Details for gene set HALLMARK

Table: GSEA Results Summary

Dataset	CLP.Basophil_Pheno.cls #Group2_versus_Group4.Basophil_Pheno.cls #Group2_versus_Group4_repos
Phenotype	Basophil_Pheno.cls#Group2_versus_Group4_repos
Upregulated in class	1
GeneSet	HALLMARK_APOPTOSIS
Enrichment Score (ES)	0.24242704
Normalized Enrichment Score (NES)	1.1020125
Nominal p-value	0.30020285
FDR q-value	0.96055174
FWER p-Value	0.988

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Fas	4	1.273	0.0380	Yes
2	Casp9	198	0.709	0.0488	Yes
3	Sptan1	222	0.693	0.0683	Yes
4	Cd38	228	0.688	0.0887	Yes
5	Pmaip1	390	0.623	0.0986	Yes
6	Clu	408	0.612	0.1160	Yes
7	Cdkn1b	528	0.575	0.1268	Yes
8	Casp2	590	0.561	0.1403	Yes
9	Erbb3	694	0.539	0.1509	Yes
10	F2r	722	0.533	0.1654	Yes
11	Ptk2	816	0.517	0.1758	Yes
12	Irf1	992	0.487	0.1809	Yes
13	Gsr	1063	0.478	0.1914	Yes
14	Bcap31	1238	0.453	0.1955	Yes
15	Jun	1518	0.422	0.1929	Yes
16	Add1	1859	0.385	0.1858	Yes
17	Igf2r	1970	0.376	0.1911	Yes
18	Nefh	2052	0.368	0.1977	Yes
19	Mcl1	2260	0.351	0.1969	Yes
20	Ppp3r1	2612	0.323	0.1874	Yes
21	Anxa1	2794	0.310	0.1868	Yes
22	Dpyd	2844	0.305	0.1933	Yes
23	Ifngr1	3131	0.285	0.1862	Yes
24	Top2a	3252	0.278	0.1880	Yes
25	Pea15a	3368	0.271	0.1898	Yes
26	Rela	3698	0.249	0.1793	Yes
27	App	3705	0.248	0.1864	Yes
28	Atf3	3724	0.246	0.1928	Yes
29	Hgf	3745	0.245	0.1991	Yes
30	Tnfrsf12a	3751	0.244	0.2061	Yes
31	Casp6	3760	0.243	0.2130	Yes
32	Tnfsf10	3761	0.243	0.2203	Yes
33	Casp4	3822	0.239	0.2242	Yes
34	Etf1	3875	0.235	0.2284	Yes
35	Cflar	3877	0.235	0.2354	Yes
36	Brca1	3878	0.235	0.2424	Yes
37	Gna15	4048	0.225	0.2399	No
38	Casp1	4153	0.220	0.2408	No
39	Lmna	4276	0.214	0.2406	No
40	Btg3	4762	0.188	0.2197	No
41	Tgfb2	4771	0.187	0.2249	No
42	Emp1	4840	0.183	0.2266	No
43	Hmgb2	4945	0.176	0.2262	No
44	Psen2	5232	0.162	0.2155	No
45	Birc3	5646	0.142	0.1971	No
46	Casp3	5790	0.134	0.1933	No
47	Fdxr	5826	0.132	0.1954	No
48	Gsn	5940	0.127	0.1930	No
49	Vdac2	5997	0.124	0.1937	No
50	Retsat	6011	0.123	0.1966	No
51	Ctnnb1	6072	0.119	0.1969	No
52	Wee1	6103	0.118	0.1988	No
53	Dnaja1	6142	0.116	0.2002	No
54	Dffa	6239	0.111	0.1983	No
55	Pdgfrb	6354	0.106	0.1953	No
56	Gadd45b	7135	0.073	0.1548	No
57	Ccnd1	7175	0.071	0.1548	No
58	Ank	7241	0.068	0.1533	No
59	Slc20a1	7437	0.058	0.1443	No
60	Sod2	7509	0.055	0.1421	No
61	Cd69	7890	0.038	0.1224	No
62	Rhob	8028	0.032	0.1159	No
63	Cyld	8280	0.021	0.1028	No
64	Cdk2	8389	0.016	0.0973	No
65	Madd	8399	0.016	0.0973	No
66	Fasl	8554	0.009	0.0892	No
67	Casp8	8610	0.007	0.0864	No
68	Cdc25b	8683	0.004	0.0826	No
69	Ier3	8942	-0.004	0.0686	No
70	Dnajc3	8999	-0.007	0.0657	No
71	Cd44	9023	-0.009	0.0647	No
72	Ppp2r5b	9088	-0.011	0.0616	No
73	Rock1	9184	-0.014	0.0568	No
74	Xiap	9553	-0.030	0.0376	No
75	Rara	10245	-0.061	0.0016	No
76	Timp2	10248	-0.061	0.0033	No
77	Dap	10255	-0.062	0.0049	No
78	Tgfbr3	10266	-0.062	0.0062	No
79	Tspo	10275	-0.063	0.0076	No
80	Pdcd4	10358	-0.066	0.0051	No
81	Sqstm1	10772	-0.085	-0.0149	No
82	Psen1	10995	-0.094	-0.0242	No
83	Bcl2l1	11235	-0.104	-0.0342	No
84	Smad7	11381	-0.110	-0.0388	No
85	Bax	11533	-0.116	-0.0436	No
86	Nedd9	11757	-0.125	-0.0520	No
87	Cdkn1a	11830	-0.130	-0.0521	No
88	Lef1	12000	-0.137	-0.0572	No
89	Rnasel	12214	-0.147	-0.0645	No
90	Ppt1	12268	-0.149	-0.0629	No
91	Ccnd2	12447	-0.158	-0.0679	No
92	Mmp2	12474	-0.159	-0.0645	No
93	Bid	12480	-0.160	-0.0600	No
94	Timp3	12493	-0.161	-0.0558	No
95	Bcl2l11	12596	-0.165	-0.0565	No
96	Gch1	12986	-0.185	-0.0722	No
97	Eno2	13070	-0.189	-0.0711	No
98	Dap3	13202	-0.195	-0.0724	No
99	Aifm3	13306	-0.201	-0.0720	No
100	H1f0	13426	-0.205	-0.0723	No
101	Mgmt	13458	-0.207	-0.0678	No
102	Bcl2l2	13785	-0.219	-0.0791	No
103	Bcl10	13950	-0.229	-0.0812	No
104	Cav1	13976	-0.231	-0.0756	No
105	Hmox1	14017	-0.233	-0.0708	No
106	Bik	14029	-0.233	-0.0644	No
107	Crebbp	14079	-0.236	-0.0600	No
108	Satb1	14334	-0.249	-0.0664	No
109	Ifitm3	14352	-0.251	-0.0598	No
110	Sc5d	14437	-0.255	-0.0568	No
111	Rhot2	14614	-0.265	-0.0584	No
112	Tap1	14642	-0.267	-0.0519	No
113	Cth	14765	-0.272	-0.0504	No
114	Gpx1	14826	-0.276	-0.0454	No
115	Btg2	14930	-0.282	-0.0425	No
116	Sat1	15133	-0.294	-0.0448	No
117	Plcb2	15294	-0.303	-0.0444	No
118	Il18	15442	-0.312	-0.0431	No
119	Bnip3l	15484	-0.315	-0.0359	No
120	Krt18	15731	-0.331	-0.0394	No
121	Isg20	15740	-0.332	-0.0299	No
122	Lgals3	15946	-0.347	-0.0307	No
123	Dnm1l	16015	-0.352	-0.0239	No
124	Casp7	16016	-0.352	-0.0133	No
125	Gpx4	16076	-0.355	-0.0059	No
126	Gadd45a	16096	-0.357	0.0038	No
127	Tnf	16363	-0.378	0.0006	No
128	Sod1	16618	-0.402	-0.0012	No
129	Txnip	17054	-0.448	-0.0116	No
130	Diablo	17551	-0.514	-0.0233	No
131	Bmf	17602	-0.522	-0.0103	No
132	Ddit3	17713	-0.547	0.0001	No
133	Pak1	17985	-0.614	0.0037	No
134	Ebp	18072	-0.646	0.0184	No