Details for gene set HALLMARK_INFLAMMATORY

Table: GSEA Results Summary

Dataset	CLP.Basophil_Pheno.cls #Group3_versus_Group4.Basophil_Pheno.cls #Group3_versus_Group4_repos
Phenotype	Basophil_Pheno.cls#Group3_versus_Group4_repos
Upregulated in class	2
GeneSet	HALLMARK_INFLAMMATORY_RESPONSE
Enrichment Score (ES)	0.24792938
Normalized Enrichment Score (NES)	1.0266191
Nominal p-value	0.43380857
FDR q-value	0.76588285
FWER p-Value	0.984

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Slc11a2	81	0.868	0.0206	Yes
2	Il2rb	87	0.862	0.0452	Yes
3	Rasgrp1	112	0.828	0.0678	Yes
4	P2rx7	131	0.806	0.0901	Yes
5	Il18r1	379	0.651	0.0954	Yes
6	Ifngr2	756	0.539	0.0903	Yes
7	Olr1	953	0.498	0.0939	Yes
8	Gch1	1105	0.477	0.0995	Yes
9	Lck	1207	0.460	0.1072	Yes
10	Kif1b	1215	0.458	0.1200	Yes
11	Ldlr	1248	0.454	0.1314	Yes
12	Ptafr	1290	0.449	0.1421	Yes
13	Acvr2a	1416	0.436	0.1478	Yes
14	Il15	1569	0.416	0.1515	Yes
15	Tapbp	1809	0.390	0.1497	Yes
16	Gnai3	1919	0.379	0.1546	Yes
17	Atp2c1	2119	0.362	0.1542	Yes
18	Tlr1	2172	0.357	0.1617	Yes
19	Il10	2255	0.348	0.1672	Yes
20	Sele	2337	0.341	0.1726	Yes
21	Cxcl10	2359	0.339	0.1813	Yes
22	Gna15	2480	0.333	0.1843	Yes
23	Cybb	2497	0.331	0.1930	Yes
24	Icosl	2570	0.326	0.1984	Yes
25	Plaur	2583	0.325	0.2071	Yes
26	Itga5	2592	0.324	0.2160	Yes
27	Cd69	2692	0.316	0.2197	Yes
28	Csf1	2832	0.307	0.2210	Yes
29	Gpr183	2900	0.302	0.2260	Yes
30	Nfkbia	2939	0.298	0.2325	Yes
31	Ptger2	3046	0.294	0.2352	Yes
32	Gpr132	3091	0.292	0.2413	Yes
33	Il10ra	3551	0.261	0.2237	Yes
34	Ffar2	3709	0.250	0.2223	Yes
35	Slc1a2	3815	0.245	0.2236	Yes
36	Ros1	3816	0.245	0.2307	Yes
37	Slc7a2	3821	0.245	0.2376	Yes
38	Cd82	3947	0.239	0.2376	Yes
39	Icam1	4078	0.231	0.2372	Yes
40	P2rx4	4105	0.229	0.2423	Yes
41	Clec5a	4124	0.228	0.2479	Yes
42	Cd48	4732	0.195	0.2203	No
43	Hif1a	4792	0.193	0.2227	No
44	Raf1	4868	0.188	0.2240	No
45	Atp2a2	4943	0.185	0.2253	No
46	Klf6	5160	0.175	0.2185	No
47	Atp2b1	5237	0.171	0.2193	No
48	Slamf1	5274	0.169	0.2222	No
49	Adgre1	5308	0.167	0.2252	No
50	Sgms2	5729	0.148	0.2065	No
51	Sema4d	5895	0.141	0.2015	No
52	Tnfsf9	5948	0.139	0.2027	No
53	Csf3r	6285	0.124	0.1879	No
54	Pvr	6321	0.123	0.1895	No
55	Sphk1	6328	0.122	0.1927	No
56	Mefv	6538	0.113	0.1845	No
57	Chst2	6567	0.112	0.1862	No
58	Pik3r5	6777	0.102	0.1777	No
59	Tlr2	6785	0.102	0.1803	No
60	Nfkb1	6878	0.098	0.1781	No
61	Aqp9	7022	0.092	0.1729	No
62	Slc28a2	7106	0.089	0.1709	No
63	Acvr1b	7138	0.088	0.1718	No
64	Irf1	7217	0.087	0.1700	No
65	Gabbr1	7229	0.087	0.1719	No
66	Mmp14	7604	0.073	0.1535	No
67	Ccrl2	7672	0.070	0.1519	No
68	Sri	7685	0.069	0.1532	No
69	Kcnj2	7807	0.064	0.1484	No
70	Il7r	7982	0.059	0.1406	No
71	Tnfsf10	7991	0.059	0.1419	No
72	Dcbld2	8272	0.047	0.1279	No
73	Ptpre	8367	0.042	0.1239	No
74	Ccr7	8477	0.037	0.1191	No
75	Abi1	8509	0.036	0.1184	No
76	Cxcr6	8524	0.035	0.1186	No
77	Ahr	8670	0.029	0.1115	No
78	Osm	8896	0.021	0.0998	No
79	Stab1	8927	0.020	0.0988	No
80	Rgs16	9089	0.013	0.0903	No
81	Ifitm1	9317	0.005	0.0781	No
82	Il15ra	9431	0.002	0.0719	No
83	Rela	9480	0.000	0.0693	No
84	Adrm1	9649	-0.004	0.0602	No
85	Slc7a1	9691	-0.006	0.0581	No
86	Met	9777	-0.009	0.0537	No
87	Pde4b	9829	-0.011	0.0513	No
88	Eif2ak2	9919	-0.014	0.0468	No
89	Selenos	10051	-0.018	0.0402	No
90	Calcrl	10071	-0.019	0.0397	No
91	Ebi3	10337	-0.029	0.0260	No
92	Pcdh7	10455	-0.034	0.0206	No
93	Adora2b	10733	-0.043	0.0066	No
94	Hrh1	10748	-0.044	0.0072	No
95	Il18rap	10920	-0.051	-0.0008	No
96	Cmklr1	10942	-0.051	-0.0004	No
97	Kcnmb2	10967	-0.052	-0.0002	No
98	Ly6e	10973	-0.052	0.0010	No
99	Psen1	10987	-0.053	0.0018	No
100	Nod2	11167	-0.058	-0.0063	No
101	Mxd1	11406	-0.068	-0.0174	No
102	Gp1ba	11464	-0.070	-0.0185	No
103	Slc31a1	11470	-0.070	-0.0168	No
104	Best1	11604	-0.075	-0.0219	No
105	Il1r1	11696	-0.079	-0.0246	No
106	Ccl5	11848	-0.084	-0.0304	No
107	Emp3	12371	-0.106	-0.0559	No
108	Gpc3	12437	-0.108	-0.0564	No
109	Lpar1	12482	-0.110	-0.0556	No
110	Fzd5	12534	-0.112	-0.0552	No
111	Rnf144b	12871	-0.126	-0.0699	No
112	Tnfrsf1b	12996	-0.132	-0.0729	No
113	Hpn	13059	-0.135	-0.0724	No
114	Sell	13337	-0.147	-0.0833	No
115	Lcp2	13342	-0.147	-0.0793	No
116	Il4ra	13358	-0.148	-0.0759	No
117	Slc4a4	13529	-0.156	-0.0807	No
118	Ptger4	13621	-0.160	-0.0811	No
119	Ifnar1	14049	-0.181	-0.0992	No
120	Scarf1	14291	-0.193	-0.1068	No
121	Myc	14626	-0.209	-0.1191	No
122	Npffr2	15086	-0.235	-0.1375	No
123	Kcna3	15420	-0.254	-0.1484	No
124	Btg2	15575	-0.265	-0.1492	No
125	Rtp4	15610	-0.267	-0.1433	No
126	Il18	15848	-0.283	-0.1481	No
127	Ripk2	15979	-0.292	-0.1468	No
128	Tnfrsf9	16158	-0.305	-0.1478	No
129	Rhog	16224	-0.310	-0.1424	No
130	Icam4	16226	-0.310	-0.1335	No
131	Tlr3	16295	-0.313	-0.1282	No
132	Cdkn1a	16347	-0.318	-0.1218	No
133	Nlrp3	16777	-0.352	-0.1352	No
134	Lyn	16778	-0.352	-0.1250	No
135	Irak2	16797	-0.355	-0.1157	No
136	Scn1b	16845	-0.358	-0.1080	No
137	Nampt	16965	-0.369	-0.1038	No
138	Irf7	16979	-0.372	-0.0938	No
139	Bst2	17051	-0.380	-0.0867	No
140	Slc31a2	17135	-0.392	-0.0800	No
141	Rgs1	17343	-0.417	-0.0793	No
142	Ptgir	17440	-0.430	-0.0721	No
143	Axl	17483	-0.437	-0.0618	No
144	Itgb3	17986	-0.534	-0.0739	No
145	Nmi	18013	-0.541	-0.0597	No
146	Hbegf	18043	-0.551	-0.0454	No
147	P2ry2	18224	-0.637	-0.0369	No
148	Tacr3	18325	-0.772	-0.0201	No
149	Abca1	18362	-0.851	0.0025	No