Details for gene set HALLMARK_EPITHELIAL_MESENCHYMAL

Table: GSEA Results Summary

Dataset	CLP.Basophil_Pheno.cls #Group2_versus_Group4.Basophil_Pheno.cls #Group2_versus_Group4_repos
Phenotype	Basophil_Pheno.cls#Group2_versus_Group4_repos
Upregulated in class	1
GeneSet	HALLMARK_EPITHELIAL_MESENCHYMAL_TRANSITION
Enrichment Score (ES)	0.31437266
Normalized Enrichment Score (NES)	1.3085283
Nominal p-value	0.04684318
FDR q-value	0.7842676
FWER p-Value	0.789

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Fas	4	1.273	0.0441	Yes
2	Matn2	60	0.883	0.0717	Yes
3	Sdc4	174	0.727	0.0909	Yes
4	Thbs2	295	0.660	0.1072	Yes
5	Calu	486	0.584	0.1171	Yes
6	Tgfbi	570	0.565	0.1322	Yes
7	Abi3bp	685	0.541	0.1448	Yes
8	Fap	909	0.499	0.1500	Yes
9	Lamc1	953	0.492	0.1648	Yes
10	Tgm2	1024	0.483	0.1777	Yes
11	Qsox1	1078	0.475	0.1914	Yes
12	Edil3	1114	0.469	0.2058	Yes
13	Tagln	1177	0.460	0.2184	Yes
14	Comp	1223	0.456	0.2317	Yes
15	Nid2	1280	0.448	0.2442	Yes
16	Vim	1417	0.432	0.2518	Yes
17	Lrp1	1471	0.427	0.2638	Yes
18	Jun	1518	0.422	0.2759	Yes
19	Cdh2	2011	0.372	0.2619	Yes
20	Magee1	2032	0.370	0.2737	Yes
21	Sfrp4	2571	0.324	0.2555	Yes
22	Itgb1	2759	0.313	0.2562	Yes
23	Mest	2996	0.294	0.2535	Yes
24	Serpinh1	3152	0.283	0.2548	Yes
25	Gja1	3162	0.282	0.2642	Yes
26	Spock1	3235	0.279	0.2699	Yes
27	Cadm1	3374	0.271	0.2718	Yes
28	Itgav	3470	0.264	0.2758	Yes
29	Fuca1	3562	0.259	0.2798	Yes
30	Sgcd	3625	0.254	0.2852	Yes
31	Fgf2	3652	0.252	0.2925	Yes
32	Tnfrsf12a	3751	0.244	0.2957	Yes
33	Cdh11	3922	0.232	0.2944	Yes
34	Adam12	3988	0.228	0.2988	Yes
35	Itga2	4065	0.224	0.3024	Yes
36	Fn1	4252	0.215	0.2997	Yes
37	Dab2	4253	0.215	0.3072	Yes
38	Fbn1	4273	0.214	0.3136	Yes
39	Col4a1	4391	0.207	0.3144	Yes
40	Cald1	4552	0.198	0.3125	No
41	Col4a2	4682	0.193	0.3122	No
42	Mylk	5062	0.170	0.2973	No
43	Sdc1	5143	0.166	0.2987	No
44	Tnfaip3	5318	0.157	0.2947	No
45	Vcam1	5638	0.143	0.2822	No
46	Col5a1	5814	0.133	0.2772	No
47	P3h1	5902	0.129	0.2769	No
48	Notch2	6014	0.123	0.2751	No
49	Thy1	6118	0.117	0.2736	No
50	Col16a1	6122	0.117	0.2775	No
51	Vcan	6161	0.115	0.2794	No
52	Mcm7	6345	0.106	0.2731	No
53	Pdgfrb	6354	0.106	0.2763	No
54	Il15	6383	0.104	0.2784	No
55	Slc6a8	6572	0.095	0.2714	No
56	Col11a1	6577	0.095	0.2745	No
57	Fbln1	6683	0.093	0.2720	No
58	Pfn2	6755	0.090	0.2712	No
59	Flna	6867	0.085	0.2681	No
60	Pcolce	7129	0.073	0.2564	No
61	Gadd45b	7135	0.073	0.2586	No
62	Col1a2	7720	0.045	0.2282	No
63	Capg	7866	0.038	0.2216	No
64	Tpm4	7934	0.036	0.2192	No
65	Col12a1	8010	0.032	0.2162	No
66	Rhob	8028	0.032	0.2164	No
67	Copa	8135	0.027	0.2116	No
68	Plaur	8145	0.027	0.2120	No
69	Spp1	8575	0.008	0.1888	No
70	Ecm2	8922	-0.003	0.1700	No
71	Cd44	9023	-0.009	0.1648	No
72	Vegfc	9333	-0.021	0.1487	No
73	Plod1	9384	-0.023	0.1467	No
74	Dst	9548	-0.030	0.1389	No
75	Gpx7	9781	-0.040	0.1276	No
76	Lgals1	9784	-0.040	0.1289	No
77	Ppib	9866	-0.044	0.1260	No
78	Col7a1	10216	-0.060	0.1090	No
79	Tgfbr3	10266	-0.062	0.1084	No
80	Lama2	10327	-0.065	0.1074	No
81	Sntb1	10837	-0.088	0.0826	No
82	Thbs1	10882	-0.089	0.0833	No
83	Bmp1	10949	-0.092	0.0829	No
84	Mmp14	10979	-0.094	0.0846	No
85	Basp1	11066	-0.098	0.0833	No
86	Cap2	11074	-0.098	0.0863	No
87	Dpysl3	11196	-0.102	0.0833	No
88	Igfbp4	11292	-0.106	0.0818	No
89	Tpm1	11376	-0.110	0.0810	No
90	Sgcb	11383	-0.110	0.0845	No
91	Sparc	11458	-0.113	0.0844	No
92	Postn	11604	-0.119	0.0806	No
93	Id2	11704	-0.124	0.0795	No
94	Fstl1	11972	-0.136	0.0696	No
95	Colgalt1	12149	-0.144	0.0650	No
96	Wipf1	12349	-0.152	0.0594	No
97	Itgb5	12397	-0.155	0.0623	No
98	Mmp2	12474	-0.159	0.0637	No
99	Timp3	12493	-0.161	0.0683	No
100	Gem	12697	-0.170	0.0631	No
101	Plod3	12981	-0.185	0.0540	No
102	Eno2	13070	-0.189	0.0558	No
103	Serpine2	13219	-0.196	0.0545	No
104	Itga5	13349	-0.203	0.0545	No
105	Col1a1	13395	-0.205	0.0591	No
106	Pmepa1	13460	-0.207	0.0628	No
107	Pvr	13518	-0.210	0.0670	No
108	Plod2	13546	-0.211	0.0728	No
109	Vegfa	13826	-0.222	0.0653	No
110	Slit2	13883	-0.226	0.0701	No
111	Fstl3	13981	-0.231	0.0728	No
112	Gpc1	14055	-0.234	0.0770	No
113	Tgfb1	14083	-0.236	0.0837	No
114	Ecm1	14190	-0.241	0.0863	No
115	Itgb3	14353	-0.251	0.0861	No
116	Nt5e	14766	-0.273	0.0731	No
117	Lama3	15070	-0.290	0.0666	No
118	Tpm2	15072	-0.291	0.0766	No
119	Sat1	15133	-0.294	0.0836	No
120	Anpep	15194	-0.298	0.0906	No
121	Slit3	15972	-0.348	0.0602	No
122	Gadd45a	16096	-0.357	0.0659	No
123	Emp3	16420	-0.384	0.0616	No
124	Fzd8	16587	-0.399	0.0664	No
125	Glipr1	16916	-0.433	0.0635	No
126	Ntm	17581	-0.519	0.0452	No