Details for gene set HALLMARK_P53

Table: GSEA Results Summary

Dataset	CLP.Basophil_Pheno.cls #Group3_versus_Group4.Basophil_Pheno.cls #Group3_versus_Group4_repos
Phenotype	Basophil_Pheno.cls#Group3_versus_Group4_repos
Upregulated in class	2
GeneSet	HALLMARK_P53_PATHWAY
Enrichment Score (ES)	0.24377328
Normalized Enrichment Score (NES)	1.1291082
Nominal p-value	0.24186991
FDR q-value	0.76220423
FWER p-Value	0.962

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Csrnp2	18	1.120	0.0251	Yes
2	Jag2	26	1.049	0.0491	Yes
3	Ninj1	171	0.764	0.0590	Yes
4	Sertad3	219	0.733	0.0735	Yes
5	Ephx1	338	0.666	0.0825	Yes
6	Cgrrf1	418	0.637	0.0930	Yes
7	Rhbdf2	479	0.609	0.1039	Yes
8	S100a4	534	0.589	0.1146	Yes
9	Triap1	632	0.563	0.1224	Yes
10	Ak1	720	0.546	0.1304	Yes
11	Pdgfa	881	0.513	0.1335	Yes
12	Dram1	1016	0.490	0.1376	Yes
13	Nol8	1102	0.478	0.1440	Yes
14	Plk3	1471	0.427	0.1338	Yes
15	Alox8	1545	0.419	0.1395	Yes
16	Tob1	1562	0.417	0.1483	Yes
17	Tprkb	1638	0.407	0.1537	Yes
18	Cd81	1717	0.398	0.1587	Yes
19	Vdr	1806	0.391	0.1629	Yes
20	Slc19a2	1884	0.382	0.1676	Yes
21	Ppm1d	1931	0.377	0.1739	Yes
22	Gls2	2067	0.368	0.1750	Yes
23	F2r	2076	0.368	0.1831	Yes
24	Tcn2	2093	0.365	0.1908	Yes
25	Fuca1	2218	0.352	0.1921	Yes
26	App	2240	0.350	0.1991	Yes
27	Tpd52l1	2459	0.335	0.1950	Yes
28	Cdk5r1	2540	0.328	0.1982	Yes
29	Gadd45a	2605	0.322	0.2022	Yes
30	Plxnb2	2623	0.321	0.2087	Yes
31	Klf4	2657	0.318	0.2143	Yes
32	Fas	2729	0.313	0.2177	Yes
33	Epha2	3079	0.293	0.2054	Yes
34	Ankra2	3101	0.291	0.2110	Yes
35	Tax1bp3	3219	0.284	0.2112	Yes
36	Vwa5a	3240	0.282	0.2166	Yes
37	Hexim1	3264	0.280	0.2219	Yes
38	Polh	3435	0.268	0.2188	Yes
39	H2aj	3527	0.263	0.2199	Yes
40	Fam162a	3541	0.262	0.2253	Yes
41	Ndrg1	3582	0.258	0.2291	Yes
42	Abhd4	3621	0.256	0.2330	Yes
43	H1f2	3667	0.253	0.2364	Yes
44	Nudt15	3675	0.253	0.2419	Yes
45	Xpc	3748	0.249	0.2438	Yes
46	Cd82	3947	0.239	0.2385	No
47	Fgf13	4255	0.220	0.2267	No
48	Mxd4	4330	0.215	0.2277	No
49	Sdc1	4425	0.211	0.2275	No
50	Retsat	4548	0.206	0.2256	No
51	Trafd1	4613	0.202	0.2268	No
52	Jun	4741	0.195	0.2243	No
53	Zfp365	4794	0.192	0.2259	No
54	Klk8	4887	0.187	0.2253	No
55	Elp1	4954	0.184	0.2259	No
56	Tspyl2	5023	0.182	0.2264	No
57	Wrap73	5134	0.176	0.2245	No
58	Gm2a	5141	0.176	0.2283	No
59	Irak1	5187	0.174	0.2298	No
60	Ip6k2	5232	0.171	0.2314	No
61	Tm7sf3	5265	0.170	0.2336	No
62	Rrad	5311	0.167	0.2350	No
63	Ddit4	5497	0.158	0.2286	No
64	Ier5	5527	0.157	0.2306	No
65	Ralgds	5590	0.153	0.2308	No
66	Trp63	5674	0.150	0.2297	No
67	Apaf1	5695	0.149	0.2321	No
68	Stom	5906	0.141	0.2239	No
69	Tnfsf9	5948	0.139	0.2248	No
70	Ada	6084	0.133	0.2205	No
71	Sphk1	6328	0.122	0.2100	No
72	Baiap2	6577	0.112	0.1990	No
73	Abcc5	6793	0.102	0.1896	No
74	Phlda3	6795	0.102	0.1919	No
75	Zbtb16	6838	0.100	0.1919	No
76	Acvr1b	7138	0.088	0.1776	No
77	Notch1	7327	0.084	0.1692	No
78	Dcxr	7339	0.083	0.1705	No
79	Atf3	7380	0.081	0.1702	No
80	Slc3a2	7551	0.074	0.1626	No
81	Ptpn14	7621	0.072	0.1605	No
82	Ccng1	7700	0.069	0.1578	No
83	Blcap	7751	0.066	0.1566	No
84	Traf4	7765	0.066	0.1574	No
85	Fos	7832	0.064	0.1553	No
86	Def6	8108	0.054	0.1415	No
87	Vamp8	8188	0.050	0.1383	No
88	Rad9a	8235	0.048	0.1369	No
89	Slc35d1	8302	0.046	0.1343	No
90	Casp1	8365	0.042	0.1319	No
91	Ptpre	8367	0.042	0.1329	No
92	Steap3	8464	0.038	0.1285	No
93	Tgfb1	8671	0.029	0.1178	No
94	Hspa4l	8816	0.024	0.1105	No
95	Pitpnc1	8859	0.022	0.1087	No
96	Rchy1	8991	0.017	0.1019	No
97	Rgs16	9089	0.013	0.0969	No
98	Ctsd	9303	0.006	0.0854	No
99	Rack1	9450	0.001	0.0774	No
100	Pmm1	9565	-0.001	0.0711	No
101	Iscu	9567	-0.001	0.0711	No
102	Mknk2	9741	-0.008	0.0618	No
103	Rnf19b	9779	-0.009	0.0600	No
104	Sp1	9942	-0.015	0.0514	No
105	Rad51c	10074	-0.019	0.0447	No
106	Foxo3	10098	-0.020	0.0439	No
107	Hint1	10107	-0.021	0.0439	No
108	Dnttip2	10303	-0.027	0.0339	No
109	Wwp1	10308	-0.028	0.0343	No
110	Fdxr	10386	-0.031	0.0308	No
111	Abat	10413	-0.032	0.0301	No
112	Ldhb	10606	-0.039	0.0205	No
113	Sfn	10659	-0.041	0.0186	No
114	Ifi30	10660	-0.041	0.0196	No
115	Ppp1r15a	10749	-0.044	0.0158	No
116	Tap1	10831	-0.047	0.0124	No
117	Pom121	10958	-0.052	0.0067	No
118	Prkab1	10988	-0.053	0.0064	No
119	Irag2	11178	-0.059	-0.0026	No
120	Cdh13	11193	-0.060	-0.0020	No
121	Mxd1	11406	-0.068	-0.0121	No
122	Ier3	11665	-0.077	-0.0244	No
123	Osgin1	11807	-0.083	-0.0302	No
124	Itgb4	11860	-0.085	-0.0311	No
125	Rps27l	11875	-0.085	-0.0299	No
126	Sesn1	11961	-0.089	-0.0325	No
127	Rb1	11982	-0.090	-0.0315	No
128	Kif13b	12041	-0.092	-0.0325	No
129	Cyfip2	12045	-0.092	-0.0305	No
130	Plk2	12114	-0.095	-0.0321	No
131	Ccnd2	12146	-0.096	-0.0315	No
132	Cdkn2a	12335	-0.104	-0.0394	No
133	Trp53	12516	-0.112	-0.0467	No
134	Pvt1	12527	-0.112	-0.0446	No
135	Hdac3	12969	-0.131	-0.0658	No
136	Tgfa	13091	-0.137	-0.0693	No
137	Zfp36l1	13156	-0.139	-0.0695	No
138	Rpl36	13214	-0.142	-0.0694	No
139	Ccp110	13216	-0.142	-0.0661	No
140	Btg1	13249	-0.143	-0.0645	No
141	Ei24	13264	-0.144	-0.0619	No
142	Tsc22d1	13446	-0.151	-0.0684	No
143	Prmt2	13451	-0.152	-0.0650	No
144	Dgka	13537	-0.156	-0.0661	No
145	Ccnk	13618	-0.160	-0.0667	No
146	Txnip	13636	-0.161	-0.0639	No
147	Bax	13674	-0.163	-0.0622	No
148	Rab40c	13723	-0.165	-0.0610	No
149	Pidd1	13874	-0.172	-0.0652	No
150	Ercc5	13925	-0.174	-0.0639	No
151	Trib3	14177	-0.187	-0.0733	No
152	Ddit3	14199	-0.189	-0.0701	No
153	Cdkn2aip	14311	-0.195	-0.0716	No
154	Fbxw7	14629	-0.209	-0.0842	No
155	Eps8l2	14785	-0.217	-0.0876	No
156	Ctsf	14939	-0.227	-0.0907	No
157	Rps12	15155	-0.237	-0.0970	No
158	Tnni1	15187	-0.239	-0.0931	No
159	Rap2b	15211	-0.241	-0.0888	No
160	Ccnd3	15217	-0.241	-0.0835	No
161	Btg2	15575	-0.265	-0.0969	No
162	Cebpa	15587	-0.266	-0.0913	No
163	Mdm2	15633	-0.269	-0.0875	No
164	Mapkapk3	15692	-0.272	-0.0844	No
165	Zmat3	16315	-0.314	-0.1112	No
166	S100a10	16325	-0.315	-0.1044	No
167	Cdkn1a	16347	-0.318	-0.0981	No
168	Rxra	16780	-0.353	-0.1136	No
169	Bak1	16827	-0.357	-0.1078	No
170	St14	16992	-0.373	-0.1081	No
171	Hmox1	17043	-0.380	-0.1021	No
172	Rpl18	17410	-0.424	-0.1123	No
173	Sat1	17564	-0.451	-0.1102	No
174	Pcna	17694	-0.473	-0.1062	No
175	Hras	17761	-0.484	-0.0986	No
176	Sec61a1	17784	-0.489	-0.0884	No
177	Coq8a	17806	-0.494	-0.0781	No
178	Slc7a11	17882	-0.513	-0.0702	No
179	Ddb2	17929	-0.520	-0.0607	No
180	Procr	18012	-0.541	-0.0526	No
181	Hbegf	18043	-0.551	-0.0414	No
182	Rrp8	18173	-0.607	-0.0343	No
183	H2ac25	18184	-0.613	-0.0206	No
184	Aen	18199	-0.625	-0.0069	No
185	Socs1	18332	-0.785	0.0042	No