Details for gene set HALLMARK_PROTEIN

Table: GSEA Results Summary

Dataset	CLP.Basophil_Pheno.cls #Group2_versus_Group3.Basophil_Pheno.cls #Group2_versus_Group3_repos
Phenotype	Basophil_Pheno.cls#Group2_versus_Group3_repos
Upregulated in class	1
GeneSet	HALLMARK_PROTEIN_SECRETION
Enrichment Score (ES)	0.41638786
Normalized Enrichment Score (NES)	1.7744485
Nominal p-value	0.008032128
FDR q-value	0.07408978
FWER p-Value	0.06

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Tspan8	7	1.027	0.0537	Yes
2	Abca1	113	0.733	0.0865	Yes
3	Cltc	119	0.721	0.1242	Yes
4	Copb2	548	0.523	0.1284	Yes
5	Anp32e	763	0.475	0.1417	Yes
6	Napg	880	0.457	0.1595	Yes
7	Atp1a1	1018	0.437	0.1750	Yes
8	Egfr	1411	0.388	0.1740	Yes
9	M6pr	1432	0.386	0.1933	Yes
10	Uso1	1578	0.373	0.2050	Yes
11	Tpd52	1614	0.370	0.2225	Yes
12	Zw10	1685	0.362	0.2378	Yes
13	Atp7a	1927	0.342	0.2426	Yes
14	Clta	2002	0.334	0.2562	Yes
15	Dst	2174	0.322	0.2638	Yes
16	Copb1	2209	0.320	0.2788	Yes
17	Galc	2221	0.318	0.2950	Yes
18	Tmed10	2315	0.313	0.3063	Yes
19	Atp6v1h	2463	0.300	0.3141	Yes
20	Ocrl	2619	0.288	0.3208	Yes
21	Vamp3	2872	0.270	0.3213	Yes
22	Sec24d	2901	0.268	0.3339	Yes
23	Sec31a	2977	0.262	0.3436	Yes
24	Tmx1	3084	0.255	0.3512	Yes
25	Rab5a	3235	0.245	0.3559	Yes
26	Rer1	3280	0.243	0.3663	Yes
27	Gla	3467	0.230	0.3683	Yes
28	Rps6ka3	3662	0.219	0.3692	Yes
29	Arfgef2	3667	0.218	0.3804	Yes
30	Vps45	3716	0.215	0.3892	Yes
31	Stx16	3865	0.208	0.3920	Yes
32	Mon2	3867	0.208	0.4029	Yes
33	Lman1	3997	0.199	0.4063	Yes
34	Arcn1	4156	0.191	0.4078	Yes
35	Arf1	4243	0.186	0.4129	Yes
36	Cog2	4354	0.180	0.4164	Yes
37	Adam10	5075	0.148	0.3849	No
38	Cope	5154	0.144	0.3882	No
39	Ykt6	5261	0.139	0.3897	No
40	Arfgef1	5321	0.135	0.3936	No
41	Ap2b1	5502	0.127	0.3905	No
42	Rab22a	5612	0.123	0.3910	No
43	Bet1	5885	0.109	0.3819	No
44	Golga4	5951	0.106	0.3839	No
45	Krt18	6573	0.079	0.3542	No
46	Lamp2	6690	0.075	0.3518	No
47	Rab2a	6853	0.068	0.3465	No
48	Mapk1	7184	0.055	0.3314	No
49	Snap23	7280	0.050	0.3289	No
50	Bnip3	7332	0.048	0.3286	No
51	Pam	7347	0.046	0.3303	No
52	Stx7	7470	0.041	0.3258	No
53	Ctsc	7763	0.028	0.3113	No
54	Ap1g1	7930	0.022	0.3034	No
55	Scamp1	7994	0.019	0.3010	No
56	Scamp3	8239	0.009	0.2881	No
57	Ergic3	8439	0.000	0.2773	No
58	Clcn3	8474	-0.000	0.2754	No
59	Rab9	8637	-0.007	0.2670	No
60	Ap3b1	8809	-0.014	0.2584	No
61	Snx2	9040	-0.024	0.2470	No
62	Igf2r	9072	-0.025	0.2467	No
63	Ap2m1	9183	-0.030	0.2422	No
64	Napa	9190	-0.030	0.2435	No
65	Arfip1	9284	-0.034	0.2402	No
66	Dnm1l	9687	-0.050	0.2209	No
67	Tsg101	9979	-0.063	0.2083	No
68	Tom1l1	10026	-0.064	0.2092	No
69	Yipf6	10467	-0.085	0.1896	No
70	Gosr2	11289	-0.119	0.1511	No
71	Ap2s1	11366	-0.123	0.1534	No
72	Sec22b	11407	-0.125	0.1578	No
73	Dop1a	11431	-0.126	0.1632	No
74	Vps4b	11478	-0.128	0.1674	No
75	Rab14	11969	-0.151	0.1486	No
76	Cav2	12056	-0.154	0.1520	No
77	Sgms1	12211	-0.162	0.1521	No
78	Ap3s1	12279	-0.165	0.1572	No
79	Stam	12364	-0.170	0.1615	No
80	Vamp4	12380	-0.170	0.1696	No
81	Gnas	12554	-0.179	0.1696	No
82	Gbf1	12792	-0.191	0.1667	No
83	Stx12	12883	-0.195	0.1721	No
84	Cln5	13614	-0.233	0.1445	No
85	Cd63	13655	-0.235	0.1546	No
86	Ppt1	13755	-0.240	0.1619	No
87	Arfgap3	13784	-0.242	0.1731	No
88	Kif1b	15341	-0.331	0.1056	No
89	Sod1	15637	-0.351	0.1079	No
90	Sh3gl2	16177	-0.396	0.0994	No
91	Ica1	16500	-0.425	0.1042	No