Details for gene set HALLMARK_APICAL

Table: GSEA Results Summary

Dataset	CLP.Basophil_Pheno.cls #Group3_versus_Group4.Basophil_Pheno.cls #Group3_versus_Group4_repos
Phenotype	Basophil_Pheno.cls#Group3_versus_Group4_repos
Upregulated in class	2
GeneSet	HALLMARK_APICAL_JUNCTION
Enrichment Score (ES)	0.22559474
Normalized Enrichment Score (NES)	0.93382275
Nominal p-value	0.55284554
FDR q-value	0.8229802
FWER p-Value	0.996

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Lima1	65	0.909	0.0226	Yes
2	Hadh	158	0.779	0.0399	Yes
3	Layn	196	0.747	0.0594	Yes
4	Kcnh2	346	0.664	0.0703	Yes
5	Mvd	420	0.635	0.0845	Yes
6	Mdk	693	0.552	0.0855	Yes
7	Thy1	762	0.536	0.0972	Yes
8	Sirpa	843	0.520	0.1077	Yes
9	Cd276	918	0.505	0.1182	Yes
10	Shroom2	1291	0.449	0.1107	Yes
11	Adam15	1299	0.447	0.1232	Yes
12	Col17a1	1338	0.444	0.1339	Yes
13	Cadm3	1380	0.441	0.1443	Yes
14	Alox8	1545	0.419	0.1474	Yes
15	Mapk11	1714	0.398	0.1496	Yes
16	Itga9	1826	0.388	0.1547	Yes
17	Ctnnd1	1904	0.380	0.1614	Yes
18	Ptk2	1916	0.379	0.1717	Yes
19	Irs1	1941	0.376	0.1812	Yes
20	Wasl	2035	0.370	0.1867	Yes
21	Vcan	2037	0.370	0.1973	Yes
22	Tspan4	2230	0.351	0.1969	Yes
23	B4galt1	2332	0.342	0.2012	Yes
24	Tgfbi	2421	0.336	0.2060	Yes
25	Cdh4	2470	0.334	0.2130	Yes
26	Tro	2837	0.307	0.2017	Yes
27	Pals1	2847	0.306	0.2100	Yes
28	Pik3r3	2869	0.305	0.2176	Yes
29	Plcg1	3057	0.294	0.2158	Yes
30	Cap1	3440	0.268	0.2026	Yes
31	Map3k20	3558	0.261	0.2037	Yes
32	Icam5	3625	0.255	0.2074	Yes
33	Map4k2	3775	0.248	0.2064	Yes
34	Gnai1	3909	0.241	0.2060	Yes
35	Vcl	4051	0.232	0.2050	Yes
36	Icam1	4078	0.231	0.2102	Yes
37	Gtf2f1	4113	0.228	0.2149	Yes
38	Stx4a	4129	0.228	0.2206	Yes
39	Cdh11	4158	0.226	0.2256	Yes
40	Jam3	4292	0.217	0.2245	No
41	Thbs3	4604	0.203	0.2133	No
42	Myh9	4633	0.201	0.2176	No
43	Sgce	4715	0.197	0.2188	No
44	Zyx	4782	0.193	0.2207	No
45	Nrtn	4813	0.191	0.2246	No
46	Tmem8b	5386	0.164	0.1980	No
47	Rhof	5458	0.160	0.1987	No
48	Cdk8	5495	0.158	0.2013	No
49	Tsc1	5575	0.154	0.2014	No
50	Itga2	5600	0.153	0.2045	No
51	Vasp	5644	0.151	0.2065	No
52	Skap2	5899	0.141	0.1966	No
53	Actb	6015	0.136	0.1942	No
54	Rsu1	6058	0.134	0.1958	No
55	Lamb3	6158	0.130	0.1941	No
56	Ptprc	6206	0.128	0.1952	No
57	Cd86	6400	0.120	0.1880	No
58	Itgb1	6416	0.119	0.1907	No
59	Msn	6447	0.117	0.1924	No
60	Nectin2	6471	0.116	0.1945	No
61	Baiap2	6577	0.112	0.1919	No
62	Pard6g	6727	0.105	0.1868	No
63	Pten	6847	0.099	0.1831	No
64	Akt2	6855	0.099	0.1856	No
65	Evl	7112	0.088	0.1741	No
66	Actn4	7223	0.087	0.1706	No
67	Atp1a3	7443	0.079	0.1608	No
68	Shc1	7548	0.074	0.1573	No
69	Nectin1	7564	0.074	0.1586	No
70	Traf1	7595	0.073	0.1590	No
71	Cd34	7675	0.069	0.1567	No
72	Insig1	7764	0.066	0.1538	No
73	Ikbkg	7823	0.064	0.1524	No
74	Cadm2	7895	0.061	0.1503	No
75	Nectin4	7976	0.059	0.1476	No
76	Ldlrap1	8023	0.057	0.1468	No
77	Syk	8123	0.053	0.1429	No
78	Akt3	8184	0.050	0.1410	No
79	Mmp2	8192	0.050	0.1421	No
80	Taok2	8203	0.050	0.1430	No
81	Inppl1	8283	0.047	0.1400	No
82	Mapk14	8431	0.039	0.1331	No
83	Actg1	8543	0.034	0.1280	No
84	Crat	8555	0.034	0.1283	No
85	Tial1	9075	0.014	0.1003	No
86	Epb41l2	9094	0.013	0.0997	No
87	Sorbs3	9137	0.012	0.0977	No
88	Pkd1	9453	0.001	0.0805	No
89	Icam2	9571	-0.001	0.0741	No
90	Negr1	9700	-0.006	0.0673	No
91	Tjp1	10066	-0.019	0.0479	No
92	Ctnna1	10399	-0.032	0.0306	No
93	Cd274	10460	-0.034	0.0283	No
94	Amh	10568	-0.038	0.0235	No
95	Vav2	10776	-0.045	0.0135	No
96	Nlgn2	10874	-0.049	0.0096	No
97	Myl12b	10906	-0.050	0.0093	No
98	Nf1	10976	-0.053	0.0070	No
99	Rasa1	11019	-0.053	0.0063	No
100	Nexn	11090	-0.055	0.0040	No
101	Actn1	11312	-0.064	-0.0062	No
102	Rras	11556	-0.074	-0.0174	No
103	Arhgef6	11651	-0.077	-0.0204	No
104	Fbn1	11670	-0.077	-0.0191	No
105	Itgb4	11860	-0.085	-0.0271	No
106	Myh10	11888	-0.086	-0.0261	No
107	Rac2	11900	-0.086	-0.0242	No
108	Itga3	12031	-0.092	-0.0287	No
109	Gamt	12433	-0.108	-0.0475	No
110	Cnn2	12616	-0.116	-0.0542	No
111	Mapk13	12636	-0.117	-0.0518	No
112	Pecam1	12954	-0.130	-0.0655	No
113	Pfn1	12987	-0.131	-0.0634	No
114	Gnai2	13122	-0.138	-0.0668	No
115	Nrap	13551	-0.157	-0.0858	No
116	Adam23	13616	-0.160	-0.0847	No
117	Dhx16	13635	-0.161	-0.0810	No
118	Pbx2	13704	-0.164	-0.0800	No
119	Tubg1	13879	-0.172	-0.0846	No
120	Nf2	13956	-0.176	-0.0837	No
121	Jup	14038	-0.180	-0.0830	No
122	Lama3	14376	-0.198	-0.0958	No
123	Vcam1	14397	-0.199	-0.0911	No
124	Dlg1	14479	-0.203	-0.0897	No
125	Nrxn2	14512	-0.205	-0.0856	No
126	Slit2	14639	-0.209	-0.0865	No
127	Sdc3	14745	-0.215	-0.0861	No
128	Exoc4	14756	-0.216	-0.0804	No
129	Pik3cb	14767	-0.216	-0.0747	No
130	Cercam	14802	-0.218	-0.0703	No
131	Adam9	14829	-0.220	-0.0654	No
132	Src	14831	-0.220	-0.0591	No
133	Vwf	14860	-0.222	-0.0543	No
134	Itga10	14973	-0.229	-0.0539	No
135	Egfr	15079	-0.235	-0.0529	No
136	Speg	15208	-0.240	-0.0530	No
137	Actn2	15219	-0.241	-0.0466	No
138	Arpc2	15322	-0.248	-0.0451	No
139	Sympk	15375	-0.252	-0.0407	No
140	Nlgn3	15390	-0.252	-0.0342	No
141	Amigo2	15735	-0.275	-0.0451	No
142	Adra1b	15994	-0.293	-0.0509	No
143	Icam4	16226	-0.310	-0.0546	No
144	Bmp1	16604	-0.340	-0.0655	No
145	Ywhah	16711	-0.347	-0.0613	No
146	Mpzl1	16898	-0.363	-0.0611	No
147	Amigo1	17113	-0.389	-0.0616	No
148	Nfasc	17170	-0.395	-0.0534	No
149	Fscn1	17265	-0.408	-0.0468	No
150	Cdh1	17500	-0.440	-0.0469	No
151	Hras	17761	-0.484	-0.0473	No
152	Col16a1	17951	-0.527	-0.0425	No
153	Nectin3	18059	-0.557	-0.0323	No
154	Wnk4	18297	-0.707	-0.0250	No
155	Cldn15	18400	-1.079	0.0004	No