Details for gene set HALLMARK

Table: GSEA Results Summary

Dataset	CMP.CMP_Pheno.cls#Group1_versus_Group4.CMP_Pheno.cls#Group1_versus_Group4_repos
Phenotype	CMP_Pheno.cls#Group1_versus_Group4_repos
Upregulated in class	0
GeneSet	HALLMARK_HYPOXIA
Enrichment Score (ES)	0.20830615
Normalized Enrichment Score (NES)	1.0179961
Nominal p-value	0.41
FDR q-value	0.95507956
FWER p-Value	0.976

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Cavin1	56	0.881	0.0187	Yes
2	Phkg1	169	0.721	0.0307	Yes
3	Car12	191	0.706	0.0470	Yes
4	Slc25a1	319	0.646	0.0563	Yes
5	Bgn	352	0.631	0.0702	Yes
6	Myh9	568	0.562	0.0730	Yes
7	Vhl	623	0.550	0.0837	Yes
8	Stc2	795	0.517	0.0877	Yes
9	Ak4	796	0.516	0.1003	Yes
10	Hmox1	878	0.503	0.1086	Yes
11	Jmjd6	905	0.499	0.1195	Yes
12	Hdlbp	1007	0.487	0.1263	Yes
13	Jun	1049	0.479	0.1359	Yes
14	Errfi1	1111	0.470	0.1443	Yes
15	Dusp1	1229	0.453	0.1495	Yes
16	Gpc1	1342	0.440	0.1545	Yes
17	Dtna	1693	0.402	0.1466	Yes
18	Siah2	1743	0.397	0.1538	Yes
19	Pgm1	1835	0.388	0.1587	Yes
20	Ppp1r15a	1937	0.379	0.1628	Yes
21	Noct	2188	0.361	0.1589	Yes
22	Sdc2	2333	0.349	0.1602	Yes
23	S100a4	2483	0.336	0.1608	Yes
24	Rragd	2623	0.325	0.1617	Yes
25	Rbpj	2686	0.322	0.1664	Yes
26	Fam162a	2808	0.314	0.1679	Yes
27	Gpi1	2821	0.314	0.1750	Yes
28	Pdk3	2835	0.313	0.1820	Yes
29	Fos	2959	0.306	0.1833	Yes
30	Foxo3	3034	0.301	0.1869	Yes
31	Btg1	3153	0.292	0.1880	Yes
32	Il6	3188	0.290	0.1934	Yes
33	Klf6	3285	0.285	0.1955	Yes
34	Kdm3a	3293	0.284	0.2021	Yes
35	Slc37a4	3525	0.266	0.1968	Yes
36	Cdkn1c	3611	0.262	0.1989	Yes
37	Maff	3816	0.252	0.1947	Yes
38	Ero1a	3838	0.250	0.1997	Yes
39	Fosl2	3917	0.244	0.2017	Yes
40	Eno2	3981	0.240	0.2044	Yes
41	P4ha1	4055	0.237	0.2065	Yes
42	Ilvbl	4186	0.230	0.2055	Yes
43	Ext1	4284	0.226	0.2061	Yes
44	Pfkp	4429	0.218	0.2041	Yes
45	Aldoa	4452	0.217	0.2083	Yes
46	Plaur	4579	0.209	0.2070	No
47	Ankzf1	4944	0.190	0.1931	No
48	Xpnpep1	4955	0.189	0.1972	No
49	Gpc4	5014	0.186	0.1988	No
50	Klhl24	5057	0.183	0.2012	No
51	Cdkn1a	5106	0.180	0.2031	No
52	Hexa	5181	0.178	0.2037	No
53	Slc2a3	5493	0.165	0.1919	No
54	Hspa5	5552	0.163	0.1930	No
55	Pdk1	5565	0.162	0.1963	No
56	Ets1	5812	0.150	0.1875	No
57	Gapdhs	5833	0.149	0.1901	No
58	Ids	6000	0.142	0.1851	No
59	Pgk1	6075	0.138	0.1847	No
60	Gaa	6184	0.133	0.1825	No
61	Dcn	6300	0.129	0.1798	No
62	Pgm2	6457	0.121	0.1748	No
63	Ndst1	6541	0.117	0.1734	No
64	Egfr	6620	0.114	0.1722	No
65	Bcl2	6816	0.110	0.1650	No
66	Pklr	7230	0.092	0.1462	No
67	Zfp292	7282	0.090	0.1458	No
68	Eno3	7382	0.086	0.1428	No
69	Tpd52	7535	0.080	0.1371	No
70	Pim1	7609	0.077	0.1352	No
71	Hk2	7929	0.062	0.1205	No
72	Wsb1	7953	0.062	0.1208	No
73	Tpi1	8048	0.058	0.1174	No
74	Fbp1	8374	0.045	0.1020	No
75	Irs2	8628	0.035	0.0899	No
76	B3galt6	8674	0.033	0.0884	No
77	Akap12	8770	0.029	0.0843	No
78	Ugp2	9002	0.021	0.0730	No
79	Pnrc1	9098	0.017	0.0686	No
80	Pygm	9414	0.004	0.0526	No
81	Hs3st1	9551	0.000	0.0457	No
82	Kdelr3	9639	-0.000	0.0412	No
83	Tiparp	9672	-0.002	0.0397	No
84	Vegfa	9830	-0.009	0.0319	No
85	Vldlr	9934	-0.012	0.0269	No
86	Hk1	9944	-0.012	0.0268	No
87	Ccng2	9966	-0.013	0.0260	No
88	Tnfaip3	10050	-0.016	0.0222	No
89	Mt1	10269	-0.025	0.0117	No
90	Tgm2	10383	-0.029	0.0066	No
91	Ppfia4	10489	-0.033	0.0021	No
92	Gbe1	10547	-0.036	0.0000	No
93	Pfkfb3	10555	-0.036	0.0006	No
94	Angptl4	10563	-0.036	0.0011	No
95	Col5a1	10619	-0.039	-0.0008	No
96	Pam	10870	-0.049	-0.0123	No
97	Nedd4l	11090	-0.058	-0.0221	No
98	Adora2b	11390	-0.070	-0.0356	No
99	Sap30	11399	-0.071	-0.0343	No
100	Kif5a	11608	-0.080	-0.0429	No
101	P4ha2	11640	-0.082	-0.0425	No
102	Cdkn1b	11654	-0.082	-0.0411	No
103	Nfil3	11681	-0.083	-0.0404	No
104	Isg20	11751	-0.085	-0.0419	No
105	Anxa2	11881	-0.092	-0.0462	No
106	Nr3c1	11935	-0.094	-0.0466	No
107	Ndrg1	12268	-0.108	-0.0609	No
108	Gcnt2	12354	-0.112	-0.0625	No
109	Pfkl	12365	-0.113	-0.0602	No
110	Galk1	12397	-0.114	-0.0590	No
111	Tgfb3	12506	-0.119	-0.0616	No
112	Pdgfb	12609	-0.124	-0.0638	No
113	Ldhc	12692	-0.127	-0.0648	No
114	Eno1b	12868	-0.131	-0.0706	No
115	Aldoc	12887	-0.132	-0.0682	No
116	Lxn	12919	-0.133	-0.0665	No
117	Ppargc1a	13028	-0.139	-0.0686	No
118	Tpst2	13074	-0.141	-0.0675	No
119	Map3k1	13179	-0.146	-0.0692	No
120	Mxi1	13183	-0.146	-0.0658	No
121	Slc2a1	14034	-0.179	-0.1048	No
122	Gys1	14105	-0.183	-0.1039	No
123	Cp	14145	-0.185	-0.1013	No
124	F3	14189	-0.187	-0.0989	No
125	Cavin3	14198	-0.188	-0.0947	No
126	Large1	14305	-0.193	-0.0954	No
127	Slc6a6	14757	-0.218	-0.1130	No
128	Prdx5	14993	-0.231	-0.1194	No
129	Atp7a	15049	-0.234	-0.1164	No
130	Glrx	15078	-0.235	-0.1121	No
131	Scarb1	15115	-0.238	-0.1081	No
132	Selenbp1	15225	-0.242	-0.1078	No
133	Slc2a5	15240	-0.242	-0.1025	No
134	Csrp2	15464	-0.256	-0.1076	No
135	Cited2	15705	-0.268	-0.1133	No
136	Ldha	15825	-0.273	-0.1126	No
137	Prkca	15827	-0.273	-0.1060	No
138	Cxcr4	15890	-0.277	-0.1024	No
139	Tes	15918	-0.279	-0.0969	No
140	Casp6	15985	-0.283	-0.0934	No
141	Bhlhe40	16086	-0.288	-0.0914	No
142	Rora	16146	-0.292	-0.0872	No
143	Zfp36	16184	-0.295	-0.0819	No
144	Atf3	16702	-0.329	-0.1002	No
145	Cav1	16896	-0.339	-0.1017	No
146	Ddit4	17175	-0.360	-0.1071	No
147	Sult2b1	17208	-0.362	-0.0998	No
148	B4galnt2	17438	-0.383	-0.1021	No
149	Gpc3	17873	-0.416	-0.1140	No
150	Tgfbi	17888	-0.418	-0.1045	No
151	Klf7	17902	-0.420	-0.0949	No
152	Ddit3	18645	-0.507	-0.1203	No
153	Grhpr	18719	-0.520	-0.1112	No
154	Ndst2	18721	-0.521	-0.0985	No
155	Plac8	18817	-0.536	-0.0902	No
156	Plin2	18980	-0.569	-0.0845	No
157	Ampd3	19153	-0.610	-0.0783	No
158	Mif	19269	-0.641	-0.0685	No
159	Bnip3l	19427	-0.691	-0.0595	No
160	Sdc3	19498	-0.727	-0.0453	No
161	Nagk	19529	-0.742	-0.0286	No
162	Stbd1	19539	-0.748	-0.0107	No
163	Ier3	19694	-0.919	0.0039	No