Details for gene set HALLMARK_G2M

Table: GSEA Results Summary

Dataset	CLP.Basophil_Pheno.cls #Group6_versus_Group8.Basophil_Pheno.cls #Group6_versus_Group8_repos
Phenotype	Basophil_Pheno.cls#Group6_versus_Group8_repos
Upregulated in class	4
GeneSet	HALLMARK_G2M_CHECKPOINT
Enrichment Score (ES)	0.36179313
Normalized Enrichment Score (NES)	1.471301
Nominal p-value	0.10993657
FDR q-value	0.14594874
FWER p-Value	0.381

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Meis2	354	0.742	-0.0016	Yes
2	Mybl2	396	0.714	0.0134	Yes
3	Stil	478	0.662	0.0249	Yes
4	Slc7a1	510	0.648	0.0388	Yes
5	Bard1	643	0.600	0.0461	Yes
6	Hus1	655	0.597	0.0598	Yes
7	Aurka	796	0.578	0.0661	Yes
8	Fancc	841	0.573	0.0775	Yes
9	Nek2	1112	0.521	0.0752	Yes
10	Hmgb3	1184	0.505	0.0835	Yes
11	Odc1	1256	0.490	0.0914	Yes
12	Ndc80	1275	0.488	0.1022	Yes
13	Gins2	1279	0.487	0.1138	Yes
14	Cdkn3	1335	0.475	0.1222	Yes
15	Mki67	1336	0.475	0.1337	Yes
16	Ccna2	1536	0.444	0.1334	Yes
17	Katna1	1544	0.443	0.1437	Yes
18	Odf2	1545	0.443	0.1544	Yes
19	Rpa2	1726	0.429	0.1549	Yes
20	Polq	1787	0.424	0.1618	Yes
21	Kif5b	1930	0.416	0.1640	Yes
22	Tpx2	2158	0.403	0.1613	Yes
23	Ezh2	2326	0.393	0.1616	Yes
24	E2f4	2379	0.387	0.1681	Yes
25	Dbf4	2402	0.384	0.1761	Yes
26	Brca2	2413	0.383	0.1848	Yes
27	Ttk	2468	0.378	0.1909	Yes
28	Uck2	2471	0.377	0.1999	Yes
29	Ilf3	2571	0.365	0.2033	Yes
30	Abl1	2576	0.364	0.2118	Yes
31	Pole	2586	0.363	0.2201	Yes
32	Lig3	2626	0.358	0.2266	Yes
33	Mad2l1	2731	0.345	0.2292	Yes
34	Incenp	2764	0.341	0.2357	Yes
35	Nasp	2780	0.340	0.2430	Yes
36	Cdc45	3017	0.316	0.2377	Yes
37	Numa1	3074	0.311	0.2421	Yes
38	Efna5	3113	0.309	0.2475	Yes
39	Map3k20	3152	0.305	0.2527	Yes
40	Rasal2	3269	0.298	0.2535	Yes
41	Tfdp1	3298	0.296	0.2591	Yes
42	Rad21	3334	0.294	0.2643	Yes
43	Hnrnpu	3385	0.291	0.2686	Yes
44	Chaf1a	3448	0.287	0.2721	Yes
45	Ccnb2	3462	0.285	0.2782	Yes
46	Kif20b	3463	0.285	0.2851	Yes
47	Rbl1	3464	0.285	0.2920	Yes
48	Cdc25b	3521	0.282	0.2957	Yes
49	Pola2	3541	0.280	0.3014	Yes
50	Exo1	3583	0.277	0.3059	Yes
51	Tmpo	3617	0.275	0.3107	Yes
52	Tra2b	3768	0.269	0.3089	Yes
53	Kmt5a	3772	0.269	0.3152	Yes
54	Hira	3779	0.268	0.3214	Yes
55	Kif4	3804	0.266	0.3264	Yes
56	Kpnb1	3824	0.265	0.3318	Yes
57	Cdc7	3847	0.263	0.3369	Yes
58	Nsd2	3931	0.257	0.3386	Yes
59	Tent4a	4026	0.252	0.3395	Yes
60	Nup50	4665	0.231	0.3100	Yes
61	Cenpf	4843	0.226	0.3058	Yes
62	H2az1	4924	0.221	0.3067	Yes
63	Pafah1b1	4946	0.219	0.3108	Yes
64	Kif22	4956	0.219	0.3156	Yes
65	Chek1	5024	0.215	0.3171	Yes
66	Kif2c	5076	0.211	0.3194	Yes
67	Fbxo5	5129	0.207	0.3215	Yes
68	Hspa8	5155	0.206	0.3251	Yes
69	Xpo1	5222	0.202	0.3264	Yes
70	Rad23b	5259	0.200	0.3292	Yes
71	Gspt1	5420	0.191	0.3250	Yes
72	Plk4	5437	0.189	0.3287	Yes
73	Ube2c	5504	0.186	0.3296	Yes
74	Prpf4b	5541	0.184	0.3320	Yes
75	Birc5	5581	0.181	0.3343	Yes
76	Hmmr	5584	0.181	0.3385	Yes
77	Kif15	5667	0.177	0.3383	Yes
78	Kif23	5691	0.175	0.3412	Yes
79	Top2a	5727	0.174	0.3435	Yes
80	Tnpo2	5747	0.172	0.3466	Yes
81	Suv39h1	5773	0.171	0.3494	Yes
82	Hnrnpd	5876	0.165	0.3478	Yes
83	Dtymk	5955	0.162	0.3474	Yes
84	Aurkb	6043	0.156	0.3464	Yes
85	Lmnb1	6055	0.156	0.3495	Yes
86	Amd1	6106	0.153	0.3505	Yes
87	Cenpe	6120	0.153	0.3534	Yes
88	Rad54l	6147	0.151	0.3557	Yes
89	Ddx39a	6179	0.150	0.3576	Yes
90	Srsf1	6267	0.145	0.3563	Yes
91	Ncl	6380	0.140	0.3535	Yes
92	Nup98	6435	0.137	0.3538	Yes
93	Tacc3	6483	0.134	0.3545	Yes
94	Stag1	6490	0.133	0.3574	Yes
95	Cul4a	6494	0.133	0.3604	Yes
96	Ube2s	6552	0.131	0.3605	Yes
97	Ccnd1	6644	0.126	0.3585	Yes
98	Kif11	6694	0.124	0.3588	Yes
99	Mapk14	6695	0.124	0.3618	Yes
100	Srsf2	6758	0.121	0.3613	No
101	Smc2	6916	0.113	0.3554	No
102	Espl1	6985	0.110	0.3543	No
103	Egf	7002	0.109	0.3561	No
104	Casp8ap2	7164	0.101	0.3497	No
105	Sap30	7201	0.099	0.3501	No
106	Upf1	7234	0.097	0.3507	No
107	Orc6	7339	0.093	0.3472	No
108	Prim2	7572	0.082	0.3364	No
109	Cdc25a	7576	0.081	0.3382	No
110	Cdkn1b	7605	0.080	0.3386	No
111	Snrpd1	7785	0.072	0.3305	No
112	Knl1	7823	0.070	0.3302	No
113	Dkc1	7833	0.070	0.3314	No
114	Smc4	7853	0.069	0.3320	No
115	Smarcc1	7869	0.068	0.3328	No
116	Troap	7892	0.067	0.3332	No
117	Cks2	7939	0.064	0.3323	No
118	Orc5	8070	0.057	0.3265	No
119	Lbr	8077	0.057	0.3275	No
120	Nusap1	8215	0.051	0.3212	No
121	Hif1a	8316	0.046	0.3169	No
122	Mcm3	8395	0.043	0.3136	No
123	Smad3	8452	0.039	0.3115	No
124	Cdc27	8501	0.037	0.3097	No
125	Mcm5	8586	0.033	0.3059	No
126	Tle3	8642	0.031	0.3036	No
127	H2bc12	8812	0.023	0.2949	No
128	E2f3	8906	0.019	0.2903	No
129	Mnat1	8937	0.018	0.2891	No
130	Smc1a	9011	0.015	0.2854	No
131	Racgap1	9161	0.009	0.2775	No
132	Plk1	9749	-0.001	0.2453	No
133	Notch2	9830	-0.005	0.2410	No
134	Prc1	9901	-0.008	0.2374	No
135	Atrx	9997	-0.011	0.2324	No
136	Dmd	10054	-0.014	0.2297	No
137	G3bp1	10059	-0.014	0.2298	No
138	Pml	10127	-0.017	0.2265	No
139	E2f1	10140	-0.017	0.2263	No
140	Ss18	10154	-0.018	0.2260	No
141	Tgfb1	10339	-0.026	0.2165	No
142	Prmt5	10395	-0.028	0.2142	No
143	Mcm6	10403	-0.029	0.2145	No
144	Foxn3	10430	-0.030	0.2138	No
145	Mcm2	10521	-0.034	0.2097	No
146	Cul1	10806	-0.045	0.1952	No
147	Sqle	10989	-0.053	0.1865	No
148	Meis1	11001	-0.054	0.1872	No
149	H2ax	11004	-0.054	0.1884	No
150	Cul5	11024	-0.055	0.1886	No
151	Cbx1	11043	-0.056	0.1890	No
152	Ccnt1	11073	-0.057	0.1888	No
153	Cdc6	11104	-0.058	0.1885	No
154	Slc38a1	11156	-0.060	0.1872	No
155	Mtf2	11397	-0.068	0.1757	No
156	Pds5b	11540	-0.074	0.1696	No
157	Sfpq	11582	-0.076	0.1692	No
158	Ctcf	11593	-0.077	0.1705	No
159	Jpt1	11639	-0.079	0.1700	No
160	Ewsr1	11645	-0.079	0.1716	No
161	Rps6ka5	11710	-0.082	0.1701	No
162	Bub1	11759	-0.084	0.1694	No
163	Syncrip	11830	-0.088	0.1677	No
164	Hmga1b	11992	-0.094	0.1611	No
165	Ccnf	12008	-0.095	0.1626	No
166	Srsf10	12130	-0.101	0.1584	No
167	Bub3	12479	-0.116	0.1421	No
168	Pbk	12568	-0.121	0.1402	No
169	Cenpa	12574	-0.121	0.1428	No
170	Wrn	12661	-0.125	0.1411	No
171	Stmn1	12663	-0.125	0.1440	No
172	Slc12a2	12896	-0.135	0.1346	No
173	Slc7a5	13021	-0.143	0.1312	No
174	Cdkn2c	13030	-0.143	0.1342	No
175	Cul3	13149	-0.149	0.1313	No
176	Ythdc1	13414	-0.163	0.1208	No
177	H2az2	13499	-0.167	0.1202	No
178	E2f2	14254	-0.207	0.0838	No
179	Nolc1	14404	-0.216	0.0808	No
180	Chmp1a	14646	-0.230	0.0731	No
181	Cks1b	14821	-0.241	0.0694	No
182	Pura	15238	-0.267	0.0529	No
183	Cdk4	15278	-0.269	0.0573	No
184	Marcks	15318	-0.272	0.0617	No
185	Myc	15669	-0.292	0.0495	No
186	Top1	15691	-0.294	0.0555	No
187	Pttg1	15768	-0.300	0.0585	No
188	Traip	16001	-0.311	0.0533	No
189	Arid4a	16708	-0.370	0.0235	No
190	Bcl3	17207	-0.423	0.0063	No
191	Cdk1	17376	-0.446	0.0078	No
192	Cdc20	17982	-0.572	-0.0116	No
193	Dr1	18024	-0.582	0.0002	No
194	Atf5	18358	-0.864	0.0027	No