Details for gene set HALLMARK

Table: GSEA Results Summary

Dataset	CLP.Basophil_Pheno.cls #Group2_versus_Group3.Basophil_Pheno.cls #Group2_versus_Group3_repos
Phenotype	Basophil_Pheno.cls#Group2_versus_Group3_repos
Upregulated in class	1
GeneSet	HALLMARK_GLYCOLYSIS
Enrichment Score (ES)	0.20625861
Normalized Enrichment Score (NES)	0.93800545
Nominal p-value	0.5731225
FDR q-value	0.9339624
FWER p-Value	1.0

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Gpc3	126	0.715	0.0132	Yes
2	Psmc4	141	0.708	0.0323	Yes
3	Nasp	181	0.677	0.0492	Yes
4	Got2	356	0.574	0.0558	Yes
5	Rpe	376	0.570	0.0708	Yes
6	Me1	421	0.559	0.0840	Yes
7	Gapdhs	455	0.549	0.0977	Yes
8	Copb2	548	0.523	0.1073	Yes
9	Dld	554	0.522	0.1217	Yes
10	Sap30	707	0.484	0.1270	Yes
11	Ndst3	824	0.466	0.1337	Yes
12	Gnpda1	1003	0.439	0.1363	Yes
13	Tgfbi	1148	0.420	0.1402	Yes
14	Vldlr	1296	0.401	0.1434	Yes
15	Hdlbp	1333	0.397	0.1525	Yes
16	Egfr	1411	0.388	0.1592	Yes
17	P4ha1	1431	0.386	0.1691	Yes
18	Fkbp4	1457	0.384	0.1785	Yes
19	Agrn	1510	0.379	0.1863	Yes
20	Aldh9a1	1616	0.369	0.1909	Yes
21	B4galt4	1639	0.367	0.2000	Yes
22	Pfkfb1	1835	0.350	0.1991	Yes
23	Arpp19	1916	0.343	0.2044	Yes
24	Pkp2	2052	0.330	0.2063	Yes
25	G6pdx	2449	0.301	0.1930	No
26	Ppp2cb	2642	0.287	0.1905	No
27	Egln3	2705	0.281	0.1950	No
28	Pfkp	2974	0.262	0.1877	No
29	Fut8	3394	0.235	0.1713	No
30	Sdc3	3434	0.233	0.1757	No
31	Hs6st2	3448	0.232	0.1815	No
32	Nsdhl	3569	0.224	0.1813	No
33	Hspa5	3607	0.222	0.1855	No
34	Ak4	3638	0.220	0.1900	No
35	Mdh1	3729	0.215	0.1911	No
36	Pkm	3818	0.210	0.1922	No
37	Slc16a3	4079	0.195	0.1834	No
38	Sdhc	4081	0.195	0.1888	No
39	Met	4161	0.191	0.1899	No
40	Tpst1	4321	0.182	0.1863	No
41	Cog2	4354	0.180	0.1896	No
42	Ak3	4432	0.176	0.1903	No
43	Hax1	4478	0.174	0.1927	No
44	Pgk1	4594	0.169	0.1912	No
45	Col5a1	4677	0.165	0.1913	No
46	Plod2	4740	0.162	0.1925	No
47	Cln6	4918	0.155	0.1871	No
48	Qsox1	4926	0.155	0.1911	No
49	Il13ra1	4961	0.153	0.1935	No
50	Pygl	4974	0.153	0.1971	No
51	Alg1	5060	0.148	0.1967	No
52	Cdk1	5084	0.147	0.1995	No
53	Gne	5276	0.138	0.1929	No
54	Aurka	5369	0.133	0.1916	No
55	Slc35a3	5373	0.133	0.1952	No
56	Gfus	5714	0.117	0.1799	No
57	Slc25a13	5738	0.116	0.1818	No
58	Gfpt1	5831	0.111	0.1799	No
59	Chpf2	5858	0.110	0.1816	No
60	Taldo1	6252	0.093	0.1627	No
61	Vegfa	6301	0.091	0.1626	No
62	Ier3	6445	0.085	0.1571	No
63	Rragd	6494	0.083	0.1568	No
64	Galk2	6557	0.080	0.1557	No
65	Gclc	6572	0.079	0.1571	No
66	B4galt2	6776	0.071	0.1480	No
67	Stmn1	6812	0.070	0.1480	No
68	Kif2a	6903	0.066	0.1450	No
69	Mxi1	6951	0.064	0.1442	No
70	Ankzf1	6988	0.063	0.1440	No
71	Slc37a4	7178	0.055	0.1352	No
72	Ppia	7208	0.054	0.1351	No
73	Pmm2	7255	0.052	0.1340	No
74	Polr3k	7298	0.050	0.1331	No
75	Pam	7347	0.046	0.1318	No
76	Hk2	7460	0.042	0.1268	No
77	Txn1	7747	0.029	0.1120	No
78	Gmppb	7961	0.021	0.1009	No
79	Ddit4	7963	0.021	0.1014	No
80	Pgls	7974	0.020	0.1014	No
81	Abcb6	8059	0.016	0.0972	No
82	Pgm2	8128	0.013	0.0939	No
83	Xylt2	8199	0.010	0.0903	No
84	Plod1	8200	0.010	0.0906	No
85	Hs2st1	8217	0.010	0.0900	No
86	Eno1b	8266	0.008	0.0876	No
87	Cxcr4	8377	0.003	0.0816	No
88	Ldha	8424	0.001	0.0792	No
89	Pygb	8521	-0.002	0.0740	No
90	Tpi1	8586	-0.005	0.0706	No
91	Glrx	8592	-0.005	0.0705	No
92	Mdh2	8673	-0.009	0.0663	No
93	Sdc2	8799	-0.014	0.0599	No
94	Akr1a1	8805	-0.014	0.0600	No
95	Pdk3	8969	-0.020	0.0516	No
96	Aldoa	9135	-0.028	0.0434	No
97	Ext2	9224	-0.031	0.0394	No
98	Ugp2	9295	-0.035	0.0366	No
99	B3gat3	9477	-0.042	0.0278	No
100	B4galt1	9492	-0.042	0.0282	No
101	Gys1	9533	-0.044	0.0273	No
102	Sdc1	9686	-0.050	0.0204	No
103	Casp6	10014	-0.064	0.0042	No
104	Chpf	10052	-0.066	0.0040	No
105	P4ha2	10168	-0.071	-0.0003	No
106	Kif20a	10285	-0.076	-0.0045	No
107	Ang	10289	-0.077	-0.0025	No
108	Zfp292	10317	-0.077	-0.0018	No
109	Nt5e	10476	-0.085	-0.0081	No
110	Isg20	10541	-0.088	-0.0091	No
111	Cyb5a	10612	-0.091	-0.0104	No
112	Galk1	10631	-0.091	-0.0088	No
113	Med24	10775	-0.097	-0.0140	No
114	Mif	10821	-0.099	-0.0136	No
115	Prps1	10845	-0.101	-0.0121	No
116	Pgam1	10862	-0.101	-0.0101	No
117	Hmmr	10929	-0.105	-0.0108	No
118	Glce	11029	-0.109	-0.0132	No
119	Aldh7a1	11149	-0.113	-0.0165	No
120	Slc25a10	11196	-0.116	-0.0158	No
121	Bik	11255	-0.118	-0.0156	No
122	Lct	11375	-0.123	-0.0187	No
123	B3gnt3	11489	-0.129	-0.0212	No
124	Me2	11593	-0.133	-0.0231	No
125	Srd5a3	11630	-0.135	-0.0213	No
126	Ppfia4	11857	-0.145	-0.0296	No
127	Ecd	11908	-0.148	-0.0282	No
128	Agl	11928	-0.149	-0.0251	No
129	Rbck1	11986	-0.151	-0.0239	No
130	Cenpa	12091	-0.155	-0.0253	No
131	Gale	12230	-0.162	-0.0283	No
132	Homer1	12350	-0.169	-0.0301	No
133	Gmppa	12421	-0.172	-0.0291	No
134	Angptl4	12502	-0.176	-0.0285	No
135	Ext1	12639	-0.183	-0.0308	No
136	Irs2	13331	-0.218	-0.0626	No
137	Vcan	13413	-0.223	-0.0607	No
138	Ero1a	13639	-0.234	-0.0665	No
139	Tgfa	13867	-0.245	-0.0721	No
140	Chst12	13922	-0.248	-0.0681	No
141	Got1	14029	-0.254	-0.0667	No
142	Depdc1a	14124	-0.258	-0.0647	No
143	Idua	14142	-0.259	-0.0583	No
144	Fam162a	14269	-0.266	-0.0578	No
145	Idh1	14430	-0.276	-0.0588	No
146	Paxip1	14471	-0.278	-0.0531	No
147	Bpnt1	14704	-0.291	-0.0577	No
148	Gpc1	14771	-0.295	-0.0530	No
149	Cth	14939	-0.306	-0.0536	No
150	Cd44	15000	-0.309	-0.0482	No
151	Lhpp	15094	-0.315	-0.0445	No
152	Pcx	15103	-0.315	-0.0360	No
153	Gusb	15237	-0.324	-0.0342	No
154	Capn5	15332	-0.331	-0.0301	No
155	Sod1	15637	-0.351	-0.0369	No
156	Eno2	15728	-0.359	-0.0317	No
157	Adora2b	15749	-0.360	-0.0227	No
158	Chst2	15982	-0.378	-0.0248	No
159	Gpc4	16025	-0.381	-0.0164	No
160	Gpr87	16139	-0.392	-0.0116	No
161	Nanp	16153	-0.394	-0.0012	No
162	B3galt6	16848	-0.463	-0.0263	No
163	Mpi	16920	-0.469	-0.0170	No
164	Gal3st1	16996	-0.476	-0.0077	No
165	B4galt7	17073	-0.486	0.0018	No
166	Ndufv3	17324	-0.518	0.0026	No
167	Phka2	17864	-0.619	-0.0095	No
168	Spag4	17905	-0.631	0.0060	No
169	Cited2	18216	-0.766	0.0105	No