Details for gene set HALLMARK

Table: GSEA Results Summary

Dataset	CMP.CMP_Pheno.cls#Group2_versus_Group4.CMP_Pheno.cls#Group2_versus_Group4_repos
Phenotype	CMP_Pheno.cls#Group2_versus_Group4_repos
Upregulated in class	1
GeneSet	HALLMARK_GLYCOLYSIS
Enrichment Score (ES)	0.25794336
Normalized Enrichment Score (NES)	1.1697761
Nominal p-value	0.19423077
FDR q-value	0.47636428
FWER p-Value	0.862

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Stc2	60	0.944	0.0171	Yes
2	Nt5e	133	0.816	0.0308	Yes
3	Vldlr	153	0.792	0.0468	Yes
4	Aurka	175	0.775	0.0622	Yes
5	Polr3k	509	0.625	0.0586	Yes
6	Dld	535	0.617	0.0704	Yes
7	Gmppb	554	0.610	0.0825	Yes
8	Sap30	758	0.561	0.0841	Yes
9	Pfkp	854	0.544	0.0909	Yes
10	Mpi	939	0.531	0.0979	Yes
11	Tpi1	990	0.519	0.1065	Yes
12	Ang	1040	0.510	0.1148	Yes
13	Alg1	1074	0.505	0.1239	Yes
14	Abcb6	1152	0.496	0.1306	Yes
15	Hdlbp	1198	0.489	0.1387	Yes
16	Me1	1208	0.488	0.1487	Yes
17	Ero1a	1243	0.484	0.1573	Yes
18	Gapdhs	1270	0.480	0.1662	Yes
19	Fkbp4	1467	0.458	0.1660	Yes
20	P4ha1	1617	0.443	0.1678	Yes
21	Rragd	1648	0.439	0.1757	Yes
22	Prps1	1798	0.422	0.1770	Yes
23	Kif20a	1817	0.420	0.1851	Yes
24	Got2	1819	0.419	0.1940	Yes
25	Hs6st2	1826	0.419	0.2026	Yes
26	Hmmr	1883	0.412	0.2085	Yes
27	Ppia	1899	0.411	0.2165	Yes
28	Nasp	1955	0.405	0.2224	Yes
29	Cdk1	2014	0.400	0.2280	Yes
30	Got1	2027	0.399	0.2359	Yes
31	Bik	2341	0.369	0.2278	Yes
32	Hs2st1	2343	0.369	0.2356	Yes
33	Hspa5	2434	0.362	0.2387	Yes
34	Dsc2	2447	0.361	0.2458	Yes
35	B3gnt3	2576	0.352	0.2468	Yes
36	Copb2	2637	0.348	0.2511	Yes
37	Adora2b	2659	0.346	0.2575	Yes
38	Col5a1	2792	0.338	0.2579	Yes
39	Gnpda1	3382	0.297	0.2342	No
40	Slc25a13	3479	0.292	0.2356	No
41	Aldh9a1	3638	0.282	0.2335	No
42	Ak4	3735	0.278	0.2345	No
43	Aldoa	3765	0.276	0.2389	No
44	Qsox1	3795	0.274	0.2433	No
45	Nol3	3855	0.271	0.2461	No
46	B3galt6	4239	0.244	0.2317	No
47	Vegfa	4396	0.235	0.2288	No
48	Fam162a	4474	0.230	0.2298	No
49	Il13ra1	4547	0.226	0.2309	No
50	Gpc1	4734	0.216	0.2260	No
51	Cog2	4894	0.208	0.2224	No
52	B4galt4	4897	0.208	0.2267	No
53	Hax1	4953	0.204	0.2282	No
54	Pfkfb1	5132	0.195	0.2233	No
55	Mertk	5229	0.189	0.2225	No
56	Gpc3	5424	0.182	0.2164	No
57	Lhpp	5566	0.174	0.2130	No
58	Ldhc	5570	0.174	0.2165	No
59	Eno2	5707	0.168	0.2132	No
60	Gfpt1	5758	0.167	0.2142	No
61	Pgm2	5806	0.165	0.2153	No
62	Slc35a3	5901	0.161	0.2139	No
63	Cln6	6005	0.155	0.2120	No
64	Med24	6020	0.154	0.2145	No
65	Xylt2	6048	0.152	0.2164	No
66	Pam	6509	0.131	0.1957	No
67	Srd5a3	6520	0.131	0.1980	No
68	Gal3st1	6531	0.131	0.2003	No
69	Gale	6712	0.121	0.1937	No
70	Pgk1	6761	0.119	0.1938	No
71	Plod1	6801	0.117	0.1943	No
72	Pkm	6900	0.112	0.1917	No
73	Psmc4	7168	0.099	0.1802	No
74	Fut8	7275	0.095	0.1768	No
75	Galk1	7288	0.094	0.1782	No
76	Mdh2	7486	0.085	0.1699	No
77	Bpnt1	7492	0.085	0.1715	No
78	Tgfa	7496	0.085	0.1731	No
79	Idh1	7705	0.075	0.1641	No
80	Kif2a	7807	0.071	0.1605	No
81	Me2	7937	0.066	0.1553	No
82	Ndufv3	7957	0.065	0.1557	No
83	Ugp2	7990	0.064	0.1554	No
84	Ak3	8186	0.053	0.1466	No
85	Tpst1	8261	0.051	0.1439	No
86	Arpp19	8310	0.048	0.1425	No
87	Hk2	8451	0.042	0.1363	No
88	Pgam1	8497	0.040	0.1348	No
89	Sdc1	8758	0.029	0.1222	No
90	Isg20	9092	0.016	0.1055	No
91	Pdk3	9098	0.015	0.1056	No
92	Zfp292	9229	0.011	0.0992	No
93	Pcx	9243	0.010	0.0987	No
94	Ddit4	9280	0.008	0.0971	No
95	Dcn	9358	0.005	0.0932	No
96	Stmn1	9431	0.002	0.0896	No
97	Egfr	9488	0.000	0.0868	No
98	Agrn	10210	-0.027	0.0505	No
99	Chst12	10228	-0.028	0.0503	No
100	Pygl	10316	-0.032	0.0465	No
101	Gpc4	10366	-0.034	0.0448	No
102	Mdh1	10679	-0.047	0.0298	No
103	Pygb	10789	-0.051	0.0254	No
104	Gys1	10885	-0.056	0.0217	No
105	Galk2	10895	-0.056	0.0225	No
106	Paxip1	11368	-0.074	-0.0000	No
107	Slc37a4	11433	-0.077	-0.0017	No
108	Glce	11810	-0.093	-0.0189	No
109	Gne	11856	-0.095	-0.0192	No
110	Spag4	11872	-0.095	-0.0179	No
111	Tgfbi	12188	-0.110	-0.0316	No
112	Slc25a10	12385	-0.119	-0.0391	No
113	Plod2	12437	-0.121	-0.0391	No
114	Cd44	12556	-0.126	-0.0425	No
115	Ecd	12702	-0.133	-0.0470	No
116	B4galt1	13023	-0.146	-0.0602	No
117	Gclc	13134	-0.150	-0.0626	No
118	Eno1b	13150	-0.151	-0.0602	No
119	Txn1	13352	-0.160	-0.0670	No
120	B4galt2	13396	-0.162	-0.0658	No
121	P4ha2	13536	-0.169	-0.0693	No
122	Sod1	13666	-0.173	-0.0721	No
123	Pmm2	13679	-0.174	-0.0690	No
124	Egln3	13702	-0.175	-0.0664	No
125	Ppp2cb	13734	-0.177	-0.0642	No
126	Gmppa	13752	-0.178	-0.0613	No
127	Homer1	13762	-0.178	-0.0580	No
128	Ppfia4	13923	-0.184	-0.0622	No
129	Nanp	13930	-0.185	-0.0586	No
130	Mxi1	13948	-0.186	-0.0555	No
131	Nsdhl	14149	-0.195	-0.0615	No
132	Gusb	14232	-0.199	-0.0615	No
133	Ldha	14330	-0.204	-0.0621	No
134	Ext1	14356	-0.205	-0.0590	No
135	Cenpa	14391	-0.207	-0.0563	No
136	Chpf2	14418	-0.208	-0.0532	No
137	Ext2	14423	-0.208	-0.0489	No
138	Rpe	14432	-0.208	-0.0449	No
139	G6pdx	14582	-0.216	-0.0479	No
140	Cyb5a	14680	-0.221	-0.0481	No
141	Cth	14727	-0.223	-0.0457	No
142	Rbck1	14894	-0.232	-0.0493	No
143	Pkp2	15236	-0.249	-0.0614	No
144	Gpr87	15516	-0.263	-0.0700	No
145	Sdhc	15609	-0.267	-0.0690	No
146	Depdc1a	15723	-0.274	-0.0689	No
147	B3gat3	15827	-0.280	-0.0682	No
148	Cxcr4	16010	-0.291	-0.0713	No
149	Aldh7a1	16031	-0.292	-0.0661	No
150	Idua	16355	-0.312	-0.0759	No
151	Phka2	16364	-0.312	-0.0696	No
152	Glrx	16476	-0.320	-0.0685	No
153	Kdelr3	16661	-0.331	-0.0708	No
154	Gfus	16813	-0.343	-0.0712	No
155	Taldo1	16828	-0.344	-0.0646	No
156	Angptl4	16854	-0.346	-0.0585	No
157	Akr1a1	16881	-0.348	-0.0523	No
158	Irs2	16918	-0.351	-0.0467	No
159	Sdc2	17258	-0.374	-0.0560	No
160	Ndst3	17325	-0.379	-0.0513	No
161	Chst1	17345	-0.380	-0.0442	No
162	Agl	17425	-0.386	-0.0400	No
163	Vcan	17613	-0.400	-0.0410	No
164	Slc16a3	17717	-0.411	-0.0375	No
165	Ankzf1	17983	-0.437	-0.0417	No
166	B4galt7	18142	-0.451	-0.0401	No
167	Mif	18259	-0.465	-0.0361	No
168	Pgls	18401	-0.483	-0.0330	No
169	Capn5	18438	-0.488	-0.0244	No
170	Casp6	18466	-0.491	-0.0153	No
171	Sdc3	18667	-0.522	-0.0144	No
172	Ier3	18849	-0.550	-0.0119	No
173	Lct	19217	-0.628	-0.0172	No
174	Cited2	19273	-0.650	-0.0062	No
175	Met	19439	-0.706	0.0005	No
176	Chpf	19560	-0.769	0.0108	No