Details for gene set HALLMARK

Table: GSEA Results Summary

Dataset	CMP.CMP_Pheno.cls#Group2_versus_Group4.CMP_Pheno.cls#Group2_versus_Group4_repos
Phenotype	CMP_Pheno.cls#Group2_versus_Group4_repos
Upregulated in class	1
GeneSet	HALLMARK_HYPOXIA
Enrichment Score (ES)	0.23361537
Normalized Enrichment Score (NES)	1.0540434
Nominal p-value	0.3618677
FDR q-value	0.5950618
FWER p-Value	0.942

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Stc2	60	0.944	0.0192	Yes
2	Vldlr	153	0.792	0.0332	Yes
3	Cavin1	195	0.757	0.0489	Yes
4	Anxa2	272	0.716	0.0619	Yes
5	Slc25a1	283	0.711	0.0782	Yes
6	Car12	436	0.651	0.0858	Yes
7	Ets1	540	0.615	0.0950	Yes
8	Phkg1	732	0.567	0.0987	Yes
9	Sap30	758	0.561	0.1106	Yes
10	Pklr	786	0.557	0.1224	Yes
11	Pfkp	854	0.544	0.1318	Yes
12	S100a4	971	0.524	0.1382	Yes
13	Tpi1	990	0.519	0.1495	Yes
14	Jmjd6	1020	0.514	0.1602	Yes
15	Myh9	1128	0.498	0.1665	Yes
16	Hdlbp	1198	0.489	0.1745	Yes
17	Gpi1	1213	0.488	0.1853	Yes
18	Ero1a	1243	0.484	0.1952	Yes
19	Gapdhs	1270	0.480	0.2052	Yes
20	Tnfaip3	1410	0.464	0.2091	Yes
21	P4ha1	1617	0.443	0.2090	Yes
22	Rragd	1648	0.439	0.2178	Yes
23	Pim1	1658	0.438	0.2277	Yes
24	Plaur	1996	0.401	0.2199	Yes
25	Cdkn1a	2287	0.374	0.2140	Yes
26	Hspa5	2434	0.362	0.2150	Yes
27	Adora2b	2659	0.346	0.2118	Yes
28	Col5a1	2792	0.338	0.2130	Yes
29	Pgm1	2798	0.338	0.2207	Yes
30	Hmox1	2987	0.324	0.2188	Yes
31	Hs3st1	3107	0.318	0.2202	Yes
32	Ilvbl	3293	0.303	0.2180	Yes
33	Errfi1	3595	0.285	0.2093	Yes
34	Fos	3727	0.278	0.2092	Yes
35	Ak4	3735	0.278	0.2154	Yes
36	Aldoa	3765	0.276	0.2204	Yes
37	Vhl	3805	0.273	0.2249	Yes
38	Ids	3965	0.263	0.2230	Yes
39	Foxo3	4042	0.258	0.2252	Yes
40	B3galt6	4239	0.244	0.2210	Yes
41	Vegfa	4396	0.235	0.2186	Yes
42	Mt1	4398	0.235	0.2240	Yes
43	Fam162a	4474	0.230	0.2256	Yes
44	Dusp1	4491	0.229	0.2302	Yes
45	Tgfb3	4619	0.222	0.2290	Yes
46	Gpc1	4734	0.216	0.2283	Yes
47	Ndst1	4798	0.212	0.2300	Yes
48	Ccng2	4826	0.210	0.2336	Yes
49	Pfkl	5089	0.196	0.2249	No
50	Gpc3	5424	0.182	0.2121	No
51	Ldhc	5570	0.174	0.2089	No
52	Eno2	5707	0.168	0.2059	No
53	Bhlhe40	5783	0.166	0.2060	No
54	Pgm2	5806	0.165	0.2087	No
55	Cdkn1b	5879	0.162	0.2089	No
56	Cp	6146	0.147	0.1988	No
57	Maff	6367	0.137	0.1908	No
58	Zfp36	6411	0.136	0.1918	No
59	Tpd52	6448	0.134	0.1931	No
60	Pam	6509	0.131	0.1932	No
61	Nr3c1	6634	0.125	0.1898	No
62	Scarb1	6663	0.123	0.1912	No
63	Pgk1	6761	0.119	0.1891	No
64	Pdk1	6830	0.115	0.1883	No
65	F3	6965	0.108	0.1841	No
66	Tiparp	6982	0.108	0.1858	No
67	Grhpr	7060	0.104	0.1843	No
68	Galk1	7288	0.094	0.1749	No
69	Dtna	7748	0.074	0.1533	No
70	Rbpj	7972	0.065	0.1434	No
71	Ugp2	7990	0.064	0.1441	No
72	Akap12	8130	0.056	0.1383	No
73	Atf3	8249	0.051	0.1335	No
74	Siah2	8285	0.050	0.1329	No
75	Hk2	8451	0.042	0.1254	No
76	Hexa	8617	0.035	0.1178	No
77	Hk1	8692	0.032	0.1148	No
78	Pnrc1	8904	0.023	0.1046	No
79	Slc6a6	8924	0.022	0.1042	No
80	Kdm3a	8997	0.019	0.1009	No
81	Isg20	9092	0.016	0.0965	No
82	Pdk3	9098	0.015	0.0966	No
83	Zfp292	9229	0.011	0.0902	No
84	Ddit4	9280	0.008	0.0879	No
85	Jun	9351	0.005	0.0844	No
86	Dcn	9358	0.005	0.0842	No
87	Egfr	9488	0.000	0.0776	No
88	Bgn	9743	-0.008	0.0649	No
89	Map3k1	9852	-0.012	0.0597	No
90	Slc2a3	10119	-0.024	0.0467	No
91	Noct	10149	-0.025	0.0458	No
92	Gpc4	10366	-0.034	0.0356	No
93	Gaa	10606	-0.044	0.0244	No
94	Gcnt2	10615	-0.045	0.0251	No
95	Kif5a	10685	-0.047	0.0227	No
96	Pfkfb3	10690	-0.047	0.0236	No
97	Tes	10775	-0.051	0.0205	No
98	Prkca	10850	-0.054	0.0180	No
99	Gys1	10885	-0.056	0.0176	No
100	Klf7	10910	-0.057	0.0177	No
101	Nedd4l	11251	-0.069	0.0020	No
102	Ppargc1a	11314	-0.072	0.0005	No
103	Slc37a4	11433	-0.077	-0.0037	No
104	Klhl24	11453	-0.078	-0.0028	No
105	Cdkn1c	11524	-0.081	-0.0045	No
106	Eno3	11884	-0.096	-0.0205	No
107	Wsb1	11909	-0.097	-0.0194	No
108	Pygm	11913	-0.098	-0.0173	No
109	Atp7a	11926	-0.098	-0.0156	No
110	Tgfbi	12188	-0.110	-0.0263	No
111	Cavin3	12533	-0.124	-0.0409	No
112	Klf6	12700	-0.133	-0.0463	No
113	Nfil3	12834	-0.138	-0.0498	No
114	Plin2	12894	-0.142	-0.0494	No
115	Eno1b	13150	-0.151	-0.0589	No
116	Csrp2	13490	-0.167	-0.0723	No
117	P4ha2	13536	-0.169	-0.0706	No
118	Lxn	13550	-0.170	-0.0672	No
119	Il6	13602	-0.172	-0.0657	No
120	Xpnpep1	13688	-0.175	-0.0660	No
121	Ppfia4	13923	-0.184	-0.0735	No
122	Mxi1	13948	-0.186	-0.0704	No
123	Slc2a5	14075	-0.192	-0.0723	No
124	Ndrg1	14300	-0.203	-0.0789	No
125	Ldha	14330	-0.204	-0.0756	No
126	Ext1	14356	-0.205	-0.0720	No
127	Tgm2	14360	-0.205	-0.0673	No
128	Aldoc	14601	-0.217	-0.0745	No
129	Bcl2	14736	-0.223	-0.0760	No
130	Large1	14918	-0.232	-0.0798	No
131	Slc2a1	15050	-0.239	-0.0808	No
132	Ampd3	15160	-0.245	-0.0806	No
133	Tpst2	15397	-0.257	-0.0866	No
134	B4galnt2	15424	-0.259	-0.0818	No
135	Ddit3	15804	-0.279	-0.0946	No
136	Cxcr4	16010	-0.291	-0.0982	No
137	Fosl2	16025	-0.292	-0.0920	No
138	Gbe1	16053	-0.293	-0.0865	No
139	Fbp1	16253	-0.305	-0.0895	No
140	Btg1	16308	-0.309	-0.0849	No
141	Ppp1r15a	16352	-0.311	-0.0798	No
142	Glrx	16476	-0.320	-0.0785	No
143	Pdgfb	16521	-0.323	-0.0732	No
144	Kdelr3	16661	-0.331	-0.0724	No
145	Rora	16757	-0.338	-0.0693	No
146	Angptl4	16854	-0.346	-0.0660	No
147	Irs2	16918	-0.351	-0.0610	No
148	Prdx5	16933	-0.352	-0.0534	No
149	Selenbp1	17041	-0.359	-0.0504	No
150	Sdc2	17258	-0.374	-0.0526	No
151	Plac8	17316	-0.378	-0.0466	No
152	Ankzf1	17983	-0.437	-0.0703	No
153	Ndst2	18134	-0.450	-0.0673	No
154	Mif	18259	-0.465	-0.0627	No
155	Casp6	18466	-0.491	-0.0616	No
156	Sdc3	18667	-0.522	-0.0595	No
157	Cav1	18845	-0.549	-0.0556	No
158	Ier3	18849	-0.550	-0.0428	No
159	Nagk	19199	-0.624	-0.0458	No
160	Cited2	19273	-0.650	-0.0342	No
161	Sult2b1	19281	-0.653	-0.0192	No
162	Stbd1	19490	-0.729	-0.0126	No
163	Bnip3l	19747	-1.142	0.0012	No