk	7703	0.074	0.2228	No
79	Nlgn2	8059	0.063	0.2064	No
80	Pard6g	8206	0.058	0.2005	No
81	Nrxn2	8218	0.057	0.2015	No
82	Cnn2	8263	0.056	0.2007	No
83	Pik3cb	8545	0.046	0.1877	No
84	Gnai1	9103	0.027	0.1600	No
85	Map3k20	9467	0.016	0.1419	No
86	Gtf2f1	9559	0.013	0.1376	No
87	Gnai2	9666	0.009	0.1324	No
88	Amigo1	9676	0.009	0.1322	No
89	Lamb3	9747	0.007	0.1288	No
90	Skap2	9785	0.006	0.1271	No
91	Dlg1	9861	0.003	0.1234	No
92	Tial1	9947	0.000	0.1190	No
93	Parva	9975	0.000	0.1176	No
94	Pbx2	10331	-0.008	0.0998	No
95	Epb41l2	10338	-0.008	0.0997	No
96	Atp1a3	10347	-0.008	0.0995	No
97	Nectin4	10584	-0.016	0.0879	No
98	Pten	10666	-0.018	0.0842	No
99	Src	10695	-0.019	0.0833	No
100	Myl12b	10946	-0.027	0.0713	No
101	Actn4	11086	-0.032	0.0651	No
102	Ptprc	11152	-0.034	0.0626	No
103	Rac2	11264	-0.037	0.0580	No
104	Cldn14	11268	-0.037	0.0588	No
105	Pfn1	11271	-0.037	0.0597	No
106	Bmp1	11344	-0.039	0.0571	No
107	Tsc1	11525	-0.045	0.0491	No
108	Nf1	11584	-0.047	0.0475	No
109	Sorbs3	11663	-0.049	0.0448	No
110	Cd274	11717	-0.051	0.0435	No
111	Itga9	11840	-0.055	0.0388	No
112	Arpc2	11910	-0.058	0.0368	No
113	Icam4	12074	-0.063	0.0302	No
114	Pecam1	12588	-0.077	0.0061	No
115	Map4k2	12709	-0.080	0.0021	No
116	Nf2	12767	-0.082	0.0015	No
117	Akt2	12911	-0.088	-0.0035	No
118	Hras	12995	-0.091	-0.0052	No
119	Actn1	13178	-0.097	-0.0119	No
120	Shc1	13218	-0.099	-0.0112	No
121	Zyx	13260	-0.101	-0.0106	No
122	Gamt	13288	-0.102	-0.0092	No
123	Ctnna1	13743	-0.119	-0.0292	No
124	Amh	13765	-0.120	-0.0270	No
125	Exoc4	13822	-0.121	-0.0266	No
126	Sympk	14279	-0.140	-0.0461	No
127	Thbs3	14384	-0.143	-0.0475	No
128	Cdh8	14387	-0.143	-0.0437	No
129	Mapk11	14405	-0.144	-0.0407	No
130	Itgb1	14660	-0.155	-0.0495	No
131	Akt3	14959	-0.169	-0.0602	No
132	Actg1	15342	-0.181	-0.0747	No
133	Nrap	15410	-0.185	-0.0732	No
134	Arhgef6	15438	-0.186	-0.0695	No
135	Itga10	15693	-0.197	-0.0772	No
136	Ctnnd1	15889	-0.208	-0.0815	No
137	Col17a1	15924	-0.209	-0.0776	No
138	Ldlrap1	16122	-0.220	-0.0817	No
139	Rsu1	16291	-0.229	-0.0841	No
140	Irs1	16367	-0.232	-0.0816	No
141	Sirpa	16445	-0.237	-0.0792	No
142	Nectin1	16466	-0.238	-0.0737	No
143	Nectin2	16568	-0.243	-0.0723	No
144	Cd86	16763	-0.257	-0.0753	No
145	Nexn	16802	-0.260	-0.0702	No
146	B4galt1	16819	-0.260	-0.0640	No
147	Rhof	17106	-0.280	-0.0710	No
148	Ptk2	17348	-0.297	-0.0753	No
149	Wnk4	17589	-0.312	-0.0791	No
150	Itgb4	17685	-0.319	-0.0753	No
151	Vcam1	18078	-0.355	-0.0857	No
152	Cntn1	18319	-0.382	-0.0876	No
153	Kcnh2	18556	-0.403	-0.0888	No
154	Itga2	18645	-0.417	-0.0820	No
155	Lima1	18787	-0.437	-0.0774	No
156	Mmp2	18797	-0.438	-0.0660	No
157	Vcan	18800	-0.439	-0.0543	No
158	Nlgn3	18902	-0.454	-0.0471	No
159	Fbn1	18919	-0.457	-0.0356	No
160	Layn	18923	-0.457	-0.0234	No
161	Rras	19117	-0.496	-0.0199	No
162	Tgfbi	19183	-0.512	-0.0094	No
163	Slit2	19603	-0.681	-0.0123	No
164	Sdc3	19686	-0.772	0.0043	No