Details for gene set HALLMARK_APICAL

Table: GSEA Results Summary

Dataset	CMP.CMP_Pheno.cls#Group2_versus_Group4.CMP_Pheno.cls#Group2_versus_Group4_repos
Phenotype	CMP_Pheno.cls#Group2_versus_Group4_repos
Upregulated in class	1
GeneSet	HALLMARK_APICAL_JUNCTION
Enrichment Score (ES)	0.28027445
Normalized Enrichment Score (NES)	1.1397485
Nominal p-value	0.23689727
FDR q-value	0.4694745
FWER p-Value	0.895

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Jam3	20	1.057	0.0224	Yes
2	Cdk8	171	0.779	0.0321	Yes
3	Adra1b	269	0.716	0.0430	Yes
4	Dhx16	275	0.714	0.0586	Yes
5	Inppl1	319	0.696	0.0719	Yes
6	Mpzl1	338	0.686	0.0862	Yes
7	Actn3	415	0.659	0.0970	Yes
8	Ywhah	492	0.630	0.1071	Yes
9	Mapk13	531	0.618	0.1189	Yes
10	Cadm3	734	0.566	0.1211	Yes
11	Mdk	884	0.538	0.1255	Yes
12	Gtf2f1	898	0.537	0.1367	Yes
13	Adam15	900	0.537	0.1486	Yes
14	Adam9	925	0.533	0.1592	Yes
15	Rhof	999	0.517	0.1670	Yes
16	Myh9	1128	0.498	0.1715	Yes
17	Icam1	1204	0.489	0.1786	Yes
18	Cap1	1466	0.458	0.1754	Yes
19	Shroom2	1474	0.458	0.1853	Yes
20	Cdh1	1683	0.434	0.1843	Yes
21	Tsc1	1786	0.423	0.1885	Yes
22	Vwf	1947	0.406	0.1893	Yes
23	Tro	2034	0.398	0.1938	Yes
24	Msn	2080	0.393	0.2002	Yes
25	Cdh11	2189	0.381	0.2032	Yes
26	Pik3cb	2191	0.381	0.2116	Yes
27	Vasp	2199	0.380	0.2197	Yes
28	Mmp9	2446	0.361	0.2152	Yes
29	Insig1	2533	0.356	0.2187	Yes
30	Itga3	2633	0.348	0.2213	Yes
31	Actb	2715	0.343	0.2248	Yes
32	Adamts5	2806	0.337	0.2277	Yes
33	Crb3	3063	0.319	0.2218	Yes
34	Thy1	3087	0.319	0.2277	Yes
35	Rasa1	3098	0.319	0.2342	Yes
36	Taok2	3301	0.303	0.2307	Yes
37	Icam5	3302	0.303	0.2374	Yes
38	Traf1	3316	0.301	0.2434	Yes
39	Baiap2	3335	0.300	0.2492	Yes
40	Nectin3	3432	0.296	0.2508	Yes
41	Cd276	3490	0.291	0.2544	Yes
42	Cldn15	3521	0.289	0.2593	Yes
43	Itgb1	3522	0.289	0.2657	Yes
44	Vcl	3540	0.288	0.2712	Yes
45	Epb41l2	3560	0.287	0.2766	Yes
46	Pals1	3613	0.284	0.2803	Yes
47	Col16a1	3924	0.266	0.2704	No
48	Tmem8b	4367	0.237	0.2531	No
49	Adam23	4624	0.222	0.2450	No
50	Skap2	4998	0.201	0.2304	No
51	Amh	5088	0.197	0.2302	No
52	Wasl	5211	0.190	0.2282	No
53	Parva	5236	0.189	0.2312	No
54	Ikbkg	5337	0.186	0.2302	No
55	Ptk2	5398	0.184	0.2312	No
56	Actn1	5432	0.181	0.2336	No
57	Negr1	5442	0.181	0.2372	No
58	Tjp1	5561	0.175	0.2350	No
59	Amigo2	5670	0.169	0.2333	No
60	Nfasc	5714	0.168	0.2348	No
61	Cdh8	5840	0.163	0.2320	No
62	Mapk11	6070	0.151	0.2237	No
63	Actn4	6096	0.150	0.2258	No
64	Plcg1	6149	0.147	0.2264	No
65	Ctnnd1	6156	0.146	0.2293	No
66	Pten	6193	0.144	0.2307	No
67	Mapk14	6456	0.133	0.2203	No
68	Myh10	6768	0.118	0.2071	No
69	Nrtn	6973	0.108	0.1990	No
70	Stx4a	7018	0.106	0.1992	No
71	Tial1	7065	0.104	0.1991	No
72	Shc1	7085	0.103	0.2004	No
73	Vav2	7175	0.099	0.1981	No
74	Mmp2	7335	0.091	0.1920	No
75	Fbn1	7407	0.089	0.1904	No
76	Cd274	7467	0.086	0.1893	No
77	Hadh	7872	0.068	0.1702	No
78	Nf2	7922	0.066	0.1691	No
79	Icam4	7983	0.064	0.1675	No
80	Gnai2	8281	0.050	0.1535	No
81	Sgce	8635	0.034	0.1362	No
82	Ptprc	8703	0.031	0.1335	No
83	Ctnna1	8799	0.028	0.1293	No
84	Tubg1	9354	0.005	0.1011	No
85	Irs1	9378	0.004	0.1000	No
86	Actg1	9438	0.002	0.0971	No
87	Egfr	9488	0.000	0.0946	No
88	Fscn1	9491	0.000	0.0945	No
89	Nrap	9667	-0.005	0.0857	No
90	Sympk	9867	-0.013	0.0758	No
91	Hras	9902	-0.014	0.0744	No
92	Arhgef6	10098	-0.023	0.0649	No
93	Gamt	10391	-0.035	0.0508	No
94	Nectin2	10401	-0.036	0.0512	No
95	Dlg1	10613	-0.045	0.0414	No
96	Ldlrap1	10637	-0.045	0.0412	No
97	Nf1	10824	-0.053	0.0329	No
98	Wnk4	10857	-0.054	0.0325	No
99	Gnai1	10891	-0.056	0.0321	No
100	Akt2	10919	-0.057	0.0320	No
101	Cercam	11038	-0.063	0.0273	No
102	Pkd1	11253	-0.070	0.0180	No
103	Evl	11746	-0.090	-0.0051	No
104	Cdh4	12098	-0.106	-0.0207	No
105	Lamb3	12134	-0.108	-0.0201	No
106	Tgfbi	12188	-0.110	-0.0203	No
107	Cldn14	12265	-0.114	-0.0217	No
108	Amigo1	12345	-0.117	-0.0231	No
109	Cd86	12467	-0.122	-0.0266	No
110	Jup	12538	-0.125	-0.0274	No
111	Nlgn2	12541	-0.125	-0.0247	No
112	Map3k20	12555	-0.125	-0.0226	No
113	Pik3r3	12629	-0.129	-0.0234	No
114	Slit2	12633	-0.129	-0.0207	No
115	Crat	12897	-0.142	-0.0310	No
116	B4galt1	13023	-0.146	-0.0341	No
117	Alox8	13597	-0.172	-0.0595	No
118	Cntn1	13929	-0.185	-0.0723	No
119	Cadm2	13935	-0.185	-0.0684	No
120	Col17a1	14210	-0.198	-0.0780	No
121	Tspan4	14267	-0.201	-0.0764	No
122	Cd34	14634	-0.219	-0.0902	No
123	Thbs3	14740	-0.223	-0.0906	No
124	Lima1	14815	-0.228	-0.0893	No
125	Src	14835	-0.229	-0.0852	No
126	Map4k2	14881	-0.231	-0.0824	No
127	Pecam1	15038	-0.238	-0.0851	No
128	Vcam1	15126	-0.243	-0.0841	No
129	Syk	15135	-0.243	-0.0791	No
130	Pbx2	15211	-0.248	-0.0774	No
131	Exoc4	15337	-0.254	-0.0782	No
132	Cnn2	15556	-0.265	-0.0834	No
133	Nrxn2	15654	-0.270	-0.0824	No
134	Akt3	15870	-0.282	-0.0871	No
135	Zyx	15934	-0.285	-0.0839	No
136	Actn2	16002	-0.290	-0.0809	No
137	Pard6g	16506	-0.322	-0.0994	No
138	Pfn1	16715	-0.335	-0.1026	No
139	Myl12b	16735	-0.337	-0.0961	No
140	Itga2	16821	-0.343	-0.0928	No
141	Nexn	16827	-0.344	-0.0854	No
142	Cx3cl1	16970	-0.354	-0.0848	No
143	Rac2	17327	-0.379	-0.0945	No
144	Nectin4	17328	-0.379	-0.0861	No
145	Nlgn3	17523	-0.394	-0.0873	No
146	Kcnh2	17565	-0.396	-0.0806	No
147	Itga10	17574	-0.397	-0.0721	No
148	Nectin1	17580	-0.397	-0.0636	No
149	Arpc2	17601	-0.399	-0.0557	No
150	Vcan	17613	-0.400	-0.0474	No
151	Rsu1	17652	-0.404	-0.0404	No
152	Atp1a3	17676	-0.406	-0.0326	No
153	Sorbs3	17911	-0.429	-0.0350	No
154	Itgb4	18136	-0.450	-0.0364	No
155	Lama3	18199	-0.458	-0.0294	No
156	Speg	18274	-0.467	-0.0228	No
157	Sirpa	18416	-0.485	-0.0192	No
158	Mvd	18574	-0.508	-0.0159	No
159	Itga9	18636	-0.518	-0.0075	No
160	Icam2	18640	-0.519	0.0038	No
161	Sdc3	18667	-0.522	0.0141	No
162	Rras	19068	-0.593	0.0069	No
163	Layn	19205	-0.626	0.0138	No
164	Bmp1	19349	-0.675	0.0215	No